5cna

REFINED STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH ALPHA-METHYL-D-MANNOPYRANOSIDE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION AND COMPARISON WITH THE SACCHARIDE-FREE STRUCTURE

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 88.3 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CONCANAVALIN A

Canavalia ensiformis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 30–148 链 B； UniProt 30–148 链 C； UniProt 30–148 链 D； UniProt 30–148	未记录	MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5CNA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1APN THE CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF METAL-FREE CONCANAVALIN A AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1995-07-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–290（127 aa）链 B 164–290（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.247
1BXH CONCANAVALIN A COMPLEXED TO METHYL ALPHA1-2 MANNOBIOSIDE 提交 1998-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 C 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 C 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 D 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 D 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；13.5% PEG 6K, 1.0M LICL, 0.1M TRIS PH 7.0	分辨率 2.75 Å R-free 0.238
1CES CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A SOAKED WITH ZINC HAVE A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-02-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.	分辨率 2.70 Å R-free 0.249
1CJP CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-METHYLUMBELLIFERYL-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-10-03	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MUG 4-METHYLUMBELLIFERYL-ALPHA-D-GLUCOSE × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.78 Å R-free 0.216
1CN1 CRYSTAL STRUCTURE OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A. THE METAL-BINDING REGION 提交 1981-12-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）链 B 1–237（237 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.20 Å
1CON THE REFINED STRUCTURE OF CADMIUM SUBSTITUTED CONCANAVALIN A AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-03-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 8 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1CVN CONCANAVALIN A COMPLEXED TO TRIMANNOSIDE 提交 1995-08-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；pH 9.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.255
1DQ6 Manganese;Manganese concanavalin A at pH 7.0 提交 1999-12-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；2 M ammonium sulphate, 60 mM sodium acetate at pH 7, 3% PEGMe 5000, 1 mM MnCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 1.90 Å
1ENQ CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH ZINC HAVING A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-03-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.	分辨率 2.50 Å R-free 0.284
1ENR CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH ZINC AND CALCIUM HAVING A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE AND A CALCIUM ION BOUND IN THE S2 SITE 提交 1996-03-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.	分辨率 1.83 Å
1ENS CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A SOAKED WITH COBALT HAVING A COBALT ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-03-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.	分辨率 2.80 Å R-free 0.259
1GIC CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH METHYL ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-08-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	GYP methyl alpha-D-glucopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 dialysis；pH 6.8；DIALYSIS; 5MM PROTEIN CONCENTRATION WITH, pH 6.8, dialysis	分辨率 2.00 Å
1GKB CONCANAVALIN A, NEW CRYSTAL FORM 提交 2001-08-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；HANGING DROP, 30MG/ML, 10+10 UL 1 ML WELL, TRIS/HCL PH 8.0, 25%	分辨率 1.56 Å R-free 0.206
1I3H CONCANAVALIN A-DIMANNOSE STRUCTURE 提交 2001-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：residues 164-281,residues 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：residues 164-281,residues 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；PEG 6000, citirc acid, manganese chloride, calcium chloride, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.190
1JBC CONCANAVALIN A 提交 1996-08-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 8–148（141 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.15 Å R-free 0.167
1JN2 Crystal Structure of meso-tetrasulphonatophenyl porphyrin complexed with Concanavalin A 提交 2001-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 P 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 P 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SFP 5,10,15,20-TETRAKIS(4-SULPFONATOPHENYL)-21H,23H-PORPHINE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.232
1JN2 Crystal Structure of meso-tetrasulphonatophenyl porphyrin complexed with Concanavalin A 提交 2001-07-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 164–281（118 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148 链 P 30–148（119 aa）片段：UNP P02866 residues 164-281, 30-148	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 SFP 5,10,15,20-TETRAKIS(4-SULPFONATOPHENYL)-21H,23H-PORPHINE × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.232
1JW6 Crystal Structure of the Complex of Concanavalin A and Hexapeptide 提交 2001-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 PTD PENTANEDIAL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.45；300 K；Sodium phosphate , pH 5.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.0K	分辨率 1.93 Å R-free 0.250
1JW6 Crystal Structure of the Complex of Concanavalin A and Hexapeptide 提交 2001-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 PTD PENTANEDIAL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.45；300 K；Sodium phosphate , pH 5.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.0K	分辨率 1.93 Å R-free 0.250
1NLS CONCANAVALIN A AND ITS BOUND SOLVENT AT 0.94A RESOLUTION 提交 1997-01-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8	分辨率 0.94 Å R-free 0.154
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 1 164–281（118 aa）链 1 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 2 164–281（118 aa）链 2 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 3 164–281（118 aa）链 3 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 4 164–281（118 aa）链 4 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 1 164–281（118 aa）链 1 30–148（119 aa）链 2 164–281（118 aa）链 2 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 28	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 3 164–281（118 aa）链 3 30–148（119 aa）链 4 164–281（118 aa）链 4 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 22	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 1 164–281（118 aa）链 1 30–148（119 aa）链 2 164–281（118 aa）链 2 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 3 164–281（118 aa）链 3 30–148（119 aa）链 4 164–281（118 aa）链 4 30–148（119 aa）	未记录	AZI AZIDE ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Gel Acupuncture Method (GAME)；pH 8；293 K；PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.201
1ONA CO-CRYSTALS OF CONCANAVALIN A WITH METHYL-3,6-DI-O-(ALPHA-D-MANNOPYRANOSYL)-ALPHA-D-MANNOPYRANOSIDE 提交 1996-07-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；13% POLYETHYLENEGLYCOLMETHYLETHER, 40 MM HEPES PH 6.5	分辨率 2.35 Å R-free 0.282
1QNY X-ray refinement of D2O soaked crystal of concanavalin A 提交 1999-10-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 A 164–281（118 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；CRYSTALS SELECTED FOR X-RAY STUDY WERE TRANSFERRED TO A 1ML BUFFER MADE OF 99.9% D2O WITH 0.1M NANO3, 0.05M TRIS-ACETATE, 1MM MNCL2 AND 1MM CACL2 PH 6.5.	分辨率 1.80 Å R-free 0.198
1SCR HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF SINGLE-METAL-SUBSTITUTED CONCANAVALIN A: THE CO,CA-PROTEIN AT 1.6 ANGSTROMS AND THE NI,CA-PROTEIN AT 2.0 ANGSTROMS 提交 1993-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
1SCS HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF SINGLE-METAL-SUBSTITUTED CONCANAVALIN A: THE CO,CA-PROTEIN AT 1.6 ANGSTROMS AND THE NI,CA-PROTEIN AT 2.0 ANGSTROMS 提交 1993-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	CO COBALT (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.60 Å
1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 30–148（119 aa）链 F 30–148（119 aa）链 G 30–148（119 aa）链 H 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）链 E 30–148（119 aa）链 F 30–148（119 aa）链 G 30–148（119 aa）链 H 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 CA CALCIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
1VAL CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-NITROPHENYL-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-01-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	PNG 4-nitrophenyl alpha-D-glucopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
1VAM CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-NITROPHENYL-ALPHA-D-MANNOPYRANOSIDE 提交 1996-01-08	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	PNA 4-nitrophenyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.75 Å R-free 0.260
1XQN The 15k neutron structure of saccharide-free concanavalin A 提交 2004-10-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH DIALYSIS；pH 6.5；293 K；0.1M NaNO3, 0.05M Tris-acetate, 1mM MnCl2, 1mM CaCl2 (all in D2O), pH 6.50, BATCH DIALYSIS, temperature 293.0K	分辨率 2.50 Å R-free 0.320
2CNA THE COVALENT AND THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF CONCANAVALIN A, IV.ATOMIC COORDINATES,HYDROGEN BONDING,AND QUATERNARY STRUCTURE 提交 1975-04-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–290（127 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
2CTV HIGH RESOLUTION CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NATIVE CONCANAVALIN A USING RAPID LAUE DATA COLLECTION METHODS AND THE INTRODUCTION OF A MONOCHROMATIC LARGE-ANGLE OSCILLATION TECHNIQUE (LOT) 提交 1993-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.95 Å
2ENR CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH CADMIUM HAVING A CADMIUM ION BOUND IN BOTH THE S1 SITE AND THE S2 SITE 提交 1998-07-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 8–148（141 aa）	未记录	CD CADMIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；pH 5.0	分辨率 2.35 Å
2UU8 X-ray structure of Ni, Ca concanavalin A at Ultra-high resolution (0. 94A) 提交 2007-03-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	NI NICKEL (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 0.94 Å R-free 0.142
2YZ4 The neutron structure of concanavalin A at 2.2 Angstroms 提交 2007-05-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH DIALYSIS；pH 6.5；293 K；0.1M NaNO3, 0.05M Tris-acetate, 1mM MnCl2, 1mM CaCl2, pH 6.5, BATCH DIALYSIS, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.312
3CNA STRUCTURE OF CONCANAVALIN A AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1976-09-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–237（237 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
3D4K Concanavalin A Complexed to a Synthetic Analog of the Trimannoside 提交 2008-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；10-16% PEG 6000, 100 mM Sodium cacodylate, 50 mM NaCL, 1 mM MnCL2, 1 mM CaCL2, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3ENR ZINC-CALCIUM CONCANAVALIN A AT PH 6.15 提交 1999-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.15；ZNCL2, CACL2, (NH4)2SO4, sodium acetate, pH 6.15, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 12	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation；pH 8.5；273 K；10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K	分辨率 2.09 Å R-free 0.212
4P9W Structure of ConA/Rh3Man 提交 2014-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148	未记录	R3M 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.2；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.	分辨率 2.11 Å R-free 0.202
4P9X Structure of ConA/Rh3Glu complex 提交 2014-04-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 C 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 D 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148	未记录	R3G 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-glucopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.2；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.	分辨率 2.06 Å R-free 0.295
4P9Y Structure of ConA/Rh4man 提交 2014-04-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：UNP residues 164-281, 30-148	未记录	2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION；pH 7.2；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.	分辨率 1.89 Å R-free 0.258
4PF5 Crystal structure of Concanavalin A complexed with a synthetic derivative of high-mannose chain 提交 2014-04-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：Tetrameric	链 A 164–281（118 aa）片段：Residues 164-281, 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：Residues 164-281, 30-148 链 B 164–281（118 aa）片段：Residues 164-281, 30-148 链 B 30–148（119 aa）片段：Residues 164-281, 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 8 M3N 4-(hydroxymethyl)-1-(alpha-D-mannopyranosyl)-1H-1,2,3-triazole × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Acetate, 1,4-dioxane	分辨率 2.04 Å R-free 0.227
5O6N High pressure flash cooled concanavalin A 提交 2017-06-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；291 K；10 mg/ml Concanavalin A in 0.025 M HEPES pH 7.0 were mixed in a 1:1 ratio with 6 % (w/v) PEG 8000 and 0.1 M Tris pH 8.5.	分辨率 1.35 Å R-free 0.164
5WEY Joint X-ray/neutron structure of Concanavalin A with alpha1-2 D-mannobiose 提交 2017-07-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–281（118 aa）片段：unp residues 164-281; unp residues 30-148 链 A 30–148（119 aa）片段：unp residues 164-281; unp residues 30-148	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	实验方法未声明 X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；10% PEG 6K, 0.1 M sodium citrate, pH 5 in H2O	分辨率未提供
5YGM Monomeric structure of concanavalin A at pH 7.5 from Carnivalia ensiformis 提交 2017-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；PEK6K, MPD in HEPES, pH 7.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.196
5Z5L Crystal structure of ConA-R5M 提交 2018-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 96O (1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl alpha-D-mannopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
5Z5L Crystal structure of ConA-R5M 提交 2018-01-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
5Z5N Crystal structure of ConA-R1M 提交 2018-01-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 2.04 Å R-free 0.225
5Z5P Crystal structure of ConA-R3M 提交 2018-01-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 R3M 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 1.40 Å R-free 0.241
5Z5Y Crystal structure of ConA-R4M 提交 2018-01-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 1.89 Å R-free 0.244
5Z5Y Crystal structure of ConA-R4M 提交 2018-01-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 1.89 Å R-free 0.244
5ZAC Crystal structure of ConA-R2M 提交 2018-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 TA5 2H-1,2,3-TRIAZOL-4-YLMETHANOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；300 K；each 0.2 mM ConA in 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2	分辨率 2.59 Å R-free 0.372
6AHG Trimeric structure of concanavalin A from Canavalia ensiformis 提交 2018-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 CD CADMIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Polyethylene glycol 400, 0.1 M Cadmium chloride hydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6	分辨率 2.83 Å R-free 0.279
6H2M Long wavelength Mesh&Collect native SAD phasing on microcrystals 提交 2018-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；drops made from equal amounts of protein solution (1 l, 10 mg/ml in water) and reservoir solution (1l, 34%(v/v) PEG 1500), buffered with 5mM HEPES, pH 6.0	分辨率 1.93 Å R-free 0.177
6XT6 pro-concanavalin A: Precursor of circularly permuted concanavalin A 提交 2020-07-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 30–290（261 aa）链 B 30–290（261 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；Zinc chloride, HEPES, PEG 6000	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
7MG1 Concanavalin A crystallized without DNA glycoconjugate 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H3: 0.1 M potassium chloride, 0.005 M barium chloride dihydrate, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 12% w/v PEG 8000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 2.00 Å R-free 0.262
7MG2 Concanavalin A crystallized in the presence of Man-8 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and mannose-squaramide (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B6: 0.1 M sodium chloride, 0.005 M strontium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 1.80 Å R-free 0.230
7MG3 Concanavalin A crystallized in the presence of H2N-ATAT 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and 5'-ATAT-3' (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D11: 0.2 M lithium chloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 22% w/v PEG 2000 MME). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 1.60 Å R-free 0.213
7MG4 Concanavalin A crystallized in the presence of Gal-ATAT 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Gal-ATAT (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H9: 0.1 M potassium chloride, 0.002 M spermine tetrahydrochloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7.5), 7% w/v PEG 8000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
7MG5 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-ATAT 提交 2021-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and Man-ATAT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D9: 0.05 M bis-Tris (pH 7), 2 M ammonium sulfate, 5% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
7MG6 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-AGCT 提交 2021-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and Man-AGCT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D3: 0.2 M lithium sulfate, 0.05 M bis Tris (pH 7), 20% v/v MPD). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
7MG7 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-GTAC 提交 2021-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Man-GTAC (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition A4: 0.2 M potassium chloride, 0.005 M hexammine cobalt(III) chloride, 0.05 M MES (pH 6.5), 25% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 1.75 Å R-free 0.215
7MG8 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-CGCG 提交 2021-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (80 uM) and Man-CGCG (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D9: 0.05 M bis-Tris (pH 7), 2 M ammonium sulfate, 5% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 3.00 Å R-free 0.284
7MG9 Concanavalin A bound to DNA glycoconjugates, Man-TTTT and Man-AAAA 提交 2021-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM), Man-TTTT (64 uM), and Man-AAAA (64 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B5: 0.1 M lithium chloride, 0.01 M manganese(II) chloride tetrahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.55 Å R-free 0.314
7MGA Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-AAATTT 提交 2021-04-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Man-AAATTT (64 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition A3: 0.1 M sodium chloride, 0.05 M lithium chloride, 0.01 M magnesium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 25% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.00 Å R-free 0.229
7MGB Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, A(Man-T)AT 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and A(Man-T)AT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H10: 0.05 M lithium sulfate, 0.03 M magnesium sulfate heptahydrate, 0.05 M bis Tris (pH 8), 15% w/v PEG 3350). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.45 Å R-free 0.262
7MGC Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, G(Man-T)AC 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and G(Man-T)AC (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H6: 0.1 M potassium chloride, 0.002 M spermine tetrahydrochloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 15% w/v PEG 2000 MME). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.92 Å R-free 0.277
7MGD Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, T(Man-T)TT 提交 2021-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and T(Man-T)TT (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B6: 0.1 M sodium chloride, 0.005 M strontium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition	分辨率 2.05 Å R-free 0.255
8WMG Structure of ConA/Man3 提交 2023-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	WRW 4-[3,5-bis(4-carboxyphenyl)phenyl]benzoic acid × 1 ETA ETHANOLAMINE × 3 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2, pH = 7.5, Precipitant: 200 mM Ammonium phosphate	分辨率 1.97 Å R-free 0.212
8WMK Structure of ConA/Man2 提交 2023-10-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	WU0 4-[3-(4-carboxyphenyl)phenyl]benzoic acid × 2 ETA ETHANOLAMINE × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2; pH = 7.2, precipitant: Ammonium phosphate	分辨率 2.17 Å R-free 0.267
9B34 Structure of concanavalin A (ConA) dimer from the open-state structure of kainate receptor GluK2 in complex with agonist glutamate and positive allosteric modulator BPAM344 bound to two ConA dimers. Type I interface between GluK2 ligand-binding domain and ConA 提交 2024-03-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 164–281（118 aa）链 E 30–148（119 aa）链 F 164–281（118 aa）链 F 30–148（119 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å
9J1A Structure of ConA without ligand 提交 2024-08-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.8M Ammonium Sulfate, 0.1M MES pH 6.5, 0.01M Cobalt Chloride	分辨率 1.48 Å R-free 0.213
9J1B Structure of ConA/IMI-Man 提交 2024-08-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 A1EAT ~{N}-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethyl]-4-[3-[4-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethylcarbamoyl]phenyl]imidazol-3-ium-1-yl]benzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2; pH = 7.2, precipitant: Ammonium phosphate	分辨率 2.48 Å R-free 0.228
9J1C Structure of ConA/NAP-Man 提交 2024-08-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 A1EAU ~{N}2,~{N}6-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]naphthalene-2,6-dicarboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12 % w/v Polyethylene glycol 20,000	分辨率 2.43 Å R-free 0.282
9J1D Structure of ConA/PHE-Man 提交 2024-08-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）	未记录	A1EAW ~{N}2,~{N}9-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 2.0M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 3.49 Å R-free 0.229
9J1F Dimeric Structure of ConA/M2P-Man 提交 2024-08-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 164–281（118 aa）链 A 30–148（119 aa）链 D 164–281（118 aa）链 D 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 10% (w/v) PEG 3000	分辨率 2.17 Å R-free 0.257
9J1F Dimeric Structure of ConA/M2P-Man 提交 2024-08-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 164–281（118 aa）链 B 30–148（119 aa）链 C 164–281（118 aa）链 C 30–148（119 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 A1EAW ~{N}2,~{N}9-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Sodium chloride, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 10% (w/v) PEG 3000	分辨率 2.17 Å R-free 0.257

共 72 个其他 PDB 条目、89 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CONA_CANEN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148 作者链 B； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148 作者链 C； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148 作者链 D； PDB构建体 119–237； UniProt 30–148

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5cna
沉积日期 deposition_date	1994-02-11
结构标题 title	REFINED STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH ALPHA-METHYL-D-MANNOPYRANOSIDE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION AND COMPARISON WITH THE SACCHARIDE-FREE STRUCTURE
关键词 keywords	LECTIN(AGGLUTININ); LECTIN(AGGLUTININ)
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	30.14 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.73 Å
零角强度 I(0) i0	171402000.00
分子量 molecular_weight	103560.0 kDa
排除体积 excluded_volume	129110 Å³
包络体积 envelope_volume	152610 Å³
水化壳体积 shell_volume	43201 Å³
包络直径 envelope_diameter	88.4 Å
壳层 Rg shell_rg	37.13 Å
包络 Rg envelope_rg	28.57 Å
形状 Rg shape_rg	28.68 Å
总 Rg total_rg	29.61 Å
总原子数 total_atoms	7297
残基数 n_residues	948
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	88.3 Å
Rg (实空间) rg_real	29.92 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.40 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7140e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.4590e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	30.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	171400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9105
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	38.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.004
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.688
角度范围 angular_range	— – 0.2650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	27390000.0000
实空间数据点数 n_real_points	54
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.970; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.937

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CONCANAVALIN A
分子量 formula_weight	25622.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	7830

ADTIVAVELDTYPNTDIGDPSYPHIGIDIKSVRSKKTAKWNMQNGKVGTAHIIYNSVDKRLSAVVSYPNADSATVSYDVDLDNVLPEWVRVGLSASTGLYKETNTILSWSFTSKLKSNSTHETNALHFMFNQFSKDQKDLILQGDATTGTDGNLELTRVSSNGSPQGSSVGRALFYAPVHIWESSAVVASFEATFTFLIKSPDSHPADGIAFFISNIDSSIPSGSTGRLLGLFPDAN

来源 Source

来源生物 organism	Canavalia ensiformis
通用名 common_name	jack bean
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3823

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	methyl alpha-D-mannopyranoside
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MANGANESE (II) ION
分子量 formula_weight	54.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	533

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d5cnaa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d5cnab_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d5cnac_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

结构域编号 domain_id	d5cnad_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.1 — Legume lectins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	5cnaA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	5cnaB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	5cnaC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	5cnaD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

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8. 引用文献 (6)

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晶胞边长 a length_a	123.700 Å
晶胞边长 b length_b	128.600 Å
晶胞边长 c length_c	67.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.000 Å
最低分辨率 resolution_low	8.000 Å
R 因子 r_factor	0.1990
R_work r_work	0.1990
R_free r_free	—

fit	/app/data/saxs_computation/cn/5cna/5cna.fit
pddf	/app/data/pr_computation/cn/5cna/5cna.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/cn/5cna/5cna.dat