7uzv

Cytoplasmic domains of Band 3-I (local refinement from consensus reconstruction of ankyrin complexes)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 83.8 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Band 3 anion transport protein

物种未注明

UniProt P02730

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–911 链 E; UniProt 1–911 未记录 无其他共同聚合物 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4;Final gel filtration buffer contained 0.05% w/v digitonin, 130 mM KCl, 20 mM HEPES, pH 7.4, 1 mM ATP, 1 mM MgCl2, 1 mM PMSF. Peak fractions were concentrated to 8 mg/mL and 0.01% ( w/v glycyrrhizic acid was added immediately prior to vitrification. cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;4-6 seconds, wait time 30 seconds 分辨率 2.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 53 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B3AT_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–911; UniProt 1–911 作者链 E; PDB构建体 1–911; UniProt 1–911

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7uzv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7uzv
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7uzv
沉积日期 deposition_date2022-05-09
结构标题 titleCytoplasmic domains of Band 3-I (local refinement from consensus reconstruction of ankyrin complexes)
关键词 keywordsMembrane Protein, Anion Exchange, Erythrocyte, Glycoprotein, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier27.28
回转半径 Rg (电子) rg_electron26.02
零角强度 I(0) i068480500.00
分子量 molecular_weight65415.0 kDa
排除体积 excluded_volume82309 ų
包络体积 envelope_volume99421 ų
水化壳体积 shell_volume31554 ų
包络直径 envelope_diameter86.7
壳层 Rg shell_rg33.95
包络 Rg envelope_rg26.14
形状 Rg shape_rg26.01
总 Rg total_rg26.93
总原子数 total_atoms9211
残基数 n_residues584
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax83.8
Rg (实空间) rg_real27.23
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.41
I(0) (实空间) i0_real6.8480e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.5340e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal27.25
I(0) (倒空间) i0_reciprocal68480000.0000
解质量估计 total_estimate0.7389
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary30.3
偏度 Skewness skewness0.273
峰度 Kurtosis kurtosis-0.557
角度范围 angular_range— – 0.2900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha17710000.0000
实空间数据点数 n_real_points59
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.949; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.267; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.954

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id7uzvC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology930 — Mannitol-specific EII; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Mannitol-specific EII; Chain A

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)