SAXSdb — 5hx2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baseplate wedge protein gp7

Enterobacteria phage T4

UniProt P19061

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Baseplate wedge protein gp8 × 12 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 12 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 6 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 18 （P10928）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BP07_BPT4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1032； UniProt 1–1032

Baseplate wedge protein gp8

Enterobacteria phage T4

UniProt P19062

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Baseplate wedge protein gp7 × 6 （P19061） Baseplate wedge protein gp6 × 12 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 6 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 18 （P10928）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BP08_BPT4
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334 作者链 C； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334

Baseplate wedge protein gp6

Enterobacteria phage T4

UniProt P19060

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Baseplate wedge protein gp7 × 6 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 12 （P19062） Baseplate wedge protein gp53 × 6 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 18 （P10928）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BP06_BPT4
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–660； UniProt 1–660 作者链 E； PDB构建体 1–660； UniProt 1–660

Baseplate wedge protein gp53

Enterobacteria phage T4

UniProt P16011

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Baseplate wedge protein gp7 × 6 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 12 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 12 （P19060） Baseplate wedge protein gp10 × 18 （P10928）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp10 × 3 （P10928）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BP53_BPT4
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–196； UniProt 1–196

Baseplate wedge protein gp10

Enterobacteria phage T4

UniProt P10928

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 54	Baseplate wedge protein gp7 × 6 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 12 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 12 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 6 （P16011）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011）	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 9	Baseplate wedge protein gp7 × 1 （P19061） Baseplate wedge protein gp8 × 2 （P19062） Baseplate wedge protein gp6 × 2 （P19060） Baseplate wedge protein gp53 × 1 （P16011）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BP10_BPT4
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–602； UniProt 1–602 作者链 H； PDB构建体 1–602； UniProt 1–602 作者链 I； PDB构建体 1–602； UniProt 1–602

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5hx2
沉积日期 deposition_date	2016-01-29
结构标题 title	In vitro assembled star-shaped hubless T4 baseplate
关键词 keywords	T4, baseplate, complex, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5hx2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5hx2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5hx2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	137.10 Å
总 Rg	136.00 Å
原子数	171672
残基数	25134
排除体积	2980900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5hx2__assembly_1__model_1`	54-meric （54）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5hx2__assembly_2__model_1`	nonameric （9）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`5hx2__assembly_3__model_1`	nonameric （9）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Baseplate wedge protein gp7
分子量 formula_weight	119336.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	28612

MTVKAPSVTSLRISKLSANQVQVRWDDVGANFYYFVEIAETKTNSGENLPSNQYRWINLGYTANNSFFFDDADPLTTYIIRVATAAQDFEQSDWIYTEEFETFATNAYTFQNMIEMQLANKFIQEKFTLNNSDYVNFNNDTIMAALMNESFQFSPSYVDVSSISNFIIGENEYHEIQGSIQQVCKDINRVYLMESEGILYLFERYQPVVKVSNDKGQTWKAVKLFNDRVGYPLSKTVYYQSANTTYVLGYDKIFYGRKSTDVRWSADDVRFSSQDITFAKLGDQLHLGFDVEIFATYATLPANVYRIAEAITCTDDYIYVVARDKVRYIKTSNALIDFDPLSPTYSERLFEPDTMTITGNPKAVCYKMDSICDKVFALIIGEVETLNANPRTSKIIDSADKGIYVLNHDEKTWKRVFGNTEEERRRIQPGYANMSTDGKLVSLSSSNFKFLSDNVVNDPETAAKYQLIGAVKYEFPREWLADKHYHMMAFIADETSDWETFTPQPMKYYAEPFFNWSKKSNTRCWINNSDRAVVVYADLKYTKVIENIPETSPDRLVHEYWDDGDCTIVMPNVKFTGFKKYASGMLFYKASGEIISYYDFNYRVRDTVEIIWKPTEVFLKAFLQNQEHETPWSPEEERGLADPDLRPLIGTMMPDSYLLQDSNFEAFCEAYIQYLSDGYGTQYNNLRNLIRNQYPREEHAWEYLWSEIYKRNIYLNADKRDAVARFFESRSYDFYSTKGIEASYKFLFKVLYNEEVEIEIESGAGTEYDIIVQSDSLTEDLVGQTIYTATGRCNVTYIERSYSNGKLQWTVTIHNLLGRLIAGQEVKAERLPSFEGEIIRGVKGKDLLQNNIDYINRSRSYYVMKIKSNLPSSRWKSDVIRFVHPVGFGFIAITLLTMFINVGLTLKHTETIINKYKNYKWDSGLPTEYADRIAKLTPTGEIEHDSVTGEAIYEPGPMAGVKYPLPDDYNAENNNSIFQGQLPSERRKLMSPLFDASGTTFAQFRDLVNKRLKDNIGNPRDPENPTQVKIDE

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Baseplate wedge protein gp8
分子量 formula_weight	38041.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C

MNDSSVIYRAIVTSKFRTEKMLNFYNSIGSGPDKNTIFITFGRSEPWSSNENEVGFAPPYPTDSVLGVTDMWTHMMGTVKVLPSMLDAVIPRRDWGDTRYPDPYTFRINDIVVCNSAPYNATESGAGWLVYRCLDVPDTGMCSIASLTDKDECLKLGGKWTPSARSMTPPEGRGDAEGTIEPGDGYVWEYLFEIPPDVSINRCTNEYIVVPWPEELKEDPTRWGYEDNLTWQQDDFGLIYRVKANTIRFKAYLDSVYFPEAALPGNKGFRQISIITNPLEAKAHPNDPNVKAEKDYYDPEDLMRHSGEMIYMENRPPIIMAMDQTEEINILFTF

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Baseplate wedge protein gp6
分子量 formula_weight	74492.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E

MANTPVNYQLTRTANAIPEIFVGGTFAEIKQNLIEWLNGQNEFLDYDFEGSRLNVLCDLLAYNTLYIQQFGNAAVYESFMRTANLRSSVVQAAQDNGYLPTSKSAAQTEIMLTCTDALNRNYITIPRGTRFLAYAKDTSVNPYNFVSREDVIAIRDKNNQYFPRLKLAQGRIVRTEIIYDKLTPIIIYDKNIDRNQVKLYVDGAEWINWTRKSMVHAGSTSTIYYMRETIDGNTEFYFGEGEISVNASEGALTANYIGGLKPTQNSTIVIEYISTNGADANGAVGFSYADTLTNITVININENPNDDPDFVGADGGGDPEDIERIRELGTIKRETQQRCVTATDYDTFVSERFGSIIQAVQTFTDSTKPGYAFIAAKPKSGLYLTTVQREDIKNYLKDYNLAPITPSIISPNYLFIKTNLKVTYALNKLQESEQWLEGQIIDKIDRYYTEDVEIFNSSFAKSKMLTYVDDADHSVIGSSATIQMVREVQNFYKTPEAGIKYNNQIKDRSMESNTFSFNSGRKVVNPDTGLEEDVLYDVRIVSTDRDSKGIGKVIIGPFASGDVTENENIQPYTGNDFNKLANSDGRDKYYVIGEINYPADVIYWNIAKINLTSEKFEVQTIELYSDPTDDVIFTRDGSLIVFENDLRPQYLTIDLEPISQ

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Baseplate wedge protein gp53
分子量 formula_weight	22990.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MLFTFFDPIEYAAKTVNKNAPTIPMTDIFRNYKDYFKRALAGYRLRTYYIKGSPRPEELANAIYGNPQLYWVLLMCNDNYDPYYGWITSQEAAYQASIQKYKNVGGDQIVYHVNENGEKFYNLISYDDNPYVWYDKGDKARKYPQYEGALAAVDTYEAAVLENEKLRQIKIIAKSDINSFMNDLIRIMEKSYGNDK

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Baseplate wedge protein gp10
分子量 formula_weight	66281.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H,I

MKQNINIGNVVDDGTGDYLRKGGIKINENFDELYYELGDGDVPYSAGAWKTYNASSGQTLTAEWGKSYAINTSSGRVTINLPKGTVNDYNKVIRARDVFATWNVNPVTLVAASGDTIKGSAVPVEINVRFSDLELVYCAPGRWEYVKNKQIDKITSSDISNVARKEFLVEVQGQTDFLDVFRGTSYNVNNIRVKHRGNELYYGDVFSENSDFGSPGENEGELVPLDGFNIRLRQPCNIGDTVQIETFMDGVSQWRSSYTRRQIRLLDSKLTSKTSLEGSIYVTDLSTMKSIPFSAFGLIPGEPINPNSLEVRFNGILQELAGTVGMPLFHCVGADSDDEVECSVLGGTWEQSHTDYSVETDENGIPEILHFDSVFEHGDIINITWFNNDLGTLLTKDEIIDETDNLYVSQGPGVDISGDVNLTDFDKIGWPNVEAVQSYQRAFNAVSNIFDTIYPIGTIYENAVNPNNPVTYMGFGSWKLFGQGKVLVGWNEDISDPNFALNNNDLDSGGNPSHTAGGTGGSTSVTLENANLPATETDEEVLIVDENGSVIVGGCQYDPDESGPIYTKYREAKASTNSTHTPPTSITNIQPYITVYRWIRIA

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	5hx2B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	340 — baseplate structural protein gp8, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — baseplate structural protein gp8, domain 1

结构域编号 domain_id	5hx2B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	290 — baseplate structural protein gp8, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — baseplate structural protein gp8, domain 2

结构域编号 domain_id	5hx2C01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	340 — baseplate structural protein gp8, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — baseplate structural protein gp8, domain 1

结构域编号 domain_id	5hx2C02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	290 — baseplate structural protein gp8, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — baseplate structural protein gp8, domain 2

结构域编号 domain_id	5hx2D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

结构域编号 domain_id	5hx2E03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 —

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	45607

In vitro assembled star-shaped hubless T4 baseplate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baseplate wedge protein gp7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate wedge protein gp8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate wedge protein gp6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate wedge protein gp53

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate wedge protein gp10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5hx2__assembly_1__model_1

5hx2__assembly_1__model_1 | I(q)

5hx2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)