7nvw

TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ERCC2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–760； UniProt 1–760

General transcription factor IIH subunit 1

Homo sapiens

UniProt P32780

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–548； UniProt 1–548

General transcription factor IIH subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q92759

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–462； UniProt 1–462

CDK-activating kinase assembly factor MAT1

Homo sapiens

UniProt P51948

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MAT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–309； UniProt 1–309

General transcription factor IIH subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q13889

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–308； UniProt 1–308

General transcription factor IIH subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q6ZYL4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–71； UniProt 1–71

General transcription factor IIH subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q13888

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TF2H2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 6； PDB构建体 1–395； UniProt 1–395

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB

Homo sapiens

UniProt P19447

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ERCC3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 7； PDB构建体 1–782； UniProt 1–782

General transcription factor IIE subunit 1

Homo sapiens

UniProt P29083

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 11 DNA 2	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit × 1 （P18074） General transcription factor IIH subunit 1 × 1 （P32780） General transcription factor IIH subunit 4 × 1 （Q92759） CDK-activating kinase assembly factor MAT1 × 1 （P51948） General transcription factor IIH subunit 3 × 1 （Q13889） General transcription factor IIH subunit 5 × 1 （Q6ZYL4） General transcription factor IIH subunit 2 × 1 （Q13888） General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB × 1 （P19447） Non-template DNA × 1 Template DNA × 1 Unassigned Peptide, likely XPB × 1 Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZINC ION × 7	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2EA_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–439； UniProt 1–439

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7nvw
沉积日期 deposition_date	2021-03-16
结构标题 title	TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3)
关键词 keywords	Initiation, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7nvw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7nvw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7nvw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.58 Å
Rg（电子密度）	55.09 Å
总 Rg	55.31 Å
原子数	23647
残基数	2883
排除体积	421250 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7nvw__assembly_1__model_1`	tridecameric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (15)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit
分子量 formula_weight	87021.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0
原子数 atom_count	23647

MKLNVDGLLVYFPYDYIYPEQFSYMRELKRTLDAKGHGVLEMPSGTGKTVSLLALIMAYQRAYPLEVTKLIYCSRTVPEIEKVIEELRKLLNFYEKQEGEKLPFLGLALSSRKNLCIHPEVTPLRFGKDVDGKCHSLTASYVRAQYQHDTSLPHCRFYEEFDAHGREVPLPAGIYNLDDLKALGRRQGWCPYFLARYSILHANVVVYSYHYLLDPKIADLVSKELARKAVVVFDEAHNIDNVCIDSMSVNLTRRTLDRCQGNLETLQKTVLRIKETDEQRLRDEYRRLVEGLREASAARETDAHLANPVLPDEVLQEAVPGSIRTAEHFLGFLRRLLEYVKWRLRVQHVVQESPPAFLSGLAQRVCIQRKPLRFCAERLRSLLHTLEITDLADFSPLTLLANFATLVSTYAKGFTIIIEPFDDRTPTIANPILHFSCMDASLAIKPVFERFQSVIITSGTLSPLDIYPKILDFHPVTMATFTMTLARVCLCPMIIGRGNDQVAISSKFETREDIAVIRNYGNLLLEMSAVVPDGIVAFFTSYQYMESTVASWYEQGILENIQRNKLLFIETQDGAETSVALEKYQEACENGRGAILLSVARGKVSEGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYLRDQFQIRENDFLTFDAMRHAAQCVGRAIRGKTDYGLMVFADKRFARGDKRGKLPRWIQEHLTDANLNLTVDEGVQVAKYFLRQMAQPFHREDQLGLSLLSLEQLESEETLKRIEQIAQQL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 1
分子量 formula_weight	62116.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFSNESTAVKERDAVKDLLQQLLPKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSTSNHKQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTSDIIESIFRTYPAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSKDLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSASNSKSIKENSNAAIIKRFNHHSAMVLAAGLRKQEAQNEQTSEPSNMDGNSGDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSVKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDIINSFQSIRQEMEAYTPKLTQVLSSSAASSTITALSPGGALMQGGTQQAINQMVPNDIQSELKHLYVAVGELLRHFWSCFPVNTPFLEEKVVKMKSNLERFQVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRLMKKT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 4
分子量 formula_weight	52245.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MESTPSRGLNRVHLQCRNLQEFLGGLSPGVLDRLYGHPATCLAVFRELPSLAKNWVMRMLFLEQPLPQAAVALWVKKEFSKAQEESTGLLSGLRIWHTQLLPGGLQGLILNPIFRQNLRIALLGGGKAWSDDTSQLGPDKHARDVPSLDKYAEERWEVVLHFMVGSPSAAVSQDLAQLLSQAGLMKSTEPGEPPCITSAGFQFLLLDTPAQLWYFMLQYLQTAQSRGMDLVEILSFLFQLSFSTLGKDYSVEGMSDSLLNFLQHLREFGLVFQRKRKSRRYYPTRLAINLSSGVSGAGGTVHQPGFIVVETNYRLYAYTESELQIALIALFSEMLYRFPNMVVAQVTRESVQQAIASGITAQQIIHFLRTRAHPVMLKQTPVLPPTITDQIRLWELERDRLRFTEGVLYNQFLSQVDFELLLAHARELGVLVFENSAKRLMVVTPAGHSDVKRFWKRQKHSS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	CDK-activating kinase assembly factor MAT1
分子量 formula_weight	35874.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MDDQGCPRCKTTKYRNPSLKLMVNVCGHTLCESCVDLLFVRGAGNCPECGTPLRKSNFRVQLFEDPTVDKEVEIRKKVLKIYNKREEDFPSLREYNDFLEEVEEIVFNLTNNVDLDNTKKKMEIYQKENKDVIQKNKLKLTREQEELEEALEVERQENEQRRLFIQKEEQLQQILKRKNKQAFLDELESSDLPVALLLAQHKDRSTQLEMQLEKPKPVKPVTFSTGIKMGQHISLAPIHKLEEALYEYQPLQIETYGPHVPELEMLGRLGYLNHVRAASPQDLAGGYTSSLACHRALQDAFSGLFWQPS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 3
分子量 formula_weight	34416.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MVSDEDELNLLVIVVDANPIWWGKQALKESQFTLSKCIDAVMVLGNSHLFMNRSNKLAVIASHIQESRFLYPGKNGRLGDFFGDPGNPPEFNPSGSKDGKYELLTSANEVIVEEIKDLMTKSDIKGQHTETLLAGSLAKALCYIHRMNKEVKDNQEMKSRILVIKAAEDSALQYMNFMNVIFAAQKQNILIDACVLDSDSGLLQQACDITGGLYLKVPQMPSLLQYLLWVFLPDQDQRSQLILPPPVHVDYRAACFCHRNLIEIGYVCSVCLSIFCNFSPICTTCETAFKISLPPVLKAKKKKLKVSA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 5
分子量 formula_weight	8060.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

MVNVLKGVLIECDPAMKQFLLYLDESNALGKKFIIQDIDDTHVFVIAELVNVLQERVGELMDQNAFSLTQK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	General transcription factor IIH subunit 2
分子量 formula_weight	44482.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

MDEEPERTKRWEGGYERTWEILKEDESGSLKATIEDILFKAKRKRVFEHHGQVRLGMMRHLYVVVDGSRTMEDQDLKPNRLTCTLKLLEYFVEEYFDQNPISQIGIIVTKSKRAEKLTELSGNPRKHITSLKKAVDMTCHGEPSLYNSLSIAMQTLKHMPGHTSREVLIIFSSLTTCDPSNIYDLIKTLKAAKIRVSVIGLSAEVRVCTVLARETGGTYHVILDESHYKELLTHHVSPPPASSSSECSLIRMGFPQHTIASLSDQDAKPSFSMAHLDGNTEPGLTLGGYFCPQCRAKYCELPVECKICGLTLVSAPHLARSYHHLFPLDAFQEIPLEEYNGERFCYGCQGELKDQHVYVCAVCQNVFCVDCDVFVHDSLHCCPGCIHKIPAPSGV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB
分子量 formula_weight	89404.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

MGKRDRADRDKKKSRKRHYEDEEDDEEDAPGNDPQEAVPSAAGKQVDESGTKVDEYGAKDYRLQMPLKDDHTSRPLWVAPDGHIFLEAFSPVYKYAQDFLVAIAEPVCRPTHVHEYKLTAYSLYAAVSVGLQTSDITEYLRKLSKTGVPDGIMQFIKLCTVSYGKVKLVLKHNRYFVESCHPDVIQHLLQDPVIRECRLRNSEGEATELITETFTSKSAISKTAESSGGPSTSRVTDPQGKSDIPMDLFDFYEQMDKDEEEEEETQTVSFEVKQEMIEELQKRCIHLEYPLLAEYDFRNDSVNPDINIDLKPTAVLRPYQEKSLRKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKSLVGVTAACTVRKRCLVLGNSAVSVEQWKAQFKMWSTIDDSQICRFTSDAKDKPIGCSVAISTYSMLGHTTKRSWEAERVMEWLKTQEWGLMILDEVHTIPAKMFRRVLTIVQAHCKLGLTATLVREDDKIVDLNFLIGPKLYEANWMELQNNGYIAKVQCAEVWCPMSPEFYREYVAIKTKKRILLYTMNPNKFRACQFLIKFHERRNDKIIVFADNVFALKEYAIRLNKPYIYGPTSQGERMQILQNFKHNPKINTIFISKVGDTSFDLPEANVLIQISSHGGSRRQEAQRLGRVLRAKKGMVAEEYNAFFYSLVSQDTQEMAYSTKRQRFLVDQGYSFKVITKLAGMEEEDLAFSTKEEQQQLLQKVLAATDLDAEEEVVAGEFGSRSSQASRRFGTMSSMSGADDTVYMEYHSSRSKAPSKHVHPLFKRFRK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Non-template DNA
分子量 formula_weight	32911.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CGGGTGTTCCTGAAGGGGGGCTATAAAAGGGGGTGGGGGCGCGTTCGTCCTCACTCTCTTCCGCATCGCTGTCTGCGAGGGCCAGCTGTTGGGGTGAGTACTCCCT

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Template DNA
分子量 formula_weight	32508.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

AGGGAGTACTCACCCCAACAGCTGGCCCTCGCAGACAGCGATGCGGAAGAGAGTGAGGACGAACGCGCCCCCACCCCCTTTTATAGCCCCCCTTCAGGAACACCCG

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	General transcription factor IIE subunit 1
分子量 formula_weight	49516.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MADPDVLTEVPAALKRLAKYVIRGFYGIEHALALDILIRNSCVKEEDMLELLKFDRKQLRSVLNNLKGDKFIKCRMRVETAADGKTTRHNYYFINYRTLVNVVKYKLDHMRRRIETDERDSTNRASFKCPVCSSTFTDLEANQLFDPMTGTFRCTFCHTEVEEDESAMPKKDARTLLARFNEQIEPIYALLRETEDVNLAYEILEPEPTEIPALKQSKDHAATTAGAASLAGGHHREAWATKGPSYEDLYTQNVVINMDDQEDLHRASLEGKSAKERPIWLRESTVQGAYGSEDMKEGGIDMDAFQEREEGHAGPDDNEEVMRALLIHEKKTSSAMAGSVGAAAPVTAANGSDSESETSESDDDSPPRPAAVAVHKREEDEEEDDEFEEVADDPIVMVAGRPFSYSEVSQRPELVAQMTPEEKEAYIAMGQRMFEDLFE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Unassigned Peptide, likely XPB
分子量 formula_weight	698.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

XXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Unassigned Peptide, likely TFIIE-Beta
分子量 formula_weight	1635.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

XXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	129156

TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CDK-activating kinase assembly factor MAT1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIH subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

General transcription factor IIE subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7nvw__assembly_1__model_1

7nvw__assembly_1__model_1 | I(q)

7nvw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment