5j7j

NMR Derived Structure of Ca2+ Calmodulin bound to Phosphorylated PSD-95

Method: SOLUTION NMR D_max: 50.6 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calmodulin

Xenopus laevis

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–149	未记录	Disks large homolog 4 × 1 （P78352） CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成：500 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Calmodulin, 750 uM PSD-95 phosphorylated, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5J7J	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CFC CALCIUM-FREE CALMODULIN 提交 1995-08-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1CFD CALCIUM-FREE CALMODULIN 提交 1995-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1CFF NMR SOLUTION STRUCTURE OF A COMPLEX OF CALMODULIN WITH A BINDING PEPTIDE OF THE CA2+-PUMP 提交 1999-03-18	实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.115；压力 1 NMR样品组成 90% H2O/10% D2O, 100% D2O	分辨率未提供
1DMO CALMODULIN, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1996-04-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1F70 REFINED SOLUTION STRUCTURE OF CALMODULIN N-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–76（75 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM KCL；压力 ambient NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepe buffer, 100 mM KCL \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepe buffer, 100 mM KCL; 21 mg/ml filamentous phage Pf1 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1F71 REFINED SOLUTION STRUCTURE OF CALMODULIN C-TERMINAL DOMAIN 提交 2000-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 83–149（67 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM KCl；压力 ambient NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepes buffer, 100 mM KCl \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM Calmodulin U-15N,13C; 5 mM Hepes buffer, 100 mM KCl; 21 mg/ml filamentous phage pf1 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1IQ5 Calmodulin/nematode CA2+/Calmodulin dependent kinase kinase fragment 提交 2001-06-14	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–149（149 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；ammonium sulfate, citratet, sodium tartrae, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.248
1MUX SOLUTION NMR STRUCTURE OF CALMODULIN/W-7 COMPLEX: THE BASIS OF DIVERSITY IN MOLECULAR RECOGNITION, 30 STRUCTURES 提交 1997-09-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4 WW7 N-(6-AMINOHEXYL)-5-CHLORO-1-NAPHTHALENESULFONAMIDE × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）KCL, 100mM；压力 1	分辨率未提供
1NWD Solution Structure of Ca2+/Calmodulin bound to the C-terminal Domain of Petunia Glutamate Decarboxylase 提交 2003-02-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM KCl, 10 mM CaCl2 NMR样品组成 1 mM Calmodulin; 2.2 mM GAD \| 91% H2O, 9% D2O	分辨率未提供
1SY9 Structure of calmodulin complexed with a fragment of the olfactory CNG channel 提交 2004-04-01	构建体不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；308 K NMR测量条件 pH 6.7；308 K NMR样品组成 1.2 mM complex U-15N,13C, 6 mM CaCl2, 140 mM KCl, D2O \| D2O NMR样品组成 1.2 mM complex U-15N,13C, 6 mM CaCl2, 140 mM KCl, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1X02 Solution structure of stereo array isotope labeled (SAIL) calmodulin 提交 2005-03-11	构建体不同聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–148（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；310 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 0.7mM SAIL calmodulin, 5mM MES-d13, 10mM bis-Tris-d19, 5mM CaCl2, 0.1mM NaN3 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
1Y0V Crystal structure of anthrax edema factor (EF) in complex with calmodulin and pyrophosphate 提交 2004-11-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 5–148（144 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；277 K；PEG400, MgCl2, Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.307
2COL Crystal structure analysis of CyaA/C-Cam with Pyrophosphate 提交 2005-05-18	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 79–145（67 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；278 K；PEG4000, Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K	分辨率 2.20 Å R-free 0.293
2I08 Solvation effect in conformational changes of EF-hand proteins: X-ray structure of Ca2+-saturated double mutant Q41L-K75I of N-domain of calmodulin 提交 2006-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–78（78 aa）片段：N-DOMAIN OF CALMODULIN	突变：F19Y, Q41L, K75I, A1M, D78Y	CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；36% (v/v) PEG 400, 100 mM HEPES, 200 mM CaCl2, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
2K3S HADDOCK-derived structure of the CH-domain of the smoothelin-like 1 complexed with the C-domain of apocalmodulin 提交 2008-05-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 83–149（67 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；293 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] entity_1, 0.6 mM calmodulin (full length), 20 mM Bis-Tris, 0.5 mM DSS, 10 mM [U-2H] DTT, 0.03 % sodium azide, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM entity_1, 0.5 mM [U-100% 15N] calmodulin (full length), 20 mM Bis-Tris, 0.5 mM DSS, 10 mM [U-2H] DTT, 0.03 % sodium azide, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2KDU Structural basis of the Munc13-1/Ca2+-Calmodulin interaction: A novel 1-26 calmodulin binding motif with a bipartite binding mode 提交 2009-01-19	实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K NMR样品组成 10 mM calcium, 1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 1.8 mM Munc13-1, 150 mM potassium chloride, 20 mM BIS-TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 10 mM calcium, 0.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Munc13-1, 0.6 mM calmodulin, 150 mM potassium chloride, 20 mM BIS-TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 10 mM calcium, 1.5 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] calmodulin, 1.8 mM Munc13, 150 mM potassium chloride, 20 mM BIS-TRIS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2LLO Solution NMR-derived structure of calmodulin N-lobe bound with ER alpha peptide 提交 2011-11-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–81（80 aa）片段：EF-hand domains 1 and 2, residues 2-81	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LLQ Solution nmr-derived structure of calmodulin c-lobe bound with er alpha peptide 提交 2011-11-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 83–149（67 aa）片段：EF-hand domains 3 and 4, residues 83-149	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2MES Backbone 1H, 13C, 15N resonance assignments of calcium-bound calmodulin in complex with PSD95 N-terminal peptide 提交 2013-09-26	实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin, PSD95NT, DTT, Tris, CaCl2, 600 uM PSD95_N-terminal_peptide, 20 mM Tris-d11, 50 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM DTT-d, 93 % H2O, 7 % D2O, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2RRT Solution structure of Magnesium-bound form of calmodulin C-domain E104D/E140D mutant 提交 2011-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 79–149（71 aa）片段：C-terminal domain, UNP residues 79-149	突变：E28D, E64D	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；323 K；离子强度（mmCIF原始值）0.5；压力 ambient NMR样品组成 10 mM [U-2H] MES-1, 100 mM potassium chloride-2, 100 mM magnesium chloride-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4R8G Crystal Structure of Myosin-1c tail in complex with Calmodulin 提交 2014-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–149（148 aa）链 B 2–149（148 aa）链 H 2–149（148 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289.3 K；2.0M ammonium sulfate, 5% 1,4-dioxane, MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.3K	分辨率 3.50 Å R-free 0.304
5T0X Solution NMR-derived structure of calmodulin bound with ER alpha peptides 提交 2016-08-16	聚集状态不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–149（148 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 1 mM [U-99% 15N] 15N-labeled CaM/ERalpha \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 13C/15N-CaM/ERalpha \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] 13C/15N-CaM/ERalpha \| 100% D2O	分辨率未提供

共 22 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM_XENLA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–148； UniProt 2–149

Disks large homolog 4

物种未注明

UniProt P78352

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–19	片段：UNP residues 1-19 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Calmodulin × 1 （P62155） CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件：pH 7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成：500 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Calmodulin, 750 uM PSD-95 phosphorylated, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5J7J	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1KEF PDZ1 of SAP90 提交 2001-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 105–197（93 aa）片段：PDZ1 domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM NaCl；压力 1 NMR样品组成 1.0 mM protein, 10 mM phosphate buffer, 150 mM NaCl, pH 6.8 \| 10 mM phosphate buffer, 150 mM NaCl	分辨率未提供
2MES Backbone 1H, 13C, 15N resonance assignments of calcium-bound calmodulin in complex with PSD95 N-terminal peptide 提交 2013-09-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–71（71 aa）片段：UNP residues 1-71	未记录	CA CALCIUM ION × 4	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient NMR样品组成 400 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Calmodulin, PSD95NT, DTT, Tris, CaCl2, 600 uM PSD95_N-terminal_peptide, 20 mM Tris-d11, 50 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM DTT-d, 93 % H2O, 7 % D2O, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
3I4W Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 提交 2009-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）片段：Third PDZ domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 capillary contradiffusion；pH 4.6；298 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M ammonium acetate trihydrate, 25%(w/v) PEG 4000, pH 4.6, capillary contradiffusion, temperature 298K	分辨率 1.35 Å R-free 0.216
3I4W Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 提交 2009-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–403（102 aa）片段：Third PDZ domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 capillary contradiffusion；pH 4.6；298 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M ammonium acetate trihydrate, 25%(w/v) PEG 4000, pH 4.6, capillary contradiffusion, temperature 298K	分辨率 1.35 Å R-free 0.216
3I4W Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 提交 2009-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 302–403（102 aa）片段：Third PDZ domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 capillary contradiffusion；pH 4.6；298 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M ammonium acetate trihydrate, 25%(w/v) PEG 4000, pH 4.6, capillary contradiffusion, temperature 298K	分辨率 1.35 Å R-free 0.216
3I4W Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 提交 2009-07-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 302–403（102 aa）片段：Third PDZ domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 capillary contradiffusion；pH 4.6；298 K；0.2M ammonium sulphate, 0.1M ammonium acetate trihydrate, 25%(w/v) PEG 4000, pH 4.6, capillary contradiffusion, temperature 298K	分辨率 1.35 Å R-free 0.216
3K82 Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 提交 2009-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 305–402（98 aa）片段：Third PDZ domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；288 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 0.8M sodium phosphate monobasic monohydrate, 0.8M potassium phosphate monobasic, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.40 Å R-free 0.210
3ZRT Crystal structure of human PSD-95 PDZ1-2 提交 2011-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 61–249（189 aa）片段：PDZ1-2, REISDUES 61-249 链 C 61–249（189 aa）片段：PDZ1-2, REISDUES 61-249	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；0.1 M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE PH 6.0, 2.0 M SODIUM FORMATE AND 5 % PEG 4000 (DROP SIZE: 1 UL SAMPLE AND 1UL RESERVOIR SOLUTION)	分辨率 3.40 Å R-free 0.264
3ZRT Crystal structure of human PSD-95 PDZ1-2 提交 2011-06-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 61–249（189 aa）片段：PDZ1-2, REISDUES 61-249 链 D 61–249（189 aa）片段：PDZ1-2, REISDUES 61-249	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；0.1 M SODIUM ACETATE TRIHYDRATE PH 6.0, 2.0 M SODIUM FORMATE AND 5 % PEG 4000 (DROP SIZE: 1 UL SAMPLE AND 1UL RESERVOIR SOLUTION)	分辨率 3.40 Å R-free 0.264
5JXB PSD-95 extended PDZ3 in complex with SynGAP PBM 提交 2016-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 309–413（105 aa）链 C 309–413（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 10% v/v 2-Propanol, 20% w/v Polyethylene glycol 4000	分辨率 2.90 Å R-free 0.287
6QJD Crystal Structure of the truncated form of the third PDZ domain of PSD-95: residues 302-392 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–393（92 aa）片段：PDZ domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% PEG 4000	分辨率 1.55 Å R-free 0.259
6QJD Crystal Structure of the truncated form of the third PDZ domain of PSD-95: residues 302-392 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–393（92 aa）片段：PDZ domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% PEG 4000	分辨率 1.55 Å R-free 0.259
6QJD Crystal Structure of the truncated form of the third PDZ domain of PSD-95: residues 302-392 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 302–393（92 aa）片段：PDZ domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% PEG 4000	分辨率 1.55 Å R-free 0.259
6QJD Crystal Structure of the truncated form of the third PDZ domain of PSD-95: residues 302-392 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 302–393（92 aa）片段：PDZ domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% PEG 4000	分辨率 1.55 Å R-free 0.259
6QJF Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 1 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.16 M ammonium dihydrogenphosphate, 50 mM Tris, 20 % glycerol	分辨率 1.50 Å R-free 0.199
6QJF Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 1 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.16 M ammonium dihydrogenphosphate, 50 mM Tris, 20 % glycerol	分辨率 1.50 Å R-free 0.199
6QJF Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 1 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.16 M ammonium dihydrogenphosphate, 50 mM Tris, 20 % glycerol	分辨率 1.50 Å R-free 0.199
6QJF Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 1 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；0.16 M ammonium dihydrogenphosphate, 50 mM Tris, 20 % glycerol	分辨率 1.50 Å R-free 0.199
6QJG Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 2 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 30 % PEG 8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
6QJG Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 2 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 30 % PEG 8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
6QJG Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 2 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 30 % PEG 8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
6QJG Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332P mutant: space group C121, structure 2 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.1 M MES, 30 % PEG 8000	分辨率 2.00 Å R-free 0.246
6QJI Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3112 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 305–403（99 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
6QJI Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3112 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 305–403（99 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
6QJI Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3112 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 305–403（99 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
6QJI Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3112 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 305–403（99 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
6QJI Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3112 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 305–403（99 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
6QJI Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3112 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 305–403（99 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；0.2 M AMMONIUM SULPHATE, 30% PEG 4000	分辨率 1.50 Å R-free 0.261
6QJJ Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein: space group P3221 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 305–403（99 aa）片段：PDZ domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% PEG 4000	分辨率 1.70 Å R-free 0.223
6QJK Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332G mutant: space group P43 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 348–446（99 aa）片段：PDZ domain	突变：D332G	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.17 M ammonium sulphate , 25.5% PEG 8000 , 15% Glycerol	分辨率 1.05 Å R-free 0.145
6QJL Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332G mutant: space group P21 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332G	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.17 M ammonium sulphate , 25.5% PEG 8000 , 15% Glycerol	分辨率 1.04 Å R-free 0.174
6QJL Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332G mutant: space group P21 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332G	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.17 M ammonium sulphate , 25.5% PEG 8000 , 15% Glycerol	分辨率 1.04 Å R-free 0.174
6QJN Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332G mutant: space group I4122 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% 2-Propanol, 20% PEG 4000, 5% Glycerol	分辨率 1.80 Å R-free 0.227
6QJN Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein D332G mutant: space group I4122 提交 2019-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–403（102 aa）片段：PDZ domain	突变：D332G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；298 K；0.1 M sodium citrate, 20% 2-Propanol, 20% PEG 4000, 5% Glycerol	分辨率 1.80 Å R-free 0.227
6SPV Crystal structure of PDZ1-2 from PSD-95 提交 2019-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 55–249（195 aa）	未记录	GSH Glutathione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2 M calcium acetate; 0.1 M sodium cacodylate; 40% v/v PEG 400	分辨率 2.04 Å R-free 0.260
6SPZ Crystal structure of PDZ1-2 from PSD-95 with peptide ligand sequence RRESEI bound to both domains 提交 2019-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 55–249（195 aa）	未记录	GSH Glutathione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；277 K；0.2 M NaCl, 0.1 M Na/K phosphate, 50% v/v PEG 200. Matrix microseeding with Apo crystal form (PDB ID: 6spv).	分辨率 2.08 Å R-free 0.240
9TNF Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein Y397E mutant 提交 2025-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）	突变：Y397E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% w/v PEG 4000, 0.1 M sodium acetate	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
9TNF Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein Y397E mutant 提交 2025-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 302–403（102 aa）	突变：Y397E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 30% w/v PEG 4000, 0.1 M sodium acetate	分辨率 1.45 Å R-free 0.201
9TNG Crystal Structure of the third PDZ domain of PSD-95 protein E401R mutant 提交 2025-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 302–403（102 aa）	突变：E401R	ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.2 M ammonium sulphate, 25% w/v PEG 4000, 0.1 M sodium acetate	分辨率 0.95 Å R-free 0.168

共 18 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DLG4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–19； UniProt 1–19

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5j7j
沉积日期 deposition_date	2016-04-06
结构标题 title	NMR Derived Structure of Ca2+ Calmodulin bound to Phosphorylated PSD-95
关键词 keywords	phosphorylated, calmodulin, PSD-95, Voltage-Gated Channel, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 method	SOLUTION NMR

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.32 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.64 Å
零角强度 I(0) i0	95102400.00
分子量 molecular_weight	75087.0 kDa
排除体积 excluded_volume	91657 Å³
包络体积 envelope_volume	30749 Å³
水化壳体积 shell_volume	16044 Å³
包络直径 envelope_diameter	52.2 Å
壳层 Rg shell_rg	22.04 Å
包络 Rg envelope_rg	16.13 Å
形状 Rg shape_rg	15.66 Å
总 Rg total_rg	15.90 Å
总原子数 total_atoms	10072
残基数 n_residues	648
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	50.6 Å
Rg (实空间) rg_real	16.21 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.24 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.5100e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0480e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.22 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	95100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8968
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	21.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.119
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.432
角度范围 angular_range	— – 0.4900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	698800.0000
实空间数据点数 n_real_points	79
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.893; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.989

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Calmodulin
分子量 formula_weight	16721.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	10072

ADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Disks large homolog 4
分子量 formula_weight	2408.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MDCLCIVTTKKYRYQDEDT

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

▶

8. 引用文献 (1)

▶

fit	/app/data/saxs_computation/j7/5j7j/5j7j.fit
pddf	/app/data/pr_computation/j7/5j7j/5j7j.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/j7/5j7j/5j7j.dat

NMR Derived Structure of Ca2+ Calmodulin bound to Phosphorylated PSD-95

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calmodulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Disks large homolog 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)