5xoc

Crystal structure of human Smad3-FoxH1 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 78.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mothers against decapentaplegic homolog 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 220–416	片段：UNP residues 220-416	Thioredoxin 1,Forkhead box protein H1 × 3 （P0AA25,O75593）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；293 K；0.1 M citrate pH 5.4, 0.8% ethylene imine polymer and 0.5 M NaCl	分辨率 2.40 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5XOC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MHD CRYSTAL STRUCTURE OF A SMAD MH1 DOMAIN BOUND TO DNA 提交 1998-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–132（132 aa）片段：MH1 DOMAIN, RESIDUES 1 - 144 链 B 1–132（132 aa）片段：MH1 DOMAIN, RESIDUES 1 - 144	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；pH 5.6	分辨率 2.80 Å R-free 0.288
1MJS MH2 domain of transcriptional factor SMAD3 提交 2002-08-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 229–425（197 aa）片段：MH2 domain, residues 229-425	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.91 Å R-free 0.199
1MK2 SMAD3 SBD complex 提交 2002-08-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 220–425（206 aa）片段：MH2 domain, residues 220-425	未记录	ACY ACETIC ACID × 8	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.74 Å R-free 0.271
1MK2 SMAD3 SBD complex 提交 2002-08-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–425（206 aa）片段：MH2 domain, residues 220-425	未记录	ACY ACETIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.74 Å R-free 0.271
1OZJ Crystal structure of Smad3-MH1 bound to DNA at 2.4 A resolution 提交 2003-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–144（144 aa）片段：DWA DOMAIN 链 B 1–144（144 aa）片段：DWA DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；citrate, PEG2000, ammonium acetate, spermine, magnesium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.270
1U7F Crystal Structure of the phosphorylated Smad3/Smad4 heterotrimeric complex 提交 2004-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 228–424（197 aa）片段：MH2 and Linker domains 链 C 228–424（197 aa）片段：MH2 and Linker domains	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；50 mM Tris-HCl, 0-15 mM magnesium chloride, 5-15% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
2LAJ Third WW domain of human Nedd4L in complex with doubly phosphorylated human smad3 derived peptide 提交 2011-03-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 202–211（10 aa）片段：sequence database residues 202-211	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LB2 Structure of the second domain of human Nedd4L in complex with a phosphorylated pTPY motif derived from human Smad3 提交 2011-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 178–189（12 aa）片段：residues 178-189	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
5OD6 Crystal structure of Smad3-MH1 bound to the GGCGC site. 提交 2017-07-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 11–135（125 aa）链 B 11–135（125 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M lithium acetate, 20% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.235
5ODG Crystal structure of Smad3-MH1 bound to the GGCT site. 提交 2017-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 11–135（125 aa）片段：MH1 domain, UNP residues 11-135 链 B 11–135（125 aa）片段：MH1 domain, UNP residues 11-135	未记录	ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.02 M sodium potassium phosphate, 0.1 M BisTris propane pH 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.12 Å R-free 0.242
5ODG Crystal structure of Smad3-MH1 bound to the GGCT site. 提交 2017-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 11–135（125 aa）片段：MH1 domain, UNP residues 11-135 链 B 11–135（125 aa）片段：MH1 domain, UNP residues 11-135	未记录	ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.02 M sodium potassium phosphate, 0.1 M BisTris propane pH 6.5, 20% PEG 3350	分辨率 2.12 Å R-free 0.242
6ZMN Crystal structure of the Smad3-Smad5 MH1 domain chimera bound to the GGCGC site 提交 2020-07-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 10–136（127 aa）链 B 10–136（127 aa）	未记录	ACT ACETATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20% PEG 3350, 0.2 M sodium acetate	分辨率 2.33 Å R-free 0.252

共 10 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMAD3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–199； UniProt 220–416

Thioredoxin 1,Forkhead box protein H1

Homo sapiens

UniProt O75593

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 322–345	片段：UNP residues 2-109,UNP residues 322-345	Mothers against decapentaplegic homolog 3 × 3 （P84022）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；293 K；0.1 M citrate pH 5.4, 0.8% ethylene imine polymer and 0.5 M NaCl	分辨率 2.40 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5XOC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7YZB Crystal structure of the human FoxH1 bound to the TGTGGATT site 提交 2022-02-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 1–185（185 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；277 K；18% PEG 3350, 0.2 M ammonium chloride pH 6.3	分辨率 1.47 Å R-free 0.191

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FOXH1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 118–141； UniProt 322–345

Thioredoxin 1,Forkhead box protein H1

Homo sapiens

UniProt P0AA25

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 2–109	片段：UNP residues 2-109,UNP residues 322-345	Mothers against decapentaplegic homolog 3 × 3 （P84022）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.4；293 K；0.1 M citrate pH 5.4, 0.8% ethylene imine polymer and 0.5 M NaCl	分辨率 2.40 Å R-free 0.235

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5XOC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F6M CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THIOREDOXIN REDUCTASE, THIOREDOXIN, AND THE NADP+ ANALOG, AADP+ 提交 2000-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–108（108 aa）链 D 1–108（108 aa）	突变：C35S 突变：C35S	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 3AA 3-AMINOPYRIDINE-ADENINE DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；cacodylate, ammonium sulfate, PEG 3350, 3-aminopyridine adenine dinucleotide phosphate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.247
1F6M CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX BETWEEN THIOREDOXIN REDUCTASE, THIOREDOXIN, AND THE NADP+ ANALOG, AADP+ 提交 2000-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–108（108 aa）链 H 1–108（108 aa）	突变：C35S 突变：C35S	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 3AA 3-AMINOPYRIDINE-ADENINE DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；295 K；cacodylate, ammonium sulfate, PEG 3350, 3-aminopyridine adenine dinucleotide phosphate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.95 Å R-free 0.247
1KEB Crystal Structure of Double Mutant M37L,P40S E.coli Thioredoxin 提交 2001-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：M37L,P40S	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.8；300 K；100mM sodium acetate buffer, 10mM cupric acetate, 25% ethanol as precipitant, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.80 Å R-free 0.222
1KEB Crystal Structure of Double Mutant M37L,P40S E.coli Thioredoxin 提交 2001-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：M37L,P40S	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.8；300 K；100mM sodium acetate buffer, 10mM cupric acetate, 25% ethanol as precipitant, pH 3.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K	分辨率 1.80 Å R-free 0.222
1SKR T7 DNA Polymerase Complexed To DNA Primer/Template and ddATP 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG 8000, ammonium sulfate, aces, ethylene glycol, DTT , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.40 Å R-free 0.270
1SKS Binary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a cis-syn thymine dimer on the template 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.266
1SKW Binary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a disordered cis-syn thymine dimer on the template 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.278
1SL0 Ternary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a disordered cis-syn thymine dimer on the template and an incoming nucleotide 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.351
1SL0 Ternary 3' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a disordered cis-syn thymine dimer on the template and an incoming nucleotide 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 3.20 Å R-free 0.351
1SL1 Binary 5' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a cis-syn thymine dimer on the template 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.262
1SL2 Ternary 5' complex of T7 DNA polymerase with a DNA primer/template containing a cis-syn thymine dimer on the template and an incoming nucleotide 提交 2004-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 7.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.279
1SRX THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI THIOREDOXIN-S2 TO 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1976-05-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.80 Å
1T8E T7 DNA Polymerase Ternary Complex with dCTP at the Insertion Site. 提交 2004-05-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.54 Å R-free 0.255
1THO CRYSTAL STRUCTURE OF A MUTANT ESCHERICHIA COLI THIOREDOXIN WITH AN ARGININE INSERTION IN THE ACTIVE SITE 提交 1993-01-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å
1TK0 T7 DNA polymerase ternary complex with 8 oxo guanosine and ddCTP at the insertion site 提交 2004-06-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 DCT 2',3'-DIDEOXYCYTIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG8000, Amonium Sulfate, PEG400, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K	分辨率 2.30 Å R-free 0.263
1TK5 T7 DNA polymerase binary complex with 8 oxo guanosine in the templating strand 提交 2004-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；PEG 8000, Ammonium Sulfate. PEG400, Etylen Glyco, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K	分辨率 2.20 Å R-free 0.246
1TK8 T7 DNA polymerase ternary complex with 8 oxo guanosine and dAMP at the elongation site 提交 2004-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG 8000, Ammonium Sulfate, PEG400, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.50 Å R-free 0.261
1TKD T7 DNA polymerase ternary complex with 8 oxo guanosine and dCMP at the elongation site 提交 2004-06-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 3 D3T 2',3'-DIDEOXY-THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；PEG8000, Ammonium Sulfate, PEG400, Ethylene Glycol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.49 Å R-free 0.265
1TXX ACTIVE-SITE VARIANT OF E.COLI THIOREDOXIN 提交 1999-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P33V, G34W	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；DROPS (6 ML) OF 0.050 M SODIUM SUCCINATE BUFFER, PH 4.2, CONTAINING CVWC THIOREDOXIN (10 MG/ML), METHYL-ETHER PEG2000 (10% W/V) AND CUPRIC ACETATE (1 MM) WERE SUSPENDED OVER 1.0 ML WELLS OF 0.10 M SODIUM SUCCINATE BUFFER, PH 4.2, CONTAINING METHYL-ETHER PEG 2000 (20% W/V) AND CUPRIC ACETATE (2 MM)., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.20 Å
1X9M T7 DNA polymerase in complex with an N-2-acetylaminofluorene-adducted DNA 提交 2004-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；295 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K	分辨率 2.10 Å R-free 0.236
1X9S T7 DNA polymerase in complex with a primer/template DNA containing a disordered N-2 aminofluorene on the template, crystallized with dideoxy-CTP as the incoming nucleotide. 提交 2004-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.70 Å R-free 0.279
1X9W T7 DNA polymerase in complex with a primer/template DNA containing a disordered N-2 aminofluorene on the template, crystallized with dideoxy-ATP as the incoming nucleotide. 提交 2004-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.258
1XOA THIOREDOXIN (OXIDIZED DISULFIDE FORM), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1995-11-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1XOB THIOREDOXIN (REDUCED DITHIO FORM), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1995-11-28	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1ZCP Crystal Structure of a catalytic site mutant E. coli TrxA (CACA) 提交 2005-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）链 B 1–108（108 aa）	突变：G33A, P34C, C35A 突变：G33A, P34C, C35A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30% PEG4000, 0.1 M Tris, 0.2 M Magnesium chloride, 4% acetonitrile, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.281
1ZCP Crystal Structure of a catalytic site mutant E. coli TrxA (CACA) 提交 2005-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–108（108 aa）链 D 1–108（108 aa）	突变：G33A, P34C, C35A 突变：G33A, P34C, C35A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277 K；30% PEG4000, 0.1 M Tris, 0.2 M Magnesium chloride, 4% acetonitrile, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.281
1ZYQ T7 DNA polymerase in complex with 8oG and incoming ddATP 提交 2005-06-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 DAD 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；PEG, amonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.272
2AJQ Structure of replicative DNA polymerase provides insigts into the mechanisms for processivity, frameshifting and editing 提交 2005-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–108（108 aa）	突变：Residues 5 and 7 mutated to Ala	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；A complex of 1x10^-4 M T7 DNA polymerase 5A7A:thioredoxin was assembled with an equimolar amount of double stranded DNA substrate. Crystallization was achieved using a buffer containing 50mM HEPES pH 7.5, 10mM MgCl_2, 2mM DTT, and 0.5 mM terminal ddTTP Seed crystals were grown by hanging drop vapor diffusion by mixing 1ul each of protein-DNA solution and a reservoir solutions containing between 16 to 20% PEG 8000, 100mM ACES pH 7.5, 120 ammonium sulfate, 30mM MgCl2, and 5mM DTT. These crystals were used to streak-seed a grid of protein/reservoir solutions with concentrations of PEG 8000 between 13 to 15%. Pyramidal crystals appeared overnight and reached a maximum size of ~150 X 150 X 100 um3 after 3 to 4 days. Crystals were harvested overnight in mother-liquor containing 10 % PEG 400, temperature 273K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
2AJQ Structure of replicative DNA polymerase provides insigts into the mechanisms for processivity, frameshifting and editing 提交 2005-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 I 1–108（108 aa）	突变：Residues 5 and 7 mutated to Ala	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；273 K；A complex of 1x10^-4 M T7 DNA polymerase 5A7A:thioredoxin was assembled with an equimolar amount of double stranded DNA substrate. Crystallization was achieved using a buffer containing 50mM HEPES pH 7.5, 10mM MgCl_2, 2mM DTT, and 0.5 mM terminal ddTTP Seed crystals were grown by hanging drop vapor diffusion by mixing 1ul each of protein-DNA solution and a reservoir solutions containing between 16 to 20% PEG 8000, 100mM ACES pH 7.5, 120 ammonium sulfate, 30mM MgCl2, and 5mM DTT. These crystals were used to streak-seed a grid of protein/reservoir solutions with concentrations of PEG 8000 between 13 to 15%. Pyramidal crystals appeared overnight and reached a maximum size of ~150 X 150 X 100 um3 after 3 to 4 days. Crystals were harvested overnight in mother-liquor containing 10 % PEG 400, temperature 273K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.60 Å R-free 0.284
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：E101C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：E101C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–109（108 aa）	突变：E101C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIO Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 2–109（108 aa）	突变：E101C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；20% PEG 3350, 0.1M TRIS, 0.2M MAGNESIUM CHLORIDE, pH 8.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.60 Å R-free 0.292
2EIQ Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：T89C	CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；40% MPD, 1MM CUPRIC ACETATE, 10MM SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2EIQ Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：T89C	CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；40% MPD, 1MM CUPRIC ACETATE, 10MM SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2EIQ Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：T89C	CU COPPER (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；40% MPD, 1MM CUPRIC ACETATE, 10MM SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：E101C/A105C	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：E101C/A105C	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–109（108 aa）	突变：E101C/A105C	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2EIR Design of Disulfide-linked Thioredoxin Dimers and Multimers Through Analysis of Crystal Contacts 提交 2007-03-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 2–109（108 aa）	突变：E101C/A105C	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；277 K；45% MPD, 5MM CUPRIC ACETATE, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.311
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–108（108 aa）链 C 1–108（108 aa）链 D 1–108（108 aa）	突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–108（108 aa）链 G 1–108（108 aa）	突变：G74S 突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）链 D 1–108（108 aa）	突变：G74S 突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：G74S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–108（108 aa）	突变：G74S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–108（108 aa）	突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–108（108 aa）	突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1–108（108 aa）	突变：G74S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1–108（108 aa）	突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–108（108 aa）链 C 1–108（108 aa）链 D 1–108（108 aa）链 F 1–108（108 aa）链 G 1–108（108 aa）	突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S 突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FCH Crystal Structure of Thioredoxin Mutant G74S 提交 2005-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）链 E 1–108（108 aa）	突变：G74S 突变：G74S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 5.4；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 5.4, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
2FD3 Crystal Structure of Thioredoxin Mutant P34H 提交 2005-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：P34H	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 8；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 8.0, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.305
2FD3 Crystal Structure of Thioredoxin Mutant P34H 提交 2005-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–108（108 aa）	突变：P34H	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 COUNTER-DIFFUSION；pH 8；277 K；60% (v/v) MPD, Hepes 15 mM, 1 mM Ac2Cu, pH 8.0, Counter-diffusion, temperature 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.305
2TIR CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF A MUTANT ESCHERICHIA COLI THIOREDOXIN IN WHICH LYSINE 36 IS REPLACED BY GLUTAMIC ACID 提交 1993-01-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.68 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.68 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–108（108 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.68 Å
2TRX CRYSTAL STRUCTURE OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI AT 1.68 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1990-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–108（108 aa）	未记录	CU COPPER (II) ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.68 Å
3DYR Crystal structure of E. coli thioredoxin mutant I76T in its oxidized form 提交 2008-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：I76T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.290
3DYR Crystal structure of E. coli thioredoxin mutant I76T in its oxidized form 提交 2008-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：I76T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.290
4HU7 E. coli thioredoxin variant with Pro76 as single proline residue 提交 2012-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A	CU COPPER (II) ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4HU7 E. coli thioredoxin variant with Pro76 as single proline residue 提交 2012-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4HU7 E. coli thioredoxin variant with Pro76 as single proline residue 提交 2012-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–109（108 aa）链 B 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A 突变：P34A, P40A, P64A, P68A	CU COPPER (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD , pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.40 Å R-free 0.198
4HU9 E. coli thioredoxin variant with (4S)-FluoroPro76 as single proline residue 提交 2012-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH, 2 mM CuCl2, 30 % (v/v) MPD, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.55 Å R-free 0.210
4HUA E. coli thioredoxin variant with (4R)-FluoroPro76 as single proline residue 提交 2012-11-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CU COPPER (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；277.15 K；20 mM acetic acid-NaOH pH 4.5, 2 mM CuCl2, 35 % (v/v) MPD, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K	分辨率 1.10 Å R-free 0.172
4X43 Structure of proline-free E. coli Thioredoxin 提交 2014-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A, P76A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000	分辨率 1.65 Å R-free 0.218
4X43 Structure of proline-free E. coli Thioredoxin 提交 2014-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A, P76A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000	分辨率 1.65 Å R-free 0.218
4X43 Structure of proline-free E. coli Thioredoxin 提交 2014-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：Monomeric	链 C 2–109（108 aa）	突变：P34A, P40A, P64A, P68A, P76A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 1000, 10% (w/v) PEG 8000	分辨率 1.65 Å R-free 0.218
6GD1 Structure of HuR RRM3 提交 2018-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–109（109 aa）链 B 1–109（109 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；23% (w/v) PEG 2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate	分辨率 2.01 Å R-free 0.244
6H1Y CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC VARIANT OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 2018-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–14（13 aa）链 A 24–109（86 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained with a protein concentration of 20-25 mg/ml. The composition of the reservoir solution was 17% (w/v) PEG10000, 0.1 M ammonium acetate and 0.1 M BIS-TRIS buffer, pH 5.5.	分辨率 2.99 Å R-free 0.259
6H1Y CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERIC VARIANT OF THIOREDOXIN FROM ESCHERICHIA COLI 提交 2018-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–14（13 aa）链 B 24–109（86 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Crystals were obtained with a protein concentration of 20-25 mg/ml. The composition of the reservoir solution was 17% (w/v) PEG10000, 0.1 M ammonium acetate and 0.1 M BIS-TRIS buffer, pH 5.5.	分辨率 2.99 Å R-free 0.259
6H7J ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST ISOPRENALINE AND NANOBODY Nb80 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	5FW ISOPRENALINE × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.80 Å R-free 0.317
6H7J ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST ISOPRENALINE AND NANOBODY Nb80 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	5FW ISOPRENALINE × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.80 Å R-free 0.317
6H7L ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST DOBUTAMINE AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	2CV HEGA-10 × 6 NA SODIUM ION × 1 Y00 DOBUTAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.70 Å R-free 0.278
6H7L ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST DOBUTAMINE AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	2CV HEGA-10 × 3 NA SODIUM ION × 1 Y00 DOBUTAMINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.70 Å R-free 0.278
6H7M ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST SALBUTAMOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	2CV HEGA-10 × 3 68H SALBUTAMOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.76 Å R-free 0.285
6H7M ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST SALBUTAMOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	2CV HEGA-10 × 4 68H SALBUTAMOL × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.76 Å R-free 0.285
6H7N ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST XAMOTEROL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	FVK ~{N}-[2-[[(2~{S})-2-oxidanyl-3-(4-oxidanylphenoxy)propyl]amino]ethyl]morpholine-4-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
6H7N ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND PARTIAL AGONIST XAMOTEROL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	FVK ~{N}-[2-[[(2~{S})-2-oxidanyl-3-(4-oxidanylphenoxy)propyl]amino]ethyl]morpholine-4-carboxamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.50 Å R-free 0.266
6H7O ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND WEAK PARTIAL AGONIST CYANOPINDOLOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	P32 Cyanopindolol × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
6H7O ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND WEAK PARTIAL AGONIST CYANOPINDOLOL AND NANOBODY Nb6B9 提交 2018-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S	P32 Cyanopindolol × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
6IBL ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST FORMOTEROL AND NANOBODY Nb80 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S,C32S,C35S	H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
6IBL ACTIVATED TURKEY BETA1 ADRENOCEPTOR WITH BOUND AGONIST FORMOTEROL AND NANOBODY Nb80 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–109（108 aa）	突变：C32S,C35S,C32S,C35S	H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1 NA SODIUM ION × 1 2CV HEGA-10 × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1 M Hepes-NaOH pH7.5 and 21-24% PEG1500	分辨率 2.70 Å R-free 0.277
6LUR Human PUF60 UHM domain (thioredoxin fusion) in complex with a small molecule binder 提交 2020-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–109（109 aa）链 B 1–109（109 aa）链 C 1–109（109 aa）链 D 1–109（109 aa）链 E 1–109（109 aa）链 F 1–109（109 aa）链 G 1–109（109 aa）链 H 1–109（109 aa）	未记录	EVU 4-[2-[4-(aminomethyl)phenyl]phenyl]piperazin-2-one × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.3-1.6M AmSO4, 0.2M potassium formate	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–109（109 aa）	未记录	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Y The crystal structure of human MACROD2 in space group P41212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6Y4Z The crystal structure of human MACROD2 in space group P43212 提交 2020-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–109（109 aa）	未记录	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293 K；0.2 M Ammonium tartarate dibasic pH 6.7, 20% PEG 3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.228
6YEV Crystal structure of MsrA C206 and Trx C35S complex from Escherichia coli 提交 2020-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–109（109 aa）	突变：Cys35Ser	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M BIS-TRIS propane pH 6.5, 0.2M trisodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.94 Å R-free 0.258
6YEV Crystal structure of MsrA C206 and Trx C35S complex from Escherichia coli 提交 2020-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–109（109 aa）	突变：Cys35Ser	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M BIS-TRIS propane pH 6.5, 0.2M trisodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.94 Å R-free 0.258
6YEV Crystal structure of MsrA C206 and Trx C35S complex from Escherichia coli 提交 2020-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–109（109 aa）	突变：Cys35Ser	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.1M BIS-TRIS propane pH 6.5, 0.2M trisodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.94 Å R-free 0.258
7SCD Ternary complex of fixed-arm Trx-3ost5 (I299E) with 8mer-1 octasaccharide substrate and co-factor product PAP 提交 2021-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：I299E	A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.2M ammonium tartrate, 20% (w/v) PEG3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.252
7SCE Ternary complex of fixed-arm Trx-3ost5 (I299E) with 8mer-2 octasaccharide substrate and co-factor product PAP 提交 2021-09-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–108（108 aa）	突变：I299E	A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；85mM sodium acetate pH 4.6, 0.17M ammonium acetate, 25.5% (w/v) PEG4000, 15% (v/v) ethylene glycol	分辨率 2.75 Å R-free 0.246
8KGZ Crystal structure of single-chain Fv antibody against antigen peptide from SARS-CoV2 S-spike protein 提交 2023-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–109（109 aa）链 B 1–109（109 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M HEPES pH7.5	分辨率 2.21 Å R-free 0.321
8S2N Xenorhabdus bovienii Rhs toxin TreTu complex with TrxA and TriTu immunity protein 提交 2024-02-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 2–109（108 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.02 M Sodium chloride, 0.02 M Sodium acetate pH 4.0, 33 % v/v PEG 200	分辨率 2.11 Å R-free 0.232

共 52 个其他 PDB 条目、100 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	THIO_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 8–115； UniProt 2–109

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5xoc
沉积日期 deposition_date	2017-05-27
结构标题 title	Crystal structure of human Smad3-FoxH1 complex
关键词 keywords	transcription factor, complex, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	24.11 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	23.36 Å
零角强度 I(0) i0	22404900.00
分子量 molecular_weight	36385.0 kDa
排除体积 excluded_volume	45659 Å³
包络体积 envelope_volume	55197 Å³
水化壳体积 shell_volume	20921 Å³
包络直径 envelope_diameter	79.7 Å
壳层 Rg shell_rg	28.84 Å
包络 Rg envelope_rg	23.27 Å
形状 Rg shape_rg	23.35 Å
总 Rg total_rg	24.09 Å
总原子数 total_atoms	2560
残基数 n_residues	327
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	78.2 Å
Rg (实空间) rg_real	24.21 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.44 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.2400e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.1130e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	24.19 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	22400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8887
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	23.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.418
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.432
角度范围 angular_range	— – 0.3300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	5200000.0000
实空间数据点数 n_real_points	65
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.884; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.914; Smooth: 0.981

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mothers against decapentaplegic homolog 3
分子量 formula_weight	22463.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2596

GPDLQPVTYCEPAFWCSISYYELNQRVGETFHASQPSMTVDGFTDPSNSERFCLGLLSNVNRNAAVELTRRHIGRGVRLYYIGGEVFAECLSDSAIFVQSPNCNQRYGWHPATVCKIPPGCNLKIFNNQEFAALLAQSVNQGFEAVYQLTRMCTIRMSFVKGWGAEYRRQTVTSTPCWIELHLNGPLQWLDKVLTQMGS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Thioredoxin 1,Forkhead box protein H1
分子量 formula_weight	15437.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MHHHHHHSDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGSGLLCDLDALFQGVPPNKSIYDVWV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	36

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d5xoca_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.26 — SMAD/FHA domain
超家族 Superfamily superfamily	b.26.1 — SMAD/FHA domain
家族 Family family	b.26.1.1 — SMAD domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5xocA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Tumour Suppressor Smad4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	5xocB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	131.865 Å
晶胞边长 b length_b	131.865 Å
晶胞边长 c length_c	91.602 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 63 2 2
空间群编号 int_tables_number	182
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	19.883 Å
R 因子 r_factor	0.1983
R_work r_work	0.1963
R_free r_free	0.2353

fit	/app/data/saxs_computation/xo/5xoc/5xoc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/xo/5xoc/5xoc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/xo/5xoc/5xoc.dat

Crystal structure of human Smad3-FoxH1 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mothers against decapentaplegic homolog 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Thioredoxin 1,Forkhead box protein H1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Thioredoxin 1,Forkhead box protein H1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)