SAXSdb — 7tnq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microtubule associated protein SPM1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 100	Tubulin alpha chain × 26 （P10873） Tubulin beta chain × 26 （A0A125YWG5） PDI family protein × 20 （A0A125YMM3） PDI family protein × 4 （A0A125YFI4）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	S8F1Y1_TOXGM
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 1； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 10； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 11； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 12； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 13； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 14； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 15； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 16； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 17； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 18； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 19； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 2； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 20； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 21； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 22； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 23； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 3； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 4； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 5； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 6； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 7； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 8； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351 作者链 9； PDB构建体 1–351； UniProt 1–351

Tubulin alpha chain

物种未注明

UniProt P10873

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 100	Microtubule associated protein SPM1 × 24 （S8F1Y1） Tubulin beta chain × 26 （A0A125YWG5） PDI family protein × 20 （A0A125YMM3） PDI family protein × 4 （A0A125YFI4）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBA_TOXGO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A0； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 A2； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 A4； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 A6； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 A8； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 B0； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 B2； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 B4； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 B6； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 B8； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 C0； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 C2； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 C4； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 C6； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 C8； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 D0； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 D2； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 D4； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 D6； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 D8； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 E0； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 E2； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 E4； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 E6； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 E8； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453 作者链 F0； PDB构建体 1–453； UniProt 1–453

Tubulin beta chain

物种未注明

UniProt A0A125YWG5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 100	Microtubule associated protein SPM1 × 24 （S8F1Y1） Tubulin alpha chain × 26 （P10873） PDI family protein × 20 （A0A125YMM3） PDI family protein × 4 （A0A125YFI4）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A125YWG5_TOXGM
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 A1； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 A3； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 A5； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 A7； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 A9； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 B1； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 B3； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 B5； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 B7； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 B9； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 C1； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 C3； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 C5； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 C7； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 C9； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 D1； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 D3； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 D5； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 D7； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 D9； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 E1； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 E3； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 E5； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 E7； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 E9； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449 作者链 F1； PDB构建体 1–449； UniProt 1–449

PDI family protein

物种未注明

UniProt A0A125YMM3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 100	Microtubule associated protein SPM1 × 24 （S8F1Y1） Tubulin alpha chain × 26 （P10873） Tubulin beta chain × 26 （A0A125YWG5） PDI family protein × 4 （A0A125YFI4）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A125YMM3_TOXGM
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 b； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 c； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 d； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 e； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 f； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 g； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 h； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 i； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 j； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 m； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 n； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 o； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 p； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 q； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 r； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 s； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 t； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 u； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220 作者链 v； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220

PDI family protein

物种未注明

UniProt A0A125YFI4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 100	Microtubule associated protein SPM1 × 24 （S8F1Y1） Tubulin alpha chain × 26 （P10873） Tubulin beta chain × 26 （A0A125YWG5） PDI family protein × 20 （A0A125YMM3）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A125YFI4_TOXGM
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 l； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 w； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189 作者链 x； PDB构建体 1–189； UniProt 1–189

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7tnq
沉积日期 deposition_date	2022-01-21
结构标题 title	The symmetry-released subpellicular microtubule map from detergent-extracted Toxoplasma cells
关键词 keywords	parasites, Toxoplasma gondii, cytoskeleton, microtubules, tubulin, CELL INVASION; CELL INVASION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7tnq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7tnq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7tnq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	121.50 Å
总 Rg	121.50 Å
原子数	213168
残基数	27210
排除体积	3779300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7tnq__assembly_1__model_1`	100-meric （100）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Microtubule associated protein SPM1
分子量 formula_weight	38817.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0,1,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,2,20,21,22,23,3,4,5,6,7,8,9
原子数 atom_count	213168

MSGGNSNTPKKLPSEEGSDYGYPQKPQKYLPKSEQAEPDYSACCKGNDAYKGASHGTVQFSHPEEAQKYAGAAAGAETIQRGRERVAADRQPRAAGDVPARRLHLSDVDEAHRGQSPSRHPGYCVEELCTCGMHKCIPSRAPVPFTGSTQYRQEFVPKPLPPPTQVSQVTLPPSLPFEAESSYRTEFVAKPLPPPAKFSEVKLPPTLPFHGESAYRTDYVPKPLPEVAKPVEVKLPPTLPFNAQSCYRSEYVAKPLPPPVQTAEVKLPPSLPFEGSTHYRDEFQVKPLPPATKVTEVKLPPSLPFDATSMYRSDYVAKSNPICPVSKLPQYPAATYPQNHVFWDPDTKQWY

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tubulin alpha chain
分子量 formula_weight	50166.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A0,A2,A4,A6,A8,B0,B2,B4,B6,B8,C0,C2,C4,C6,C8,D0,D2,D4,D6,D8,E0,E2,E4,E6,E8,F0

MREVISIHVGQAGIQIGNACWELFCLEHGIQPDGQMPSDKTIGGGDDAFNTFFSETGAGKHVPRCVFLDLEPTVVDEVRTGTYRHLFHPEQLISGKEDAANNFARGHYTIGKEIVDLSLDRIRKLADNCTGLQGFLMFNAVGGGTGSGLGCLLLERLSVDYGKKSKLNFCSWPSPQVSTAVVEPYNSVLSTHSLLEHTDVAVMLDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIAQVISSLTASLRFDGALNVDVTEFQTNLVPYPRIHFMLSSYAPIISAEKAYHEQLSVAEITNSAFEPASMMAKCDPRHGKYMACCLMYRGDVVPKDVNAAVATIKTKRTIQFVDWCPTGFKCGINYQPPTVVPGGDLAKVMRAVCMISNSTAIAEVFSRMDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDLAALEKDYEEVGIETAEGEGEEEGYGDEY

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Tubulin beta chain
分子量 formula_weight	50119.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	26

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A1,A3,A5,A7,A9,B1,B3,B5,B7,B9,C1,C3,C5,C7,C9,D1,D3,D5,D7,D9,E1,E3,E5,E7,E9,F1

MREIVHVQGGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYCGDSDLQLERINVFYNEATGGRFVPRAILMDLEPGTMDSVRAGPFGQLFRPDNFVFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAEGCDCLQGFQITHSLGGGTGSGMGTLLISKVREEYPDRIMETFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADEVQVIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSAAMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFLIGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMFDAKNMMCASDPRHGRYLTASAMFRGRMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNMKSSVCDIPPKGLKMSVTFVGNSTAIQEMFKRVSDQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEGEFDEEEGEMGAEEGA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	PDI family protein
分子量 formula_weight	24939.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.8.1.8
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	20

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v

MSQPVFASPLNVEKRRLNEERALMQAQKAGGEGVNIQLPPNYGDMDLILFPEGSLKNSNNTVIPQSHLKGKSVALYFADGADPKCASLLPFLLNYYRTMNEGGANQKIEIIFVSLDRDREAFESHRAHMPWLSIDLENPLTEILKRHFRVMKEYEVPTYGYGSRTGVPSVIVIGSDGREAQFLPICSGLEEGDRALLRWDWRNTKFASDQFHVRPTLLEQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	PDI family protein
分子量 formula_weight	21687.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k,l,w,x

MLAADCFFGPDVVKRTQQGNYVPVRPDHFAGVSVALFFAKAGHSKCAQIVPVVRQFYKTTNFSGEKAVIEIIYVSLDKDEQDFERVRALMPWCSVEYKSCLRKKLIERYRVPNGELAFGTVRIPSTAIPLLIVIGPNGEEAGRMNFQQSDEFVLQRWDYRFNKWPGSAQRLRTLNDATDPWKKRLPQNV

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分辨率 resolution	8.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	39122

The symmetry-released subpellicular microtubule map from detergent-extracted Toxoplasma cells

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microtubule associated protein SPM1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PDI family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PDI family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7tnq__assembly_1__model_1

7tnq__assembly_1__model_1 | I(q)

7tnq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

The symmetry-released subpellicular microtubule map from detergent-extracted Toxoplasma cells

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microtubule associated protein SPM1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tubulin alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tubulin beta chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PDI family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PDI family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7tnq__assembly_1__model_1

7tnq__assembly_1__model_1 | I(q)

7tnq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)