7kd4

Structure of the C-terminal domain of the Menangle virus phosphoprotein (residues 329 -388), fused to MBP. Space group P21.

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 115.1 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltodextrin-binding protein and Phosphoprotein fusion protein

Menangle virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 3–372	突变：C352S	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.15 K；1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, Crystals were transferred into the following cryo-protective solution before vitrification: 1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, 5mM Maltose, 1 M Lithium sulfate	分辨率 1.31 Å R-free 0.196
2	信息不足单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 3–372	突变：C352S	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.15 K；1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, Crystals were transferred into the following cryo-protective solution before vitrification: 1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, 5mM Maltose, 1 M Lithium sulfate	分辨率 1.31 Å R-free 0.196

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7KD4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6XDJ Crystal Structure Analysis of MBP-SIN3 提交 2020-06-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–360（358 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.0, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6XDJ Crystal Structure Analysis of MBP-SIN3 提交 2020-06-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–360（358 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.0, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6XDJ Crystal Structure Analysis of MBP-SIN3 提交 2020-06-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–360（358 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.0, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
6XDJ Crystal Structure Analysis of MBP-SIN3 提交 2020-06-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–360（358 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris, pH 6.0, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
7FBB De novo design protein D12 with MBP tag 提交 2021-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 6–372（367 aa）	突变：D84A, K85A, E174A, N175A, K241A, E361A, K364A, D365A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；25% PEG 3350, 0.1M Sodium Acetate	分辨率 2.31 Å R-free 0.264
7FBB De novo design protein D12 with MBP tag 提交 2021-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 6–372（367 aa）	突变：D84A, K85A, E174A, N175A, K241A, E361A, K364A, D365A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；25% PEG 3350, 0.1M Sodium Acetate	分辨率 2.31 Å R-free 0.264
7FBC De novo design protein D22 with MBP tag 提交 2021-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–371（369 aa）	突变：D84A,K85A,E174A,N175A,K241A,E361A,K364A,D365A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.24；289 K；50% v/v PEG 500 MME, 0.1M Sodium HEPES, pH 7.24	分辨率 1.85 Å R-free 0.215
7FBD De novo design protein D53 with MBP tag 提交 2021-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–371（369 aa）	突变：D84A,K85A,E174A,N175A,K241A,E361A,K364A,D365A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2.2M Sodium malonate pH 7.0	分辨率 2.85 Å R-free 0.277
7FBD De novo design protein D53 with MBP tag 提交 2021-07-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–371（369 aa）	突变：D84A,K85A,E174A,N175A,K241A,E361A,K364A,D365A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；289 K；2.2M Sodium malonate pH 7.0	分辨率 2.85 Å R-free 0.277
7KD5 Structure of the C-terminal domain of the Menangle virus phosphoprotein (residues 329 -388), fused to MBP. Space group P212121 提交 2020-10-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–372（370 aa）	突变：C352S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PIN PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) × 3 PRO PROLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；291.15 K；20%(w/v) PEG 5000 mono-methyl ether, 0.2 M Pipes/KOH pH 6.7, 0.1M Proline, Crystals were transferred into the following cryo-protective solution before vitrification: 20%(w/v) PEG 5000 mono-methyl ether, 0.2 M Pipes/KOH pH 6.7, 0.1M Proline, 5mM Maltose, 20%(v/v) Ethylene Glycol	分辨率 1.55 Å R-free 0.189
7VN2 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning ATCACGTGAT 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.42 Å R-free 0.248
7VN2 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning ATCACGTGAT 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.42 Å R-free 0.248
7VN3 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning CACACGTGTG 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）链 D 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 1.94 Å R-free 0.231
7VN3 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning CACACGTGTG 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）链 B 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 1.94 Å R-free 0.231
7VN4 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning TCCACGTGGA 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）链 D 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
7VN4 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning TCCACGTGGA 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）链 B 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
7VN5 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning TTCACGTGAA 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）链 D 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10%	分辨率 1.95 Å R-free 0.244
7VN5 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning TTCACGTGAA 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）链 B 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10%	分辨率 1.95 Å R-free 0.244
7VN6 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning CGCACGTGCG 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）链 D 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.79 Å R-free 0.266
7VN6 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning CGCACGTGCG 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）链 B 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.79 Å R-free 0.266
7VN7 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning GACACGTGTC 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）链 D 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.11 Å R-free 0.244
7VN7 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning GACACGTGTC 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）链 B 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.11 Å R-free 0.244
7VN8 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning GTCACGTGAC 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–370（368 aa）链 D 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.04 Å R-free 0.240
7VN8 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-90) in complex with double-stranded DNA contaning GTCACGTGAC 提交 2021-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–370（368 aa）链 B 3–370（368 aa）	突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A 突变：D82A,K83A,E172A,N173A,K239A,E359A,K362A,D363A	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.04 Å R-free 0.240
8DX4 Clostridioides difficile R20291 minor pilin - PilW fused with Maltose Binding Protein 提交 2022-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–372（370 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；Hepes, Cesium Chloride, PEG 3350, n-Octyl-beta-D-glucoside, Sodium Chloride, ethanol	分辨率 2.49 Å R-free 0.218
8DX4 Clostridioides difficile R20291 minor pilin - PilW fused with Maltose Binding Protein 提交 2022-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–372（370 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；Hepes, Cesium Chloride, PEG 3350, n-Octyl-beta-D-glucoside, Sodium Chloride, ethanol	分辨率 2.49 Å R-free 0.218
8DX4 Clostridioides difficile R20291 minor pilin - PilW fused with Maltose Binding Protein 提交 2022-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 3–372（370 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；Hepes, Cesium Chloride, PEG 3350, n-Octyl-beta-D-glucoside, Sodium Chloride, ethanol	分辨率 2.49 Å R-free 0.218
8DX4 Clostridioides difficile R20291 minor pilin - PilW fused with Maltose Binding Protein 提交 2022-08-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 3–372（370 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；278 K；Hepes, Cesium Chloride, PEG 3350, n-Octyl-beta-D-glucoside, Sodium Chloride, ethanol	分辨率 2.49 Å R-free 0.218
8G3S MBP-Mcl1 in complex with ligand 11 提交 2023-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	FMT FORMIC ACID × 2 YLT (1'S,3aS,5R,16R,17S,19E,21S,21aR)-6'-chloro-21-methoxy-16,17-dimethyl-2,3,3',3a,4',16,17,18,21,21a-decahydro-2'H,6H,8H-15lambda~6~-spiro[10,12-etheno-15lambda~6~-furo[3,2-i][1,4]oxazepino[3,4-f][1,2,7]thiadiazacyclohexadecine-7,1'-naphthalene]-13,15,15(4H,14H)-trione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；0.17 M Mg Formate, 25.00% (w/v) PEG3350	分辨率 1.40 Å R-free 0.194
8G3T MBP-Mcl1 in complex with ligand 12 提交 2023-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	FMT FORMIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 YLK (1'S,3aS,5R,16R,17S,19Z,21R,21aR)-6'-chloro-20-fluoro-21-methoxy-16,17-dimethyl-2,3,3',3a,4',16,17,18,21,21a-decahydro-2'H,6H,8H-15lambda~6~-spiro[10,12-etheno-15lambda~6~-furo[3,2-i][1,4]oxazepino[3,4-f][1,2,7]thiadiazacyclohexadecine-7,1'-naphthalene]-13,15,15(4H,14H)-trione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；0.17M Mg Formate, 23.5% (w/v) PEG3350	分辨率 1.83 Å R-free 0.233
8G3U MBP-Mcl1 in complex with ligand 21 提交 2023-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 YKT (1'S,3aS,5R,16R,17S,19Z,21R,21aR)-6'-chloro-20-fluoro-21-{[(5S,9aS)-hexahydropyrazino[2,1-c][1,4]oxazin-8(1H)-yl]methyl}-21-methoxy-16,17-dimethyl-2,3,3',3a,4',16,17,18,21,21a-decahydro-2'H,6H,8H-15lambda~6~-spiro[10,12-(ethanediylidene)-15lambda~6~-furo[3,2-i][1,4]oxazepino[3,4-f][1,2,7]thiadiazacyclohexadecine-7,1'-naphthalene]-13,15,15(4H,14H)-trione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；0.11 M Mg Formate, 19.0% (w/v) PEG3350	分辨率 1.94 Å R-free 0.238
8G3W MBP-Mcl1 in complex with ligand 28 提交 2023-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 YKX N-[(1'S,3aS,5R,15S,17S,19Z,21R,21aR)-6'-chloro-20-fluoro-21-methoxy-17-methyl-13,15-dioxo-2,3,3',3a,4,4',13,16,17,18,21,21a-dodecahydro-2'H,6H,8H-15lambda~6~-spiro[10,12-(ethanediylidene)-15lambda~6~-furo[3,2-i][1,4]oxazepino[3,4-f][1,2,7]thiadiazacyclohexadecine-7,1'-naphthalen]-15-yl]-3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；19% (w/v) PEG3350, 0.05 M Mg Formate	分辨率 1.78 Å R-free 0.226
8G3X MBP-Mcl1 in complex with ligand 32 提交 2023-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 YLF N-[(1'S,3aS,5R,15S,17S,19Z,21R,21aR)-6'-chloro-20-fluoro-21-{[(5S,9aS)-hexahydropyrazino[2,1-c][1,4]oxazin-8(1H)-yl]methyl}-21-methoxy-17-methyl-13,15-dioxo-2,3,3',3a,4,4',13,16,17,18,21,21a-dodecahydro-2'H,6H,8H-15lambda~6~-spiro[10,12-(ethanediylidene)-15lambda~6~-furo[3,2-i][1,4]oxazepino[3,4-f][1,2,7]thiadiazacyclohexadecine-7,1'-naphthalen]-15-yl]-3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；20.5% (w/v) PEG3350, 0.11M Mg formate	分辨率 1.46 Å R-free 0.206
8G3Y MBP-Mcl1 in complex with ligand 34 提交 2023-02-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 YKL N-[(1'S,3aS,5R,15S,17S,19Z,21S,21aR)-6'-chloro-20-fluoro-21-{[(5S,9aS)-hexahydropyrazino[2,1-c][1,4]oxazin-8(1H)-yl]methyl}-21-methoxy-17-methyl-13,15-dioxo-2,3,3',3a,4,4',13,16,17,18,21,21a-dodecahydro-2'H,6H,8H-15lambda~6~-spiro[10,12-(ethanediylidene)-15lambda~6~-furo[3,2-i][1,4]oxazepino[3,4-f][1,2,7]thiadiazacyclohexadecine-7,1'-naphthalen]-15-yl]-3-methoxy-1-methyl-1H-pyrazole-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；25% (w/v) PEG3350, 0.11M Mg formate	分辨率 1.70 Å R-free 0.216
8R2O Huntingtin-Q17, 1-66, N-MBP fusion 提交 2023-11-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–372（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；293 K；0.8 M KH2PO4, 0.8 M NaH2PO4, and 0.1 M TRIS/HCl pH 8.25	分辨率 3.23 Å R-free 0.238
8R2O Huntingtin-Q17, 1-66, N-MBP fusion 提交 2023-11-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 3–372（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；293 K；0.8 M KH2PO4, 0.8 M NaH2PO4, and 0.1 M TRIS/HCl pH 8.25	分辨率 3.23 Å R-free 0.238
8R3E Huntingtin, 1-17, MBP-N 提交 2023-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 3–372（370 aa）链 B 3–372（370 aa）链 C 3–372（370 aa）链 D 3–372（370 aa）链 E 3–372（370 aa）链 F 3–372（370 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；20% (w/v) PEG 6K, 0.24 M Na2 malonate, 10mM ZnCl2 and 0.1 M MES-NaOH, pH6.0	分辨率 2.91 Å R-free 0.329
8ZLW Crystal Structure of RDGC IQ motif/dCaM Complex 提交 2024-05-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 3–371（369 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；2 % v/v Tacsimate pH 4.0, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6, 16 % w/v PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.254
9GRY Cryo-EM structure of human SLC35B1-Q113F variant with AMP-PNP 提交 2024-09-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–370（369 aa）	未记录	ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9GS3 Cryo-EM structure of human SLC35B1-E33A variant with ADP in inward facing conformation 提交 2024-09-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–370（369 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
9I20 Cryo-EM structure of human SLC35B1 with ADP 提交 2025-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–370（369 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
9M73 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-104) in complex with double-stranded DNA contaning CACATATGTG 提交 2025-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–371（369 aa）链 D 3–371（369 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.31 Å R-free 0.245
9M73 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-104) in complex with double-stranded DNA contaning CACATATGTG 提交 2025-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–371（369 aa）链 B 3–371（369 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM potassium chloride, 10 mM magnesium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.31 Å R-free 0.245
9M74 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-104) in complex with double-stranded DNA contaning CACAGCTGTG 提交 2025-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 C 3–371（369 aa）链 D 3–371（369 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.23 Å R-free 0.244
9M74 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 (21-104) in complex with double-stranded DNA contaning CACAGCTGTG 提交 2025-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 3–371（369 aa）链 B 3–371（369 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM sodium cacodylate pH 6.5, 200 mM ammonium acetate and 10 mM calcium chloride and 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000	分辨率 2.23 Å R-free 0.244
9PW7 Myeloid cell leukemia-1 (Mcl-1) complexed with compound 13 提交 2025-08-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–368（367 aa）	未记录	A1CL6 (2S,4R,5S,12P,23R)-11-chloro-7-[3-(4-chloro-3,5-dimethylphenoxy)propyl]-27,28-dimethoxy-4,15-dimethyl-32-oxo-19-oxa-2,5,15,16,23-pentaazaheptacyclo[21.6.1.1~2,6~.1~5,8~.0~12,31~.0~13,17~.0~26,30~]dotriaconta-1(30),6,8(31),9,11,13,16,24,26,28-decaene-24-carboxylic acid (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；25-30% PEG3350, 0.1 M Bis-TRIS pH 6.5, 0.2 M MgCl2	分辨率 1.95 Å R-free 0.223

共 28 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A4P1LXE0_SERSF
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–371； UniProt 3–372 作者链 B； PDB构建体 2–371； UniProt 3–372

Maltodextrin-binding protein and Phosphoprotein fusion protein

Menangle virus

UniProt Q91MK1

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 329–388	突变：C352S	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.15 K；1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, Crystals were transferred into the following cryo-protective solution before vitrification: 1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, 5mM Maltose, 1 M Lithium sulfate	分辨率 1.31 Å R-free 0.196
2	信息不足单体蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 329–388	突变：C352S	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291.15 K；1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, Crystals were transferred into the following cryo-protective solution before vitrification: 1.65 M Ammonium sulphate, 0.2M Malic acid/KOH pH 5.5, 5mM Maltose, 1 M Lithium sulfate	分辨率 1.31 Å R-free 0.196

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7KD4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4KYC Structure of the C-terminal domain of the Menangle virus phosphoprotein, fused to MBP. 提交 2013-05-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 339–388（50 aa）片段：unprot P0AEX9 residues 27-392, unprot Q91MK1 residues 339-388	突变：E172A, N173A, E359A, K362A, D363A, C352S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 BO3 BORIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.1；291.15 K；24 %(w/v) PEG8000, 0.2 M Boric acid/KOH, pH 9.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291.15K	分辨率 1.95 Å R-free 0.213
7KD5 Structure of the C-terminal domain of the Menangle virus phosphoprotein (residues 329 -388), fused to MBP. Space group P212121 提交 2020-10-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 329–388（60 aa）	突变：C352S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PIN PIPERAZINE-N,N'-BIS(2-ETHANESULFONIC ACID) × 3 PRO PROLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；291.15 K；20%(w/v) PEG 5000 mono-methyl ether, 0.2 M Pipes/KOH pH 6.7, 0.1M Proline, Crystals were transferred into the following cryo-protective solution before vitrification: 20%(w/v) PEG 5000 mono-methyl ether, 0.2 M Pipes/KOH pH 6.7, 0.1M Proline, 5mM Maltose, 20%(v/v) Ethylene Glycol	分辨率 1.55 Å R-free 0.189

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q91MK1_9MONO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 372–431； UniProt 329–388 作者链 B； PDB构建体 372–431； UniProt 329–388

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7kd4
沉积日期 deposition_date	2020-10-08
结构标题 title	Structure of the C-terminal domain of the Menangle virus phosphoprotein (residues 329 -388), fused to MBP. Space group P21.
关键词 keywords	Paramyxovirus, Pararubulavirus, RNA-dependent RNA polymerase, Viral protein; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	34.19 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	34.08 Å
零角强度 I(0) i0	142914000.00
分子量 molecular_weight	96086.0 kDa
排除体积 excluded_volume	120280 Å³
包络体积 envelope_volume	152620 Å³
水化壳体积 shell_volume	39016 Å³
包络直径 envelope_diameter	119.1 Å
壳层 Rg shell_rg	38.97 Å
包络 Rg envelope_rg	33.85 Å
形状 Rg shape_rg	34.06 Å
总 Rg total_rg	34.50 Å
总原子数 total_atoms	6754
残基数 n_residues	862
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	115.1 Å
Rg (实空间) rg_real	34.37 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.12 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4290e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.5140e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	34.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	142900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8611
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	32.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.480
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.392
角度范围 angular_range	— – 0.2300 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	61740000.0000
实空间数据点数 n_real_points	47
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.809; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.926; Smooth: 0.838

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Maltodextrin-binding protein and Phosphoprotein fusion protein
分子量 formula_weight	47132.5 kDa
突变 mutation	C352S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	8463

MKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPAAAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTNAAAKSSAASPAALSGYKMTLLALIKESIPNQAKRQKFEMQVGGIRNEQDFKNLRREIIRSAAQ

来源 Source

来源生物 organism	Menangle virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	152219
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1321

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	57.561 Å
晶胞边长 b length_b	70.074 Å
晶胞边长 c length_c	111.739 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	96.47 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.312 Å
最低分辨率 resolution_low	59.329 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1498
R_free r_free	0.1957

fit	/app/data/saxs_computation/kd/7kd4/7kd4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/kd/7kd4/7kd4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/kd/7kd4/7kd4.dat

Structure of the C-terminal domain of the Menangle virus phosphoprotein (residues 329 -388), fused to MBP. Space group P21.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltodextrin-binding protein and Phosphoprotein fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Maltodextrin-binding protein and Phosphoprotein fusion protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)