4wvi

Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep2).

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 91.3 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose-binding periplasmic protein,Signal peptidase IB

Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 33–392	片段：unp residues 33-393, unp residues 26-175 突变：K143G, Q78C, R393N	substrate peptide (pep2) × 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：BATCH MODE；290 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4WVI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HSJ SARR MBP FUSION STRUCTURE 提交 2000-12-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–387（361 aa）链 B 27–387（361 aa）	未记录	GLC alpha-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.304
2V93 EQUILLIBRIUM MIXTURE OF OPEN AND PARTIALLY-CLOSED SPECIES IN THE APO STATE OF MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN BY PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT NMR 提交 2007-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：YES	MXT 1-(1-HYDROXY-2,2,6,6-TETRAMETHYLPIPERIDIN-4-YL)PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0MM NACL；压力 1.0 NMR样品组成 10MM TRIS-HCL	分辨率未提供
3IO4 Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - Crystal C90 提交 2009-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–384（358 aa）片段：Fusion protein, see remark 999 链 B 27–384（358 aa）片段：Fusion protein, see remark 999 链 C 27–384（358 aa）片段：Fusion protein, see remark 999	未记录	ZN ZINC ION × 8 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；12% polyethylene glycol, 200 mM Zn Acetate, 200 mM Sodium Acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5 to 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.63 Å R-free 0.304
3IO6 Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C92-a 提交 2009-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–384（358 aa）片段：FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999 链 B 27–384（358 aa）片段：FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999 链 C 27–384（358 aa）片段：FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999	未记录	ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.70 Å R-free 0.293
3OSQ Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 175 提交 2010-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–199（173 aa）片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396 链 A 200–396（197 aa）片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；296 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 1.90 Å R-free 0.199
3OSR Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 311 提交 2010-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–337（311 aa）片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396 链 A 338–396（59 aa）片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；296 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K	分辨率 2.00 Å R-free 0.226
3OSR Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 311 提交 2010-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–337（311 aa）片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396 链 B 338–396（59 aa）片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；296 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K	分辨率 2.00 Å R-free 0.226
3VD8 Crystal structure of human AIM2 PYD domain with MBP fusion 提交 2012-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–384（358 aa）片段：PYD domain (UNP Residues 1-107)	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；20% PEG3350, 0.1M Potassium Acetate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.07 Å R-free 0.221
4FEB Crystal Structure of Htt36Q3H-EX1-X1-C2(Beta) 提交 2012-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–384（358 aa）链 B 27–384（358 aa）链 C 27–384（358 aa）	突变：HQHQH 突变：HQHQH 突变：HQHQH	ZN ZINC ION × 38 NA SODIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.5；278 K；PEG12K, Na Acetate, Zn Acetate, Na Cacodylate, pH 6.5, hanging drop, temperature 278K	分辨率 2.80 Å R-free 0.275
4MY2 Crystal Structure of Norrin in fusion with Maltose Binding Protein 提交 2013-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–392（367 aa）片段：Maltose binding protein (UNP residues 26-392), Norrin (UNP residues 30-133) fusion protein	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；15% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.40 Å R-free 0.237
4WGI A Single Diastereomer of a Macrolactam Core Binds Specifically to Myeloid Cell Leukemia 1 (MCL1) 提交 2014-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：unp residues 27-392,unp residues 173-291	突变：K194A, K197A, R201A	3M6 (2S)-2-[(2S,3R)-10-{[(4-fluorophenyl)sulfonyl]amino}-3-methyl-2-[(methyl{[4-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoyl}amino)methyl]-6-oxo-3,4-dihydro-2H-1,5-benzoxazocin-5(6H)-yl]propanoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；10 MG/ML MBP-MCL1 VCID 9272, 200MM MG FORMATE, 20% PEG3350, 0.5M BRD-0611, 1MM MALTOSE, CRYOPROTECTANT 20% ETHYLENE GLYCOL	分辨率 1.85 Å R-free 0.213
4WRN Crystal structure of the polymerization region of human uromodulin/Tamm-Horsfall protein 提交 2014-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–393（367 aa）链 B 27–393（367 aa）	突变：;I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A,I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A ; 突变：;I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A,I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A ;	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；Sodium/potassium tartrate, Tris-HCl	分辨率 3.20 Å R-free 0.246
4WTH Ataxin-3 Carboxy Terminal Region - Crystal C2 (triclinic) 提交 2014-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG5000 MME, 0.9 M sodium acetate, 0.06 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate	分辨率 2.25 Å R-free 0.250
4WTH Ataxin-3 Carboxy Terminal Region - Crystal C2 (triclinic) 提交 2014-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG5000 MME, 0.9 M sodium acetate, 0.06 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate	分辨率 2.25 Å R-free 0.250
4WVG Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB). 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–392（360 aa）片段：UNP RESIDUES 33-393, UNP RESIDUES 26-191	突变：S36A, R393N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 0.2 M amino acids mix (0.2 M sodium-L-glutamate, 0.2 M DL-alanine, 0.2 M glycine, 0.2 M DL-lysine, 0.2 M DL-serine), 100 mM Tris.Cl pH 8.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
4WVH Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep1). 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 33–392（360 aa）片段：unp residues 33-382, unp reisdues 26-175	突变：K143G, Q78C,K143G, Q78C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；296 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.248
4WVJ Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with an inhibitor peptide (pep3). 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 33–392（360 aa）片段：UNP RESIDUES 33-393, unp residues 26-175	突变：K143G, Q78C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；290 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.229
4XA2 Structure of the Major Type IV pilin of Acinetobacter baumannii 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–393（367 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-Tris, 22.5% PEG 3350, 0.3M 1,6 Hexandediol	分辨率 1.98 Å R-free 0.241
4XA2 Structure of the Major Type IV pilin of Acinetobacter baumannii 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–393（367 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-Tris, 22.5% PEG 3350, 0.3M 1,6 Hexandediol	分辨率 1.98 Å R-free 0.241
4XAI Crystal Structure of red flour beetle NR2E1/TLX 提交 2014-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）片段：maltose binding protein fused ligand binding domain,maltose binding protein fused ligand binding domain 链 B 27–392（366 aa）片段：maltose binding protein fused ligand binding domain,maltose binding protein fused ligand binding domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；298 K；PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.262
4XAJ Crystal structure of human NR2E1/TLX 提交 2014-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 26–392（367 aa）片段：maltose binding protein fused ligand binding domain 链 C 26–392（367 aa）片段：maltose binding protein fused ligand binding domain	突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V 突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；PEG3350	分辨率 3.55 Å R-free 0.314
4XAJ Crystal structure of human NR2E1/TLX 提交 2014-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 26–392（367 aa）片段：maltose binding protein fused ligand binding domain 链 D 26–392（367 aa）片段：maltose binding protein fused ligand binding domain	突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V 突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；PEG3350	分辨率 3.55 Å R-free 0.314
4XHS Crystal structure of human NLRP12 PYD domain and implication in homotypic interaction 提交 2015-01-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–392（366 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP P59046 residues 10-106 链 B 27–392（366 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP P59046 residues 10-106	未记录	FMT FORMIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；3.5 M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Acetate pH 4.6	分辨率 1.70 Å R-free 0.190
4YS9 Ataxin-3 Carboxy-Terminal Region - Crystal C1 (tetragonal) 提交 2015-03-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；25% PEG5000 MME, 1.0 M sodium acetate, 0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.223
5BJZ Crystal structure of maltose binding protein in complex with an allosteric synthetic antibody 提交 2017-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 26–393（368 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；283 K；0.1 M HEPES: pH 7.0 and 15% PEG4000	分辨率 1.95 Å R-free 0.229
5BJZ Crystal structure of maltose binding protein in complex with an allosteric synthetic antibody 提交 2017-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 26–393（368 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；283 K；0.1 M HEPES: pH 7.0 and 15% PEG4000	分辨率 1.95 Å R-free 0.229
5BMY Crystal structure of hPin1 WW domain (5-21) fused with maltose-binding protein 提交 2015-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–393（367 aa）	突变：R393N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；2.1 M DL-malic acid	分辨率 2.00 Å R-free 0.194
5C7R Revealing surface waters on an antifreeze protein by fusion protein crystallography 提交 2015-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–384（358 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-384, UNP P19614 residues 1-63	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.75 M (NH4)2SO4, 100 mM NaOAC (pH 4.4)	分辨率 1.94 Å R-free 0.234
5C7R Revealing surface waters on an antifreeze protein by fusion protein crystallography 提交 2015-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–384（358 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-384, UNP P19614 residues 1-63	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.75 M (NH4)2SO4, 100 mM NaOAC (pH 4.4)	分辨率 1.94 Å R-free 0.234
5CL1 Complex structure of Norrin with human Frizzled 4 提交 2015-07-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 26–392（367 aa）片段：UNP Q00604 residues 31-133 链 B 26–392（367 aa）片段：UNP Q00604 residues 31-133	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), 15% w/v polyethylene glycol 8,000	分辨率 3.80 Å R-free 0.310
5DFM Structure of Tetrahymena telomerase p19 fused to MBP 提交 2015-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–384（358 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；12 mg/ml MBP-P19 protein, 0.1 M Sodium Acetate, 2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5DFM Structure of Tetrahymena telomerase p19 fused to MBP 提交 2015-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–384（358 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；12 mg/ml MBP-P19 protein, 0.1 M Sodium Acetate, 2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5DFM Structure of Tetrahymena telomerase p19 fused to MBP 提交 2015-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 27–384（358 aa）链 B 27–384（358 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 45 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；12 mg/ml MBP-P19 protein, 0.1 M Sodium Acetate, 2.0 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5E24 Structure of the Su(H)-Hairless-DNA Repressor Complex 提交 2015-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 73	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；277 K；Tris, PEG3350, (NH4)2SO4	分辨率 2.14 Å R-free 0.193
5E24 Structure of the Su(H)-Hairless-DNA Repressor Complex 提交 2015-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric	链 C 27–396（370 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 40	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；277 K；Tris, PEG3350, (NH4)2SO4	分辨率 2.14 Å R-free 0.193
5E24 Structure of the Su(H)-Hairless-DNA Repressor Complex 提交 2015-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 27–396（370 aa）链 C 27–396（370 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R 突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 113	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；277 K；Tris, PEG3350, (NH4)2SO4	分辨率 2.14 Å R-free 0.193
5E7U MBP-MamC loop structure, a magnetite biomineralizing protein from Magnetospirillium magneticum AMB-1 提交 2015-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–389（363 aa）链 A 390–392（3 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate , 2 M Ammonium sulfate	分辨率 2.80 Å R-free 0.307
5EDU Crystal structure of human histone deacetylase 6 catalytic domain 2 in complex with trichostatin A 提交 2015-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）片段：MBP + HD6 catalytic domain 2 (UNP residues 479-835)	未记录	TSN TRICHOSTATIN A × 1 ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate, 20% PEG3350	分辨率 2.79 Å R-free 0.275
5EDU Crystal structure of human histone deacetylase 6 catalytic domain 2 in complex with trichostatin A 提交 2015-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：MBP + HD6 catalytic domain 2 (UNP residues 479-835)	未记录	TSN TRICHOSTATIN A × 1 ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate, 20% PEG3350	分辨率 2.79 Å R-free 0.275
5FIO DARPins as a new tool for experimental phasing in protein crystallography 提交 2015-09-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 29–392（364 aa）片段：UNP RESIDUES 29-392	未记录	HG MERCURY (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；30.55% W/V PEG 6000, 0.1M TRIS-CL, PH 8.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.253
5GPP Crystal structure of zebrafish ASC PYD domain 提交 2016-08-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–384（358 aa）片段：UNP residues 27-384,UNP residues 3-88	突变：D83A,K84A,E173A,N174A,K240A	SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；20% PEG2000MME, 0.1 M NaAcO	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
5GPP Crystal structure of zebrafish ASC PYD domain 提交 2016-08-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–384（358 aa）片段：UNP residues 27-384,UNP residues 3-88	突变：D83A,K84A,E173A,N174A,K240A	SO4 SULFATE ION × 3 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；20% PEG2000MME, 0.1 M NaAcO	分辨率 2.00 Å R-free 0.252
5GPQ Crystal Structure of zebrafish ASC CARD Domain 提交 2016-08-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–384（358 aa）片段：UNP residues 27-384,UNP residues 119-201	突变：D83A,K84A,E173A,N174A,K240A	CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.0 M Ammonium Citrate, 0.1 M HEPES	分辨率 2.10 Å R-free 0.199
5II4 Crystal structure of red abalone VERL repeat 1 with linker at 2.0 A resolution 提交 2016-03-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–393（367 aa）	突变：N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；40% PEG 600, 0.1M CHES	分辨率 2.00 Å R-free 0.247
5JJ4 Crystal Structure of a Variant Human Activation-induced Deoxycytidine Deaminase as an MBP fusion protein 提交 2016-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 27–393（367 aa）片段：unp residues 27-384, unp residues 3-183	未记录	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM MES pH 6.5, 200mM Calcium Acetate, 15%PEG8000	分辨率 2.81 Å R-free 0.232
5JJ4 Crystal Structure of a Variant Human Activation-induced Deoxycytidine Deaminase as an MBP fusion protein 提交 2016-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–393（367 aa）片段：unp residues 27-384, unp residues 3-183	未记录	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM MES pH 6.5, 200mM Calcium Acetate, 15%PEG8000	分辨率 2.81 Å R-free 0.232
5JJ4 Crystal Structure of a Variant Human Activation-induced Deoxycytidine Deaminase as an MBP fusion protein 提交 2016-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–393（367 aa）片段：unp residues 27-384, unp residues 3-183	未记录	ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM MES pH 6.5, 200mM Calcium Acetate, 15%PEG8000	分辨率 2.81 Å R-free 0.232
5JON Crystal structure of the unliganded form of HCN2 CNBD 提交 2016-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；34-36% dimethyl PEG 500, 240 mM potassium nitrate, 20 mM magnesium chloride, 100 mM BIS-TRIS, pH 6.0	分辨率 2.04 Å R-free 0.221
5JON Crystal structure of the unliganded form of HCN2 CNBD 提交 2016-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）	未记录	NO3 NITRATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；34-36% dimethyl PEG 500, 240 mM potassium nitrate, 20 mM magnesium chloride, 100 mM BIS-TRIS, pH 6.0	分辨率 2.04 Å R-free 0.221
5JTQ The structure of chaperone SecB in complex with unstructured MBP binding site d 提交 2016-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 108–149（42 aa）片段：residues 108-149 链 F 108–149（42 aa）片段：residues 108-149	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Maltose Binding Protein (MBP) binding site d, 150 mM potassium chloride, 50 mM potassium phosphate, 50 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5JTR The structure of chaperone SecB in complex with unstructured MBP binding site e 提交 2016-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 168–207（40 aa）片段：residues 168-207 链 F 168–207（40 aa）片段：residues 168-207 链 G 168–207（40 aa）片段：residues 168-207 链 H 168–207（40 aa）片段：residues 168-207	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Maltose Binding Protein (MBP) binding site e, 150 mM potassium chloride, 50 mM sodium phosphate, 50 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5K94 Deletion-Insertion Chimera of MBP with the Preprotein Cross-Linking Domain of the SecA ATPase 提交 2016-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–197（171 aa）链 A 202–396（195 aa）	未记录	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PCB buffer (Qiagen; sodium propionate, sodium cacodylate, bis-tris propane), pH 7.0; 19.5 % PEG 1500; 10% glycerol; 28 mg/mL protein concentration	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
5K94 Deletion-Insertion Chimera of MBP with the Preprotein Cross-Linking Domain of the SecA ATPase 提交 2016-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–197（171 aa）链 B 202–396（195 aa）	未记录	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PCB buffer (Qiagen; sodium propionate, sodium cacodylate, bis-tris propane), pH 7.0; 19.5 % PEG 1500; 10% glycerol; 28 mg/mL protein concentration	分辨率 2.10 Å R-free 0.230
5LDF Maltose binding protein genetically fused to dodecameric glutamine synthetase 提交 2016-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 M 27–396（370 aa）链 N 27–396（370 aa）链 O 27–396（370 aa）链 P 27–396（370 aa）链 Q 27–396（370 aa）链 R 27–396（370 aa）链 S 27–396（370 aa）链 T 27–396（370 aa）链 U 27–396（370 aa）链 V 27–396（370 aa）链 W 27–396（370 aa）链 X 27–396（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.20 Å
5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 29–392（364 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.306
5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 29–392（364 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.306
5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 29–392（364 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0	分辨率 3.10 Å R-free 0.306
5LEM Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_11_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 29–392（364 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；PEG6000 20% w/v, TAPS 0.02 M, pH 9.0	分辨率 2.98 Å R-free 0.295
5LOF Crystal structure of the MBP-MCL1 complex with highly selective and potent inhibitor of MCL1 提交 2016-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：K194A, K197A, R201A,K194A, K197A, R201A	70R (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(5-fluoranylfuran-2-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-[[2-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]pyrazol-3-yl]methoxy]phenyl]propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；284 K；25% PEG3350, 0.2M Magnesium Formate, 1mM Maltose	分辨率 2.20 Å R-free 0.235
5T03 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and glucuronic acid containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A	A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM di-sodium tartrate, 18-19% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.212
5T03 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and glucuronic acid containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A	A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM di-sodium tartrate, 18-19% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.212
5T05 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and IdoA2S containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A	A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 5 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM disodium tartrate, 18-19% PEG 3350, 1mM PAP, 5mM maltose, 10mM oligosaccharide ligand	分辨率 1.95 Å R-free 0.212
5T05 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and IdoA2S containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A	A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM disodium tartrate, 18-19% PEG 3350, 1mM PAP, 5mM maltose, 10mM oligosaccharide ligand	分辨率 1.95 Å R-free 0.212
5T0A Crystal Structure of Heparan Sulfate 6-O-Sulfotransferase with bound PAP and heptasaccharide substrate 提交 2016-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A	NPO P-NITROPHENOL × 1 A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25mM Tris pH 7.5 200mM disodium tartrate 18-19% PEG3350 1mM PAP 10mM oligosaccharide 5mM maltose	分辨率 1.95 Å R-free 0.213
5T0A Crystal Structure of Heparan Sulfate 6-O-Sulfotransferase with bound PAP and heptasaccharide substrate 提交 2016-08-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）	突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A	NPO P-NITROPHENOL × 1 A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25mM Tris pH 7.5 200mM disodium tartrate 18-19% PEG3350 1mM PAP 10mM oligosaccharide 5mM maltose	分辨率 1.95 Å R-free 0.213
5TTD Minor pilin FctB from S. pyogenes with engineered intramolecular isopeptide bond 提交 2016-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–392（360 aa）片段：UNP residues 33-392,UNP residues 26-148	未记录	FMT FORMIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；12.5% PEG 1000, 10% PEG 3350, 12.5% MPD, 0.1M MES/imidazole pH 6.5, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5TTD Minor pilin FctB from S. pyogenes with engineered intramolecular isopeptide bond 提交 2016-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 33–392（360 aa）片段：UNP residues 33-392,UNP residues 26-148	未记录	FMT FORMIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；12.5% PEG 1000, 10% PEG 3350, 12.5% MPD, 0.1M MES/imidazole pH 6.5, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5W0R Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with cacodylic acid 提交 2017-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP Q9GZX7 residues 13-181	未记录	ZN ZINC ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.05 M sodium cacodylate at pH 5.5, 20 mM MgCl2, 10 mM CaCl2, 10 mM spermidine, 5% PEG3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
5W0R Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with cacodylic acid 提交 2017-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP Q9GZX7 residues 13-181	未记录	ZN ZINC ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.05 M sodium cacodylate at pH 5.5, 20 mM MgCl2, 10 mM CaCl2, 10 mM spermidine, 5% PEG3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
5W0U Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with dCMP 提交 2017-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 27–392（366 aa）片段：UNP residues 27-392,UNP residues 13-181	未记录	ZN ZINC ION × 1 DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.1 M MES at pH 6.2, 3%PEG3350, 10 mM CaCl2, 20mM dCMP	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
5W0U Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with dCMP 提交 2017-05-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：UNP residues 27-392,UNP residues 13-181	未记录	ZN ZINC ION × 1 DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.1 M MES at pH 6.2, 3%PEG3350, 10 mM CaCl2, 20mM dCMP	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
5W0Z Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) 提交 2017-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-392,UNP Q9GZX7 residues 13-181	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.26 M NaCl, 0.1 M MES pH 6.0, 12% PEG3350	分辨率 3.61 Å R-free 0.307
5W0Z Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) 提交 2017-06-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-392,UNP Q9GZX7 residues 13-181	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.26 M NaCl, 0.1 M MES pH 6.0, 12% PEG3350	分辨率 3.61 Å R-free 0.307
5W1C Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with cytidine 提交 2017-06-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）链 B 27–392（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CTN 4-AMINO-1-BETA-D-RIBOFURANOSYL-2(1H)-PYRIMIDINONE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.1 M MES at pH 6.2, 3% PEG3350, 10 mM CaCl2 and 20mM Cytidine	分辨率 3.18 Å R-free 0.270
5ZD4 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 in complex with double-stranded DNA 提交 2018-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 27–392（366 aa）链 D 27–392（366 aa）	突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A 突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM sodium cacodylate (pH 6.5), 200mM potassium chloride, 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.17 Å R-free 0.244
5ZD4 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 in complex with double-stranded DNA 提交 2018-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）链 B 27–392（366 aa）	突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A 突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM sodium cacodylate (pH 6.5), 200mM potassium chloride, 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.17 Å R-free 0.244
6AEO TssL periplasmic domain 提交 2018-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG MME 2000, KSCN	分辨率 2.30 Å R-free 0.229
6AEO TssL periplasmic domain 提交 2018-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–392（366 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG MME 2000, KSCN	分辨率 2.30 Å R-free 0.229
6ANV Crystal structure of anti-CRISPR protein AcrF1 提交 2017-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–396（370 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.2；293 K；0.1 M MES (pH 6.2), 2.5% PEG 3000 (v/v), and 42% PEG400 (v/v)	分辨率 2.27 Å R-free 0.223
6ANV Crystal structure of anti-CRISPR protein AcrF1 提交 2017-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–396（370 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.2；293 K；0.1 M MES (pH 6.2), 2.5% PEG 3000 (v/v), and 42% PEG400 (v/v)	分辨率 2.27 Å R-free 0.223
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 N 26–394（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
6D1U Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer in complex with adrenomedullin 2/intermedin 提交 2018-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–392（367 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% v/v PEG 3,350 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5 0.15 M DL-malic acid	分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6D1U Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer in complex with adrenomedullin 2/intermedin 提交 2018-04-12	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% v/v PEG 3,350 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5 0.15 M DL-malic acid	分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6D1U Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer in complex with adrenomedullin 2/intermedin 提交 2018-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 26–392（367 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% v/v PEG 3,350 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5 0.15 M DL-malic acid	分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6DD5 Crystal Structure of the Cas6 Domain of Marinomonas mediterranea MMB-1 Cas6-RT-Cas1 Fusion Protein 提交 2018-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–384（358 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；295 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.85 Å R-free 0.225
6DD5 Crystal Structure of the Cas6 Domain of Marinomonas mediterranea MMB-1 Cas6-RT-Cas1 Fusion Protein 提交 2018-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–384（358 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；295 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.5 M Ammonium Sulfate	分辨率 2.85 Å R-free 0.225
6DKS Structure of the Rbpj-SHARP-DNA Repressor Complex 提交 2018-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 D 28–392（365 aa）片段：residues 28-392 链 H 28–392（365 aa）片段：residues 28-392	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.6；277 K；Bis-Tris pH6.6 100mM NaCl 40% PEG400 200mM NDSB-256	分辨率 2.78 Å R-free 0.228
6DKS Structure of the Rbpj-SHARP-DNA Repressor Complex 提交 2018-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 D 28–392（365 aa）片段：residues 28-392	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.6；277 K；Bis-Tris pH6.6 100mM NaCl 40% PEG400 200mM NDSB-256	分辨率 2.78 Å R-free 0.228
6DKS Structure of the Rbpj-SHARP-DNA Repressor Complex 提交 2018-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 H 28–392（365 aa）片段：residues 28-392	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.6；277 K；Bis-Tris pH6.6 100mM NaCl 40% PEG400 200mM NDSB-256	分辨率 2.78 Å R-free 0.228
6EG2 Crystal structure of human BRM in complex with compound 16 提交 2018-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	J7J N-(5-amino-2-chloropyridin-4-yl)-N'-(4-bromo-3-{[3-(hydroxymethyl)phenyl]ethynyl}-1,2-thiazol-5-yl)urea × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；100mM Hepes pH7.5, 200mM sodium chloride, 8% isopropanol	分辨率 2.98 Å R-free 0.304
6EG3 Crystal structure of human BRM in complex with compound 15 提交 2018-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	J7G 3-[(4-{[(2-chloropyridin-4-yl)carbamoyl]amino}pyridin-2-yl)ethynyl]benzoic acid × 1 EOH ETHANOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；100mM Tris pH7, 14% Ethanol	分辨率 2.84 Å R-free 0.267
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–195（169 aa）链 A 207–392（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate	分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 27–195（169 aa）链 B 207–392（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate	分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 27–195（169 aa）链 D 207–392（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate	分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 27–195（169 aa）链 G 207–392（186 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate	分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6N84 MBP-fusion protein of transducin-alpha residues 327-350 提交 2018-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：D83A, K84A, E173A, N174A, A216H, K220H, K240A	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；2 M Ammonium Sulphate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6	分辨率 1.75 Å R-free 0.185
6N85 Resistance to inhibitors of cholinesterase 8A (Ric8A) protein in complex with MBP-tagged transducin-alpha residues 327-350 提交 2018-11-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M MIB buffer, 25 % PEG3350pH 8.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.249
6QGD Structure of human Mcl-1 in complex with thienopyrimidine inhibitor 提交 2019-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	J1N 2-[(6-ethyl-5-phenyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-oxidanyl-propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE	分辨率 1.80 Å R-free 0.208
6QXJ Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 6a 提交 2019-03-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：K194A, K197A, R201A,K194A, K197A, R201A	JKQ (2~{R})-2-[[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-5-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；279 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE,1MM MALTOSE	分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6QYK Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 7a 提交 2019-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	JLB (2~{R})-2-[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-5-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxypropanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE	分辨率 2.30 Å R-free 0.266
6QYL Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 8a 提交 2019-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	JLE (2~{R})-2-[[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-4-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]-3-phenyl-propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE	分辨率 2.20 Å R-free 0.235
6QYN Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 10d 提交 2019-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	JL8 (2~{R})-2-[5-(3-chloranyl-2-methyl-4-oxidanyl-phenyl)-6-ethyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-phenyl-propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
6QYO Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 18a 提交 2019-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	JLH (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-ethyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-phenyl-propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE	分辨率 2.10 Å R-free 0.221
6QZ7 Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 8b 提交 2019-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	JLE (2~{R})-2-[[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-4-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]-3-phenyl-propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE	分辨率 2.20 Å R-free 0.211
6YBJ Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 3e 提交 2020-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：K194A,K197A,R201A	CL CHLORIDE ION × 1 OJW (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(5-fluoranylfuran-2-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-[(2-methylpyrazol-3-yl)methoxy]phenyl]propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris buffer pH 6.5, 20% PegMME5K	分辨率 2.50 Å R-free 0.237
6YBK Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 4d 提交 2020-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：K194A,K197A,R201A	CL CHLORIDE ION × 1 OK2 (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(4-fluorophenyl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-(pyrazin-2-ylmethoxy)phenyl]propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；0.1M BisTris buffer pH 6.5, 20% PegMME5K	分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6YBL Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 9m 提交 2020-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：K194A,K197A,R201A	OK5 (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(4-fluorophenyl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-[[2-(2-methoxyphenyl)pyrimidin-4-yl]methoxy]phenyl]propanoic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris buffer pH 6.5, 20% PegMME5K	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7ZNJ Structure of an ALYREF-exon junction complex hexamer 提交 2022-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：30-meric	链 D 23–392（370 aa）链 I 23–392（370 aa）链 N 23–392（370 aa）链 d 23–392（370 aa）链 i 23–392（370 aa）链 n 23–392（370 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å
8C8F Crystal structure of the E. coli maltodextrin-binding protein 提交 2023-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–396（396 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris pH 7.4, 30 % PEG Smear Broad, 0.1 M NaBr and 0.1 M KSCN	分辨率 1.15 Å R-free 0.152
8ETB the crystal structure of a rationally designed zinc sensor based on maltose binding protein - Zn binding conformation 提交 2022-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M MgCl2 , 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% PEG 3350.	分辨率 1.63 Å R-free 0.234
8F23 The crystal structure of a rationally designed zinc sensor based on maltose binding protein - Apo conformation 提交 2022-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.2M sodium formate, pH 7.0, 20% PEG 3350	分辨率 1.93 Å R-free 0.229
8GCR HPV16 E6-E6AP-p53 complex 提交 2023-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 27–396（370 aa）	突变：C87S,C104S,C118S,C147S	ZN ZINC ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8H68 Crystal structure of Caenorhabditis elegans NMAD-1 in complex with NOG and Mg(II) 提交 2022-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GLY GLYCINE × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 10% (w/v) PEG 6000, 10% (v/v) MPD	分辨率 2.20 Å R-free 0.242
8SOJ Cryo-EM structure of human CST bound to POT1(ESDL)/TPP1 in the absence of telomeric ssDNA 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8SOK Cryo-EM structure of human CST bound to POT1(ESDL)/TPP1 in the presence of telomeric ssDNA 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8SVY MBP-Mcl1 in complex with ligand 10 提交 2023-05-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 WUC (15P)-17-chloro-33-fluoro-12-[(2-methoxyethoxy)methyl]-5,14,22-trimethyl-28-oxa-9-thia-5,6,13,14,22-pentaazaheptacyclo[27.7.1.1~4,7~.0~11,15~.0~16,21~.0~20,24~.0~30,35~]octatriaconta-1(36),4(38),6,11(15),12,16,18,20,23,29(37),30,32,34-tridecaene-23-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；19% (w/v) PEG3350, 0.17M Mg formate	分辨率 1.47 Å R-free 0.206
8T2I Negative stain EM assembly of MYC, JAZ, and NINJA complex 提交 2023-06-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 27–392（366 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8	分辨率 10.40 Å
8W23 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, TDI-2804 (consensus map). 提交 2024-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric	链 A 28–392（365 aa）链 B 28–392（365 aa）链 C 28–392（365 aa）链 D 28–392（365 aa）链 E 28–392（365 aa）链 F 28–392（365 aa）链 G 28–392（365 aa）链 H 28–392（365 aa）链 I 28–392（365 aa）链 K 28–392（365 aa）链 L 28–392（365 aa）链 M 28–392（365 aa）链 N 28–392（365 aa）链 O 28–392（365 aa）链 P 28–392（365 aa）链 Q 28–392（365 aa）链 R 28–392（365 aa）链 S 28–392（365 aa）链 T 28–392（365 aa）链 U 28–392（365 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 20 A1AE4 N-{2-[4-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl]-4-oxo-1,4-dihydroquinazolin-7-yl}-4-methoxy-6-phenylpyridine-3-carboxamide × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
8W25 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, TDI-2804 (focused refinement map). 提交 2024-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 28–392（365 aa）链 Q 28–392（365 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 A1AE4 N-{2-[4-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl]-4-oxo-1,4-dihydroquinazolin-7-yl}-4-methoxy-6-phenylpyridine-3-carboxamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.42 Å
8W27 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, XAV (consensus map). 提交 2024-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric	链 A 28–392（365 aa）链 B 28–392（365 aa）链 C 28–392（365 aa）链 D 28–392（365 aa）链 E 28–392（365 aa）链 F 28–392（365 aa）链 G 28–392（365 aa）链 H 28–392（365 aa）链 I 28–392（365 aa）链 J 28–392（365 aa）链 L 28–392（365 aa）链 M 28–392（365 aa）链 N 28–392（365 aa）链 O 28–392（365 aa）链 P 28–392（365 aa）链 Q 28–392（365 aa）链 R 28–392（365 aa）链 S 28–392（365 aa）链 T 28–392（365 aa）链 U 28–392（365 aa）	未记录	XAV 2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-7,8-dihydro-5H-thiopyrano[4,3-d]pyrimidin-4-ol × 20 ZN ZINC ION × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.21 Å
8W28 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, XAV (focused refinement map). 提交 2024-02-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 28–392（365 aa）链 Q 28–392（365 aa）	未记录	XAV 2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-7,8-dihydro-5H-thiopyrano[4,3-d]pyrimidin-4-ol × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.19 Å
8Y20 Crystal structure of the Mcl-1 in complex with A-1210477 提交 2024-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：E173A,N174A,K240A,K391A,K394A,R398A	A1LXV A-1210477 × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG 3350, 0.2M Magnesium Formate, 1mM Maltose	分辨率 2.23 Å R-free 0.243
9GIV Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier inhibited by a UK5099-derivative 提交 2024-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–392（360 aa）	未记录	A1IL4 (2E)-2-cyano-3-[(5M)-5-(2-nitrophenyl)furan-2-yl]prop-2-enoic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.65 Å
9GIW Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier inhibited by zaprinast 提交 2024-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–392（360 aa）	未记录	A1IL3 5-(2-propoxyphenyl)-3,4-dihydro-[1,2,3]triazolo[4,5-d]pyrimidin-7-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
9GIX Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier in the apo-state 提交 2024-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–392（360 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.65 Å
9GIY Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier inhibited by mitoglitazone 提交 2024-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–392（360 aa）	未记录	LO7 Mitoglitazone × 1 A1IMZ Mitoglitazone (R-form) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.79 Å
9H2Q Stabilized complex of Chlamydia trachomatic efector CT622 in complex with human WD40 domain of ATG16L1 提交 2024-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–395（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.80 Å
9I3P CryoEM structure of the Themis:Grb2 complex with bound ProMacrobody 256 提交 2025-01-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–392（360 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris pH8, 100 mM NaCl, 2 mM DTT with added 8 mM CHAPSO for cryogrid sample preparation cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2, 5 s blotting time	分辨率 3.30 Å
9IAZ CryoEM structure of the Themis:Grb2 complex with bound ProMacrobody 256, local refinement 提交 2025-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 33–392（360 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris pH8, 100 mM NaCl, 2 mM DTT with added 8 mM CHAPSO for cryogrid sample preparation cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2, 5 s blotting time	分辨率 3.20 Å
9MAN Structure of Norrin in complex with human Tspan12 large extracellular loop (Tspan12 LEL) 提交 2025-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 26–392（367 aa）链 B 26–392（367 aa）链 C 26–392（367 aa）链 D 26–392（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.78 Å
9ME8 Co-crystal structure of maltose binding protein (MBP)-human SENP3 fusion protein in complex with PELP1 peptide 提交 2024-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 27–384（358 aa）	突变：C532S	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.085M HEPES pH 7.5, 17-20% (v/v) PEG8000	分辨率 2.93 Å R-free 0.232
9P0X Nanodisc-embedded human TF/FVIIa/XK1 in complex with 10H10 Fab (nanodisc-subtracted) 提交 2025-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 T 27–392（366 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9QBJ Legobody dimer 提交 2025-03-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 I 27–384（358 aa）链 J 27–384（358 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9UYY Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with L-Trp 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 TRP TRYPTOPHAN × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.25 Å R-free 0.300
9UYZ Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with 5-HT 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	SRO SEROTONIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.45 Å R-free 0.264
9UZ0 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) as resting state 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CIT CITRIC ACID × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.45 Å R-free 0.248
9UZ1 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) H143Y mutant complexed with L-Trp 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	突变：H143Y	TRP TRYPTOPHAN × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.35 Å R-free 0.236
9UZ2 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with Cyanide ion 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.55 Å R-free 0.238
9UZ3 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with D-Trp 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 DTR D-TRYPTOPHAN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.50 Å R-free 0.275
9UZ4 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with 5-methoxy-L-Trp 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	A1A2Y 5-methoxy-L-tryptophan × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
9UZ5 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with 5-methyl-L-Trp 提交 2025-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–392（366 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 D0Q 5-methyl-L-tryptophan × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate	分辨率 2.50 Å R-free 0.229
9VFI Structure of hTRPC3 solubilized with 4F peptide at 2.72 angstrom 提交 2025-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 27–392（366 aa）链 B 27–392（366 aa）链 C 27–392（366 aa）链 D 27–392（366 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 4 A1L5I [(2~{S})-2-[(~{E})-octadec-9-enoyl]oxy-3-oxidanyl-propyl] octadec-9-enoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
9W3K GPR151-Legobody complex 提交 2025-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 27–394（368 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å

共 109 个其他 PDB 条目、148 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECO57
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 13–372； UniProt 33–392

Maltose-binding periplasmic protein,Signal peptidase IB

Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman

UniProt Q5HHB9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 26–175	片段：unp residues 33-393, unp residues 26-175 突变：K143G, Q78C, R393N	substrate peptide (pep2) × 1 alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：BATCH MODE；290 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.219

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4WVI	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4WVG Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB). 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 26–191（166 aa）片段：UNP RESIDUES 33-393, UNP RESIDUES 26-191	突变：S36A, R393N	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 0.2 M amino acids mix (0.2 M sodium-L-glutamate, 0.2 M DL-alanine, 0.2 M glycine, 0.2 M DL-lysine, 0.2 M DL-serine), 100 mM Tris.Cl pH 8.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.242
4WVH Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep1). 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–175（150 aa）片段：unp residues 33-382, unp reisdues 26-175	突变：K143G, Q78C,K143G, Q78C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；296 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.248
4WVJ Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with an inhibitor peptide (pep3). 提交 2014-11-05	构建体不同突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–175（150 aa）片段：UNP RESIDUES 33-393, unp residues 26-175	突变：K143G, Q78C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；290 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.229

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LEP_STAAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 377–526； UniProt 26–175

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4wvi
沉积日期 deposition_date	2014-11-05
结构标题 title	Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep2).
关键词 keywords	SpsB Type-I signal peptidase, Peptide complex, Cell secretion, MBP fusion, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.31 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.61 Å
零角强度 I(0) i0	53459300.00
分子量 molecular_weight	57975.0 kDa
排除体积 excluded_volume	72905 Å³
包络体积 envelope_volume	91324 Å³
水化壳体积 shell_volume	28894 Å³
包络直径 envelope_diameter	92.1 Å
壳层 Rg shell_rg	33.30 Å
包络 Rg envelope_rg	27.44 Å
形状 Rg shape_rg	27.60 Å
总 Rg total_rg	28.25 Å
总原子数 total_atoms	4097
残基数 n_residues	531
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	91.3 Å
Rg (实空间) rg_real	28.40 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.51 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.3460e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.6010e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.38 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	53460000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8902
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	27.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.376
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.496
角度范围 angular_range	— – 0.2800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	14900000.0000
实空间数据点数 n_real_points	57
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.908; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.943; Smooth: 0.901

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maltose-binding periplasmic protein,Signal peptidase IB
分子量 formula_weight	59189.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.89
突变 mutation	K143G, Q78C, R393N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4477

MSYYHHHHHHHMLVIWINGDKGYNGLAQVGKKFEKDTGIKVTVEHPYKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYACSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDGELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTNAGAIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIVGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWSHPQFEK

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus aureus subsp. aureus str. Newman
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	426430
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	substrate peptide (pep2)
分子量 formula_weight	886.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GGGGAVPTAKA

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	371

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	63.989 Å
晶胞边长 b length_b	80.232 Å
晶胞边长 c length_c	119.879 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	19.780 Å
R 因子 r_factor	0.1895
R_work r_work	0.1879
R_free r_free	0.2194

fit	/app/data/saxs_computation/wv/4wvi/4wvi.fit
pddf	/app/data/pr_computation/wv/4wvi/4wvi.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/wv/4wvi/4wvi.dat

Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep2).

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose-binding periplasmic protein,Signal peptidase IB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltose-binding periplasmic protein,Signal peptidase IB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)