Human immunodeficiency virus type 1 group M subtype B (isolate NY5)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | SULFATE ION × 6 ;(2S)-2-[2-(cyclohexylcarbamoylamino)-3,6-dimethyl-5-(5-methyl-3,4-dihydro-2H-chromen-6-yl)pyridin-4-yl]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxy]ethanoic acid ; × 2 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | POL_HV1N5 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–166； UniProt 1197–1359 |
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| 条目编号 entry_id | 7d83 |
| 沉积日期 deposition_date | 2020-10-07 |
| 结构标题 title | Crystal structure of HIV-1 integrase catalytic core domain in complex with 2-(tert-butoxy)-2-(2-(3-cyclohexylureido)-3,6-dimethyl-5-(5-methylchroman-6-yl)pyridin-4-yl)acetic acid |
| 关键词 keywords | HIV-1 Integrase, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.22 Å |
| Rg（电子密度） | 17.93 Å |
| 总 Rg | 19.00 Å |
| 原子数 | 2282 |
| 残基数 | 274 |
| 排除体积 | 40956 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d7d83a_ |
| 类 Class class | c — Alpha and beta proteins (a/b) |
| 折叠类型 Fold fold | c.55 — Ribonuclease H-like motif |
| 超家族 Superfamily superfamily | c.55.3 — Ribonuclease H-like |
| 家族 Family family | c.55.3.2 — Retroviral integrase, catalytic domain |