4pjo

Minimal U1 snRNP

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMD3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 作者链 O； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 作者链 a； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126 作者链 o； PDB构建体 1–126； UniProt 1–126

;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;

Homo sapiens

UniProt P14678

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RSMB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95 作者链 P； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95 作者链 b； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95 作者链 p； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

Homo sapiens

UniProt P62314

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SMD1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 8–91； UniProt 2–85 作者链 Q； PDB构建体 8–91； UniProt 2–85 作者链 c； PDB构建体 8–91； UniProt 2–85 作者链 q； PDB构建体 8–91； UniProt 2–85

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

Homo sapiens

UniProt P62316

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SMD2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 R； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 d； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 r； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

Small nuclear ribonucleoprotein E

Homo sapiens

UniProt P62304

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUXE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 S； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 e； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 s； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

Small nuclear ribonucleoprotein F

Homo sapiens

UniProt P62306

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RUXF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75 作者链 T； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75 作者链 f； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75 作者链 t； PDB构建体 1–75； UniProt 1–75

Small nuclear ribonucleoprotein G

Homo sapiens

UniProt P62308

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RUXG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 U； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 g； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76 作者链 u； PDB构建体 1–76； UniProt 1–76

U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa

Homo sapiens

UniProt P08621

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein C × 1 （P09234） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RU17_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 2–60； UniProt 2–60 作者链 N； PDB构建体 2–60； UniProt 2–60 作者链 k； PDB构建体 2–60； UniProt 2–60 作者链 n； PDB构建体 2–60； UniProt 2–60

U1 small nuclear ribonucleoprotein C

Homo sapiens

UniProt P09234

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 8 POTASSIUM ION × 1 water × 4	与全部聚合物一致
2	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 MAGNESIUM ION × 5 POTASSIUM ION × 2 water × 6	与全部聚合物一致
3	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 4 POTASSIUM ION × 3 water × 7	与全部聚合物一致
4	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 9 RNA 2	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 × 1 （P62318） ;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ; × 1 （P14678） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1 × 1 （P62314） Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 × 1 （P62316） Small nuclear ribonucleoprotein E × 1 （P62304） Small nuclear ribonucleoprotein F × 1 （P62306） Small nuclear ribonucleoprotein G × 1 （P62308） U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa × 1 （P08621） U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4. × 1 ;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ; × 1 ZINC ION × 1 MAGNESIUM ION × 3 ETHANOL × 1 CHLORIDE ION × 1 SULFATE ION × 1 water × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RU1C_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61 作者链 M； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61 作者链 l； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61 作者链 m； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4pjo
沉积日期 deposition_date	2014-05-12
结构标题 title	Minimal U1 snRNP
关键词 keywords	U1 snRNP, Spliceosome, Pre-mRNA splicing, Ribonucleoprotein, splicing; SPLICING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4pjo__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4pjo__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4pjo__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.00 Å
Rg（电子密度）	28.67 Å
总 Rg	29.40 Å
原子数	6749
残基数	739
排除体积	116310 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4pjo__assembly_1__model_1`	Undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4pjo__assembly_2__model_1`	Undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4pjo__assembly_3__model_1`	Undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4pjo__assembly_4__model_1`	Undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3
分子量 formula_weight	13940.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a,O,o
原子数 atom_count	26921

MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNAPMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;
分子量 formula_weight	10911.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b,P,p

MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSMTVEGPPPKDTGIARV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1
分子量 formula_weight	10026.6 kDa
突变 mutation	M1V
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c,Q,q

GSGSGSVKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLLVDVEP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21 (DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2
分子量 formula_weight	13551.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d,R,r

MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKSGKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein E
分子量 formula_weight	10817.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e,S,s

MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLKGDNITLLQSVSN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein F
分子量 formula_weight	8369.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f,T,t

MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Small nuclear ribonucleoprotein G
分子量 formula_weight	8508.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,g,U,u

MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa
分子量 formula_weight	6862.8 kDa
突变 mutation	M1G
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k,N,n

GTQFLPPNLLALFAPRDPIPYLPPLEKLPHEKHHNQPYCGIAPYIREFEDPRDAPPPTRA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	U1 small nuclear ribonucleoprotein C
分子量 formula_weight	7279.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l,M,m

MPKFYCDYCDTYLTHDSPSVRKTHCSGRKHKENVKDYYQKWMEEQAQSLIDKTTAAFQQGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli B

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	U1 RNA variant (48-MER) with 4-helix junction replaced by kissing loop (HIV-1 (Mal) DIS) and shorter stem-loop 4.
分子量 formula_weight	19575.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	1,2,3,4

GGACUUACCUGGCAGUGAGGUGCACACACUGCAUAAUUUGUGGUAGUGGGCGAAAGCCCG

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	;RNA (5'-R(APGPGPUPAPAPGPUPCPC)-3') ;
分子量 formula_weight	3201.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	X,x,Y,y

AGGUAAGUCC

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	238.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ETHANOL
分子量 formula_weight	46.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 19 Entity 19 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	48

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 28 domains

CATH v4.4 (28 domains)

结构域编号 domain_id	4pjoA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoO00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoP00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoQ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoR00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoT00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoU00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoa00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjob00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoc00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjod00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoe00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjof00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjog00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoo00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjop00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjoq00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjor00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjos00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjot00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

结构域编号 domain_id	4pjou00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 —

▶

晶胞边长 a length_a	120.359 Å
晶胞边长 b length_b	172.627 Å
晶胞边长 c length_c	256.322 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	70.000 Å
R 因子 r_factor	0.2094
R_work r_work	0.2070
R_free r_free	0.2549

Minimal U1 snRNP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein F

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small nuclear ribonucleoprotein G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

U1 small nuclear ribonucleoprotein C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4pjo__assembly_4__model_1

4pjo__assembly_4__model_1 | I(q)

4pjo__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment