7e1x

Cryo-EM structure of hybrid respiratory supercomplex consisting of Mycobacterium tuberculosis complexIII and Mycobacterium smegmatis complexIV in presence of TB47

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R057_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341 作者链 Q； PDB构建体 1–341； UniProt 1–341

Cytochrome c oxidase subunit 3

物种未注明

UniProt A0R049

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R049_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203 作者链 S； PDB构建体 1–203； UniProt 1–203

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

物种未注明

UniProt A0R056

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R056_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139 作者链 T； PDB构建体 1–139； UniProt 1–139

Cytochrome c oxidase subunit CtaJ

物种未注明

UniProt A0R1B6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0R1B6_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79 作者链 U； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

物种未注明

UniProt A0R1B5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Y4692_MYCS2
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157 作者链 V； PDB构建体 1–157； UniProt 1–157

Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit

Mycobacterium tuberculosis H37Rv

UniProt P9WP37

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	QCRB_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–549； UniProt 1–549 作者链 N； PDB构建体 1–549； UniProt 1–549

Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit

Mycobacterium tuberculosis H37Rv

UniProt P9WH23

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit × 2 （P9WP35） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	QCRA_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429 作者链 M； PDB构建体 1–429； UniProt 1–429

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

Mycobacterium tuberculosis H37Rv

UniProt P9WP35

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 2 （A0R057） Cytochrome c oxidase subunit 1 × 2 Cytochrome c oxidase subunit 3 × 2 （A0R049） Cytochrome c oxidase polypeptide 4 × 2 （A0R056） Cytochrome c oxidase subunit CtaJ × 2 （A0R1B6） Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575 × 2 （A0R1B5） Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1 × 2 Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit × 2 （P9WP37） Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit × 2 （P9WH23） COPPER (II) ION × 8 CARDIOLIPIN × 17 PALMITIC ACID × 4 HEME-A × 4 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 MENAQUINONE-9 × 8 5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide × 2 FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ; × 4 HEME C × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	QCRC_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–280； UniProt 2–280 作者链 O； PDB构建体 2–280； UniProt 2–280

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7e1x
沉积日期 deposition_date	2021-02-03
结构标题 title	Cryo-EM structure of hybrid respiratory supercomplex consisting of Mycobacterium tuberculosis complexIII and Mycobacterium smegmatis complexIV in presence of TB47
关键词 keywords	Mycobacterium smegmatis, mycobacterium tuberculosis, complexIII, complexIV, electron transport, anti-TB drugs, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7e1x__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7e1x__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7e1x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.82 Å
Rg（电子密度）	65.69 Å
总 Rg	65.42 Å
原子数	42679
残基数	5132
排除体积	778540 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7e1x__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 2
分子量 formula_weight	38077.5 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,Q
原子数 atom_count	42679

MTPRGFRVVALSIVLGGSALLLSGCSWSDALALGWPTGITPEAKLNRELWIGSVIASFAVGAIVWGLIFWTSAFHRKKATDTELPRQFGYNMPLELTLTVIPFLIISVLFYFTVVVQERMMHKDPNPEVVIDVTAFQWNWKFGYQKIAFADGSFDYDGADPERKEAMTSRPEGKDEHGIEKVGPIRGMTPEDRTYLNFDKIETLGTSSEIPVLVLPAGKRIEFVLNSADVIHGFWVPEFLFKRDVLPEPKANNSDNVFQVSEIQQTGAFVGRCTEMCGTFHAMMNFEVRVVEPNDFKAYIDQRNAGKTNAEALAAINQPPLAITTEPFESRRGELVPQASK

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	64163.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,R

MVAEAPPIGELEARRPFPERMGPKGNLIYKLITTTDHKLIGIMYCVVCFAFFLVGGLMALFMRTELAMPGLQFLSNEQFNQLFTMHGTVMLLFYATPIVFGFANLVLPLQIGAPDVAFPRLNALSFWLFLFGALIAIAGFITPGGAADFGWTAYSPLTDAIHSPGAGGDLWIMGLAVGGLGTILGGVNMITTVVCMRAPGMTMFRMPIFTWNILVTSILVLIAFPILTAALFGLAADRHLGAHIYDPANGGVLLWQHLFWFFGHPEVYIIALPFFGIVSEIFPVFSRKPIFGYTTLIYATLAIAALSVAVWAHHMYATGAVLLPFFSFMTFLIAVPTGIKFFNWIGTMWKGQLTFETPMLFSVGFLITFLLGGLSGVLLASPPLDFHVTDSYFVIAHFHYVLFGTIVFATYAGIYFWFPKMTGRLLDERLGKLHFWLTFIGFHTTFLVQHWLGDEGMPRRYADYLPTDGFTTLNVISTVGAFILGVSMLPFVWNVFKSWRYGEPVTVDDPWGYGNSLEWATSCPPPRHNFTELPRIRSERPAFELHYPHMVERMRAEAHVGRAHHPELETADKSS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 3
分子量 formula_weight	22196.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,S

MTSAVGTSGTAITSRVHSLNRPNMVSVGTIVWLSSELMFFAGLFAMYFTARAQAGGAWPPEPTELNLALAVPVTLVLIASSFTCQMGVFAAERGDVFGLRRWYVITFLMGLFFVLGQGYEYIHLVEHGTTIPGSAYGSVFYLATGFHGLHVIGGLVAFVLLLARTKMSKFTPAQATAAIVVSYYWHFVDIVWIALFATIYFVR

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase polypeptide 4
分子量 formula_weight	15177.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,T

MHIEARLFEILTAFFALAAVVYAVLTAMFATGGVEWAGTTALVLTTGLTLITGTFFRFVARRLDTRPEDYEDAEISDGAGELGFFAPHSWWPILISLSFSTAAVGAALWLPWLIAAGVAFVITSVCGLVFEYYWGPEKH

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit CtaJ
分子量 formula_weight	8365.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,U

MSTALTHGLIGGVPLVLFAVLALIFLTRKGPHPDTYKMSDPWTHAPILWAAEEPREHGHGGHGHDSHGVVIGGGASGKW

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575
分子量 formula_weight	15911.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,V

MASGDIATVANAELDLPYGSALTSSGRISAVTEPGELSVHYPFPTMDLVVLDDALKYGSRAAKARFAVYIGPLGADTAATAREILANVPTPENAVLLAVSPDQRAIEVVYGADVKGRGIESAAPLGVSAAAASFKEGNLIDGLISAVRVMSAGVSPA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Prokaryotic respiratory supercomplex associate factor 1 PRSAF1
分子量 formula_weight	11329.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,P

MSSTQDRSQLDPEEQPVANTEVERHTGVDVEDVPSAEWGWSHMPIGVMHIGGLLSAAFLLVMMRGNHVGHVEDWFLIGFAAVIVALVGRNWWLRRRGWIR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit
分子量 formula_weight	61077.1 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,B

MSPKLSPPNIGEVLARQAEDIDTRYHPSAALRRQLNKVFPTHWSFLLGEIALYSFVVLLITGVYLTLFFDPSMVDVTYNGVYQPLRGVEMSRAYQSALDISFEVRGGLFVRQIHHWAALMFAAAIMVHLARIFFTGAFRRPRETNWVIGSLLLILAMFEGYFGYSLPDDLLSGLGLRAALSSITLGMPVIGTWLHWALFGGDFPGTILIPRLYALHILLLPGIILALIGLHLALVWFQKHTQFPGPGRTEHNVVGVRVMPVFAFKSGAFFAAIVGVLGLMGGLLQINPIWNLGPYKPSQVSAGSQPDFYMMWTEGLARIWPPWEFYFWHHTIPAPVWVAVIMGLVFVLLPAYPFLEKRFTGDYAHHNLLQRPRDVPVRTAIGAMAIAFYMVLTLAAMNDIIALKFHISLNATTWIGRIGMVILPPFVYFITYRWCIGLQRSDRSVLEHGVETGIIKRLPHGAYIELHQPLGPVDEHGHPIPLQYQGAPLPKRMNKLGSAGSPGSGSFLFADSAAEDAALREAGHAAEQRALAALREHQDSIMGSPDGEH

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis H37Rv
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis MC2 51

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit
分子量 formula_weight	46976.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,A

MSRADDDAVGVPPTCGGRSDEEERRIVPGPNPQDGAKDGAKATAVPREPDEAALAAMSNQELLALGGKLDGVRIAYKEPRWPVEGTKAEKRAERSVAVWLLLGGVFGLALLLIFLFWPWEFKAADGESDFIYSLTTPLYGLTFGLSILSIAIGAVLYQKRFIPEEISIQERHDGASREIDRKTVVANLTDAFEGSTIRRRKLIGLSFGVGMGAFGLGTLVAFAGGLIKNPWKPVVPTAEGKKAVLWTSGWTPRYQGETIYLARATGTEDGPPFIKMRPEDMDAGGMETVFPWRESDGDGTTVESHHKLQEIAMGIRNPVMLIRIKPSDLGRVVKRKGQESFNFGEFFAFTKVCSHLGCPSSLYEQQSYRILCPCHQSQFDALHFAKPIFGPAARALAQLPITIDTDGYLVANGDFVEPVGPAFWERTTT

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis H37Rv
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis MC2 51

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit
分子量 formula_weight	29152.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,C

LTKLGFTRSGGSKSGRTRRRLRRRLSGGVLLLIALTIAGGLAAVLTPTPQVAVADESSSALLRTGKQLFDTSCVSCHGANLQGVPDHGPSLIGVGEAAVYFQVSTGRMPAMRGEAQAPRKDPIFDEAQIDAIGAYVQANGGGPTVVRNPDGSIATQSLRGNDLGRGGDLFRLNCASCHNFTGKGGALSSGKYAPDLAPANEQQILTAMLTGPQNMPKFSNRQLSFEAKKDIIAYVKVATEARQPGGYLLGGFGPAPEGMAMWIIGMVAAIGLALWIGARS

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis H37Rv
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83332
宿主生物 host_organism	Mycolicibacterium smegmatis MC2 51

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	PALMITIC ACID
分子量 formula_weight	256.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	HEME-A
分子量 formula_weight	852.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	(2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate
分子量 formula_weight	718.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	MENAQUINONE-9
分子量 formula_weight	785.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	5-methoxy-2-methyl-~{N}-[[4-[4-[4-(trifluoromethyloxy)phenyl]piperidin-1-yl]phenyl]methyl]pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxamide
分子量 formula_weight	538.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
分子量 formula_weight	175.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	;(2R)-2-(hexadecanoyloxy)-3-{[(S)-hydroxy{[(1R,2R,3R,4R,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentahydroxycyclohexyl]oxy}phosphoryl]oxy}propyl (9S)-9-methyloctadecanoate ;
分子量 formula_weight	853.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	HEME C
分子量 formula_weight	618.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	7e1xB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C

结构域编号 domain_id	7e1xF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	7e1xG01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Cytochrome c oxidase, subunit III, four-helix bundle

结构域编号 domain_id	7e1xN01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C

结构域编号 domain_id	7e1xR01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	7e1xS01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Cytochrome c oxidase, subunit III, four-helix bundle

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.930 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.93 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	169988

Cryo-EM structure of hybrid respiratory supercomplex consisting of Mycobacterium tuberculosis complexIII and Mycobacterium smegmatis complexIV in presence of TB47

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase polypeptide 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit CtaJ

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Uncharacterized protein MSMEG_4692/MSMEI_4575

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome b subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex Rieske iron-sulfur subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome bc1 complex cytochrome c subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7e1x__assembly_1__model_1

7e1x__assembly_1__model_1 | I(q)

7e1x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer