SAXSdb — 7scu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Evasin P1243

Amblyomma americanum

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 24–123	未记录	C-C motif chemokine 7 × 1 （P80098）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na Acet 4.6 pH (Buffer),2 M NaCl (Precipitant)	分辨率 1.86 Å R-free 0.210

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7SCU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7SCS Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL11 提交 2021-09-29	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–123（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH (Buffer) , 2 M (NH4)2SO4 (Precipitant)	分辨率 1.51 Å R-free 0.206
7SCT Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL16 提交 2021-09-29	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–123（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.26 M (NH4)2SO4 (Precipitant),0.1 M HEPES 7.5 pH (Buffer)	分辨率 1.84 Å R-free 0.210
7SCV Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL17 提交 2021-09-29	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–123（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na Acet 4.6 pH (Buffer),2 M NaCl (Precipitant)	分辨率 2.01 Å R-free 0.251
8FJ0 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(Y44A) Complexed to Human Chemokine CCL2 提交 2022-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 21–123（103 aa）链 B 21–123（103 aa）链 C 21–123（103 aa）	突变：Y44A 突变：Y44A 突变：Y44A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M NH4SO4, 0.1 M bis-tris, Ph 5.6	分辨率 2.91 Å R-free 0.284
8FJ2 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(C8) Complexed to Human Chemokine CCL17 提交 2022-12-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–123（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4.3 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.4	分辨率 2.07 Å R-free 0.231
8FJ2 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(C8) Complexed to Human Chemokine CCL17 提交 2022-12-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–123（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4.3 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.4	分辨率 2.07 Å R-free 0.231
8FJ3 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL7(Y13A) 提交 2022-12-19	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–123（100 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M NH2SO4, 0.1 Na acetate, pH 4.8	分辨率 2.07 Å R-free 0.229
8FK6 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(Y44A) Complexed to Human Chemokine CCL7 提交 2022-12-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–123（103 aa）	突变：Y44A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M Ammonium sulfate	分辨率 1.74 Å R-free 0.223
8FK8 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(L39P) Complexed to Human Chemokine CCL7 提交 2022-12-20	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–123（103 aa）	突变：L39P	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M Ammonium sulfate	分辨率 1.96 Å R-free 0.263
8SKK Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(L39P) Complexed to Human Chemokine CCL17 提交 2023-04-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 21–123（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2M Ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.211

共 9 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E1243_AMBAM
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–101； UniProt 24–123

C-C motif chemokine 7

Homo sapiens

UniProt P80098

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 24–99	未记录	Evasin P1243 × 1 （A0A0C9S461）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na Acet 4.6 pH (Buffer),2 M NaCl (Precipitant)	分辨率 1.86 Å R-free 0.210

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7SCU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BO0 MONOCYTE CHEMOATTRACTANT PROTEIN-3, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-08-10	聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.1；303 K	分辨率未提供
1NCV DETERMINATION CC-CHEMOKINE MCP-3, NMR, 7 STRUCTURES 提交 1997-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–99（76 aa）链 B 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；290 K	分辨率未提供
4ZKC The chemokine binding protein of orf virus complexed with CCL7 提交 2015-04-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–99（76 aa）片段：UNP residues 24-99	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289 K；0.2M potassium sodium tartrate tetrahydrate, 0.1M sodium citrate tribasic dihydrate pH5.6, 2.0M ammonium citrate	分辨率 3.15 Å R-free 0.327
7S58 Crystal Structure of the tick evasin EVA-P974 complexed to human chemokine CCL7 提交 2021-09-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH (Buffer) 25 %w/v PEG 3350 (Precipitant)	分辨率 1.82 Å R-free 0.244
7S58 Crystal Structure of the tick evasin EVA-P974 complexed to human chemokine CCL7 提交 2021-09-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH (Buffer) 25 %w/v PEG 3350 (Precipitant)	分辨率 1.82 Å R-free 0.244
7S58 Crystal Structure of the tick evasin EVA-P974 complexed to human chemokine CCL7 提交 2021-09-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH (Buffer) 25 %w/v PEG 3350 (Precipitant)	分辨率 1.82 Å R-free 0.244
7S58 Crystal Structure of the tick evasin EVA-P974 complexed to human chemokine CCL7 提交 2021-09-10	实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M BIS-TRIS 6.5 pH (Buffer) 25 %w/v PEG 3350 (Precipitant)	分辨率 1.82 Å R-free 0.244
7S59 Crystal structure of the tick evasin EVA-P974 complexed to a chimera made of human chemokines CCL7 and CCL8 提交 2021-09-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 2 39–99（61 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M TRIS 8.5 pH (Buffer) 2 M (NH4)2SO4 (Precipitant)	分辨率 2.39 Å R-free 0.268
7S59 Crystal structure of the tick evasin EVA-P974 complexed to a chimera made of human chemokines CCL7 and CCL8 提交 2021-09-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 4 39–99（61 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.1 M TRIS 8.5 pH (Buffer) 2 M (NH4)2SO4 (Precipitant)	分辨率 2.39 Å R-free 0.268
8FJ3 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL7(Y13A) 提交 2022-12-19	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–99（76 aa）	突变：Y13A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M NH2SO4, 0.1 Na acetate, pH 4.8	分辨率 2.07 Å R-free 0.229
8FK6 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(Y44A) Complexed to Human Chemokine CCL7 提交 2022-12-20	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M Ammonium sulfate	分辨率 1.74 Å R-free 0.223
8FK8 Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001(L39P) Complexed to Human Chemokine CCL7 提交 2022-12-20	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–99（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2 M Ammonium sulfate	分辨率 1.96 Å R-free 0.263
8JPS Structure of Duffy Antigen Receptor for Chemokines (DARC)/ACKR1 in complex with the chemokine, CCL7 (Composite map) 提交 2023-06-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 31–93（63 aa）链 D 31–93（63 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.65 Å

共 9 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCL7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–76； UniProt 24–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7scu
沉积日期 deposition_date	2021-09-29
结构标题 title	Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL7
关键词 keywords	Inflammation, Chemokine, Ticks, Evasin, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	16.79 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	16.16 Å
零角强度 I(0) i0	5620120.00
分子量 molecular_weight	16184.0 kDa
排除体积 excluded_volume	19820 Å³
包络体积 envelope_volume	22990 Å³
水化壳体积 shell_volume	12641 Å³
包络直径 envelope_diameter	56.8 Å
壳层 Rg shell_rg	21.11 Å
包络 Rg envelope_rg	16.41 Å
形状 Rg shape_rg	16.20 Å
总 Rg total_rg	16.92 Å
总原子数 total_atoms	1124
残基数 n_residues	148
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	55.7 Å
Rg (实空间) rg_real	16.81 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.45 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.6200e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.5810e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	16.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	5620000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8027
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.413
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.231
角度范围 angular_range	— – 0.4750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	848500.0000
实空间数据点数 n_real_points	78
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.820; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Evasin P1243
分子量 formula_weight	11114.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1214

GSARNHTEDNSTEYYDYEEARCACPARHLNNTNGTVLKLLGCHYFCNGTLCTAPDGYPCYNLTAQQVRTLTTYPNTSCAVGVCMKGTCVKNGTMEQCFKTP

来源 Source

来源生物 organism	Amblyomma americanum
通用名 common_name	Lone star tick
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6943
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	C-C motif chemokine 7
分子量 formula_weight	8974.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QPVGINTSTTCCYRFINKKIPKQRLESYRRTTSSHCPREAVIFKTKLDKEICADPTQKWVQDFMKHLDKKTQTPKL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	90

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	71.258 Å
晶胞边长 b length_b	71.258 Å
晶胞边长 c length_c	66.418 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	tetragonal

分辨率 resolution	1.860 Å
最低分辨率 resolution_low	40.140 Å
R 因子 r_factor	0.1938
R_work r_work	0.1930
R_free r_free	0.2102

fit	/app/data/saxs_computation/sc/7scu/7scu.fit
pddf	/app/data/pr_computation/sc/7scu/7scu.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/sc/7scu/7scu.dat

Crystal Structure of the Tick Evasin EVA-AAM1001 Complexed to Human Chemokine CCL7

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Evasin P1243

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

C-C motif chemokine 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)