6tyl

Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 131.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans)

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–491	突变：Y232F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Nanobody A × 1 Nanobody B × 1 Nanobody C × 1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 × 1 （P10824）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate	分辨率 3.30 Å R-free 0.287
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–491	突变：Y232F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Nanobody A × 1 Nanobody B × 1 Nanobody C × 1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 × 1 （P10824）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate	分辨率 3.30 Å R-free 0.287

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6TYL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6NMG Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain 提交 2019-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–452（452 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
6NMG Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain 提交 2019-01-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–452（452 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
6NMJ Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain, "Paratone-N Immersed" 提交 2019-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–452（452 aa）	突变：F232Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris	分辨率 2.30 Å R-free 0.259
6NMJ Crystal Structure of Rat Ric-8A G alpha binding domain, "Paratone-N Immersed" 提交 2019-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–452（452 aa）	突变：F232Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25-30% PEG3350, 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris	分辨率 2.30 Å R-free 0.259
6UKT Cryo-EM structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-10-05	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–491（491 aa）	突变：Y232F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
6VU8 Structure of G-alpha-i bound to its chaperone Ric-8A 提交 2020-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–530（530 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.14 Å
8ALH X-ray structure of human NCS-1 bound to Ric-8A 提交 2022-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 400–429（30 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 3 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；30 % PEG 4000, 100 mM sodium acetate pH 4.6, 100 mM magnesium chloride	分辨率 1.86 Å R-free 0.231

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B1H241_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–492； UniProt 1–491 作者链 F； PDB构建体 2–492； UniProt 1–491

Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1

Rattus norvegicus

UniProt P10824

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–354	未记录	Resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans) × 1 （B1H241） Nanobody A × 1 Nanobody B × 1 Nanobody C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate	分辨率 3.30 Å R-free 0.287
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 1–354	未记录	Resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans) × 1 （B1H241） Nanobody A × 1 Nanobody B × 1 Nanobody C × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；285 K；1.2-1.4M Sodium Malonate	分辨率 3.30 Å R-free 0.287

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6TYL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AGR COMPLEX OF ALF4-ACTIVATED GI-ALPHA-1 WITH RGS4 提交 1997-03-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA-1	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；THE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING PEG 10000 AS THE PRECIPITANT AND SODIUM CITRATE PH 5.3 AS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
1AGR COMPLEX OF ALF4-ACTIVATED GI-ALPHA-1 WITH RGS4 提交 1997-03-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–353（353 aa）片段：ALPHA-1	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；THE COMPLEX WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING PEG 10000 AS THE PRECIPITANT AND SODIUM CITRATE PH 5.3 AS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.80 Å R-free 0.291
1AS0 GTP-GAMMA-S BOUND G42V GIA1 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：G42V	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；THE PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING 4M (NH4)2SO3 AS THE PRECIPITANT. 50 MM HEPES, PH 8.0, 10 MM MGSO4, 10 MM DTT AND 0.2 MM GTP-GAMMA-S WAS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.00 Å R-free 0.259
1AS2 GDP+PI BOUND G42V GIA1 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：G42V	PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；THE PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING 3M (NH4)H2P04 AS THE PRECIPITANT (PH 5.6). 50 MM HEPES, PH 8.0, 10 MM MGSO4, 10 MM DTT AND 5 MM GDP WAS THE BUFFER, vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.80 Å R-free 0.250
1AS3 GDP BOUND G42V GIA1 提交 1997-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：G42V	SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；THE PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN HANGING DROPS USING 4M (NH4)2SO3 AS THE PRECIPITANT. 50 MM HEPES, PH 8.0, 10 MM MGSO4, 10 MM DTT AND 5 MM GDP WAS THE BUFFER., vapor diffusion - hanging drop	分辨率 2.40 Å R-free 0.274
1BH2 A326S MUTANT OF AN INHIBITORY ALPHA SUBUNIT 提交 1998-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 31–345（315 aa）	突变：A326S	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M SODIUM ACETATE, PH 6.0, 2.0-2.1 M AMMONIUM SULFITE	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
1BOF GI-ALPHA-1 BOUND TO GDP AND MAGNESIUM 提交 1998-08-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
1CIP GI-ALPHA-1 SUBUNIT OF GUANINE NUCLEOTIDE-BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH A GTP ANALOGUE 提交 1999-04-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–354（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；PROTEIN BOUND TO GPPNHP WAS CRYSTALLIZED IN 1.8-2.0M (NH4)2SO3, 100MM SODIUM ACETATE, H 6.0, 1MM MGSO4, 1MM GPPNHP, AND 5MM DTT. PRIOR TO DATA COLLECTION CRYSTALS WERE TRANSFERED TO 2.0M LI2SO4, 1MM GPPNHP, 3MM DTT, 1MM MGSO4, 100MM BES, PH 7.0, AND 15% GLYCEROL. CRYSTALS WERE FLASH FROZEN IN LIQUID PROPANE.	分辨率 1.50 Å R-free 0.235
1FQJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTRIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, THE GAMMA SUBUNIT OF PHOSPHODIESTERASE AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(PDEGAMMA)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；15.0% PEG8000, 200mM Tris pH9.0, 0.2% beta-ME, 1mM (NH4)2WS4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.02 Å R-free 0.265
1FQJ CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETEROTRIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, THE GAMMA SUBUNIT OF PHOSPHODIESTERASE AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(PDEGAMMA)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；277 K；15.0% PEG8000, 200mM Tris pH9.0, 0.2% beta-ME, 1mM (NH4)2WS4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.02 Å R-free 0.265
1FQK CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% PEG8000, 110mM magnesium acetate, 50mM Tris pH 8.5, 0.2% beta-ME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.268
1FQK CRYSTAL STRUCTURE OF THE HETERODIMERIC COMPLEX OF THE RGS DOMAIN OF RGS9, AND THE GT/I1 CHIMERA ALPHA SUBUNIT [(RGS9)-(GT/I1ALPHA)-(GDP)-(ALF4-)-(MG2+)] 提交 2000-09-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 residues 26-215 and 295-350 linked via UNP P10824 residues 220-298	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10.5% PEG8000, 110mM magnesium acetate, 50mM Tris pH 8.5, 0.2% beta-ME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.268
1GDD TERTIARY AND QUATERNARY STRUCTURAL CHANGES IN GIA1 INDUCED BY GTP HYDROLYSIS 提交 1995-07-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.291
1GFI STRUCTURES OF ACTIVE CONFORMATIONS OF GI ALPHA 1 AND THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1994-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.20 Å R-free 0.284
1GG2 G PROTEIN HETEROTRIMER MUTANT GI_ALPHA_1(G203A) BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA 1	突变：CHAIN A, G203A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.289
1GIA STRUCTURE OF ACTIVE CONFORMATIONS OF GIA1 AND THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1994-07-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
1GIL STRUCTURE OF ACTIVE CONFORMATIONS OF GIA1 AND THE MECHANISM OF GTP HYDROLYSIS 提交 1995-01-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.30 Å R-free 0.302
1GIT STRUCTURE OF GTP-BINDING PROTEIN 提交 1996-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA 1	突变：G203A	PO4 PHOSPHATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.279
1GP2 G PROTEIN HETEROTRIMER GI_ALPHA_1 BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–353（353 aa）片段：ALPHA 1	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
1SHZ Crystal Structure of the p115RhoGEF rgRGS Domain in A Complex with Galpha(13):Galpha(i1) Chimera 提交 2004-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–47（27 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 A 185–210（26 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 A 213–230（18 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 A 240–353（114 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
1SHZ Crystal Structure of the p115RhoGEF rgRGS Domain in A Complex with Galpha(13):Galpha(i1) Chimera 提交 2004-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–47（27 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 185–210（26 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 213–230（18 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 240–353（114 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
1SHZ Crystal Structure of the p115RhoGEF rgRGS Domain in A Complex with Galpha(13):Galpha(i1) Chimera 提交 2004-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 21–47（27 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 A 185–210（26 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 A 213–230（18 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 A 240–353（114 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 21–47（27 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 185–210（26 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 213–230（18 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13) 链 D 240–353（114 aa）片段：residues 21-47, 185-210, 213-230, 240-353 of Galpha(i1) and residues 64-207, 234-235, 254-262 of Galpha(13)	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；289 K；Ammonium Sulfate, Tris, Ethylene glycol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K	分辨率 2.85 Å R-free 0.297
1SVK Structure of the K180P mutant of Gi alpha subunit bound to AlF4 and GDP 提交 2004-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：K180P	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；293.16 K；Ammonium Sulphite, Sodium Acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.16K, pH 6.50	分辨率 2.00 Å R-free 0.239
1SVS Structure of the K180P mutant of Gi alpha subunit bound to GppNHp. 提交 2004-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–353（353 aa）	突变：K180P	MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293.16 K；Ammonium Sulphite, Sodium Acetate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.16K	分辨率 1.50 Å R-free 0.209
2BCJ Crystal Structure of G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Galpha-q and Gbetagamma Subunits 提交 2005-10-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 1–28（28 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG8000, 1M NaCl, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.06 Å R-free 0.292
2RGN Crystal Structure of p63RhoGEF complex with Galpha-q and RhoA 提交 2007-10-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–28（28 aa）片段：;Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353,Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353 ;	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM HEPES pH 6.5, 14.5% PEG 3350, 400 mM KCl. Drops were microseeded to obtain large crystals, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.299
2RGN Crystal Structure of p63RhoGEF complex with Galpha-q and RhoA 提交 2007-10-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–28（28 aa）片段：;Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353,Chimeric protein of rat Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 N-terminal helix residues 1-28 and mouse Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha residues 31-353 ;	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；100 mM HEPES pH 6.5, 14.5% PEG 3350, 400 mM KCl. Drops were microseeded to obtain large crystals, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.50 Å R-free 0.299
2ZJY Structure of the K349P mutant of Gi alpha 1 subunit bound to ALF4 and GDP 提交 2008-03-11	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：K349P	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.260
2ZJZ Structure of the K349P mutant of Gi alpha 1 subunit bound to GDP 提交 2008-03-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–354（354 aa）链 B 1–354（354 aa）	突变：K349P 突变：K349P	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；pH 8.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.282
3AH8 Structure of heterotrimeric G protein Galpha-q beta gamma in complex with an inhibitor YM-254890 提交 2010-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–28（27 aa）片段：UNP entry P10824 residues 2-28, UNP entry P21279 residues 37-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.1；293 K；7% PEG 4000, 30% (v/v) glycerol, 70 mM acetate-NaOH, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.315
3D7M Crystal Structure of the G Protein Fast-Exchange Double Mutant I56C/Q333C 提交 2008-05-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：I56C, Q333C	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；16% PEG 3350, 0.24 M Li(CH3COO), 0.1 M Bis-Tris, 0.01 M SrCl2, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.90 Å R-free 0.294
3FFA Crystal Structure of a fast activating G protein mutant 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 33–348（316 aa）	突变：T329A	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；100 mM Sodium Acetate pH 5.9-6.3, 1.8-2.1 M Ammonium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K, pH 6.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.252
3FFB Gi-alpha-1 mutant in GDP bound form 提交 2008-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 6–354（349 aa）	突变：T329A	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；100 mM Sodium Acetate pH 5.9-6.3, 1.8-2.1 M Ammonium Sulphate, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K, pH 6.0	分辨率 2.57 Å R-free 0.226
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298 链 C 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N 突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
3V00 Studies of a constitutively active G-alpha subunit provide insights into the mechanism of G protein activation. 提交 2011-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 220–298（79 aa）片段：UNP P04695 1-215 & 295-350, UNP P10824 220-298	突变：G56P, K244H and D247N	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；295 K；1.9 M Ammonium Sulphate in 0.05 M Sodium Cacodylate buffer, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.90 Å R-free 0.272
4N0D Crystal structure of the K345L variant of the Gi alpha1 subunit bound to GTPgammaS 提交 2013-10-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：K345L	SO3 SULFITE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2.2 M ammonium sulfite, pH 8.0, 20 mM magnesium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.55 Å R-free 0.187
4N0E Crystal structure of the K345L variant of the Gi alpha1 subunit bound to GDP 提交 2013-10-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：K345L	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；2.0 ammonium sulfite, pH 8.0, 5 mM MgSO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.220
4PAM A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336C	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO3 SULFITE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.10 Å R-free 0.218
4PAN A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336Y	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SO3 SULFITE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.40 Å R-free 0.232
4PAO A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336C	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4PAQ A conserved phenylalanine as relay between the 5 helix and the GDP binding region of heterotrimeric G protein 提交 2014-04-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：F336Y	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；(NH4)2SO3, Sodium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.207
5KDL Crystal structure of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit bound to GTPgammaS 提交 2016-06-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；12-16 % polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether, 18% 2-propanol and 100 mM MES (pH 6.0)	分辨率 2.67 Å R-free 0.265
5KDL Crystal structure of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit bound to GTPgammaS 提交 2016-06-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–354（354 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；12-16 % polyethylene glycol (PEG) 2000 monomethyl ether, 18% 2-propanol and 100 mM MES (pH 6.0)	分辨率 2.67 Å R-free 0.265
5KDO Heterotrimeric complex of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit and the Gbeta1-Ggamma1 提交 2016-06-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；19-24 % PEG 8000, 1-5% 2-propanolol, 1% OG, 100 mM HEPES (pH 7.0) and 100 mM NaOAc (pH 6.4)	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
6M8H Crystal Structure of the R208Q mutant of G(i) subunit alpha-1 提交 2018-08-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–354（354 aa）	突变：R208Q	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；297 K；2.0 M (NH4)2SO3 pH 8.0	分辨率 2.07 Å R-free 0.197
6UKT Cryo-EM structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex 提交 2019-10-05	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 32–354（323 aa）片段：UNP residues 32-354	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.87 Å
6VMS Structure of a D2 dopamine receptor-G-protein complex in a lipid membrane 提交 2020-01-28	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–354（354 aa）	未记录	08Y bromoergocryptine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7S0F Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi protein 提交 2021-08-30	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：G203A	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.96 Å
7S0G Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi/s chimera protein 提交 2021-08-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–343（343 aa）	突变：G203A	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
9CBL Cryo-EM structure of epinephrine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：G203A	ALE L-EPINEPHRINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9CBM Cryo-EM structure of dexmedetomidine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–354（354 aa）	突变：G203A	CZX 4-[(1~{S})-1-(2,3-dimethylphenyl)ethyl]-1~{H}-imidazole × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å

共 43 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GNAI1_RAT
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354 作者链 G； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6tyl
沉积日期 deposition_date	2019-08-09
结构标题 title	Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex
关键词 keywords	Ric-8A, G protein, GEF, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.27 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	41.47 Å
零角强度 I(0) i0	788212000.00
分子量 molecular_weight	226900.0 kDa
排除体积 excluded_volume	282730 Å³
包络体积 envelope_volume	406090 Å³
水化壳体积 shell_volume	78777 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.8 Å
壳层 Rg shell_rg	48.89 Å
包络 Rg envelope_rg	41.04 Å
形状 Rg shape_rg	41.45 Å
总 Rg total_rg	41.91 Å
总原子数 total_atoms	15938
残基数 n_residues	2017
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	131.1 Å
Rg (实空间) rg_real	42.03 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.12 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.8820e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5500e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	788400000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8874
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	56.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.100
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.425
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	70330000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.903; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.963; Smooth: 0.862

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans)
分子量 formula_weight	55836.9 kDa
突变 mutation	Y232F
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F
原子数 atom_count	15938

GMEPRAVADALETGEEDAVTEALRSFNREHSQSFTFDDAQQEDRKRLAKLLVSVLEQGLSPKHRVTWLQTIRILSRDRSCLDSFASRQSLHALACYADIAISEEPIPQPPDMDVLLESLKCLCNLVLSSPTAQMLAAEARLVVRLAERVGLYRKRSYPHEVQFFDLRLLFLLTALRTDVRQQLFQELHGVRLLTDALELTLGVAPKENPLVILPAQETERAMEILKVLFNITFDSVKREVDEEDAALYRYLGTLLRHCVMADAAGDRTEEFHGHTVNLLGNLPLKCLDVLLALELHEGSLEFMGVNMDVINALLAFLEKRLHQTHRLKECVAPVLSVLTECARMHRPARKFLKAQVLPPLRDVRTRPEVGDLLRNKLVRLMTHLDTDVKRVAAEFLFVLCSESVPRFIKYTGYGNAAGLLAARGLMAGGRPEGQYSEDEDTDTEEYREAKASINPVTGRVEEKPPNPMEGMTEEQKEHEAMKLVNMFDKLSR

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Nanobody A
分子量 formula_weight	13609.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H

QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGIIFRSNGMAWYRQAPGKEREWVASITSFGDAIYRDSVKGRFTISRDNARNAVSLQTNSLKTEDTAVYYCNTYPVNSAWGQGTQVTVSSHHHHHHEPEA

来源 Source

来源生物 organism	Lama glama
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9844
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Nanobody B
分子量 formula_weight	14247.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J

QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGIVHISSMGWFRQAPGKQRELVATSPSNGDIRYADSVKGRFTLSRDNAKNTVSLQMNSLEPEDTAVYYCHSFLRHTASASYNNYYGQGTQVTVSSHHHHHHEPEA

来源 Source

来源生物 organism	Lama glama
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9844
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Nanobody C
分子量 formula_weight	14894.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,I

QVQLQESGGGLEQAGDSLRLSCAASGLIVSNYAMGWFRQAPGKEREFVAYINWNGGVTYYTNSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCARTSRASVTTRVADFGYWGQGTQVTVSSHHHHHHEPEA

来源 Source

来源生物 organism	Lama glama
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9844
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1
分子量 formula_weight	40399.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,G

MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAGYSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDAARADDARQLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6tylA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

结构域编号 domain_id	6tylF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich Repeat Variant
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Leucine-rich Repeat Variant

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	93.048 Å
晶胞边长 b length_b	144.726 Å
晶胞边长 c length_c	114.420 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.66 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	39.530 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2480
R_free r_free	0.2870

fit	/app/data/saxs_computation/ty/6tyl/6tyl.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ty/6tyl/6tyl.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ty/6tyl/6tyl.dat

Crystal structure of mammalian Ric-8A:Galpha(i):nanobody complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)