8cte

Class 2 of erythrocyte ankyrin-1 complex (Composite map)

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ankyrin-1

物种未注明

UniProt P16157

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Band 3 anion transport protein × 3 (P02730) Protein 4.2 × 1 (P16452) Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 (P18577) Ammonium transporter Rh type A × 2 (Q02094) Glycophorin-A × 2 (P02724) Aquaporin-1 × 4 (P29972) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ANK1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1881; UniProt 1–1881

Band 3 anion transport protein

物种未注明

UniProt P02730

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Ankyrin-1 × 1 (P16157) Protein 4.2 × 1 (P16452) Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 (P18577) Ammonium transporter Rh type A × 2 (Q02094) Glycophorin-A × 2 (P02724) Aquaporin-1 × 4 (P29972) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B3AT_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–911; UniProt 1–911 作者链 T; PDB构建体 1–911; UniProt 1–911 作者链 W; PDB构建体 1–911; UniProt 1–911

Protein 4.2

物种未注明

UniProt P16452

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Ankyrin-1 × 1 (P16157) Band 3 anion transport protein × 3 (P02730) Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 (P18577) Ammonium transporter Rh type A × 2 (Q02094) Glycophorin-A × 2 (P02724) Aquaporin-1 × 4 (P29972) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EPB42_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–691; UniProt 1–691

Blood group Rh(CE) polypeptide

物种未注明

UniProt P18577

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Ankyrin-1 × 1 (P16157) Band 3 anion transport protein × 3 (P02730) Protein 4.2 × 1 (P16452) Ammonium transporter Rh type A × 2 (Q02094) Glycophorin-A × 2 (P02724) Aquaporin-1 × 4 (P29972) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RHCE_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–417; UniProt 1–417

Ammonium transporter Rh type A

物种未注明

UniProt Q02094

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Ankyrin-1 × 1 (P16157) Band 3 anion transport protein × 3 (P02730) Protein 4.2 × 1 (P16452) Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 (P18577) Glycophorin-A × 2 (P02724) Aquaporin-1 × 4 (P29972) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RHAG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–409; UniProt 1–409 作者链 Q; PDB构建体 1–409; UniProt 1–409

Glycophorin-A

物种未注明

UniProt P02724

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Ankyrin-1 × 1 (P16157) Band 3 anion transport protein × 3 (P02730) Protein 4.2 × 1 (P16452) Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 (P18577) Ammonium transporter Rh type A × 2 (Q02094) Aquaporin-1 × 4 (P29972) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GLPA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–150; UniProt 1–150 作者链 N; PDB构建体 1–150; UniProt 1–150

Aquaporin-1

物种未注明

UniProt P29972

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 Ankyrin-1 × 1 (P16157) Band 3 anion transport protein × 3 (P02730) Protein 4.2 × 1 (P16452) Blood group Rh(CE) polypeptide × 1 (P18577) Ammonium transporter Rh type A × 2 (Q02094) Glycophorin-A × 2 (P02724) CHOLESTEROL × 10 Digitonin × 2 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AQP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 O; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 R; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269 作者链 S; PDB构建体 1–269; UniProt 1–269

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8cte
沉积日期 deposition_date2022-05-14
结构标题 titleClass 2 of erythrocyte ankyrin-1 complex (Composite map)
关键词 keywordsMembrane Protein, Anion Exchange, Erythrocyte, Glycoprotein, TRANSPORT PROTEIN-STRUCTURAL PROTEIN complex; TRANSPORT PROTEIN/STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8cte__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8cte__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8cte__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)63.29 Å
Rg(电子密度)62.91 Å
总 Rg63.00 Å
原子数38776
残基数4980
排除体积704170 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8cte__assembly_1__model_1 tetradecameric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id8cteK01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3430 — Ammonium transporter fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ammonium transporter AmtB like domains
结构域编号 domain_id8cteL01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3430 — Ammonium transporter fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ammonium transporter AmtB like domains
结构域编号 domain_id8cteQ01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3430 — Ammonium transporter fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ammonium transporter AmtB like domains
结构域编号 domain_id8cteT01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology930 — Mannitol-specific EII; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Mannitol-specific EII; Chain A
结构域编号 domain_id8cteX01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id8cteX02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology260 — Coagulation Factor XIII; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transglutaminase-like
结构域编号 domain_id8cteX03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id8cteX04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
▶

7. 引用文献 (1)