5upl

CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector inteface - 2 peptide: PAK4FL, CDC42 - UNREFINED

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 84.2 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase PAK 4

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 2–426	片段：UNP residues 2-426 突变：S474SEP 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Cell division control protein 42 homolog × 1 （P60953）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 50mM Na2SO4, 6% PEG6000	分辨率 3.00 Å R-free 0.310

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5UPL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2CDZ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN P21-ACTIVATED KINASE 4 IN COMPLEX WITH CGP74514A 提交 2006-01-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–591（301 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 291-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	23D N2-[(1R,2S)-2-AMINOCYCLOHEXYL]-N6-(3-CHLOROPHENYL)-9-ETHYL-9H-PURINE-2,6-DIAMINE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.248
2J0I CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN P21-ACTIVATED KINASE 4 提交 2006-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–591（301 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 291-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；150 UL SITTING DROPS, 4DEG, 0.2M K3(CIT), 0.1M BIS-TRIS PROPANE PH 6.5, 20% PEG3350, 10% ETHYLENE GLYCOL	分辨率 1.60 Å R-free 0.215
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 I 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 J 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 L 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 O 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2OV2 The crystal structure of the human RAC3 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 4 (PAK4) 提交 2007-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 M 10–44（35 aa）片段：CRIB domain 链 P 10–44（35 aa）片段：CRIB domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；0.2M Ammonium acetate, 0.1M Citrate, 30% PEG 4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.225
2Q0N Structure of human p21 activating kinase 4 (PAK4) in complex with a consensus peptide 提交 2007-05-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 291–591（301 aa）片段：Kinase domain, residues 291-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；1.7M Ammonium sulfate, 15% PEG400, 1M Tris-HCl pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.75 Å R-free 0.228
2X4Z Crystal Structure of the Human p21-Activated Kinase 4 in Complex with PF-03758309 提交 2010-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 296–591（296 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 296-591	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 2 7KC PF-3758309 × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.262
4APP Crystal Structure of the Human p21-Activated Kinase 4 in Complex with (S)-N-(5-(3-benzyl-1-methylpiperazine-4-carbonyl)-6,6-dimethyl-1,4,5, 6-tetrahydropyrrolo(3,4-c)pyrazol-3-yl)-3-phenoxybenzamide 提交 2012-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	N53 N-[6,6-dimethyl-5-[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethyl)piperazin-1-yl]carbonyl-2,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazol-3-yl]-3-phenoxy-benzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；294 K；CRYSTALS WERE GROWN FROM THE HANGING DROP VAPOR DIFFUSION METHOD AT 21 DEGREES CELCIUS BY MIXING 3.6 MICROLITERS OF A 10 MG/ML PROTEIN SOLUTION WITH A RESERVIOR SOLUTION CONTAINING: 5% (W/V) MEPEG 5K, 0.1 M IMIDAZOLE AT PH 6.2, 0.1 M (NH4)2HPO4 AND 5MM DTT	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
4FIE Full-length human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–423（423 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES, 500 mM K/Na tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.11 Å R-free 0.276
4FIE Full-length human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–423（423 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES, 500 mM K/Na tartrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.11 Å R-free 0.276
4FIF Catalytic domain of human PAK4 with RPKPLVDP peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–318（318 aa）链 C 49–56（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.227
4FIF Catalytic domain of human PAK4 with RPKPLVDP peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–318（318 aa）链 D 49–56（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.227
4FIG Catalytic domain of human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.01 Å R-free 0.221
4FIG Catalytic domain of human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；0.1M MES, 700 mM K/Na tartrate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 3.01 Å R-free 0.221
4FIH Catalytic domain of human PAK4 with QKFTGLPRQW peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 1.5M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.97 Å R-free 0.225
4FII Catalytic domain of human PAK4 with RPKPLVDP peptide 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–318（318 aa）链 B 49–56（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 1.5M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.240
4FIJ Catalytic domain of human PAK4 提交 2012-06-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–318（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 1.5M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.271
4JDH Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 in complex with Paktide T peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.00 Å R-free 0.224
4JDI Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 in complex with Paktide S peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.85 Å R-free 0.233
4JDJ Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 F461V mutant in complex with Paktide T peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	突变：F461V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.244
4JDK Crystal structure of Serine/threonine-protein kinase PAK 4 F461V mutant in complex with Paktide S peptide substrate 提交 2013-02-25	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）	突变：F461V 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Tris-HCl, 1.5 - 2.0 M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
4L67 Crystal Structure of Catalytic Domain of PAK4 提交 2013-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：UNP residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 12%(M/V) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.80 Å R-free 0.333
4L67 Crystal Structure of Catalytic Domain of PAK4 提交 2013-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 36–60（25 aa）片段：UNP residues 36-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；0.1M Tris pH 8.5, 12%(M/V) PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K	分辨率 2.80 Å R-free 0.333
4NJD Structure of p21-activated kinase 4 with a novel inhibitor KY-04031 提交 2013-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：UNP residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NJD N-(1H-indazol-5-yl)-N'-[2-(1H-indol-3-yl)ethyl]-6-methoxy-1,3,5-triazine-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；297 K；0.6M sodium potassium tartrate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K	分辨率 2.50 Å R-free 0.321
4O0V Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors 提交 2013-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：unp residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2OL 1-({1-(2-aminopyrimidin-4-yl)-2-[(2-methoxyethyl)amino]-1H-benzimidazol-6-yl}ethynyl)cyclohexanol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；277 K；500 uL of 0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350 in the reservoir, and drops set up by mixing 1.0 uL of reservoir solution and 1.0 uL of protein, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4O0X Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors 提交 2013-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：unp residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2OQ 1-{[1-(4-amino-1,3,5-triazin-2-yl)-2-methyl-1H-benzimidazol-6-yl]ethynyl}cyclohexanol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350 in the reservoir, and drops set up by mixing 1.0 uL of reservoir solution and 1.0 uL of protein, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.48 Å R-free 0.242
4O0Y Back pocket flexibility provides group-II PAK selectivity for type 1 kinase inhibitors 提交 2013-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：unp residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2OO 4-[1-(4-amino-1,3,5-triazin-2-yl)-2-(ethylamino)-1H-benzimidazol-6-yl]-2-methylbut-3-yn-2-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.3；277 K；0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350 in the reservoir, and drops set up by mixing 1.0 uL of reservoir solution and 1.0 uL of protein, pH 8.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.238
4XBR In cellulo Crystal Structure of PAK4 in complex with Inka 提交 2014-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 278–591（314 aa）片段：UNP residues 166-203,UNP residues 278-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 IN CELL；310.15 K；In cellulo growth	分辨率 2.94 Å R-free 0.230
4XBU In vitro Crystal Structure of PAK4 in complex with Inka peptide 提交 2014-12-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298.15 K；Tris-HCl, PEG 8000	分辨率 2.06 Å R-free 0.243
5BMS Crystal structure of P21-activated kinase 4 in complex with an inhibitor compound 29 提交 2015-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：Protein kinase domain residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	4T6 N~2~-[(7-chloro-1H-benzimidazol-6-yl)methyl]-N~4~-(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M Tri-Potassium citrate and 20% PEG3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.230
5I0B Structure of PAK4 提交 2016-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：UNP residues 300-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	67U 6-bromo-2-[1-methyl-3-(propan-2-yl)-1H-pyrazol-4-yl]-1H-imidazo[4,5-b]pyridine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.8M sodium potassium tartrate, 0.1M TRIS pH 8.5	分辨率 3.09 Å R-free 0.269
5UPK CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector interface - 3 peptide: PAK4cat, PAK4-N45, CDC42 提交 2017-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–45（45 aa）片段：UNP residues 1-45 链 B 109–426（318 aa）片段：UNP residues 109-426	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 22% PEG1,000	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
5VED PAK4 kinase domain in complex with Staurosporine 提交 2017-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	STU STAUROSPORINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 1.5 - 2.0 M Na acetate	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
5VEE PAK4 kinase domain in complex with FRAX486 提交 2017-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	981 6-(2,4-dichlorophenyl)-8-ethyl-2-{[3-fluoro-4-(piperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 1.5 - 2.0 M Na acetate	分辨率 2.50 Å R-free 0.276
5VEF PAK4 kinase domain in complex with fasudil 提交 2017-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 286–591（306 aa）片段：UNP residues 286-591	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M77 5-(1,4-DIAZEPAN-1-SULFONYL)ISOQUINOLINE × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) and 1.5 - 2.0 M Na acetate	分辨率 1.75 Å R-free 0.239
5XVA Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZH216 提交 2017-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain (UNP RESIDUES 300-591)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8FU [6-chloranyl-4-[(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl]-[(3R)-3-methylpiperazin-1-yl]methanone × 1 EOH ETHANOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M Imidazole pH 6.5, 1.0 M sodium acetate trihydrate	分辨率 1.85 Å R-free 0.209
5XVF Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZH062 提交 2017-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–588（289 aa）片段：PAK4 Kinase Domain (UNP RESIDUES 300-588)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8FR 2-(4-azanylpiperidin-1-yl)-6-chloranyl-N-(1-methylimidazol-4-yl)quinazolin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG3350.	分辨率 2.65 Å R-free 0.251
5XVG Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZH226 提交 2017-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain (UNP RESIDUES 300-591)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8FX [6-chloranyl-4-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl]-[(3R)-3-methylpiperazin-1-yl]methanone × 1 EOH ETHANOL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.5M Magnesium formate dihydrate	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
5ZJW Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor CZg353 提交 2018-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9EO (3Z)-N-[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]-3-[(1H-imidazol-2-yl)(phenyl)methylidene]-2-oxo-2,3-dihydro-1H-indole-5-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BCT BICARBONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；291 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 25% PEG 3350, 0.2 M NaCl	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
6WLX PAK4 kinase domain in complex with beta-catenin Ser675 substrate peptide 提交 2020-04-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 2M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, 5mM peptide	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
6WLY PAK4 kinase domain in complex with LIMK1 Thr508 substrate peptide 提交 2020-04-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Tris-HCl, 2M Na acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K, 2mM peptide	分辨率 1.90 Å R-free 0.205
7CMB Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor 41 提交 2020-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G5X 1-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-6-[2-(1-oxidanylcyclohexyl)ethynyl]indole-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG3350	分辨率 2.59 Å R-free 0.251
7CP3 Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor 47 提交 2020-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：PAK4 Kinase Domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GC6 [(3R)-3-azanylpiperidin-1-yl]-[1-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-6-[2-(1-oxidanylcyclohexyl)ethynyl]indol-3-yl]methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；0.1M Tris pH 8.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
7CP4 Crystal Structure of PAK4 in complex with inhibitor 55 提交 2020-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）片段：Protein kinase domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GCC [1-(2-azanylpyrimidin-4-yl)-6-[2-(1-oxidanylcyclohexyl)ethynyl]indol-3-yl]-[(3S)-3-methylpiperazin-1-yl]methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291 K；0.2M Ammonium sulfate, 0.1M Bis-tris 5.5, 25% PEG 3350, 0.1M Guanidine hydrochloride	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
7S46 PAK4cat (D440N/S474E) in complex with Integrin beta5 760-770 peptide 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	突变：D440N, S474E	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5) and 0.5 M tri-sodium citrate	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
7S48 PAK4cat in complex with Integrin beta5 760-770 peptide 提交 2021-09-08	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–426（318 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Tris-HCl (pH 8.5) and 0.5 M tri-sodium citrate	分辨率 1.90 Å R-free 0.222
8AHG PAC-FragmentDEL: Photoactivated covalent capture of DNA encoded fragments for hit discovery 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	突变：L310A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M4I ~{N}-methyl-3-propan-2-yl-1~{H}-pyrazolo[3,4-c]pyridine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.8M Na/K tartrate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 1.89 Å R-free 0.227
8AHH PAC FragmentDEL: Photoactivated covalent capture of DNA encoded fragments for hit discovery 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	突变：L310A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M4X 5-cyano-~{N}-methyl-pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.8M Na/K tartrate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.04 Å R-free 0.250
8AHI PAC-FragmentDEL: Photoactivated covalent capture of DNA encoded fragments for hit discovery 提交 2022-07-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	突变：L310A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	M56 ~{N}-methyl-1,3-benzothiazole-6-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.8M Na/K tartrate 0.1M Tris pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.249
8YHK The Crystal Structure of P21-Activated Kinases Pak4 from Biortus 提交 2024-02-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 291–591（301 aa）	未记录	PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.4 M Potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 3.30 Å R-free 0.319
9D52 Structure of PAK4 in complex with compound 18 提交 2024-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1A2R 2-cyano-N-[3-({6-[(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)amino]pyrazin-2-yl}amino)bicyclo[1.1.1]pentan-1-yl]acetamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 4% (v/v) PEG 8000	分辨率 2.45 Å R-free 0.287
9D53 PAK4 in complex with compound 7 提交 2024-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–591（292 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1A2P N~2~-{[(1s,4s)-4-aminocyclohexyl]methyl}-N~4~-(5-cyclopropyl-1,3-thiazol-2-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Bis-Tris-Propane, pH 9.0, 10% PEG 20,000	分辨率 2.47 Å R-free 0.263

共 46 个其他 PDB 条目、61 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PAK4_HUMAN
Isoform	O96013-2
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 29–453； UniProt 2–426

Cell division control protein 42 homolog

Homo sapiens

UniProt P60953

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–177	片段：UNP residues 1-177	Serine/threonine-protein kinase PAK 4 × 1 （O96013）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；0.1M Tris-HCl pH 8.5, 50mM Na2SO4, 6% PEG6000	分辨率 3.00 Å R-free 0.310

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5UPL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A4R G12V MUTANT OF HUMAN PLACENTAL CDC42 GTPASE IN THE GDP FORM 提交 1998-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–191（191 aa）链 B 1–191（191 aa）	突变：YES 突变：YES	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GNH AMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；pH 4.60	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
1AJE CDC42 FROM HUMAN, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-05-02	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–187（187 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K	分辨率未提供
1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 2–177（176 aa）	突变：M501P	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.9；pH 5.9	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 2–177（176 aa）	突变：M501P	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.9；pH 5.9	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
1AM4 COMPLEX BETWEEN CDC42HS.GMPPNP AND P50 RHOGAP (H. SAPIENS) 提交 1997-06-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 2–177（176 aa）	突变：M501P	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.9；pH 5.9	分辨率 2.70 Å R-free 0.280
1AN0 CDC42HS-GDP COMPLEX 提交 1997-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–190（189 aa）链 B 2–190（189 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.8；pH 4.8	分辨率 2.80 Å R-free 0.344
1CEE SOLUTION STRUCTURE OF CDC42 IN COMPLEX WITH THE GTPASE BINDING DOMAIN OF WASP 提交 1999-03-08	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–179（179 aa）片段：CDC42	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 1	分辨率未提供
1CF4 CDC42/ACK GTPASE-BINDING DOMAIN COMPLEX 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–191（191 aa）	突变：Q61L	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K NMR样品组成 [50%2H; 100%15N,13C]-labelled Cdc42, unlabelled f-ACK, 90% H2O/10% \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 [U-15N] f-ACK, Cdc42, 90% H2O/10% \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 [U-13C; U-15N] f-ACK, Cdc42, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 [U-13C; U-15N] Cdc42, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 [U-100% 15N] Cdc42, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1DOA Structure of the rho family gtp-binding protein cdc42 in complex with the multifunctional regulator rhogdi 提交 1999-12-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–188（188 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 GER GERAN-8-YL GERAN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；15% PEG 4000, 100 mM Glutamic Acid, 25 mM MgSO4, 50 mM Tris, 2 mM NaN3, 2 mM LDAO , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.320
1DOA Structure of the rho family gtp-binding protein cdc42 in complex with the multifunctional regulator rhogdi 提交 1999-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–188（188 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 6 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 GER GERAN-8-YL GERAN × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；15% PEG 4000, 100 mM Glutamic Acid, 25 mM MgSO4, 50 mM Tris, 2 mM NaN3, 2 mM LDAO , pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 18K, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.320
1E0A Cdc42 complexed with the GTPase binding domain of p21 activated kinase 提交 2000-03-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–184（184 aa）片段：1-184	突变：YES	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）5 MM NA2HPO4, 25MM NACL；压力 1 NMR样品组成 90% WATER, 10% D2O	分辨率未提供
1EES SOLUTION STRUCTURE OF CDC42HS COMPLEXED WITH A PEPTIDE DERIVED FROM P-21 ACTIVATED KINASE, NMR, 20 STRUCTURES 提交 2000-02-02	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–178（178 aa）片段：AMINO ACIDS 1-178	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）64 mM；压力 ambient NMR样品组成 0.8 mM U-15N,13C Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM U-15N Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM Cdc42Hs, 0.8 mM U-15N,13C PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM Cdc42Hs, 0.8 mM U-15N PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM 70%-2H,U-15N,13C Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM U-2H,15N Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.8 mM U-15N,13C Cdc42Hs, 0.8 mM PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 100% D2O NMR样品组成 0.8 mM Cdc42Hs, 0.8 mM U-15N,13C PBD46; 25 mM NaCl, 5 mM Na2PO4, 5 mM MgCl2, 1 mM NaN3, pH 5.5 \| 100% D2O	分辨率未提供
1GRN CRYSTAL STRUCTURE OF THE CDC42/CDC42GAP/ALF3 COMPLEX. 提交 1998-07-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–191（191 aa）片段：CDC42	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.259
1KI1 Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42 提交 2001-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–188（188 aa）片段：residues 1-188	突变：C188S	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
1KI1 Guanine Nucleotide Exchange Region of Intersectin in Complex with Cdc42 提交 2001-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–188（188 aa）片段：residues 1-188	突变：C188S	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；PEG 4000, ammonium sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
1KZ7 Crystal Structure of the DH/PH Fragment of Murine Dbs in Complex with the Placental Isoform of Human Cdc42 提交 2002-02-06	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–188（188 aa）片段：residues 1-188	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000, sodium formate, Tris HCL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
1KZ7 Crystal Structure of the DH/PH Fragment of Murine Dbs in Complex with the Placental Isoform of Human Cdc42 提交 2002-02-06	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–188（188 aa）片段：residues 1-188	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000, sodium formate, Tris HCL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.40 Å R-free 0.239
1KZG DbsCdc42(Y889F) 提交 2002-02-06	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–188（188 aa）片段：residues 1-188	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000,Tris HCL, NaFormate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.259
1KZG DbsCdc42(Y889F) 提交 2002-02-06	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–188（188 aa）片段：residues 1-188	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；PEG 8000,Tris HCL, NaFormate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.259
1NF3 Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6 提交 2002-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–181（180 aa）	突变：Q61L	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；24% PEG 4000, 100mM sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1NF3 Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6 提交 2002-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–181（180 aa）	突变：Q61L	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；24% PEG 4000, 100mM sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.273
1NF3 Structure of Cdc42 in a complex with the GTPase-binding domain of the cell polarity protein, Par6 提交 2002-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–181（180 aa）链 B 2–181（180 aa）	突变：Q61L 突变：Q61L	MG MAGNESIUM ION × 2 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；293 K；24% PEG 4000, 100mM sodium citrate, 0.2M ammonium acetate, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.273
2ASE NMR structure of the F28L mutant of Cdc42Hs 提交 2005-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–178（178 aa）	突变：F28L	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）30 mM；压力 ambient NMR样品组成 U-15N Cdc42Hs, 25 mM phosphate buffer, 5 mM MgCl2, pH 5.5, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 U-15N Cdc42Hs, 25 mM phosphate buffer, 5 mM MgCl2, pH 5.5, 100% D2O \| 100% D2O NMR样品组成 Cdc42Hs, 25 mM phosphate buffer, 5 mM MgCl2, pH 5.5, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2DFK Crystal structure of the CDC42-Collybistin II complex 提交 2006-03-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–191（191 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PEG 8000, Potassium dihydrogen phosphate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 8.00	分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2DFK Crystal structure of the CDC42-Collybistin II complex 提交 2006-03-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–191（191 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PEG 8000, Potassium dihydrogen phosphate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 8.00	分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2DFK Crystal structure of the CDC42-Collybistin II complex 提交 2006-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–191（191 aa）链 D 1–191（191 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；PEG 8000, Potassium dihydrogen phosphate, NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K, pH 8.00	分辨率 2.15 Å R-free 0.229
2KB0 Cdc42(T35A) 提交 2008-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–178（178 aa）	突变：T35A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；298 K；压力 ambient NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Cdc42(T35A), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2NGR TRANSITION STATE COMPLEX FOR GTP HYDROLYSIS BY CDC42: COMPARISONS OF THE HIGH RESOLUTION STRUCTURES FOR CDC42 BOUND TO THE ACTIVE AND CATALYTICALLY COMPROMISED FORMS OF THE CDC42-GAP. 提交 1998-07-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–191（191 aa）片段：FULL-LENGTH CDC42 IN COMPLEX WITH A C-TERMINAL ACTIVE DOMAIN OF CDC42GAP(R305A) MUTANT.	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 1.90 Å R-free 0.293
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–181（181 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–181（181 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–181（181 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2ODB The crystal structure of human cdc42 in complex with the CRIB domain of human p21-activated kinase 6 (PAK6) 提交 2006-12-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–181（181 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；0.1M acetate, 2M (NH4)2SO4, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
2QRZ Cdc42 bound to GMP-PCP: Induced Fit by Effector is Required 提交 2007-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–189（189 aa）链 B 1–189（189 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12% PEG 6K, 100 mM Na Acetate, 50 mM MES, pH 6.0, 100 mM Ammonium Sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
2WM9 Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42. 提交 2009-06-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–188（188 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；THE PROTEIN WAS CONCENTRATED TO 6 MG/ML. CRYSTALS WERE GROWN USING HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION. 1 UL OF COMPLEX WITH 200 MM NDSB-201 ADDED TO PROTEIN PRIOR TO CRYSTALLIZATION WAS MIXED WITH EQUAL VOLUME OF CRYSTALLIZATION BUFFER: 14% (W/V) PEG3350,100 MM MES (PH 6.0), 200 MM AMMONIUM ACETATE, 12% GLYCEROL. CRYSTALS WERE GROWN AT 20C.	分辨率 2.20 Å R-free 0.251
2WMN Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42-GDP. 提交 2009-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–188（188 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.39 Å R-free 0.276
2WMO Structure of the complex between DOCK9 and Cdc42. 提交 2009-07-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–188（188 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.272
3GCG crystal structure of MAP and CDC42 complex 提交 2009-02-22	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–178（177 aa）片段：UNP residues 2-178	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M Hepes pH 7.5, 10% PEG 6000, 5% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.277
3QBV Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin 提交 2011-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–178（178 aa）片段：UNP Residues 1-178	突变：F56R	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.65 Å R-free 0.284
3QBV Structure of designed orthogonal interaction between CDC42 and nucleotide exchange domains of intersectin 提交 2011-01-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–178（178 aa）片段：UNP Residues 1-178	突变：F56R	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；100mm TRIS pH 7.5, 25% PEG 3350, 150mm ammonium sulfate, and 1mM DTT, temperature 295k, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.65 Å R-free 0.284
3VHL Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK8 in complex with Cdc42 (T17N mutant) 提交 2011-08-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–188（188 aa）	突变：T17N, C188S	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.2M Potassium phosphate, 20% PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.08 Å R-free 0.232
4DID Crystal structure of Salmonella effector N-terminal domain SopB in complex with Cdc42 提交 2012-01-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–183（183 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；277 K；0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate-citrate pH 4.2, 20% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.237
4ITR Crystal Structure of IbpAFic2-H3717A in complex with adenylylated Cdc42 提交 2013-01-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–191（191 aa）链 D 1–191（191 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Bis-Tris, (NH4)2SO4, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4JS0 Complex of Cdc42 with the CRIB-PR domain of IRSp53 提交 2013-03-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–178（178 aa）	突变：G12V	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PE4 2-{2-[2-(2-{2-[2-(2-ETHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHANOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；18-20% PEG 4000, 0.2M magnesium chloride, 0.004M betain hydrochloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 1.90 Å R-free 0.199
4YC7 Crystal structure of human FMNL2 GBD-FH3 Domains bound to Cdc42-GppNHp 提交 2015-02-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–179（179 aa）片段：UNP residues 1-179	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；20 mM Tris/HCl (pH 8.0), 14% (v/v) PEG 3350, 0.25 M magnesium acetate	分辨率 2.50 Å R-free 0.253
4YDH The structure of human FMNL1 N-terminal domains bound to Cdc42 提交 2015-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–179（179 aa）链 D 1–179（179 aa）	未记录	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；17% (v/v) PEG 3350, 0.16 M tri-ammonium citrate	分辨率 3.80 Å R-free 0.281
5FI1 Crystal Structure of the P-Rex1 DH/PH tandem in complex with Cdc42 提交 2015-12-22	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–191（191 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；Ammonium citrate, PEG 3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.198
5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–188（188 aa）	突变：C188S	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000	分辨率 3.30 Å R-free 0.257
5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–188（188 aa）	突变：C188S	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000	分辨率 3.30 Å R-free 0.257
5UPK CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector interface - 3 peptide: PAK4cat, PAK4-N45, CDC42 提交 2017-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–177（177 aa）	突变：Q61L	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 22% PEG1,000	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJ4 Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK7 in complex with Cdc42 提交 2018-08-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350 and tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.26 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6AJL DOCK7 mutant I1836Y complexed with Cdc42 提交 2018-08-28	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–188（188 aa）	突变：C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, tri-potassium citrate monohydrate	分辨率 3.23 Å R-free 0.259
6SIU Crystal structure of IbpAFic2 covalently tethered to Cdc42 提交 2019-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–191（191 aa）链 D 1–191（191 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 10 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 2 LJN [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-(acetamidomethyl)-1,2,3-triazol-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292 K；1.6 M ammonium sulfate and 0.1 M citric acid	分辨率 2.49 Å R-free 0.239
6SUP Crystal Structure of TcdB2-TccC3-Cdc42 提交 2019-09-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 167–179（13 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293.15 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.5, 12 % PEG 4000 Seeding: 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M tri-sodium acetate pH 4.6, 12 % PEG 6000	分辨率 2.00 Å R-free 0.320
6TKY Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–188（188 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.	分辨率 2.55 Å R-free 0.246
6TKY Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–188（188 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.	分辨率 2.55 Å R-free 0.246
6TKZ Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric	链 C 1–188（188 aa）链 D 1–188（188 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.	分辨率 2.64 Å R-free 0.274
6TKZ Crystal structure of the DHR2 domain of DOCK10 in complex with CDC42 提交 2019-11-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric	链 C 1–188（188 aa）链 D 1–188（188 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.5；293 K；25% (w/v) PEG 3350, 200 mM potassium acetate, 8% (v/v) 1,1,1,3,3,3-Hexafluoro-2-propanol.	分辨率 2.64 Å R-free 0.274
7S0Y Structures of TcdB in complex with Cdc42 提交 2021-08-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 4–179（176 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 1 UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 11 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1 M sodium cacodylate (pH 6.6), 2.4 M ammonium sulfate, and 2.5% (v/v) Jeffamine M-600 (pH 7.0)	分辨率 2.79 Å R-free 0.259
8I5F Crystal structure of the DHR-2 domain of DOCK10 in complex with Cdc42 (T17N mutant) 提交 2023-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–188（188 aa）链 D 1–188（188 aa）	突变：T17N, C188S 突变：T17N, C188S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 8000, sodium chloride	分辨率 2.80 Å R-free 0.296
9GRM Cdc42 in complex with inhibitory peptide 提交 2024-09-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–184（184 aa）片段：1-184	突变：Q61L	GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1 NMR样品组成 0.48 mM [U-100% 15N] Cdc42, 0.58 mM None Peptide, 50 mM None sodium phosphate, 150 mM None sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-13C; U-15N] Cdc42, 0.45 mM None Peptide, 50 mM None sodium phosphate, 150 mM None sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.415 mM [U-100% 15N] Peptide, 0.45 mM None Cdc42, 50 mM None sodium phosphate, 150 mM None sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
9VM2 Structure of DOCK6-Cdc42 complex protomer 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–187（187 aa）	突变：G15A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.94 Å
9VM3 Structure of DOCK6-Cdc42 complex 提交 2025-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–187（187 aa）链 D 1–187（187 aa）	突变：G15A 突变：G15A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 4.52 Å

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UniProt名称	CDC42_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–177； UniProt 1–177

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5upl
沉积日期 deposition_date	2017-02-03
结构标题 title	CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector inteface - 2 peptide: PAK4FL, CDC42 - UNREFINED
关键词 keywords	Transferase, GTPase, Kinase, CRIB; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.43 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.54 Å
零角强度 I(0) i0	42544400.00
分子量 molecular_weight	51757.0 kDa
排除体积 excluded_volume	65482 Å³
包络体积 envelope_volume	81331 Å³
水化壳体积 shell_volume	27179 Å³
包络直径 envelope_diameter	88.3 Å
壳层 Rg shell_rg	32.10 Å
包络 Rg envelope_rg	25.47 Å
形状 Rg shape_rg	25.57 Å
总 Rg total_rg	26.22 Å
总原子数 total_atoms	3639
残基数 n_residues	466
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	84.2 Å
Rg (实空间) rg_real	26.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.49 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.2540e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.7600e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.44 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	42540000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9027
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	28.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.334
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.467
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	10010000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.927; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.971

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase PAK 4
分子量 formula_weight	51099.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
突变 mutation	S474SEP
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3639

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMENLYFQGFGKRKKRVEISAPSNFEHRVHTGFDQHEQKFTGLPRQWQSLIEESARRPKPLVDPACITSIQPGAPKTIVRGSKGAKDGALTLLLDEFENMSVTRSNSLRRDSPPPPARARQENGMPEKPPGPRSPQREPQRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRKQQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTRMNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVPRRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDNLPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRTR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cell division control protein 42 homolog
分子量 formula_weight	20716.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MQTIKCVVVGDGAVGKTCLLISYTTNKFPSEYVPTVFDNYAVTVMIGGEPYTLGLFDTAGQEDYDRLRPLSYPQTDVFLVCFSVVSPSSFENVKEKWVPEITHHCPKTPFLLVGTQIDLRDDPSTIEKLAKNKQKPITPETAEKLARDLKAVKYVECSALTQKGLKNVFDEAILAALLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d5upla_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5uplb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.8 — G proteins

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	5uplA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	5uplA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	5uplB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	141.652 Å
晶胞边长 b length_b	141.652 Å
晶胞边长 c length_c	62.093 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.003 Å
最低分辨率 resolution_low	43.637 Å
R 因子 r_factor	0.2593
R_work r_work	0.2568
R_free r_free	0.3102

fit	/app/data/saxs_computation/up/5upl/5upl.fit
pddf	/app/data/pr_computation/up/5upl/5upl.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/up/5upl/5upl.dat

CDC42 binds PAK4 via an extended GTPase-effector inteface - 2 peptide: PAK4FL, CDC42 - UNREFINED

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase PAK 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cell division control protein 42 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)