SAXSdb — 6odf

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1

Eastern equine encephalitis virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 480 其他聚合物 360	E2 × 240 （E9KXL2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 360	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 6	E2 × 4 （E9KXL2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 6	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 40 其他聚合物 30	E2 × 20 （E9KXL2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 30	与蛋白数一致
4	其他组合	异源复合物	蛋白 48 其他聚合物 36	E2 × 24 （E9KXL2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 36	与蛋白数一致
5	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 6	E2 × 4 （E9KXL2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E9KXM2_EEEV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 C； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 E； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 G； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242

E2

Eastern equine encephalitis virus

UniProt E9KXL2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 480 其他聚合物 360	E1 × 240 （E9KXM2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 360	与蛋白数一致
2	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 6	E1 × 4 （E9KXM2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 6	与蛋白数一致
3	其他组合	异源复合物	蛋白 40 其他聚合物 30	E1 × 20 （E9KXM2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 30	与蛋白数一致
4	其他组合	异源复合物	蛋白 48 其他聚合物 36	E1 × 24 （E9KXM2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 36	与蛋白数一致
5	其他组合	异源复合物	蛋白 8 其他聚合物 6	E1 × 4 （E9KXM2） ;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ; × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E9KXL2_EEEV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744 作者链 D； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744 作者链 F； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744 作者链 H； PDB构建体 1–420； UniProt 325–744

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6odf
沉积日期 deposition_date	2019-03-26
结构标题 title	EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate
关键词 keywords	EEEV, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6odf__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6odf__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6odf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	280.10 Å
总 Rg	280.20 Å
原子数	1590720
残基数	203760
排除体积	28222000 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6odf__assembly_1__model_1`	480-meric （480）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`6odf__assembly_2__model_1`	octameric （8）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`6odf__assembly_3__model_1`	40-meric （40）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`6odf__assembly_4__model_1`	48-meric （48）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`6odf__assembly_5__model_1`	octameric （8）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	E1
分子量 formula_weight	47938.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.90
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G
原子数 atom_count	26512

YEHTAVMPNKVGIPYKALVERPGYAPVHLQIQLVNTRIIPSTNLEYITCKYKTKVPSPVVKCCGATQCTSKPHPDYQCQVFTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQMSEAYVERSEECSIDHAKAYKVHTGTVQAMVNITYGSVSWRSADVYVNGETPAKIGDAKLIIGPLSSAWSPFDNKVVVYGHEVYNYDFPEYGTGKAGSFGDLQSRTSTSNDLYANTNLKLQRPQAGIVHTPFTQAPSGFERWKRDKGAPLNDVAPFGCSIALEPLRAENCAVGSIPISIDIPDAAFTRISETPTVSDLECKITECTYASDFGGIATVAYKSSKAGNCPIHSPSGVAVIKENDVTLAESGSFTFHFSTANIHPAFKLQVCTSAVTCKGDCKPPKDHIVDYPAQHTESFTSAISATAWSWLKVLVGGTSAFIVLGLIATAVVALVLFFHRH

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
通用名 common_name	EEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Cricetinae gen. sp.

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	E2
分子量 formula_weight	47047.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.90
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H

DLDTHFTQYKLARPYIADCPNCGHSRCDSPIAIEEVRGDAHAGVIRIQTSAMFGLKTDGVDLAYMSFMNGKTQKSIKIDNLHVRTSAPCSLVSHHGYYILAQCPPGDTVTVGFHDGPNRHTCTVAHKVEFRPVGREKYRHPPEHGVELPCNRYTHKRADQGHYVEMHQPGLVADHSLLSIHSAKVKITVPSGAQVKYYCKCPDVREGITSSDHTTTCTDVKQCRAYLIDNKKWVYNSGRLPRGEGDTFKGKLHVPFVPVKAKCIATLAPEPLVEHKHRTLILHLHPDHPTLLTTRSLGSDANPTRQWIERPTTVNFTVTGEGLEYTWGNHPPKRVWAQESGEGNPHGWPHEVVVYYYNRYPLTTIIGLCTCVAIIMVSCVTSVWLLCRTRNLCITPYKLAPNAQVPILLALLCCIKPTRA

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
通用名 common_name	EEEV
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Cricetinae gen. sp.

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;2-O-sulfo-beta-L-galactopyranuronic acid-(1-4)-[(2R,3R,4R,5R,6R)-2,4,5-trihydroxy-6-(sulfooxy)tetrahydro-2H-pyran-3-yl]sulfamic acid ;
分子量 formula_weight	581.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

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分辨率 resolution	5.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	17022

EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

E2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6odf__assembly_1__model_1

6odf__assembly_1__model_1 | I(q)

6odf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

7. 引用文献 (1)

EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

E2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6odf__assembly_1__model_1

6odf__assembly_1__model_1 | I(q)

6odf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

7. 引用文献 (1)