7kif

Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 transcription factor

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

Mycobacterium tuberculosis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPOA_MYCTA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 B； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

Mycobacterium tuberculosis

UniProt A5U052

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPOB_MYCTA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–1172； UniProt 6–1177

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

Mycobacterium tuberculosis

UniProt A0A045J9E2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A045J9E2_MYCTX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 3–1318； UniProt 1–1316

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

Mycobacterium tuberculosis

UniProt A0A0T9N9K3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0T9N9K3_MYCTX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–110； UniProt 40–149

RNA polymerase sigma factor SigA

Mycobacterium tuberculosis

UniProt A0A0H3LGM9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0H3LGM9_MYCTE
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–528； UniProt 3–530

RNA polymerase-binding protein RbpA

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P9WHJ4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBPA_MYCTO
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111

RNA polymerase-binding transcription factor CarD

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P9WJG2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 Probable transcriptional regulator WhiB7 × 1 （Q6MX01） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CARD_MYCTO
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

Probable transcriptional regulator WhiB7

Mycobacterium tuberculosis

UniProt Q6MX01

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 9 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （A0A045J9E2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A0T9N9K3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （A0A0H3LGM9） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2） DNA (63-MER) × 1 DNA (55-MER) × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	WHB7A_MYCTU
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7kif
沉积日期 deposition_date	2020-10-23
结构标题 title	Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 transcription factor
关键词 keywords	RNA polymerase, Transcription factor, Mycobacterium tuberculosis, Iron cluster, TRANSCRIPTION, TRANSFERASE-DNA complex; TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7kif__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7kif__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7kif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	53.65 Å
Rg（电子密度）	52.44 Å
总 Rg	52.70 Å
原子数	30322
残基数	3710
排除体积	530940 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7kif__assembly_1__model_1`	undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha
分子量 formula_weight	37745.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	30322

MLISQRPTLSEDVLTDNRSQFVIEPLEPGFGYTLGNSLRRTLLSSIPGAAVTSIRIDGVLHEFTTVPGVKEDVTEIILNLKSLVVSSEEDEPVTMYLRKQGPGEVTAGDIVPPAGVTVHNPGMHIATLNDKGKLEVELVVERGRGYVPAVQNRASGAEIGRIPVDSIYSPVLKVTYKVDATRVEQRTDFDKLILDVETKNSISPRDALASAGKTLVELFGLARELNVEAEGIEIGPSPAEADHIASFALPIDDLDLTVRSYNCLKREGVHTVGELVARTESDLLDIRNFGQKSIDEVKIKLHQLGLSLKDSPPSFDPSEVAGYDVATGTWSTEGAYDEQDYAETEQL

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	129372.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

LADSRQSKTAASPSPSRPQSSSNNSVPGAPNRVSFAKLREPLEVPGLLDVQTDSFEWLIGSPRWRESAAERGDVNPVGGLEEVLYELSPIEDFSGSMSLSFSDPRFDDVKAPVDECKDKDMTYAAPLFVTAEFINNNTGEIKSQTVFMGDFPMMTEKGTFIINGTERVVVSQLVRSPGVYFDETIDKSTDKTLHSVKVIPSRGAWLEFDVDKRDTVGVRIDRKRRQPVTVLLKALGWTSEQIVERFGFSEIMRSTLEKDNTVGTDEALLDIYRKLRPGEPPTKESAQTLLENLFFKEKRYDLARVGRYKVNKKLGLHVGEPITSSTLTEEDVVATIEYLVRLHEGQTTMTVPGGVEVPVETDDIDHFGNRRLRTVGELIQNQIRVGMSRMERVVRERMTTQDVEAITPQTLINIRPVVAAIKEFFGTSQLSQFMDQNNPLSGLTHKRRLSALGPGGLSRERAGLEVRDVHPSHYGRMCPIETPEGPNIGLIGSLSVYARVNPFGFIETPYRKVVDGVVSDEIVYLTADEEDRHVVAQANSPIDADGRFVEPRVLVRRKAGEVEYVPSSEVDYMDVSPRQMVSVATAMIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPLVRSEAPLVGTGMELRAAIDAGDVVVAEESGVIEEVSADYITVMHDNGTRRTYRMRKFARSNHGTCANQCPIVDAGDRVEAGQVIADGPCTDDGEMALGKNLLVAIMPWEGHNYEDAIILSNRLVEEDVLTSIHIEEHEIDARDTKLGAEEITRDIPNISDEVLADLDERGIVRIGAEVRDGDILVGKVTPKGETELTPEERLLRAIFGEKAREVRDTSLKVPHGESGKVIGIRVFSREDEDELPAGVNELVRVYVAQKRKISDGDKLAGRHGNKGVIGKILPVEDMPFLADGTPVDIILNTHGVPRRMNIGQILETHLGWCAHSGWKVDAAKGVPDWAARLPDELLEAQPNAIVSTPVFDGAQEAELQGLLSCTLPNRDGDVLVDADGKAMLFDGRSGEPFPYPVTVGYMYIMKLHHLVDDKIHARSTGPYSMITQQPLGGKAQFGGQRFGEMECWAMQAYGAAYTLQELLTIKSDDTVGRVKVYEAIVKGENIPEPGIPESFKVLLKELQSLCLNVEVLSSDGAAIELREGEDEDLERAAANLGINLSRNESASVEDLA

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;
分子量 formula_weight	147097.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GAMLDVNFFDELRIGLATAEDIRQWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCEKIFGPTRDWECYCGKYKRVRFKGIICERCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAPVTHIWYFKGVPSRLGYLLDLAPKDLEKIIYFAAYVITSVDEEMRHNELSTLEAEMAVERKAVEDQRDGELEARAQKLEADLAELEAEGAKADARRKVRDGGEREMRQIRDRAQRELDRLEDIWSTFTKLAPKQLIVDENLYRELVDRYGEYFTGAMGAESIQKLIENFDIDAEAESLRDVIRNGKGQKKLRALKRLKVVAAFQQSGNSPMGMVLDAVPVIPPELRPMVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLIDLGAPEIIVNNEKRMLQESVDALFDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSDLLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPQLKLHQCGLPKLMALELFKPFVMKRLVDLNHAQNIKSAKRMVERQRPQVWDVLEEVIAEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPMLVEGKAIQLHPLVCEAFNADFDGDQMAVHLPLSAEAQAEARILMLSSNNILSPASGRPLAMPRLDMVTGLYYLTTEVPGDTGEYQPASGDHPETGVYSSPAEAIMAADRGVLSVRAKIKVRLTQLRPPVEIEAELFGHSGWQPGDAWMAETTLGRVMFNELLPLGYPFVNKQMHKKVQAAIINDLAERYPMIVVAQTVDKLKDAGFYWATRSGVTVSMADVLVPPRKKEILDHYEERADKVEKQFQRGALNHDERNEALVEIWKEATDEVGQALREHYPDDNPIITIVDSGATGNFTQTRTLAGMKGLVTNPKGEFIPRPVKSSFREGLTVLEYFINTHGARKGLADTALRTADSGYLTRRLVDVSQDVIVREHDCQTERGIVVELAERAPDGTLIRDPYIETSAYARTLGTDAVDEAGNVIVERGQDLGDPEIDALLAAGITQVKVRSVLTCATSTGVCATCYGRSMATGKLVDIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHQGGVGEDITGGLPRVQELFEARVPRGKAPIADVTGRVRLEDGERFYKITIVPDDGGEEVVYDKISKRQRLRVFKHEDGSERVLSDGDHVEVGQQLMEGSADPHEVLRVQGPREVQIHLVREVQEVYRAQGVSIHDKHIEVIVRQMLRRVTIIDSGSTEFLPGSLIDRAEFEAENRRVVAEGGEPAAGRPVLMGITKASLATDSWLSAASFQETTRVLTDAAINCRSDKLNGLKENVIIGKLIPAGTGINRYRNIAVQPTEEARAAAYTIPSYEDQYYSPDFGAATGAAVPLDDYGYSDYR

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit omega
分子量 formula_weight	11819.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

VSISQSDASLAAVPAVDQFDPSSGASGGYDTPLGITNPPIDELLDRVSSKYALVIYAAKRARQINDYYNQLGEGILEYVGPLVEPGLQEKPLSIALREIHADLLEHTEGE

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	RNA polymerase sigma factor SigA
分子量 formula_weight	57845.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

VAATKASTATDEPVKRTATKSPAASASGAKTGAKRTAAKSASGSPPAKRATKPAARSVKPASAPQDTTTSTIPKRKTRAAAKSAAAKAPSARGHATKPRAPKDAQHEAATDPEDALDSVEELDAEPDLDVEPGEDLDLDAADLNLDDLEDDVAPDADDDLDSGDDEDHEDLEAEAAVAPGQTADDDEEIAEPTEKDKASGDFVWDEDESEALRQARKDAELTASADSVRAYLKQIGKVALLNAEEEVELAKRIEAGLYATQLMTELSERGEKLPAAQRRDMMWICRDGDRAKNHLLEANLRLVVSLAKRYTGRGMAFLDLIQEGNLGLIRAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAMADQARTIRIPVHMVEVINKLGRIQRELLQDLGREPTPEELAKEMDITPEKVLEIQQYAREPISLDQTIGDEGDSQLGDFIEDSEAVVAVDAVSFTLLQDQLQSVLDTLSEREAGVVRLRFGLTDGQPRTLDEIGQVYGVTRERIRQIESKTMSKLRHPSRSQVLRDYLD

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	RNA polymerase-binding protein RbpA
分子量 formula_weight	12993.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MADRVLRGSRLGAVSYETDRNHDLAPRQIARYRTDNGEEFEVPFADDAEIPGTWLCRNGMEGTLIEGDLPEPKKVKPPRTHWDMLLERRSIEELEELLKERLELIRSRRRG

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	RNA polymerase-binding transcription factor CarD
分子量 formula_weight	17933.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MIFKVGDTVVYPHHGAALVEAIETRTIKGEQKEYLVLKVAQGDLTVRVPAENAEYVGVRDVVGQEGLDKVFQVLRAPHTEEPTNWSRRYKANLEKLASGDVNKVAEVVRDLWRRDQERGLSAGEKRMLAKARQILVGELALAESTDDAKAETILDEVLAAAS

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA (63-MER)
分子量 formula_weight	30844.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	O

CTGTACCGGCAAACGCGCAGGTCAGAAAATCGGTTGTGGTCAGCTGCTGCCACCGGTTAACCTCCAGGTCGCATTCTGCTGCCAGCCTGGAGATGGCATT

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA (55-MER)
分子量 formula_weight	30862.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	P

AATGCCATCTCCAGGCTGGCAGCAGAATGCGACCTGGAGGTTAACCGGTGGCAGCAGCTGACCACAACCGATTTTCTGACCTGCGCGTTTGCCGGTACAG

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Probable transcriptional regulator WhiB7
分子量 formula_weight	10153.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MSVLTVPRQTPRQRLPVLPCHVGDPDLWFADTPAGLEVAKTLCVSCPIRRQCLAAALQRAEPWGVWGGEIFDQGSIVSHKRPRGRPRKDAVA

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	7kifB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain

结构域编号 domain_id	7kifD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3

结构域编号 domain_id	7kifD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.94 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	87743

Mycobacterium tuberculosis WT RNAP transcription open promoter complex with WhiB7 transcription factor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase sigma factor SigA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase-binding protein RbpA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase-binding transcription factor CarD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable transcriptional regulator WhiB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7kif__assembly_1__model_1

7kif__assembly_1__model_1 | I(q)

7kif__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer