5bqj

Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with 21-hydroxy-oligomycin

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 86.8 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit 9, mitochondrial

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–76 链 B； UniProt 2–76 链 C； UniProt 2–76 链 D； UniProt 2–76 链 E； UniProt 2–76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	E21 21-hydroxy-oligomycin × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.237
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 2–76 链 L； UniProt 2–76 链 M； UniProt 2–76 链 N； UniProt 2–76 链 O； UniProt 2–76	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	E21 21-hydroxy-oligomycin × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.237

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5BQJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2WPD The Mg.ADP inhibited state of the yeast F1c10 ATP synthase 提交 2009-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 J 1–76（76 aa）链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1 M HEPES/HCL PH 7.5, 12% PEG MME 5000, 100 MM SODIUM CHLORIDE MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS/HCL PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 0.02% SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.66 MM ADP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF	分辨率 3.43 Å R-free 0.297
2XOK Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution 提交 2010-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）链 T 1–76（76 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE.	分辨率 3.01 Å R-free 0.253
3U2F ATP synthase c10 ring in proton-unlocked conformation at PH 8.3 提交 2011-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；294 K；68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.3M NACL, 0.1M MALONATE PH 7.0, 2MM MGSO4, 50MM BICINE, PH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.216
3U2Y ATP synthase c10 ring in proton-unlocked conformation at pH 6.1 提交 2011-10-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；294 K；68% MPD, 8% propolyene glycol, 0.3M NaCl, 0.1M malonate pH 7.0, 2mM MgSO4, 50 mM MES pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.50 Å R-free 0.227
3U32 ATP synthase c10 ring reacted with DCCD at pH 5.5 提交 2011-10-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	DCW DICYCLOHEXYLUREA × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；294 K；68% MPD, 8% propolyene glycol, 0.3M NaCl, 2mM MgSO4, 50 mM MES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.254
3UD0 ATP synthase C10 ring in proton-unlocked conformation at PH 5.5 提交 2011-10-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；294 K；68% MPD, 8% PROPOLYENE GLYCOL, 0.3M NACL, 0.1M MALONATE PH 7.0, 2MM MGSO4, 50 MM MES PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K. SOAKING: 68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.4M NACL, 2MM MGCL2, 50MM MES PH 5.5, FOR 12 HOURS AT 294K.	分辨率 2.00 Å R-free 0.221
3ZRY Rotor architecture in the F(1)-c(10)-ring complex of the yeast F-ATP synthase 提交 2011-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 J 1–76（76 aa）链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；10% PEG 4000, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 100 MM HEPES PH 6.5 MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION (10 MG/ML) CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 3 MM SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.04 MM ADP, 1 MM AMP-PNP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF.	分辨率 6.50 Å R-free 0.339
4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：46-meric	链 J 1–76（76 aa）链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）链 j 1–76（76 aa）链 k 1–76（76 aa）链 l 1–76（76 aa）链 m 1–76（76 aa）链 n 1–76（76 aa）链 o 1–76（76 aa）链 p 1–76（76 aa）链 q 1–76（76 aa）链 r 1–76（76 aa）链 s 1–76（76 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4；pH 7.4；250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,	分辨率 37.00 Å
4F4S Structure of the yeast F1Fo ATPase c10 ring with bound oligomycin 提交 2012-05-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 1–76（76 aa）链 B 1–76（76 aa）链 C 1–76（76 aa）链 D 1–76（76 aa）链 E 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFO Oligomycin A × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.3M NACL, 2MM MGSO4, 50MM MES PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
4F4S Structure of the yeast F1Fo ATPase c10 ring with bound oligomycin 提交 2012-05-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFO Oligomycin A × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.3M NACL, 2MM MGSO4, 50MM MES PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
5BPS Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin A 提交 2015-05-28	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–76（75 aa）链 B 2–76（75 aa）链 C 2–76（75 aa）链 D 2–76（75 aa）链 E 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFO Oligomycin A × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
5BPS Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin A 提交 2015-05-28	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 2–76（75 aa）链 L 2–76（75 aa）链 M 2–76（75 aa）链 N 2–76（75 aa）链 O 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFO Oligomycin A × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
5BQ6 Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin B 提交 2015-05-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–76（75 aa）链 B 2–76（75 aa）链 C 2–76（75 aa）链 D 2–76（75 aa）链 E 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFB oligomycin B × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；278 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
5BQ6 Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin B 提交 2015-05-28	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 2–76（75 aa）链 L 2–76（75 aa）链 M 2–76（75 aa）链 N 2–76（75 aa）链 O 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFB oligomycin B × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；278 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
5BQA Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin C 提交 2015-05-28	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 A 2–76（75 aa）链 B 2–76（75 aa）链 C 2–76（75 aa）链 D 2–76（75 aa）链 E 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EF4 oligomycin C × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
5BQA Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin C 提交 2015-05-28	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 K 2–76（75 aa）链 L 2–76（75 aa）链 M 2–76（75 aa）链 N 2–76（75 aa）链 O 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EF4 oligomycin C × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
6B2Z Cryo-EM structure of the dimeric FO region of yeast mitochondrial ATP synthase 提交 2017-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：38-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）链 B 1–76（76 aa）链 C 1–76（76 aa）链 D 1–76（76 aa）链 E 1–76（76 aa）链 F 1–76（76 aa）链 G 1–76（76 aa）链 H 1–76（76 aa）链 I 1–76（76 aa）链 J 1–76（76 aa）链 K 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE；blot for 26 seconds before plunging	分辨率 3.60 Å
6B8H Mosaic model of yeast mitochondrial ATP synthase monomer 提交 2017-10-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）链 J 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）链 T 1–76（76 aa）链 U 1–76（76 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.60 Å
6CP3 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc with inhibitor of oligomycin bound. 提交 2018-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）链 T 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6CP5 Monomer yeast ATP synthase Fo reconstituted in nanodisc with inhibitor of oligomycin bound generated from focused refinement. 提交 2018-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 2–76（75 aa）链 L 2–76（75 aa）链 M 2–76（75 aa）链 N 2–76（75 aa）链 O 2–76（75 aa）链 P 2–76（75 aa）链 Q 2–76（75 aa）链 R 2–76（75 aa）链 S 2–76（75 aa）链 T 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EFO Oligomycin A × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6CP6 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc. 提交 2018-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）链 T 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
6CP7 Monomer yeast ATP synthase Fo reconstituted in nanodisc generated from masked refinement. 提交 2018-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 1–76（76 aa）链 L 1–76（76 aa）链 M 1–76（76 aa）链 N 1–76（76 aa）链 O 1–76（76 aa）链 P 1–76（76 aa）链 Q 1–76（76 aa）链 R 1–76（76 aa）链 S 1–76（76 aa）链 T 1–76（76 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
6WTD Monomer yeast ATP synthase Fo reconstituted in nanodisc with inhibitor of Bedaquiline bound 提交 2020-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 K 2–76（75 aa）链 L 2–76（75 aa）链 M 2–76（75 aa）链 N 2–76（75 aa）链 O 2–76（75 aa）链 P 2–76（75 aa）链 Q 2–76（75 aa）链 R 2–76（75 aa）链 S 2–76（75 aa）链 T 2–76（75 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7TK2 Yeast ATP synthase State 1binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.50 Å
7TK3 Yeast ATP synthase State 1binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.30 Å
7TK4 Yeast ATP synthase State 1binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.00 Å
7TK5 Yeast ATP synthase State 1binding(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.80 Å
7TK6 Yeast ATP synthase State 1catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.50 Å
7TK7 Yeast ATP synthase State 1catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.70 Å
7TK8 Yeast ATP synthase State 1catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.70 Å
7TK9 Yeast ATP synthase State 1catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.00 Å
7TKA Yeast ATP synthase State 1catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.10 Å
7TKB Yeast ATP synthase State 1catalytic(f) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.30 Å
7TKC Yeast ATP synthase State 1catalytic(g) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.80 Å
7TKD Yeast ATP synthase State 1catalytic(h) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.70 Å
7TKE Yeast ATP synthase State 2binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.10 Å
7TKF Yeast ATP synthase State 2binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.10 Å
7TKG Yeast ATP synthase State 2catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.50 Å
7TKH Yeast ATP synthase State 2catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.40 Å
7TKI Yeast ATP synthase State 2catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.10 Å
7TKJ Yeast ATP synthase State 2catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.50 Å
7TKK Yeast ATP synthase State 2catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.30 Å
7TKL Yeast ATP synthase State 3binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.40 Å
7TKM Yeast ATP synthase State 3binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.50 Å
7TKN Yeast ATP synthase State 3binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.10 Å
7TKO Yeast ATP synthase State 3catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.80 Å
7TKP Yeast ATP synthase State 3catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.60 Å
7TKQ Yeast ATP synthase State 3catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.50 Å
7TKR Yeast ATP synthase State 3catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 6.50 Å
7TKS Yeast ATP synthase State 3catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 0 1–76（76 aa）链 1 1–76（76 aa）链 2 1–76（76 aa）链 3 1–76（76 aa）链 4 1–76（76 aa）链 5 1–76（76 aa）链 6 1–76（76 aa）链 7 1–76（76 aa）链 8 1–76（76 aa）链 9 1–76（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 7.50 Å
8F29 Yeast ATP synthase in conformation-1 at pH 6 提交 2022-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 K 1–75（75 aa）链 L 1–75（75 aa）链 M 1–75（75 aa）链 N 1–75（75 aa）链 O 1–75（75 aa）链 P 1–75（75 aa）链 Q 1–75（75 aa）链 R 1–75（75 aa）链 S 1–75（75 aa）链 T 1–75（75 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8F39 Yeast ATP synthase in conformation-2, at pH 6 提交 2022-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 K 1–75（75 aa）链 L 1–75（75 aa）链 M 1–75（75 aa）链 N 1–75（75 aa）链 O 1–75（75 aa）链 P 1–75（75 aa）链 Q 1–75（75 aa）链 R 1–75（75 aa）链 S 1–75（75 aa）链 T 1–75（75 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å

共 48 个其他 PDB 条目、52 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 B； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 C； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 D； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 E； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 K； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 L； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 M； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 N； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76 作者链 O； PDB构建体 2–76； UniProt 2–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5bqj
沉积日期 deposition_date	2015-05-29
结构标题 title	Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with 21-hydroxy-oligomycin
关键词 keywords	;C10 ring, F1FO ATP synthase, 21-hydroxy-oligomycin, mitochondria, membrane, protein-antibiotic complex, MEMBRANE PROTEIN-ANTIBIOTIC complex ;; MEMBRANE PROTEIN/ANTIBIOTIC
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.44 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.32 Å
零角强度 I(0) i0	73045300.00
分子量 molecular_weight	80905.0 kDa
排除体积 excluded_volume	107320 Å³
包络体积 envelope_volume	121980 Å³
水化壳体积 shell_volume	36272 Å³
包络直径 envelope_diameter	92.7 Å
壳层 Rg shell_rg	35.47 Å
包络 Rg envelope_rg	27.37 Å
形状 Rg shape_rg	27.32 Å
总 Rg total_rg	28.28 Å
总原子数 total_atoms	5698
残基数 n_residues	737
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	86.8 Å
Rg (实空间) rg_real	28.23 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.63 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.3050e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1320e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.30 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	73050000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8262
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	38.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.073
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.438
角度范围 angular_range	— – 0.2800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4101000.0000
实空间数据点数 n_real_points	57
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.916; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	5bqjA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjE00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjK00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjL00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjM00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjN00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

结构域编号 domain_id	5bqjO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

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8. 引用文献 (2)

▶

晶胞边长 a length_a	75.975 Å
晶胞边长 b length_b	75.975 Å
晶胞边长 c length_c	489.218 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	160

空间群 space_group	I 41 2 2
空间群编号 int_tables_number	98
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2006
R_work r_work	0.1986
R_free r_free	0.2372

描述 description	ATP synthase subunit 9, mitochondrial
分子量 formula_weight	7790.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.-.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,K,L,M,N,O
原子数 atom_count	6007

Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with 21-hydroxy-oligomycin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit 9, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

描述 description	21-hydroxy-oligomycin
分子量 formula_weight	807.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	129

fit	/app/data/saxs_computation/bq/5bqj/5bqj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bq/5bqj/5bqj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bq/5bqj/5bqj.dat