8ffz

TFIIIA-TFIIIC-Brf1-TBP complex bound to 5S rRNA gene

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription factor IIIA

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P39933

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF3A_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–429; UniProt 1–429

Transcription factor tau 138 kDa subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P34111

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TFC3_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–1160; UniProt 1–1160

Transcription factor tau 131 kDa subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P33339

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TFC4_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–1025; UniProt 1–1025

Transcription factor tau 95 kDa subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32367

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TFC1_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–649; UniProt 1–649

Transcription factor tau 91 kDa subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q06339

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TFC6_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–672; UniProt 1–672

Transcription factor tau 60 kDa subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12308

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TFC8_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–588; UniProt 1–588

Transcription factor tau 55 kDa subunit

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12415

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein × 1 (P13393,P29056) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TFC7_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–435; UniProt 1–435

Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P13393

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBP_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 387–566; UniProt 61–240

Transcription factor IIIB 70 kDa subunit,TATA-box-binding protein

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P29056

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 8 DNA 2 Transcription factor IIIA × 1 (P39933) Transcription factor tau 138 kDa subunit × 1 (P34111) Transcription factor tau 131 kDa subunit × 1 (P33339) Transcription factor tau 95 kDa subunit × 1 (P32367) Transcription factor tau 91 kDa subunit × 1 (Q06339) Transcription factor tau 60 kDa subunit × 1 (Q12308) Transcription factor tau 55 kDa subunit × 1 (Q12415) DNA (151-MER) × 1 DNA (151-MER) × 1 ZINC ION × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF3B_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–382; UniProt 1–382 作者链 H; PDB构建体 579–736; UniProt 439–596

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8ffz
沉积日期 deposition_date2022-12-11
结构标题 titleTFIIIA-TFIIIC-Brf1-TBP complex bound to 5S rRNA gene
关键词 keywordstranscription factor, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex; TRANSCRIPTION/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ffz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ffz__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ffz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)75.19 Å
Rg(电子密度)74.46 Å
总 Rg74.63 Å
原子数38962
残基数4347
排除体积677080 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8ffz__assembly_1__model_1 decameric (10) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id8ffzG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1240 — Phosphoglycerate mutase-like
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7. 引用文献 (2)