8gp3

Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 182.6 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-arrestin-1

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–418 链 B； UniProt 1–418	未记录	C-X-C chemokine receptor type 4 × 2 （P61073） Fab30 Heavy Chain × 2 Fab30 Light Chain × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8GP3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4JQI Structure of active beta-arrestin1 bound to a G protein-coupled receptor phosphopeptide 提交 2013-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–393（392 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M L-proline , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
4JQI Structure of active beta-arrestin1 bound to a G protein-coupled receptor phosphopeptide 提交 2013-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–393（392 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PRO PROLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M L-proline , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
6KL7 Beta-arrestin 1 mutant S13D/T275D 提交 2019-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–418（418 aa）	突变：S13D, T275D	BA BARIUM ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.05 M HEPES 7.5, 70 mM BaCl2, 9% PEG 3550	分辨率 2.79 Å R-free 0.274
6KL7 Beta-arrestin 1 mutant S13D/T275D 提交 2019-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–418（418 aa）	突变：S13D, T275D	BA BARIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.05 M HEPES 7.5, 70 mM BaCl2, 9% PEG 3550	分辨率 2.79 Å R-free 0.274
6U1N GPCR-Beta arrestin structure in lipid bilayer 提交 2019-08-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 2–393（392 aa）	未记录	2CU 3-amino-5-chloro-N-cyclopropyl-4-methyl-6-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]thieno[2,3-b]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8GO8 Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C5a anaphylatoxin chemotactic receptor 1, C5aR1 提交 2022-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–418（418 aa）链 B 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.41 Å
8HST The structure of rat beta-arrestin1 提交 2022-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–394（394 aa）	突变：C59V,C125S,C140S,C150V,C242V,C251V,C269S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；5% (w/v) PEG 8000, 100mM Imidazole/ Hydrochloric acid pH 8.0, 100mM Calcium acetate	分辨率 2.66 Å R-free 0.248
8HST The structure of rat beta-arrestin1 提交 2022-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–394（394 aa）	突变：C59V,C125S,C140S,C150V,C242V,C251V,C269S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；5% (w/v) PEG 8000, 100mM Imidazole/ Hydrochloric acid pH 8.0, 100mM Calcium acetate	分辨率 2.66 Å R-free 0.248
8HSV The structure of rat beta-arrestin1 in complex with a rat Mdm2 peptide 提交 2022-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–394（394 aa）链 B 1–394（394 aa）	突变：C59V,C125S,C140S,C150V,C242V,C251V,C269S 突变：C59V,C125S,C140S,C150V,C242V,C251V,C269S	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；1M ammonium sulfate, 0.1M HEPES pH 9.5, 5mM n-dodecyl-b-iminodipropionic acid, monosodium salt	分辨率 3.00 Å R-free 0.208
8I0N Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C5a anaphylatoxin chemotactic receptor 1, C5aR1 (Local refine) 提交 2023-01-11	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–418（418 aa）链 B 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.26 Å
8I0Q Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4 (Local refine) 提交 2023-01-11	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–418（418 aa）链 B 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.45 Å
8J8Z Structure of beta-arrestin1 in complex with D6Rpp 提交 2023-05-02	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–418（418 aa）链 B 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8JA3 Structure of beta-arrestin1 in complex with C3aRpp 提交 2023-05-05	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–357（357 aa）链 B 1–357（357 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.94 Å
9BT8 Structure of Src in complex with beta-arrestin 1 revealing SH3 binding sites 提交 2024-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–393（392 aa）	突变：C59V, P120C, C125S, C140L, C150V, C242V, C251V, C269S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9CX3 Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1 提交 2024-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–393（392 aa）	突变：C59V, P120C, C125S, C140L, C150V, C242V, C251V, C269S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9CX9 Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1 提交 2024-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 2–393（392 aa）	突变：C59V, E92C, C125S, C140L, C150V, C242V, C251V, C269S	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9DNG Structure of rat beta-arrestin 1 by fiducial-assisted cryo-EM 提交 2024-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–176（175 aa）链 A 182–393（212 aa）	突变：M29W, H124I, R128L 突变：M29W, H124I, R128L	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.52 Å
9DNM Structure of rat beta-arrestin 1 bound to allosteric inhibitor 提交 2024-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–176（175 aa）链 A 182–393（212 aa）	突变：M29W, H124I, R128L 突变：M29W, H124I, R128L	ODN (1beta,6beta,7beta,8alpha,9beta,10alpha,13alpha,14R,16beta)-1,6,7,14-tetrahydroxy-7,20-epoxykauran-15-one × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9KYU Structure of beta-arrestin1 in complex with mouse C5aR1pp 提交 2024-12-09	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–418（418 aa）链 D 1–418（418 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å

共 16 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARRB1_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–418； UniProt 1–418 作者链 B； PDB构建体 1–418； UniProt 1–418

C-X-C chemokine receptor type 4

物种未注明

UniProt P61073

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 336–352 链 V； UniProt 336–352	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Beta-arrestin-1 × 2 （P29066） Fab30 Heavy Chain × 2 Fab30 Light Chain × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8GP3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
22XC Structure of CXCR4 in complex with a de-novo designed mini-protein antagonist 提交 2026-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–352（351 aa）链 G 2–352（351 aa）链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 3 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.28 Å
2K03 Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing a sulfotyrosine at postition 21 提交 2008-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–38（38 aa）片段：N-terminus, residues 1-38 链 D 1–38（38 aa）片段：N-terminus, residues 1-38	突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）21；压力 AMBIENT NMR样品组成 .338 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCL12/SDF1-alpha, .970 mM CXCR4, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.07 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCR4, 0.67 mM CXCL12/SDF1-alpha, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2K04 Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing no sulfotyrosines 提交 2008-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–38（38 aa）片段：N-terminus, residues 1-38 链 D 1–38（38 aa）片段：N-terminus, residues 1-38	突变：C28A 突变：C28A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）21；压力 AMBIENT NMR样品组成 .31 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCL12/SDF1-alpha, .775 mM CXCR4, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCR4, 0.625 mM CXCL12/SDF1-alpha, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2K05 Structure of SDF1 in complex with the CXCR4 N-terminus containing sulfotyrosines at postitions 7, 12 and 21 提交 2008-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–38（38 aa）片段：N-terminus, residues 1-38 链 D 1–38（38 aa）片段：N-terminus, residues 1-38	突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C28A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；308 K；离子强度（mmCIF原始值）21；压力 AMBIENT NMR样品组成 .338 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCL12/SDF1-alpha, .97 mM CXCR4, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.07 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CXCR4, 0.67 mM CXCL12/SDF1-alpha, 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N55 Structure of constitutively monomeric CXCL12 in complex with the CXCR4 N-terminus 提交 2015-07-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–38（38 aa）	突变：C28A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient NMR样品组成 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 25 mM [U-2H] MES, 10 % [U-99% 2H] D2O, 0.02 % sodium azide, 2 mM protein_2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_2, 25 mM [U-2H] MES, 0.02 % sodium azide, 10 % [U-99% 2H] D2O, 2 mM protein_1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3ODU The 2.5 A structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with small molecule antagonist IT1t 提交 2010-08-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 A 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 B 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 B 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319	突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T	ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 5 OLA OLEIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 20% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Taurine, 0.1M Sodium citrate, pH 5.5, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.282
3OE0 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a cyclic peptide antagonist CVX15 提交 2010-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–228（227 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319 链 A 231–319（89 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319	突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 7；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 25% PEG400, 0.3M Potassium sodium tartrate, 0.1 M Tris pH 7.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.267
3OE6 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in I222 spacegroup 提交 2010-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-325 链 A 230–325（96 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-325	突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T	ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 6 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 20-26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Nickel chloride, 0.1M Sodium citrate pH 5.0-5.5, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.306
3OE8 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 B 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 C 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 C 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319	突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T	ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Strontium chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.295
3OE8 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 A 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 B 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 B 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 C 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 C 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319	突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T	ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Strontium chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.295
3OE8 Crystal structure of the CXCR4 chemokine receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–229（228 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319 链 A 230–319（90 aa）片段：CXCR4 residues 2-229, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 230-319	突变：L125W, C1054T, C1097T 突变：L125W, C1054T, C1097T	ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 26% PEG400, 0.3M Sodium malonate, 5mM Strontium chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.295
3OE9 Crystal structure of the chemokine CXCR4 receptor in complex with a small molecule antagonist IT1t in P1 spacegroup 提交 2010-08-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–228（227 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319 链 A 231–319（89 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319 链 B 2–228（227 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319 链 B 231–319（89 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319	突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, C1054T, C1097T	ITD (6,6-dimethyl-5,6-dihydroimidazo[2,1-b][1,3]thiazol-3-yl)methyl N,N'-dicyclohexylimidothiocarbamate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 6；293 K；Lipidic cubic phase made of monoolein and cholesterol, 27-35% PEG400, 0.27-0.33M Sodium malonate, 5mM Hexamine cobalt chloride, 0.1M MES pH 6.0, LIPIDIC CUBIC PHASE, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.284
4RWS Crystal structure of CXCR4 and viral chemokine antagonist vMIP-II complex (PSI Community Target) 提交 2014-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–228（227 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319 链 A 231–319（89 aa）片段：CXCR4 residues 2-228, LYSOZYME residues 1002-1161, CXCR4 residues 231-319	突变：L125W, T240P, D187C, C1054T, C1097T 突变：L125W, T240P, D187C, C1054T, C1097T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；pH 5.5；293 K；100 mM sodium citrate pH 5.5, 28% PEG 400, 120 mM ammonium phosphate dibasic, 2-6% polypropylene P400, Lipidic cubic phase, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
8I0Q Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4 (Local refine) 提交 2023-01-11	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 U 336–352（17 aa）链 V 336–352（17 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.45 Å
8K3Z Cryo-EM structure of CXCR4 in complex with CXCL12 提交 2023-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 25–320（296 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.81 Å
8U4N Structure of Apo CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å
8U4O Structure of CXCL12-bound CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å
8U4P Structure of AMD3100-bound CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1 VH6 Plerixafor × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
8U4Q Structure of REGN7663 Fab-bound CXCR4/Gi complex 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.36 Å
8U4R Structure of REGN7663-Fab bound CXCR4 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8U4S Structure of trimeric CXCR4 in complex with REGN7663 Fab 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 C 2–352（351 aa）链 G 2–352（351 aa）链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 6 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
8U4T Structure of tetrameric CXCR4 in complex with REGN7663 Fab 提交 2023-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 AA 2–352（351 aa）链 I 2–352（351 aa）链 Q 2–352（351 aa）链 R 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 16 D21 (2R)-1-(hexadecanoyloxy)-3-(phosphonooxy)propan-2-yl (9Z)-octadec-9-enoate × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.38 Å
8YU7 Cryo-EM structure of CXCR4 tetramer 提交 2024-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–352（351 aa）链 B 2–352（351 aa）链 C 2–352（351 aa）链 D 2–352（351 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
8ZPL Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist HF51116 提交 2024-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 1–224（224 aa）链 R 241–319（79 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 2 A1D8K (2S)-N-[[4-[[3-(cyclohexylamino)propylamino]methyl]phenyl]methyl]-5-(diaminomethylideneamino)-2-(pyridin-2-ylmethylamino)pentanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å
8ZPM Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist AMD070 提交 2024-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 1–224（224 aa）链 R 241–319（79 aa）	未记录	A1D8L Mavorixafor × 1 CLR CHOLESTEROL × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8ZPN Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with antagonist AMD3100 提交 2024-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 R 1–224（224 aa）链 R 241–319（79 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1 VH6 Plerixafor × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å
9MDU Human CXCR4 tetramer 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–352（352 aa）链 B 1–352（352 aa）链 C 1–352（352 aa）链 D 1–352（352 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9ME1 hCXCR4-CXCL12 complex with 1:1 stoichiometry 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–352（352 aa）链 B 1–352（352 aa）链 C 1–352（352 aa）链 D 1–352（352 aa）链 E 1–352（352 aa）链 I 1–352（352 aa）链 K 1–352（352 aa）链 L 1–352（352 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
9MEJ Global structure of hCXCR4 and HIV-2 gp120 提交 2024-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–352（352 aa）链 B 1–352（352 aa）链 C 1–352（352 aa）链 D 1–352（352 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.99 Å
9MEN CryoEM structure of hCXCR4 tetramer bound to HIV-2/gp120/V3 loop 提交 2024-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–352（352 aa）链 B 1–352（352 aa）链 C 1–352（352 aa）链 D 1–352（352 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.57 Å
9MET CXCR4-HIV-2/gp120-CD4 提交 2024-12-08	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 M 1–352（352 aa）链 N 1–352（352 aa）链 O 1–352（352 aa）链 S 1–352（352 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.65 Å
9MEU CXCR4 tetramer bound to 4 CXCL12 dimers 提交 2024-12-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–352（352 aa）链 B 1–352（352 aa）链 C 1–352（352 aa）链 D 1–352（352 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å
9UPU Cryo-EM strucutre of CXCR4 complexed with agonist SDV1a 提交 2025-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 1–337（337 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9UPV Cryo-EM structure of CXCR4 complexed with agonist SDVX1 提交 2025-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 1–337（337 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å

共 32 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CXCR4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–17； UniProt 336–352 作者链 V； PDB构建体 1–17； UniProt 336–352

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8gp3
沉积日期 deposition_date	2022-08-25
结构标题 title	Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4
关键词 keywords	GPCR, Arrestin, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	55.76 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	56.21 Å
零角强度 I(0) i0	389579000.00
分子量 molecular_weight	163120.0 kDa
排除体积 excluded_volume	203700 Å³
包络体积 envelope_volume	325350 Å³
水化壳体积 shell_volume	51899 Å³
包络直径 envelope_diameter	194.2 Å
壳层 Rg shell_rg	52.31 Å
包络 Rg envelope_rg	55.59 Å
形状 Rg shape_rg	56.28 Å
总 Rg total_rg	55.85 Å
总原子数 total_atoms	11494
残基数 n_residues	1512
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	182.6 Å
Rg (实空间) rg_real	56.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.55 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8960e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.4690e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	55.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	389000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7774
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	39.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.439
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.633
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	24790000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.765; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.697; Smooth: 0.109

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-arrestin-1
分子量 formula_weight	47088.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	11494

MGDKGTRVFKKASPNGKLTVYLGKRDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLKERRVYVTLTCAFRYGREDLDVLGLTFRKDLFVANVQSFPPAPEDKKPLTRLQERLIKKLGEHAYPFTFEIPPNLPCSVTLQPGPEDTGKACGVDYEVKAFCAENLEEKIHKRNSVRLVIRKVQYAPERPGPQPTAETTRQFLMSDKPLHLEASLDKEIYYHGEPISVNVHVTNNTNKTVKKIKISVRQYADICLFNTAQYKCPVAMEEADDTVAPSSTFCKVYTLTPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTLLREGANREILGIIVSYKVKVKLVVSRGGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPKEEPPHREVPESETPVDTNLIELDTNDDDIVFEDFARQRLKGMKDDKDEEDDGTGSPHLNNR

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	C-X-C chemokine receptor type 4
分子量 formula_weight	2380.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,U

GHSSVSTESESSSFHSS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fab30 Heavy Chain
分子量 formula_weight	25512.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I

EISEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNVYSSSIHWVRQAPGKGLEWVASISSYYGYTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSRQFWYSGLDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Fab30 Light Chain
分子量 formula_weight	23435.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

SDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSVSSAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASSLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYKYVPVTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDSQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

▶

8. 引用文献 (2)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	53387

fit	/app/data/saxs_computation/gp/8gp3/8gp3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/gp/8gp3/8gp3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/gp/8gp3/8gp3.dat

Structure of beta-arrestin1 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C-X-C chemokine receptor type 4, CXCR4

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-arrestin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

C-X-C chemokine receptor type 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)