SAXSdb — 5wie

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 × 4 （P63141,P63142） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 20 POTASSIUM ION × 16	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 × 4 （P63141,P63142） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POTASSIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCAB2_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–333； UniProt 36–367 作者链 G； PDB构建体 2–333； UniProt 36–367

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

Mus musculus

UniProt P63141

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 20 POTASSIUM ION × 16	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POTASSIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNA2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 80–93； UniProt 266–279 作者链 H； PDB构建体 80–93； UniProt 266–279

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

Mus musculus

UniProt P63142

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 20 POTASSIUM ION × 16	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 8	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 × 4 （P62483） NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 POTASSIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNA2_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 38–79； UniProt 1–42 作者链 H； PDB构建体 38–79； UniProt 1–42

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5wie
沉积日期 deposition_date	2017-07-19
结构标题 title	Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state
关键词 keywords	Ion Channel, Membrane Protein, Inactivation, Voltage-gated, METAL TRANSPORT; MEMBRANE PROTEIN, METAL TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5wie__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5wie__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5wie__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	51.30 Å
Rg（电子密度）	51.79 Å
总 Rg	51.93 Å
原子数	20952
残基数	2616
排除体积	377320 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5wie__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5wie__assembly_2__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Voltage-gated potassium channel subunit beta-2
分子量 formula_weight	37353.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,G
原子数 atom_count	10955

MLQFYRNLGKSGLRVSCLGLGTWVTFGGQITDEMAEHLMTLAYDNGINLFDTAEVYAAGKAEVVLGNIIKKKGWRRSSLVITTKIFWGGKAETERGLSRKHIIEGLKASLERLQLEYVDVVFANRPDPNTPMEETVRAMTHVINQGMAMYWGTSRWSSMEIMEAYSVARQFNLIPPICEQAEYHMFQREKVEVQLPELFHKIGVGAMTWSPLACGIVSGKYDSGIPPYSRASLKGYQWLKDKILSEEGRRQQAKLKELQAIAERLGCTLPQLAIAWCLRNEGVSSVLLGASNAEQLMENIGAIQVLPKLSSSIVHEIDSILGNKPYSKKDYRS

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Pichia

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2
分子量 formula_weight	60455.3 kDa
突变 mutation	V406W
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,H

MSAWSHPQFEKGGGSGGGSGGSAWSHPQFEKLVPRGSMTVATGDPVDEAAAHPGHPQDTYDPEADHESSERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEERPLPENEFQRQVWLLFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENEDMHGGGVTFHTYSQSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPYYVTIFLTESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERDSQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIWSNFNYFYHRETEGEEQAQYLQVTSSPKIPSSPDLKKSRSASTISKSDYMEIQEGVNNSNEDFREENLKTANSTLANTNYVNITKMLTDV

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Pichia

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
分子量 formula_weight	743.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	(1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate
分子量 formula_weight	749.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	5wieA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — NADP-dependent oxidoreductase domain

结构域编号 domain_id	5wieB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	5wieB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	5wieB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

结构域编号 domain_id	5wieG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — NADP-dependent oxidoreductase domain

结构域编号 domain_id	5wieH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	710 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Potassium Channel Kv1.1; Chain A

结构域编号 domain_id	5wieH02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

结构域编号 domain_id	5wieH03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 —

▶

晶胞边长 a length_a	143.124 Å
晶胞边长 b length_b	143.124 Å
晶胞边长 c length_c	284.510 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 4 21 2
空间群编号 int_tables_number	90
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	40.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2360
R_free r_free	0.2430

Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5wie__assembly_2__model_1

5wie__assembly_2__model_1 | I(q)

5wie__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-gated potassium channel subunit beta-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2,Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5wie__assembly_2__model_1

5wie__assembly_2__model_1 | I(q)

5wie__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)