7q27

Crystal structure of Angiotensin-1 converting enzyme C-domain in complex with dual ACE/NEP inhibitor AD011

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 78.9 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Angiotensin-converting enzyme

Homo sapiens

UniProt P12821

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 642–1238 突变:E64G, N90Q, N155Q, N337Q, N586Q ;beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 8KC (2~{S})-2-[[(2~{S})-1-[[(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-1-oxidanyl-1-oxidanylidene-propan-2-yl]amino]-1-oxidanylidene-hexan-2-yl]amino]-4-phenyl-butanoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 BO3 BORIC ACID × 5 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;289 K;0.1 M MIB pH 4.0, 5% glycerol, 16% PEG 3350 分辨率 1.50 Å R-free 0.178

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 89 个其他 PDB 条目、150 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACE_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–597; UniProt 642–1238

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7q27

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7q27
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7q27
沉积日期 deposition_date2021-10-23
结构标题 titleCrystal structure of Angiotensin-1 converting enzyme C-domain in complex with dual ACE/NEP inhibitor AD011
关键词 keywordsAngiotensin-1 converting enzyme, Dual inhibitor, NEP, Metalloprotease, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.05
回转半径 Rg (电子) rg_electron23.79
零角强度 I(0) i078349100.00
分子量 molecular_weight70034.0 kDa
排除体积 excluded_volume87673 ų
包络体积 envelope_volume100400 ų
水化壳体积 shell_volume33706 ų
包络直径 envelope_diameter83.5
壳层 Rg shell_rg32.45
包络 Rg envelope_rg24.02
形状 Rg shape_rg23.77
总 Rg total_rg24.74
总原子数 total_atoms9698
残基数 n_residues586
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax78.9
Rg (实空间) rg_real24.92
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.35
I(0) (实空间) i0_real7.8350e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.0600e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.96
I(0) (倒空间) i0_reciprocal78350000.0000
解质量估计 total_estimate0.8927
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary32.5
偏度 Skewness skewness0.197
峰度 Kurtosis kurtosis-0.339
角度范围 angular_range— – 0.3150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha20310000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.874; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.988

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)