SAXSdb — 6sja

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Protein E6 × 1 （P03126） ;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 ZINC ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MALE_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–362； UniProt 27–387

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3

Homo sapiens

UniProt Q14653

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Protein E6 × 1 （P03126） ;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 ZINC ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IRF3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 372–383； UniProt 137–148

Protein E6

Human papillomavirus type 16

UniProt P03126

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2 其他聚合物 1	Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3 × 1 （P0AEX9,Q14653） ;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 ZINC ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VE6_HPV16
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–153； UniProt 7–158

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6sja
沉积日期 deposition_date	2019-08-13
结构标题 title	Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with IRF3 LxxLL motif
关键词 keywords	HPV16 E6 protein, IRF3 mutant, LxxLL motif, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6sja__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6sja__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6sja__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.88 Å
Rg（电子密度）	25.98 Å
总 Rg	26.92 Å
原子数	4133
残基数	517
排除体积	73871 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6sja__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3
分子量 formula_weight	41733.2 kDa
突变 mutation	E360A,K363A,D364A,K84A,K240A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4668

MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSAVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAEDILDELLGNMV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein E6
分子量 formula_weight	18439.3 kDa
突变 mutation	F1047R,C1080S,C1097S,C1111S,C1140S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GAMFQDPQERPRKLPQLCTELQTTIHDIILECVYCKQQLLRREVYDFARRDLCIVYRDGNPYAVCDKCLKFYSKISEYRHYSYSLYGTTLEQQYNKPLSDLLIRCINCQKPLSPEEKQRHLDKKQRFHNIRGRWTGRCMSCSRSSRTRRETQL

来源 Source

来源生物 organism	Human papillomavirus type 16
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	333760
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	828.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	481

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6sjaB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	240 — CRO Repressor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — E6 early regulatory protein

结构域编号 domain_id	6sjaB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	240 — CRO Repressor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — E6 early regulatory protein

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晶胞边长 a length_a	97.659 Å
晶胞边长 b length_b	132.870 Å
晶胞边长 c length_c	43.025 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	45.830 Å
R 因子 r_factor	0.1606
R_work r_work	0.1590
R_free r_free	0.1905

Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with IRF3 LxxLL motif

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein E6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6sja__assembly_1__model_1

6sja__assembly_1__model_1 | I(q)

6sja__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of HPV16 E6 oncoprotein in complex with IRF3 LxxLL motif

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Interferon regulatory factor 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein E6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6sja__assembly_1__model_1

6sja__assembly_1__model_1 | I(q)

6sja__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)