8fd7

Structure of the human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 complexed with gabapentin

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 202.3 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1

Oryctolagus cuniculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 1 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–1106	未记录	Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 （Q13936） Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 （P54286） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 GBN [1-(AMINOMETHYL)CYCLOHEXYL]ACETIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 WO9 (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate × 1 YSW (2S)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate × 1 CLR CHOLESTEROL × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8FD7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JBR Cryo-EM structure of the rabbit voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex at 4.2 angstrom 提交 2015-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 1–39（39 aa）链 F 56–661（606 aa）链 F 956–1106（151 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15 BMA beta-D-mannopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 20mM MOPS, 200mM NaCl, 0.5mM CaCl2,0.1% digitonin；pH 7.4；20mM MOPS, 200mM NaCl, 0.5mM CaCl2,0.1% digitonin cryo-EM玻璃化条件 Blot for 2 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
5GJV Structure of the mammalian voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex at near atomic resolution 提交 2016-07-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–1106（1106 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 14 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；100 mM Tris-HCl, pH 8.0,200 mM NaCl, 10 mM CaCl2,15 mM reduced glutathione, 0.1% digitonin, and protease inhibitors. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2 s and flash-frozen in liquid ethane cooled by liquid nitrogen	分辨率 3.60 Å
5GJW Structure of the mammalian voltage-gated calcium channel Cav1.1 complex for ClassII map 提交 2016-07-02	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–1106（1106 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；100 mM Tris-HCl, pH 8.0,200 mM NaCl, 10 mM CaCl2,15 mM reduced glutathione, 0.1% digitonin, and protease inhibitors. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2 s and flash-frozen in liquid ethane cooled by liquid nitrogen	分辨率 3.90 Å
6JP5 Rabbit Cav1.1-Nifedipine Complex 提交 2019-03-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 1–1074（1074 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9 CA CALCIUM ION × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 8 C5U dimethyl 2,6-dimethyl-4-(2-nitrophenyl)-1,4-dihydropyridine-3,5-dicarboxylate × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 ETA ETHANOLAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6JP8 Rabbit Cav1.1-Bay K8644 Complex 提交 2019-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 29–1075（1047 aa）	未记录	C8U methyl (4~{S})-2,6-dimethyl-5-nitro-4-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-1,4-dihydropyridine-3-carboxylate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 2 ETA ETHANOLAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
6JPA Rabbit Cav1.1-Verapamil Complex 提交 2019-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 29–1075（1047 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 8 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 4YH (2S)-2-(3,4-dimethoxyphenyl)-5-{[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl](methyl)amino}-2-(propan-2-yl)pentanenitrile × 2 ETA ETHANOLAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
6JPB Rabbit Cav1.1-Diltiazem Complex 提交 2019-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 29–1075（1047 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CA CALCIUM ION × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 4 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 C9F Diltiazem × 1 ETA ETHANOLAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7JPK Rabbit Cav1.1 in the presence of 100 micromolar (S)-(-)-Bay K8644 in nanodiscs at 3.0 Angstrom resolution 提交 2020-08-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 9 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 C8U methyl (4~{S})-2,6-dimethyl-5-nitro-4-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-1,4-dihydropyridine-3-carboxylate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 5 seconds before plunging	分辨率 3.00 Å
7JPL Rabbit Cav1.1 in the presence of 10 micromolar (S)-(-)-Bay K8644 in nanodiscs at 3.4 Angstrom resolution 提交 2020-08-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 9 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 C8U methyl (4~{S})-2,6-dimethyl-5-nitro-4-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-1,4-dihydropyridine-3-carboxylate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 5 seconds before plunging	分辨率 3.40 Å
7JPV Rabbit Cav1.1 in the presence of 1 micromolar (S)-(-)-Bay K8644 in nanodiscs at 3.4 Angstrom resolution 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 9 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 5 seconds before plunging	分辨率 3.40 Å
7JPW Rabbit Cav1.1 in the presence of 100 micromolar (R)-(+)-Bay K8644 in nanodiscs at 3.2 Angstrom resolution 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 9 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 VFY methyl (4R)-2,6-dimethyl-5-nitro-4-[2-(trifluoromethyl)phenyl]-1,4-dihydropyridine-3-carboxylate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 5 seconds before plunging	分辨率 3.20 Å
7JPX Rabbit Cav1.1 in the presence of 100 micromolar amlodipine in nanodiscs at 2.9 Angstrom resolution 提交 2020-08-10	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 9 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 1 6UB amlodipine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 5 seconds before plunging	分辨率 2.90 Å
8E56 Rabbit L-type voltage-gated calcium channel Cav1.1 in the presence of Amiodarone at 2.8 Angstrom resolution 提交 2022-08-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8E57 Rabbit L-type voltage-gated calcium channel Cav1.1 in the presence of Amiodarone and 100 microM MNI-1 at 2.8 Angstrom resolution 提交 2022-08-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 WFR propan-2-yl (2S)-2-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-ethynyl-3-hydroxy-4-methyloxolan-2-yl]methoxy}(phenoxy)phosphoryl]amino}propanoate (non-preferred name) × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
8E58 Rabbit L-type voltage-gated calcium channel Cav1.1 in the presence of Amiodarone and 1 mM MNI-1 at 3.0 Angstrom resolution 提交 2022-08-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1106（1106 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 WFR propan-2-yl (2S)-2-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-4-ethynyl-3-hydroxy-4-methyloxolan-2-yl]methoxy}(phenoxy)phosphoryl]amino}propanoate (non-preferred name) × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8EOG Structure of the human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 complexed with L-leucine 提交 2022-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 29–1079（1051 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 LEU LEUCINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 WNZ (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate × 1 WO9 (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CA2D1_RABIT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–1105； UniProt 1–1106

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C

Homo sapiens

UniProt Q13936

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 1 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–1648	未记录	Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 × 1 （P13806） Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 （P54286） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 GBN [1-(AMINOMETHYL)CYCLOHEXYL]ACETIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 WO9 (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate × 1 YSW (2S)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate × 1 CLR CHOLESTEROL × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8FD7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1T0J Crystal structure of a complex between voltage-gated calcium channel beta2a subunit and a peptide of the alpha1c subunit 提交 2004-04-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 428–445（18 aa）片段：Residues 428-443	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris-Cl, PEG 4000, NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.242
1T0J Crystal structure of a complex between voltage-gated calcium channel beta2a subunit and a peptide of the alpha1c subunit 提交 2004-04-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 428–445（18 aa）片段：Residues 428-443	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris-Cl, PEG 4000, NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.242
2LQC NMR solution structure of a Ca2+-Calmodulin with a binding motif (NSCaTE) peptide from the N-terminal cytoplasmic domain of the L-type Voltage-Cated Calcium Channel alpha1C subunit 提交 2012-02-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 47–68（22 aa）片段：UNP residues 47-68	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] calmodulin, 2 mM NSCaTE peptide, 55 M H2O, 5 M [U-99% 2H] D2O, 10 mM DTT, 20 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NSCaTE peptide, 0.5 mM calmodulin, 55 M H2O, 5 M [U-99% 2H] D2O, 10 mM DTT, 20 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] calmodulin, 2 mM NSCaTE peptide, 7.5 mg Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3G43 Crystal structure of the calmodulin-bound Cav1.2 C-terminal regulatory domain dimer 提交 2009-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1609–1682（74 aa）片段：C-terminal fragment: UNP residues 1609-1682 链 F 1609–1682（74 aa）片段：C-terminal fragment: UNP residues 1609-1682	未记录	CA CALCIUM ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 1.0 M LiCl, 3% w/v MPD, 100 mM MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.269
3OXQ Crystal Structure of Ca2+/CaM-CaV1.2 pre-IQ/IQ domain complex 提交 2010-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1609–1685（77 aa）片段：preIQ/IQ domain (unp residues 1609-1685)	未记录	CA CALCIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Li2SO4, 24.5% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.288
3OXQ Crystal Structure of Ca2+/CaM-CaV1.2 pre-IQ/IQ domain complex 提交 2010-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1609–1685（77 aa）片段：preIQ/IQ domain (unp residues 1609-1685)	未记录	CA CALCIUM ION × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Li2SO4, 24.5% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.55 Å R-free 0.288
5V2P CaV beta2a subunit: CaV1.2 AID-CAP complex 提交 2017-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 427–445（19 aa）片段：AID-CAP (UNP residues 427-445)	突变：K427C, Q428S, Q429P, E432C	NI NICKEL (II) ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 8VY 1,3-bis(bromomethyl)benzene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；34-37% PEG400, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M MES, pH 6.3	分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5V2Q CaV beta2a subunit: CaV1.2 AID-CEN complex 提交 2017-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 427–445（19 aa）片段：AID-CEN (UNP residues 427-445)	突变：K427A, Q428S, Q429P, K435C, D439C	CL CHLORIDE ION × 1 8VY 1,3-bis(bromomethyl)benzene × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；1.5-1.7 M ammonium sulfate, 5 mM BME, 0.1 M HEPES, pH 7.0	分辨率 1.70 Å R-free 0.196
6C0A Actinin-1 EF-Hand bound to the Cav1.2 IQ Motif 提交 2017-12-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1587–1609（23 aa）片段：IQ Motif (UNP residues 1587-1609)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1 NMR样品组成 300 uM [U-99% 15N] Actinin-1 EF hand, 300 uM IQ Motif, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 uM [U-99% 15N] Cav1.2 IQ Motif, 300 uM Actinin-1 EF 3,3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 300 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Actinin-1 EF 3,4, 300 uM Cav1.2 IQ Motif, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 12 mg/mL Pf1 phage, 300 uM [U-99% 15N] Actinin-1 EF 3,4, 300 uM Cav1.2 IQ Motif, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 12 mg/mL Pf1 phage, 300 uM [U-99% 15N] Cav1.2 IQ Motif, 300 uM Actinin-1 EF 3,4, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6DAD 1.65 Angstrom crystal structure of the N97I Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1611–1644（34 aa）片段：UNP residues 1611-1644	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.1 M sodium malonate, 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.208
6DAD 1.65 Angstrom crystal structure of the N97I Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1611–1644（34 aa）片段：UNP residues 1611-1644	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.1 M sodium malonate, 0.1 M HEPES, pH 7.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.208
6DAE 2.0 Angstrom crystal structure of the D95V Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1611–1644（34 aa）片段：UNP residues 1611-1644	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.3；277 K；1 M lithium chloride, 30% PEG6000, 0.1M Bicine, pH 10.3	分辨率 2.00 Å R-free 0.226
6DAE 2.0 Angstrom crystal structure of the D95V Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1611–1644（34 aa）片段：UNP residues 1611-1644	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10.3；277 K；1 M lithium chloride, 30% PEG6000, 0.1M Bicine, pH 10.3	分辨率 2.00 Å R-free 0.226
6DAF 2.4 Angstrom crystal structure of the F141L Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1611–1644（34 aa）片段：UNP residues 1611-1644	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.5 M potassium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6DAF 2.4 Angstrom crystal structure of the F141L Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1611–1644（34 aa）片段：UNP residues 1611-1644	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.5 M potassium nitrate, 20% PEG3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.243
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；ammonium sulfate	分辨率 2.40 Å R-free 0.283
6U3A 1.65 Angstrom crystal structure of the N97S Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；DL-malic acid	分辨率 1.65 Å R-free 0.209
6U3A 1.65 Angstrom crystal structure of the N97S Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；DL-malic acid	分辨率 1.65 Å R-free 0.209
6U3B 1.7 Angstrom crystal structure of the Q135P Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 550 MME, sodium acetate	分辨率 1.70 Å R-free 0.200
6U3D 1.75 Angstrom crystal structure of the N53I Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350, citric acid	分辨率 1.75 Å R-free 0.201
6U3D 1.75 Angstrom crystal structure of the N53I Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1611–1644（34 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350, citric acid	分辨率 1.75 Å R-free 0.201
7L8V NMR Structure of half-calcified calmodulin mutant (CaMEF12) bound to the IQ-motif of CaV1.2 提交 2021-01-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1662–1682（21 aa）片段：IQ-motif residues 1662-1682	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-95% 15N] calmodulin, 0.75 mM IQ-motif, 10 mM TRIS, 2 mM CALCIUM ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] calmodulin, 0.75 mM IQ-motif, 10 mM TRIS, 2 mM CALCIUM ION, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8EOI Structure of a human EMC:human Cav1.2 channel complex in GDN detergent 提交 2022-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 K 109–1658（1550 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8FHS Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of amiodarone and sofosbuvir at 3.3 Angstrom resolution 提交 2022-12-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2221（2221 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 WG6 Sofosbuvir × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CLR CHOLESTEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8WE6 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 at 2.9 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2201（2201 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8WE7 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of calciseptine at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2201（2201 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8WE8 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of calciseptine, amlodipine and pinaverium at 2.9 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–2201（2201 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 6UB amlodipine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8WE9 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 (Class I) in the presence of pinaverium at 3.0 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2201（2201 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8WEA Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 (Class II) in the presence of pinaverium at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–2201（2201 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 WB9 4-[(2-bromanyl-4,5-dimethoxy-phenyl)methyl]-4-[2-[2-[(1~{R},2~{S},5~{R})-6,6-dimethyl-2-bicyclo[3.1.1]heptanyl]ethoxy]ethyl]morpholin-4-ium × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9ZZ4 NMR structure of CaBP1 bound to the IQ motif of Cav1.2 提交 2026-01-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1587–1609（23 aa）片段：IQ Motif (UNP residues 1587-1609)	未记录	CA CALCIUM ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] CaBP1 C-Lobe, 0.75 mM CaV1.2 IQ motif, 1 mM Ca2+, 10 mM [U-100% 2H] Tris, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CaBP1 C-Lobe, 0.9 mM CaV1.2 IQ motif, 1 mM Ca2+, 10 mM [U-100% 2H] Tris, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供

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UniProt名称	CAC1C_HUMAN
Isoform	Q13936-20
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–1648； UniProt 1–1648

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3

Oryctolagus cuniculus

UniProt P54286

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 1 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–477	未记录	Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 × 1 （P13806） Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 （Q13936） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 GBN [1-(AMINOMETHYL)CYCLOHEXYL]ACETIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 WO9 (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate × 1 YSW (2S)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate × 1 CLR CHOLESTEROL × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8FD7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8EOG Structure of the human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 complexed with L-leucine 提交 2022-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 171–361（191 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 LEU LEUCINE × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 WNZ (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate × 1 WO9 (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EOI Structure of a human EMC:human Cav1.2 channel complex in GDN detergent 提交 2022-10-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 J 38–361（324 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CACB3_RABIT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–477； UniProt 1–477

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8fd7
沉积日期 deposition_date	2022-12-02
结构标题 title	Structure of the human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 complexed with gabapentin
关键词 keywords	voltage-gated calcium channel, CaV alpha2delta, drug binding, gabapentin, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	56.19 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	56.25 Å
零角强度 I(0) i0	1016470000.00
分子量 molecular_weight	279660.0 kDa
排除体积 excluded_volume	355700 Å³
包络体积 envelope_volume	541650 Å³
水化壳体积 shell_volume	84597 Å³
包络直径 envelope_diameter	211.6 Å
壳层 Rg shell_rg	54.07 Å
包络 Rg envelope_rg	55.80 Å
形状 Rg shape_rg	56.23 Å
总 Rg total_rg	56.23 Å
总原子数 total_atoms	19698
残基数 n_residues	2416
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	202.3 Å
Rg (实空间) rg_real	56.60 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.68 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0160e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.3290e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	55.85 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1015000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6190
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	57.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.556
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.061
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	69950000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.756; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.041; Positv: 1.000; Valcen: 0.933; Smooth: 0.718

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1
分子量 formula_weight	125082.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D
原子数 atom_count	19701

MAAGRPLAWTLTLWQAWLILIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVHQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIDDANFRRQVSYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDDVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFAKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKPIGVGIPTINLRKRRPNVQNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKIEETITQARYSETLKPDNFEESGYTFLAPRDYCSDLKPSDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNTDLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQKNIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSIADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAADMEDDDFTASMSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHVEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPDPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWSIIGIQFVLLWLVSGSRHCLL

来源 Source

来源生物 organism	Oryctolagus cuniculus
通用名 common_name	rabbit
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9986
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C
分子量 formula_weight	187082.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MVNENTRMYIPEENHQGSNYGSPRPAHANMNANAAAGLAPEHIPTPGAALSWQAAIDAARQAKLMGSAGNATISTVSSTQRKRQQYGKPKKQGSTTATRPPRALLCLTLKNPIRRACISIVEWKPFEIIILLTIFANCVALAIYIPFPEDDSNATNSNLERVEYLFLIIFTVEAFLKVIAYGLLFHPNAYLRNGWNLLDFIIVVVGLFSAILEQATKADGANALGGKGAGFDVKALRAFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNSIIKAMVPLLHIALLVLFVIIIYAIIGLELFMGKMHKTCYNQEGIADVPAEDDPSPCALETGHGRQCQNGTVCKPGWDGPKHGITNFDNFAFAMLTVFQCITMEGWTDVLYWVNDAVGRDWPWIYFVTLIIIGSFFVLNLVLGVLSGEFSKEREKAKARGDFQKLREKQQLEEDLKGYLDWITQAEDIDPENEDEGMDEEKPRNMSMPTSETESVNTENVAGGDIEGENCGARLAHRISKSKFSRYWRRWNRFCRRKCRAAVKSNVFYWLVIFLVFLNTLTIASEHYNQPNWLTEVQDTANKALLALFTAEMLLKMYSLGLQAYFVSLFNRFDCFVVCGGILETILVETKIMSPLGISVLRCVRLLRIFKITRYWNSLSNLVASLLNSVRSIASLLLLLFLFIIIFSLLGMQLFGGKFNFDEMQTRRSTFDNFPQSLLTVFQILTGEDWNSVMYDGIMAYGGPSFPGMLVCIYFIILFICGNYILLNVFLAIAVDNLADAESLTSAQKEEEEEKERKKLARTASPEKKQELVEKPAVGESKEEKIELKSITADGESPPATKINMDDLQPNENEDKSPYPNPETTGEEDEEEPEMPVGPRPRPLSELHLKEKAVPMPEASAFFIFSSNNRFRLQCHRIVNDTIFTNLILFFILLSSISLAAEDPVQHTSFRNHILGNADYVFTSIFTLEIILKMTAYGAFLHKGSFCRNYFNILDLLVVSVSLISFGIQSSAINVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQCVFVAIRTIGNIVIVTTLLQFMFACIGVQLFKGKLYTCSDSSKQTEAECKGNYITYKDGEVDHPIIQPRSWENSKFDFDNVLAAMMALFTVSTFEGWPELLYRSIDSHTEDKGPIYNYRVEISIFFIIYIIIIAFFMMNIFVGFVIVTFQEQGEQEYKNCELDKNQRQCVEYALKARPLRRYIPKNQHQYKVWYVVNSTYFEYLMFVLILLNTICLAMQHYGQSCLFKIAMNILNMLFTGLFTVEMILKLIAFKPKHYFCDAWNTFDALIVVGSIVDIAITEVNPAEHTQCSPSMNAEENSRISITFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTLLWTFIKSFQALPYVALLIVMLFFIYAVIGMQVFGKIALNDTTEINRNNNFQTFPQAVLLLFRCATGEAWQDIMLACMPGKKCAPESEPSNSTEGETPCGSSFAVFYFISFYMLCAFLIINLFVAVIMDNFDYLTRDWSILGPHHLDEFKRIWAEYDPEAKGRIKHLDVVTLLRRIQPPLGFGKLCPHRVACKRLVSMNMPLNSDGTVMFNATLFALVRTALRIKTEGNLEQANEELRAIIKKIWKRTSMKLLDQVVPPAGDDEVTVGKFYATFLIQEYFRKFKKRKEQGLVGKPSQRNA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3
分子量 formula_weight	53889.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MYEDSYVPGFEDSEAGSADSYTSRPSLDSDVSLEEDRESARREVESQAQQQLERAKHKPVAFAVRTNVSYCGVLDEECPVQGSGINFEAKDFLHIKEKYSNDWWIGRLVKEGGDIAFIPSPQRLESIRLKQEQKARRSGNPSSLSDIGNRRSPPPSLAKQKQKQAEHVPPYDVVPSMRPVVLVGPSLKGYEVTDMMQKALFDFLKHRFDGRISITRVTADLSLAKRSVLNNPGKRTIIERSSARSSIAEVQSEIERIFELAKSLQLVVLDADTINHPAQLAKTSLAPIIVFVKVSSPKVLQRLIRSRGKSQMKHLTVQMMAYDKLVQCPPESFDVILDENQLEDACEHLAEYLEVYWRATHHPAPGPGLLGPPSAIPGLQSQQLLGERGEEHSPLERDSLMPSDEAWTGSSQRSSRHLEEDYADAYQDLYQPHRQHTSGLPSANGHDPQDRLLAQDSEHNHNDRNWQRNRPWPKDSY

来源 Source

来源生物 organism	Oryctolagus cuniculus
通用名 common_name	rabbit
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9986
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	[1-(AMINOMETHYL)CYCLOHEXYL]ACETIC ACID
分子量 formula_weight	171.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	(2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate
分子量 formula_weight	649.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	(2S)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate
分子量 formula_weight	579.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL
分子量 formula_weight	386.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 12 Entity 12 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	259107

fit	/app/data/saxs_computation/fd/8fd7/8fd7.fit
pddf	/app/data/pr_computation/fd/8fd7/8fd7.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/fd/8fd7/8fd7.dat

Structure of the human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 complexed with gabapentin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

实体 12 Entity 12 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)