SAXSdb — 7xay

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit

Saccharomyces cerevisiae S288C

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Histone acetyltransferase type B subunit 2 × 1 （P39984） Histone chaperone asf1 × 1 （Q4WXX5） Histone H3 × 1 （P61830） Histone H4 × 1 （P02309） COENZYME A × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C562_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–105； UniProt 23–127

Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12341

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Histone acetyltransferase type B subunit 2 × 1 （P39984） Histone chaperone asf1 × 1 （Q4WXX5） Histone H3 × 1 （P61830） Histone H4 × 1 （P02309） COENZYME A × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HAT1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 107–416； UniProt 11–320

Histone acetyltransferase type B subunit 2

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P39984

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit × 1 （P0ABE7,Q12341） Histone chaperone asf1 × 1 （Q4WXX5） Histone H3 × 1 （P61830） Histone H4 × 1 （P02309） COENZYME A × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	HAT2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–401； UniProt 1–401

Histone chaperone asf1

Aspergillus fumigatus Af293

UniProt Q4WXX5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit × 1 （P0ABE7,Q12341） Histone acetyltransferase type B subunit 2 × 1 （P39984） Histone H3 × 1 （P61830） Histone H4 × 1 （P02309） COENZYME A × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ASF1_ASPFU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–154； UniProt 1–154

Histone H3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P61830

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit × 1 （P0ABE7,Q12341） Histone acetyltransferase type B subunit 2 × 1 （P39984） Histone chaperone asf1 × 1 （Q4WXX5） Histone H4 × 1 （P02309） COENZYME A × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136

Histone H4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P02309

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit × 1 （P0ABE7,Q12341） Histone acetyltransferase type B subunit 2 × 1 （P39984） Histone chaperone asf1 × 1 （Q4WXX5） Histone H3 × 1 （P61830） COENZYME A × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–96； UniProt 8–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7xay
沉积日期 deposition_date	2022-03-19
结构标题 title	Crystal structure of Hat1-Hat2-Asf1-H3-H4
关键词 keywords	Histone acetyltransferase, Histones, Enzymatic activity, Histone chaperone, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7xay__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7xay__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7xay__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	35.82 Å
Rg（电子密度）	35.48 Å
总 Rg	35.85 Å
原子数	8299
残基数	1015
排除体积	147110 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7xay__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit
分子量 formula_weight	48211.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8299

ADLEDNWETLNDNLKVIEKADNAAQVKDALTKMRAAALDAQKATPPKLEDKSPDSPEMKDFRHGFDILVGQIDDALKLANEGKVKEAQAAAEQLKTTRNAYIQKYLWTSSANEALRVSIVGENAVQFSPLFTYPIYGDSEKIYGYKDLIIHLAFDSVTFKPYVNVKYSAKLGDDNIVDVEKKLLSFLPKDDVIVRDEAKWVDCFAEERKTHNLSDVFEKVSEYSLNGEEFVVYKSSLVDDFARRMHRRVQIFSLLFIEAANYIDETDPSWQIYWLLNKKTKELIGFVTTYKYWHYLGAKSFDEDIDKKFRAKISQFLIFPPYQNKGHGSCLYEAIIQSWLEDKSITEITVEDPNEAFDDLRDRNDIQRLRKLGYDAVFQKHSDLSDEFLESSRKSLKLEERQFNRLVEMLLLLNNS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone acetyltransferase type B subunit 2
分子量 formula_weight	45105.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MENQEKPLSVDEEYDLWKSNVPLMYDFVSETRLTWPSLTVQWLPTPVQELDGGFIKQELIIGTHTSGEEENYLKFAEINLPKEILSNEDPQEEAGEEYQSSLPAPRSNIRITAKYEHEEEITRARYMPQDPNIVATINGQGTVFLYSRSEGLQSTLKFHKDNGYALSFSTLVKGRLLSGSDDHTVALWEVGSGGDPTKPVRTWNDLHSDIINDNKWHNFNKDLFGTVSEDSLLKINDVRANNTTIDTVKCPQPFNTLAFSHHSSNLLAAAGMDSYVYLYDLRNMKEPLHHMSGHEDAVNNLEFSTHVDGVVVSSGSDNRLMMWDLKQIGAEQTPDDAEDGVPELIMVHAGHRSSVNDFDLNPQIPWLVASAEEENILQVWKCSHSLPIVGGPPKVNKDIIS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone chaperone asf1
分子量 formula_weight	17545.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSVVSLLGVKIVNNPAPFLAPYQFEITFECLEQLQKDLEWKLTYVGSATSSEYDQELDSLLVGPIPVGVNKFLFEADAPDLKRIPTSEILGVTVILLTCSYDGREFVRVGYYVNNEYDSEELTQDPPAKPIIERIRRNILAEKPRVTRFAIKWD

来源 Source

来源生物 organism	Aspergillus fumigatus Af293
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	330879
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	15259.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

ARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	10719.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

GKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRKTVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	COENZYME A
分子量 formula_weight	767.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	96.410 Å
晶胞边长 b length_b	124.684 Å
晶胞边长 c length_c	161.066 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	3.300 Å
最低分辨率 resolution_low	22.400 Å
R 因子 r_factor	0.2321
R_work r_work	0.2304
R_free r_free	0.2563

Crystal structure of Hat1-Hat2-Asf1-H3-H4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Soluble cytochrome b562,Histone acetyltransferase type B catalytic subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone acetyltransferase type B subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone chaperone asf1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7xay__assembly_1__model_1

7xay__assembly_1__model_1 | I(q)

7xay__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 non-polymer

7. 引用文献 (1)