Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–721 链 B; UniProt 1–721 | 突变:I587V | Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.00 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7L7G | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3JUI Crystal Structure of the C-terminal Domain of Human Translation Initiation Factor eIF2B epsilon Subunit 提交 2009-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
548–721(174 aa)
片段:C-terminal Domain
|
突变:E678G 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7.7;289 K;PEG8000, Calcium acetate, Sodium Cocadylate, pH 7.7, vapor diffusion, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 6CAJ Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B from Homo sapiens 提交 2018-01-31 | 突变/修饰不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6EZO Eukaryotic initiation factor EIF2B in complex with ISRIB 提交 2017-11-16 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6K71 eIF2 - eIF2B complex 提交 2019-06-05 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 6K72 eIF2(aP) - eIF2B complex 提交 2019-06-05 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 6O81 Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to translation initiation factor 2 from Homo sapiens 提交 2019-03-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 6O85 Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to eukaryotic translation initiation factor 2 from Homo sapiens 提交 2019-03-08 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | C7B 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 6O9Z Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to eukaryotic translation initiation factor 2 from Homo sapiens 提交 2019-03-15 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 7D43 eIF2B-eIF2(aP), aPg complex 提交 2020-09-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7D44 eIF2B-eIF2(aP), aP2 complex 提交 2020-09-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7D45 eIF2B-eIF2(aP), aP1 complex 提交 2020-09-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7D46 eIF2B apo 提交 2020-09-22 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7F64 eIF2B-SFSV NSs 提交 2021-06-24 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.42 Å |
| 7F66 eIF2B-SFSV NSs-1-eIF2 提交 2021-06-24 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.76 Å |
| 7F67 eIF2B-SFSV NSs-2-eIF2 提交 2021-06-24 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 7KMF Sugar phosphate activation of the stress sensor eIF2B 提交 2020-11-02 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 B
1–721(721 aa)
链 I
1–721(721 aa)
|
未记录 | F6P 6-O-phosphono-beta-D-fructofuranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;Prior to grid preparation, the protein mixture was diluted with 25 mM HEPES, 100 mM KCl, 2 mM 446 MgCl2, 1 mM DTT, pH 7.5 to
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.91 Å |
| 7L70 The eukaryotic translation initiation factor 2B from Homo sapiens in its apo form 提交 2020-12-24 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7RLO Structure of the human eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF2B) in complex with a viral protein NSs 提交 2021-07-26 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 7TRJ The eukaryotic translation initiation factor 2B from Homo sapiens with a H160D mutation in the beta subunit 提交 2022-01-29 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7VLK eIF2B-SFSV NSs C2-imposed 提交 2021-10-04 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.27 Å |
| 8TQO Eukaryotic translation initiation factor 2B tetramer 提交 2023-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8TQZ Eukaryotic translation initiation factor 2B with a mutation (L516A) in the delta subunit 提交 2023-08-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–721(721 aa)
链 B
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9HVD Native human P-eIF2-eIF2B complex 提交 2024-12-27 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9HVE Native human eIF2-eIF2B complex 提交 2024-12-27 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 9QC6 Structure of eIF2B decamer bound to (P)eIF2 alpha and Compound A-(S) 提交 2025-03-04 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric |
链 I
1–721(721 aa)
链 J
1–721(721 aa)
|
未记录 | A1I5O ~{N}-[(1~{S})-7-[3-[[ethanoyl(methyl)amino]methyl]phenyl]-5-(trifluoromethyl)-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-2-[[(3~{R},4~{S})-3-fluoranylpiperidin-4-yl]methoxy]-~{N}-methyl-ethanamide × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.83 Å |
共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | EI2BE_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–721; UniProt 1–721 作者链 B; PDB构建体 1–721; UniProt 1–721 |