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6sq9

Crystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and 3-hydroxynaphthalene-2-carboxylic acid

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 59.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]

Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv)

UniProt P9WGR1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–269 未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 BZJ 3-hydroxynaphthalene-2-carboxylic acid × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M sodium acetate 25-30% PEG 400 分辨率 1.75 Å R-free 0.179

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6SQ9 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4BGE Crystal structure of InhA(S94A) mutant in complex with pyridomycin 提交 2013-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A PYW Pyridomycin × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.25 Å R-free 0.278
4BGE Crystal structure of InhA(S94A) mutant in complex with pyridomycin 提交 2013-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
突变：S94A 突变：S94A PYW Pyridomycin × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.25 Å R-free 0.278
4BGE Crystal structure of InhA(S94A) mutant in complex with pyridomycin 提交 2013-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A PYW Pyridomycin × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.25 Å R-free 0.278
4BGI Crystal structure of InhA(S94A) mutant in complex with OH-141 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–269（268 aa）
链 D 2–269（268 aa）
链 E 2–269（268 aa）
链 F 2–269（268 aa）
突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A I4I 3-hydroxy-N-[(2R,5R,6S,9S,10S,11R)-10-hydroxy-5,11-dimethyl-3,7,12-trioxo-2-(propan-2-yl)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododecan-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.09 Å R-free 0.238
4BGI Crystal structure of InhA(S94A) mutant in complex with OH-141 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–269（268 aa）
链 B 2–269（268 aa）
突变：S94A 突变：S94A I4I 3-hydroxy-N-[(2R,5R,6S,9S,10S,11R)-10-hydroxy-5,11-dimethyl-3,7,12-trioxo-2-(propan-2-yl)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododecan-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.09 Å R-free 0.238
4BGI Crystal structure of InhA(S94A) mutant in complex with OH-141 提交 2013-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–269（268 aa）
链 D 2–269（268 aa）
链 E 2–269（268 aa）
链 F 2–269（268 aa）
突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A 突变：S94A I4I 3-hydroxy-N-[(2R,5R,6S,9S,10S,11R)-10-hydroxy-5,11-dimethyl-3,7,12-trioxo-2-(propan-2-yl)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododecan-6-yl]pyridine-2-carboxamide × 1 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 3 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.09 Å R-free 0.238
4QXM Crystal structure of the InhA:GSK_SB713 complex 提交 2014-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 G 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 713 N-(2-chloro-4-fluorobenzyl)-4-[(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-1-yl)methyl]benzamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；291 K；0.1 M N-(2-acetamido)iminodiacetic acid, pH 6.8, 6% v/v DMSO, 16% w/v PEG3350, 0.18 M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.20 Å R-free 0.222
4TZK Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis enoyl reductase (INHA) complexed WITH 1-CYCLOHEXYL-N-(3,5-DICHLOROPHENYL)-5-OXOPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2014-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 641 (3S)-1-CYCLOHEXYL-N-(3,5-DICHLOROPHENYL)-5-OXOPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；8% MPD, 50mM NA citrate pH6.5, 100 mM HEPES pH7.5
分辨率 1.62 Å R-free 0.151
4TZT CRYSTAL STRUCTURE OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ENOYL REDUCTASE (INHA) COMPLEXED WITH N-(3-CHLORO-2-METHYLPHENYL)-1-CYCLOHEXYL- 5-OXOPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE 提交 2014-07-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 468 (3S)-N-(3-CHLORO-2-METHYLPHENYL)-1-CYCLOHEXYL-5-OXOPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；10% MPD, 50mM Na Citrate pH 6.5, 100 mM Hepes pH 7.2
分辨率 1.86 Å R-free 0.168
4U0J Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis enoyl reductase (INHA) complexed with 1-CYCLOHEXYL-5-OXO-N-PHENYLPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE, refined with new ligand restraints 提交 2014-07-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 566 (3S)-1-CYCLOHEXYL-5-OXO-N-PHENYLPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；10% MPD, 50mM Na Citrate pH 6.5, Hepes pH 7.0
分辨率 1.62 Å R-free 0.166
4U0K Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis enoyl reductase complexed with N-(5-chloro-2-methylphenyl)-1-cyclohexyl-5-oxopyrrolidine-3-carboxamide 提交 2014-07-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 744 (3S)-N-(5-CHLORO-2-METHYLPHENYL)-1-CYCLOHEXYL-5-OXOPYRROLIDINE-3-CARBOXAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；6% MPD, 50 mM Na Citrate pH 6.5, 100mM Hepes pH 8.0
分辨率 1.90 Å R-free 0.173
5G0S InhA in complex with a DNA encoded library hit 提交 2016-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 EEH N-[4-[2-[(2S)-4-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-3-oxidanylidene-2-(phenylmethyl)piperazin-1-yl]-2-oxidanylidene-ethyl]cyclohexyl]-2-(3-methyl-1-benzothiophen-2-yl)ethanamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.2
分辨率 1.74 Å R-free 0.186
5G0T InhA in complex with a DNA encoded library hit 提交 2016-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 S72 1-benzyl-N-[cis-4-(2-{[(4-fluorophenyl)methyl][2-(methylamino)-2-oxoethyl]amino}-2-oxoethyl)cyclohexyl]-5-methyl-1H-1,2,3-triazole-4-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.2
分辨率 1.54 Å R-free 0.182
5G0U InhA in complex with a DNA encoded library hit 提交 2016-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9CV 5-[(4-fluoranyl-3-phenoxy-phenyl)methylamino]-~{N}-methyl-6-[(1-pyridin-2-ylpiperidin-4-yl)amino]pyridine-3-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；PH 7.2
分辨率 1.73 Å R-free 0.217
5G0V InhA in complex with a DNA encoded library hit 提交 2016-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 JDD N-[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]-2-(4-pyrazol-1-ylphenyl)-N-(1-pyridin-2-ylpiperidin-4-yl)ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.2
分辨率 1.79 Å R-free 0.188
5JFO Structure of the M.tuberculosis enoyl-reductase InhA in complex with GSK625 提交 2016-04-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 6KA N-{1-[(2-chloro-6-fluorophenyl)methyl]-1H-pyrazol-3-yl}-5-[(1S)-1-(3-methyl-1H-pyrazol-1-yl)ethyl]-1,3,4-thiadiazol-2-amine × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.1 M Sodium malonate, 0.1 M Hepes pH 7.0, 0.5% (v/v) Jeffamine ED-2001 pH 7.0
分辨率 2.91 Å R-free 0.231
5MTQ Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT511 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 G 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XT3 2-[4-[(4-cyclohexyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenoxy]benzenecarbonitrile × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.6 M sodium acetate, pH 7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.213
5MTQ Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT511 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
链 H 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XT3 2-[4-[(4-cyclohexyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenoxy]benzenecarbonitrile × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.6 M sodium acetate, pH 7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.213
5MTR Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT512 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 G 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XT0 2-[4-[(4-cyclopentyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenoxy]benzenecarbonitrile × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M sodium acetate, pH 7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
5MTR Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT512 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
链 H 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XT0 2-[4-[(4-cyclopentyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenoxy]benzenecarbonitrile × 4 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.6 M sodium acetate, pH 7.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.234
5OIC InhA (T2A mutant) complexed with (4-((1H-pyrazol-1-yl)methyl)phenyl)methanol 提交 2017-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–269（267 aa）
突变：T2A NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9VQ [4-(pyrazol-1-ylmethyl)phenyl]methanol × 4 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35-42% Ethoxyethanol and 0.1M Mes pH 6.5 - 6.8. 5% glycerol used as cryoprotectant. Crystals were soaked to obtain ligand complex.
分辨率 1.87 Å R-free 0.182
5OIF InhA (T2A mutant) complexed with 1-benzyl-3-methyl-1H-pyrazol-5-amine 提交 2017-07-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
突变：T2A 突变：T2A NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9W5 5-methyl-2-(phenylmethyl)pyrazol-3-amine × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.17% MPD, 0.3M Mg(NO3)2, 0.1M Tris pH8 and 20% PEG2K Cryo - well soln
分辨率 2.03 Å R-free 0.222
5OIL InhA (T2A mutant) complexed with 1-cyclohexyl-3-(pyridin-3-ylmethyl)urea 提交 2017-07-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
突变：T2A NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9VW 1-cyclohexyl-3-(pyridin-3-ylmethyl)urea × 4 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35-42% Ethoxyethanol and 0.1M Mes pH 6.5-6.8. 5% glycerol used as cryoprotectant. Crystals were soaked to obtain ligand complex.
分辨率 2.76 Å R-free 0.230
5OIM InhA (T2A mutant) complexed with ethyl 2-methyl-4,5,6,7-tetrahydrobenzo[d]thiazole-6-carboxylate 提交 2017-07-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
突变：T2A 9VZ ethyl (6~{R})-2-methyl-4,5,6,7-tetrahydro-1,3-benzothiazole-6-carboxylate × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35-42% Ethoxyethanol and 0.1M Mes pH 6.5-6.8. 5% glycerol used as cryoprotectant. Crystals were soaked to obtain ligand complex.
分辨率 1.91 Å R-free 0.180
5OIN InhA (T2A mutant) complexed with N-(1-(pyrimidin-2-yl)piperidin-4-yl)acetamide 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9W2 ~{N}-(1-pyrimidin-2-ylpiperidin-4-yl)ethanamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35-42% Ethoxyethanol and 0.1M Mes pH 6.5-6.8. 5% glycerol used as cryoprotectant. Crystals were soaked to obtain ligand complex.
分辨率 2.82 Å R-free 0.186
5OIO InhA (T2A mutant) complexed with 5-((3,5-dimethyl-1H-pyrazol-1-yl)methyl)-N-ethyl-1,3,4-thiadiazol-2-amine 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–269（267 aa）
链 B 3–269（267 aa）
突变：T2A 突变：T2A 9VT 5-[(3,5-dimethylpyrazol-1-yl)methyl]-~{N}-ethyl-1,3,4-thiadiazol-2-amine × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35-42% Ethoxyethanol and 0.1M Mes pH 6.5-6.8. 5% glycerol used as cryoprotectant. Crystals were soaked to obtain ligand complex.
分辨率 2.74 Å R-free 0.201
5OIP InhA (T2A mutant) complexed with 1-(Pyridin-3-ylmethyl)-3-(1-(pyrimidin-2-yl)piperidin-4-yl)urea 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–269（267 aa）
突变：T2A NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9WE 1-(pyridin-3-ylmethyl)-3-(1-pyrimidin-2-ylpiperidin-4-yl)urea × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% glycerol, 25% 1,2propanediol, 0.1M PO4. Cryo is well solution
分辨率 1.71 Å R-free 0.173
5OIQ InhA (T2A mutant) complexed with 2,6-dimethyl-3-phenylpyridin-4(1H)-one 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–269（267 aa）
链 B 3–269（267 aa）
链 C 3–269（267 aa）
链 D 3–269（267 aa）
突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 9WB 2,6-dimethyl-3-phenyl-1~{H}-pyridin-4-one × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；0.5M NaCl, 0.1M NaH2PO4 pH 6.8, 15% w/v PEG2K. Cryo - well + 20% glycerol
分辨率 2.65 Å R-free 0.227
5OIR InhA (T2A mutant) complexed with 2,6-Dimethyl-3-(1-(pyrimidin-2-yl)piperidin-4-yl)pyridin-4(1H)-one 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–269（267 aa）
突变：T2A NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9W8 2,6-dimethyl-3-(1-pyrimidin-2-ylpiperidin-4-yl)-1~{H}-pyridin-4-one × 4 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 16 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；35-42% Ethoxyethanol and 0.1M Mes pH 6.5-6.8. 5% glycerol used as cryoprotectant. Crystals were soaked to obtain ligand complex.
分辨率 1.97 Å R-free 0.189
5OIS InhA (T2A mutant) complexed with 4-((5-Amino-3-methyl-1H-pyrazol-1-yl)methyl)-N-(2-chloro-4-fluorobenzyl)benzamide 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 3–269（267 aa）
链 D 3–269（267 aa）
链 F 3–269（267 aa）
链 H 3–269（267 aa）
突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 9WK 4-[(5-azanyl-3-methyl-pyrazol-1-yl)methyl]-~{N}-[(2-chloranyl-4-fluoranyl-phenyl)methyl]benzamide × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；10% PEG6K, 0.1M Bicine pH9. Cryo - well + 25% ethylene glycol
分辨率 2.24 Å R-free 0.189
5OIT InhA (T2A mutant) complexed with 5-((5-Amino-3-methyl-1H-pyrazol-1-yl)methyl)-N-(1-(2-chloro-6-fluorobenzyl)-1H-pyrazol-3-yl)-1,3,4-thiadiazol-2-amine 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
链 H 1–269（269 aa）
突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 突变：T2A 9WH 5-[(5-azanyl-3-methyl-pyrazol-1-yl)methyl]-~{N}-[1-[(2-chloranyl-6-fluoranyl-phenyl)methyl]pyrazol-3-yl]-1,3,4-thiadiazol-2-amine × 4 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Ammonium Sulfate, 30% PEG4K. Cryo - well + 30% ethylene glycol
分辨率 2.58 Å R-free 0.199
5UGS Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT501 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 G 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XT5 5-[(4-cyclopropyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-(2-methylphenoxy)phenol × 5 CL CHLORIDE ION × 6 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris/HCl, pH 8.0; 2.5 M NaCl
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5UGS Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT501 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XT5 5-[(4-cyclopropyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-(2-methylphenoxy)phenol × 4 CL CHLORIDE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1 M Tris/HCl, pH 8.0; 2.5 M NaCl
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5UGT Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT504 提交 2017-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 G 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XTW 2-(2-chloranylphenoxy)-5-[(4-cyclopropyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]phenol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2 M sodium acetate, pH 7.0
分辨率 2.60 Å R-free 0.239
5UGU Crystal structure of M. tuberculosis InhA inhibited by PT506 提交 2017-01-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 XTV 2-[4-[(4-cyclopropyl-1,2,3-triazol-1-yl)methyl]-2-oxidanyl-phenoxy]benzenecarbonitrile × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；2.4 M sodium acetate, pH 7.0
分辨率 1.95 Å R-free 0.212
6EP8 InhA Y158F mutant in complex with NADH from Mycobacterium tuberculosis 提交 2017-10-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
突变：Y158F NA SODIUM ION × 16 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 GOL GLYCEROL × 24 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；287 K；Thrombin cleaved InhA at 10 mg/ml with 3 to 10 mM of NADH was crystallized in a 24-well crystal plate, Combiclover Junior (Jena Bioscience). The best crystals appeared in drops of 2 ul of enzyme solution, 1 ul of the reservoir solution and 1 ul of distilled water. The reservoir solution contained 100 mM HEPES/NaOH pH 7.5, 50 mM sodium citrate pH 6.5, 7-9 % 2-methyl-2,4-pentanediol. Crystals appeared typically within two to three weeks in this condition.
分辨率 1.80 Å R-free 0.175
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Q 53–61（9 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 Z 53–61（9 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 P 53–61（9 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6GH1 HLA-E*01:03 in complex with Mtb44 提交 2018-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 R 53–61（9 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293.5 K；2.4 M Ammonium Sulphate, 0.1 M MES, pH 6
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
6R9W Crystal structure of InhA in complex with AP-124 inhibitor 提交 2019-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 JVZ (2~{S})-1-(benzimidazol-1-yl)-3-(2,3-dihydro-1~{H}-inden-5-yloxy)propan-2-ol × 2 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；17% w/v PEG 4000, 0.1 M ADA pH 6.8, 6 mM DMSO, 0.1 M ammonium acetate, 1% glycerol, 4.5 mM NAD
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6R9W Crystal structure of InhA in complex with AP-124 inhibitor 提交 2019-04-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；292.15 K；17% w/v PEG 4000, 0.1 M ADA pH 6.8, 6 mM DMSO, 0.1 M ammonium acetate, 1% glycerol, 4.5 mM NAD
分辨率 1.75 Å R-free 0.227
6SQ5 Crystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and 3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]prop-2-enoic acid 提交 2019-09-03 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 LRW (~{E})-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]prop-2-enoic acid × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M sodium acetate 25-30% PEG 400
分辨率 1.84 Å R-free 0.182
6SQ7 Crystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and 2-(4-chloro-3-nitrobenzoyl)benzoic acid 提交 2019-09-03 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 9FN 2-(4-chloranyl-3-nitro-phenyl)carbonylbenzoic acid × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M sodium acetate 25-30% PEG 400
分辨率 1.76 Å R-free 0.164
6SQB Crystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and 3-(3-chlorophenyl)propanoic acid 提交 2019-09-03 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 LSQ 3-(3-chlorophenyl)propanoic acid × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M sodium acetate 25-30% PEG 400
分辨率 1.77 Å R-free 0.174
6SQD Crystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and 2-pyrazol-1-ylbenzoic acid 提交 2019-09-03 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 LT8 2-pyrazol-1-ylbenzoic acid × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M sodium acetate 25-30% PEG 400
分辨率 1.72 Å R-free 0.180
6SQL Crystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and N-(3-(aminomethyl)phenyl)-5-chloro-3-methylbenzo[b]thiophene-2-sulfonamide 提交 2019-09-04 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 LTK ~{N}-[3-(aminomethyl)phenyl]-5-chloranyl-3-methyl-1-benzothiophene-2-sulfonamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M sodium acetate 25-30% PEG 400
分辨率 2.35 Å R-free 0.204
6ZKW Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E bound to InhA (53-61) 提交 2020-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 53–61（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M TRIS pH 8.5, 25 % (w/v) PEG 4000, 15 % Glycerol
分辨率 2.26 Å R-free 0.287
6ZKX Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E (Y84C) bound to InhA (53-61 GCG) 提交 2020-06-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 53–64（12 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25% (w/v) PEG 4000, 15% Glycerol
分辨率 2.17 Å R-free 0.244
6ZKY Crystal structure of InhA:01 TCR in complex with HLA-E (S147C) bound to InhA (53-61 H3C) 提交 2020-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 53–61（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293.15 K；0.1 M Sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5, 1.5 M Ammonium sulfate
分辨率 2.65 Å R-free 0.273
7E48 Crystal structure of InhA in complex with 3-nitropropanoic acid inhibitor 提交 2021-02-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 3NP 3-NITROPROPANOIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8.5；293 K；Purified protein incubated with NADH and 3NP in 5% (w/v) ethanol, 5% (w/v) MPD, 200mM sodium chloride, 100mM Tris-HCl pH 8.5
分辨率 2.50 Å R-free 0.220
8OTL structure of InhA from Mycobacterium tuberculosis in complex with 5-(((4-(2-hydroxyphenoxy)benzyl)(octyl)amino)methyl)-2-phenoxyphenol 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；285 K；14 % PEG 4000 100 mM ADA 100 mM acetate ammonium, pH 6.8, 5 % DMSO
分辨率 2.11 Å R-free 0.237
8OTL structure of InhA from Mycobacterium tuberculosis in complex with 5-(((4-(2-hydroxyphenoxy)benzyl)(octyl)amino)methyl)-2-phenoxyphenol 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 VZE 5-[[octyl-[[4-(2-oxidanylphenoxy)phenyl]methyl]amino]methyl]-2-phenoxy-phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；285 K；14 % PEG 4000 100 mM ADA 100 mM acetate ammonium, pH 6.8, 5 % DMSO
分辨率 2.11 Å R-free 0.237
8OTM structure of InhA from mycobacterium tuberculosis in complex with N-((1-(3-hydroxy-4-phenoxybenzyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl)-2-oxo-2H-chromene-3-carboxamide 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 VZI 2-oxidanylidene-~{N}-[[1-[(3-oxidanyl-4-phenoxy-phenyl)methyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methyl]chromene-3-carboxamide × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 5 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；285 K；14 % PEG 4000 100 mM ADA 100 mM acetate ammonium, pH 6.8, 5 % DMSO
分辨率 1.60 Å R-free 0.177
8OTN structure of InhA from mycobacterium tuberculosis in complex with inhibitor 7-((1-(3-Hydroxy-4-phenoxybenzyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methoxy)-4-methyl-2H-chromen-2-one 提交 2023-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 NAD NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 4 VZR 4-methyl-7-[[1-[(3-oxidanyl-4-phenoxy-phenyl)methyl]-1,2,3-triazol-4-yl]methoxy]chromen-2-one × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；14 % PEG 4000 100 mM ADA 100 mM ammonium acetate 5 % DMSO pH 6.8
分辨率 1.96 Å R-free 0.233
9RJG Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin (compound 1) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 PYW Pyridomycin × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；InhA at 4-8 mg/ml 30% (v/v) PEG 300 0.1 M MES
分辨率 1.71 Å R-free 0.194
9RJG Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin (compound 1) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 PYW Pyridomycin × 4 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；InhA at 4-8 mg/ml 30% (v/v) PEG 300 0.1 M MES
分辨率 1.71 Å R-free 0.194
9RJH Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin-derivative KV26a (compound 4) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 A1JGW ~{N}-[(5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-2-oxidanyl-benzamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；Inh4 4-8 mg/ml 30% PEG 550 MME 0.1 M NaCl 0.1 M Bicine
分辨率 1.71 Å R-free 0.198
9RJH Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin-derivative KV26a (compound 4) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 A1JGW ~{N}-[(5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-2-oxidanyl-benzamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；Inh4 4-8 mg/ml 30% PEG 550 MME 0.1 M NaCl 0.1 M Bicine
分辨率 1.71 Å R-free 0.198
9RJI Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin-derivative KV29a (compound 5) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 A1JG1 ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-oxidanyl-pyridine-3-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；30% PEG 550 MME 0.1 M NaCl 0.1 M Bicine
分辨率 1.77 Å R-free 0.235
9RJI Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin-derivative KV29a (compound 5) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 A1JG1 ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-oxidanyl-pyridine-3-carboxamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；30% PEG 550 MME 0.1 M NaCl 0.1 M Bicine
分辨率 1.77 Å R-free 0.235
9RJJ Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV37a (compound 9) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 A1JG0 ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-2,3-bis(oxidanyl)benzamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；30% PEG 550 MME 0.1 M NaCl 0.1 M Bicine
分辨率 2.08 Å R-free 0.218
9RJJ Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV37a (compound 9) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 A1JG0 ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-2,3-bis(oxidanyl)benzamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；30% PEG 550 MME 0.1 M NaCl 0.1 M Bicine
分辨率 2.08 Å R-free 0.218
9RJK Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV41a (compound 11) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 A1JG3 ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-3-fluoranyl-2-oxidanyl-benzamide × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；30% (v/v) PEG 300 0.1 M MES
分辨率 1.66 Å R-free 0.205
9RJL Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV35a (compound 12) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 A1JGY ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-chloranyl-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；0.1 M NaCl 0.1 M Bicine 30 % PEGMME 550
分辨率 1.70 Å R-free 0.216
9RJL Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV35a (compound 12) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 A1JGY ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-chloranyl-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；0.1 M NaCl 0.1 M Bicine 30 % PEGMME 550
分辨率 1.70 Å R-free 0.216
9RJM Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative EP196 (compound 13) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
未记录 A1JGX ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-fluoranyl-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；0.1 MES 0.1 MgCl2 30 % PEG 400
分辨率 1.99 Å R-free 0.227
9RJM Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative EP196 (compound 13) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
链 E 1–269（269 aa）
链 F 1–269（269 aa）
未记录 A1JGX ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-fluoranyl-3-oxidanyl-pyridine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；0.1 MES 0.1 MgCl2 30 % PEG 400
分辨率 1.99 Å R-free 0.227
9RJN Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV32a (compound 14) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 A1JGZ ~{N}-[(2~{Z},5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-3-oxidanyl-pyrazine-2-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 MES 30% PEG 400
分辨率 2.50 Å R-free 0.250
9RJP Structure of Mycobacterium tuberculosis InhA in complex with pyridomycin derivative KV25a (compound 15) 提交 2025-06-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–269（269 aa）
链 B 1–269（269 aa）
链 C 1–269（269 aa）
链 D 1–269（269 aa）
未记录 A1JG2 ~{N}-[(5~{R},6~{S},9~{S},10~{S},11~{R})-2-butan-2-ylidene-5,11-dimethyl-10-oxidanyl-3,7,12-tris(oxidanylidene)-9-(pyridin-3-ylmethyl)-1,4-dioxa-8-azacyclododec-6-yl]-4-oxidanyl-1,2,5-thiadiazole-3-carboxamide × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES 30 % PEG 300
分辨率 2.15 Å R-free 0.232

共 52 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 INHA_MYCTU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–270； UniProt 1–269

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6sq9

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6sq9
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6sq9
沉积日期 deposition_date2019-09-03
结构标题 titleCrystal structure of M. tuberculosis InhA in complex with NAD+ and 3-hydroxynaphthalene-2-carboxylic acid
关键词 keywordsInhA, NADH-dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.99 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.88 Å
零角强度 I(0) i015529400.00
分子量 molecular_weight29466.0 kDa
排除体积 excluded_volume36839 ų
包络体积 envelope_volume42262 ų
水化壳体积 shell_volume19415 ų
包络直径 envelope_diameter61.1 Å
壳层 Rg shell_rg24.52 Å
包络 Rg envelope_rg18.20 Å
形状 Rg shape_rg17.91 Å
总 Rg total_rg18.77 Å
总原子数 total_atoms2068
残基数 n_residues268
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax59.3 Å
Rg (实空间) rg_real18.87 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real1.5530e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.7900e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.89 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal15530000.0000
解质量估计 total_estimate0.8956
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.7 Å
偏度 Skewness skewness0.154
峰度 Kurtosis kurtosis-0.394
角度范围 angular_range— – 0.4200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha3495000.0000
实空间数据点数 n_real_points73
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.887; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.991; Smooth: 0.985
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6sq9a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.2 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
超家族 Superfamily superfamilyc.2.1 — NAD(P)-binding Rossmann-fold domains
家族 Family familyc.2.1.2 — Tyrosine-dependent oxidoreductases

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id6sq9A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)