8h4r

The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex with Dinaciclib from Biortus

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 81.7 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme,Cyclin-dependent kinase 3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–218	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G1/S-specific cyclin-E1 × 1 （P24864） 1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH 6.60	分辨率 2.75 Å R-free 0.223

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8H4R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B8X GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FUSED WITH THE NUCLEAR MATRIX TARGETING SIGNAL OF THE TRANSCRIPTION FACTOR AML-1 提交 1999-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–280（280 aa）片段：NMTS FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.310
1B8X GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FUSED WITH THE NUCLEAR MATRIX TARGETING SIGNAL OF THE TRANSCRIPTION FACTOR AML-1 提交 1999-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–280（280 aa）片段：NMTS FRAGMENT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.310
1BG5 CRYSTAL STRUCTURE OF THE ANKYRIN BINDING DOMAIN OF ALPHA-NA,K-ATPASE AS A FUSION PROTEIN WITH GLUTATHIONE S-TRANSFERASE 提交 1998-06-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）片段：RESIDUES 1-218 FROM GLUTATHIONE S-TRANSFERASE, RESIDUES 219-254 FROM MINIMAL ALPHA-NA,K-ATPASE ANKYRIN BINDING DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.8；pH 8.8	分辨率 2.60 Å R-free 0.359
1DUG STRUCTURE OF THE FIBRINOGEN G CHAIN INTEGRIN BINDING AND FACTOR XIIIA CROSSLINKING SITES OBTAINED THROUGH CARRIER PROTEIN DRIVEN CRYSTALLIZATION 提交 2000-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；PEG 3350, sodium acetate, sodium chloride, ammonium sulfate, Tris, reduced glutathione, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
1GNE THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF GLUTATHIONE S-TRANSFERASE OF SCHISTOSOMA JAPONICUM FUSED WITH A CONSERVED NEUTRALIZING EPITOPE ON GP41 OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
1GTA CRYSTAL STRUCTURES OF A SCHISTOSOMAL DRUG AND VACCINE TARGET: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FROM SCHISTOSOMA JAPONICA AND ITS COMPLEX WITH THE LEADING ANTISCHISTOSOMAL DRUG PRAZIQUANTEL 提交 1994-12-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å
1GTB CRYSTAL STRUCTURES OF A SCHISTOSOMAL DRUG AND VACCINE TARGET: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FROM SCHISTOSOMA JAPONICA AND ITS COMPLEX WITH THE LEADING ANTISCHISTOSOMAL DRUG PRAZIQUANTEL 提交 1994-12-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	PZQ PRAZIQUANTEL × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å
1M99 Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with glutathione sulfonic acid 提交 2002-07-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	GTS GLUTATHIONE SULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；ammonium sulfate, ethanol, dithiothrietol, threalose, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.261
1M9A Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with S-hexylglutathione 提交 2002-07-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；ammonium sulfate,ethanol, dithiothrietol, threalose, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.224
1M9B Crystal structure of the 26 kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum complexed with gamma-glutamyl[S-(2-iodobenzyl)cysteinyl]glycine 提交 2002-07-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	IBG GAMMA-GLUTAMYL[S-(2-IODOBENZYL)CYSTEINYL]GLYCINE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；ammonium sulfate, ethanol, dithiothrietol, threalose, sodium acetate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.60 Å R-free 0.275
1U87 Crystal Structure Of The 26 Kda Glutathione S-Transferase Y7F mutant From Schistosoma Japonicum Complexed With Glutathione 提交 2004-08-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	突变：Y7F	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；0.2M sodium citrate, 2M ammonium sulphate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 3.50 Å R-free 0.271
1U88 Crystal Structure Of The 26 Kda Glutathione S-Transferase Y7F mutant From Schistosoma Japonicum Complexed With S-Octyl Glutathione 提交 2004-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	突变：Y7F 突变：Y7F	GTY L-GAMMA-GLUTAMYL-S-OCTYL-D-CYSTEINYLGLYCINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；297 K；0.2M sodium citrate, 2M ammonium sulphate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 3.50 Å R-free 0.317
1UA5 Non-fusion GST from S. japonicum in complex with glutathione 提交 2003-02-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；ammonium sulfate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.50 Å R-free 0.221
1Y6E Orthorhombic glutathione S-transferase of Schistosoma japonicum 提交 2004-12-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–217（217 aa）链 B 1–217（217 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Modified Microbatch；pH 5.5；294 K；25% (w/v) PEG 3350, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, Modified Microbatch, temperature 294K X-ray结晶条件 Modified Microbatch；pH 5.5；294 K；36% (w/v) PEG MME 5000, 0.1M sodium acetate pH 5.5, Modified Microbatch, temperature 294K	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
3CRT Structural characterization of an engineered allosteric protein 提交 2008-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–214（214 aa）	突变：L50C	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG8000, 50mM tris, 5mM B-mercaptoethanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3CRU Structural characterization of an engineered allosteric protein 提交 2008-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–214（214 aa）	突变：L50C	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；20% PEG8000, 50 mM Tris-HCL, 3 mM B-ME., pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.291
3D0Z Structural charcaterization of an engineered allosteric protein 提交 2008-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–214（214 aa）	突变：L50H	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；20% PEG8000, 50mM TRIS, 5mM B-mercaptoethanol , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.311
3QMZ Crystal structure of the cytoplasmic dynein heavy chain motor domain 提交 2011-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 T 2–218（217 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 5.7	分辨率 6.00 Å R-free 0.430
3QMZ Crystal structure of the cytoplasmic dynein heavy chain motor domain 提交 2011-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 2–218（217 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M sodium citrate, 0.2 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 5.7	分辨率 6.00 Å R-free 0.430
4AI6 Dynein Motor Domain - ADP complex 提交 2012-02-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092 链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.40 Å R-free 0.303
4AKG Dynein Motor Domain - ATP complex 提交 2012-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092 链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å R-free 0.305
4AKH Dynein Motor Domain - AMPPNP complex 提交 2012-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.60 Å R-free 0.302
4AKH Dynein Motor Domain - AMPPNP complex 提交 2012-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.60 Å R-free 0.302
4AKI Dynein Motor Domain - LuAc derivative 提交 2012-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092 链 B 2–218（217 aa）片段：RESIDUES 1-218,1364-3038,3292-4092	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.70 Å R-free 0.289
4ECB Chimeric GST Containing Inserts of Kininogen Peptides 提交 2012-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–49（49 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228 链 A 50–218（169 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228 链 B 1–49（49 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228 链 B 50–218（169 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-507, 50-228	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, 200 mM KCl, 35% Pentaerythritol propoxylate, 0.1 M ATP solution, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.248
4ECC Chimeric GST Containing Inserts of Kininogen Peptides 提交 2012-03-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–49（49 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-510, 50-228 链 A 50–215（166 aa）片段：unp residues 1-49, kinonogen 498-510, 50-228	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；(1)0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M Hepes, 25% PEG 3350 (2)0.2 M Lithium Sulfate, 25% PEG 3350, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.269
4WR4 Crystal Structure of GST Mutated with Halogenated Tyrosine (7bGST-1) 提交 2014-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GSH Glutathione × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M TRI-SODIUM CITRATE, 1.3M AMMONIUM SULFATE, 0.2M LITHIUM SULFATE	分辨率 1.60 Å R-free 0.222
4WR5 Crystal Structure of GST Mutated with Halogenated Tyrosine (7cGST-1) 提交 2014-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GSH Glutathione × 2 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；2.0M AMMONIUM SULFATE, 0.1M MES PH 7.0	分辨率 1.93 Å R-free 0.233
5GZZ Crystal Structure of FIN219-SjGST complex with JA 提交 2016-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）	未记录	JAA {(1R,2R)-3-oxo-2-[(2Z)-pent-2-en-1-yl]cyclopentyl}acetic acid × 1 GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；297 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
5GZZ Crystal Structure of FIN219-SjGST complex with JA 提交 2016-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；297 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
5GZZ Crystal Structure of FIN219-SjGST complex with JA 提交 2016-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；297 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris-HCl, 40%(w/v) PEG 4000	分辨率 2.39 Å R-free 0.234
6JI6 Crystal structure of glutathione S-transferase complexed and modified with glutathione 提交 2019-02-20	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 8 ACT ACETATE ION × 4 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M Bis-Tris, 0.4M Ammonium acetate, 26% w/v PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.224
6N8U DRAFT model of Schistosoma japonicum Glutathione S-transferase expression tag 提交 2018-11-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG3350, 0.1M sodium acetate	分辨率 1.96 Å R-free 0.256
6RWD Crystal structure of SjGST in complex with GSH and ellagic acid at 1.53 Angstrom resolution 提交 2019-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	GSH Glutathione × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 REF 2,3,7,8-tetrahydroxychromeno[5,4,3-cde]chromene-5,10-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；8.5 mg/ml SjGST in 10 mM Tris HCl, pH 7.0 was crystallised in 0.2M sodium chloride, 0.1 M BIS-TRIS, pH 5.5, 25% (w/v) PEG 3350.	分辨率 1.53 Å R-free 0.216
7AL7 The Crystal Structure of Human IL-18 in Complex With Human IL-18 Binding Protein 提交 2020-10-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–218（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.2 M Calcium acetate hydrate, 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, 18% w/v Polyethylene glycol 8000	分辨率 1.80 Å R-free 0.232
7ESG Crystal structure of Haloarcula marismortui CheB with Glutathione S-transferase expression tag 提交 2021-05-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289.15 K；20% PEG 3350, 200 mM Potassium citrate tribasic monohydrate, pH 8.3	分辨率 2.53 Å R-free 0.372
7NT8 Influenza virus H3N2 nucleoprotein - R416A mutant 提交 2021-03-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.02 M of each alcohol (1,6-hexanediol, 0.2 M 1-butanol, 0.2 M (RS)-1,2- propanediol, 0.2 M 2-propanol, 0.2 M 1,4-butanediol, 0.2 M 1,3-propanediol), 0.1 M MES/imidazole pH 6.5.	分辨率 2.22 Å R-free 0.265
7NT8 Influenza virus H3N2 nucleoprotein - R416A mutant 提交 2021-03-09	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% w/v PEG 8000, 20% v/v ethylene glycol, 0.02 M of each alcohol (1,6-hexanediol, 0.2 M 1-butanol, 0.2 M (RS)-1,2- propanediol, 0.2 M 2-propanol, 0.2 M 1,4-butanediol, 0.2 M 1,3-propanediol), 0.1 M MES/imidazole pH 6.5.	分辨率 2.22 Å R-free 0.265
7XQK The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex from Biortus. 提交 2022-05-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH6.5	分辨率 2.25 Å R-free 0.202
8DHB Active FLCN GAP complex 提交 2022-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 H 2–218（217 aa）	未记录	CZC [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,6-bis(oxidanylidene)-3~{H}-purin-9-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.53 Å
8GYD Structure of Schistosoma japonicum Glutathione S-transferase bound with the ligand complex of 16 提交 2022-09-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	0IH (2R)-2-[[2-(5-chloranylthiophen-2-yl)-4-oxidanylidene-6-[2-(1H-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)phenyl]quinazolin-3-yl]methyl]-3-(4-chlorophenyl)propanoic acid × 3 EOH ETHANOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；49% Saturated ammonium sulfate, 0.3 M Sodium acetate, pH 5.6, 2% ethanol, 10 mM DTT	分辨率 1.70 Å R-free 0.215
8JHU Legionella effector protein SidI 提交 2023-05-25	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8OK1 WD repeat containing protein 5 (WDR5)- N225A mutant 提交 2023-03-26	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 50 mM ammonium sulfate, 24% PEG3350	分辨率 1.38 Å R-free 0.218
8OKF WD repeat containing protein 5 (WDR5)- PER2 peptide 提交 2023-03-28	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	144 TRIS-HYDROXYMETHYL-METHYL-AMMONIUM × 2 CL CHLORIDE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Tris pH 8.0, 50 mM sodium chloride, 13% PEG8000	分辨率 1.85 Å R-free 0.201
8RDY Saccharomyces cerevisiae Prp43 helicase in complex with Pxr1 提交 2023-12-08	突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–218（218 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.33 Å
8SEN Cryo-EM Structure of RyR1 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.49 Å
8SEO Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.92 Å
8SEP Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.57 Å
8SEQ Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8SER Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
8SES Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 ADE ADENINE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.98 Å
8SET Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP 提交 2023-04-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9AXA CryoEM structure of activated CRAF/MEK/14-3-3 complex with NST-628 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）	突变：Y340D Y341D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：Y340D Y341D 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
9AXC Activated CRAF/MEK heterotetramer from focused refinement of CRAF/MEK/14-3-3 complex 提交 2024-03-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）	突变：Y340D Y341D 突变：Y340D Y341D	A1AHE N-[3-fluoro-4-({7-[(3-fluoropyridin-2-yl)oxy]-4-methyl-2-oxo-2H-1-benzopyran-3-yl}methyl)pyridin-2-yl]-N'-methylsulfuric diamide × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.16 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric	链 DA 1–218（218 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric	链 DA 1–218（218 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.78 Å
9JPR Local refinement of H11 nanotubes assembled from baculovirus capsid protein 提交 2024-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9JPS Local refinement of H12 nanotubes assembled from baculovirus capsid protein 提交 2024-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9K2O Local refinement of A7 nanotubes assembled from baculovirus capsid protein 提交 2024-10-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）链 C 1–218（218 aa）链 D 1–218（218 aa）链 E 1–218（218 aa）链 F 1–218（218 aa）链 G 1–218（218 aa）链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9N48 Crystal structure of PAK1 bound to compound C1 提交 2025-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	A1BV1 (6M)-8-[2-(2-aminoethoxy)ethyl]-6-[2-chloro-3-fluoro-4-(2-oxopyrrolidin-1-yl)phenyl]-2-(ethylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；0.2 M Lithium Sulfate, 0.1 M Tris pH8.5, 30% PEG4000	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
9N4U Crystal structure of PAK1 bound to compound R1 提交 2025-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	A1BV8 (3M)-3-[(4P)-2-chloro-4-(6-methylpyridin-2-yl)phenyl]-1-{2-[2-(dimethylamino)ethoxy]ethyl}-1,6-naphthyridin-2(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris pH 8.5, 30% PEG4000	分辨率 1.77 Å R-free 0.203
9NBX Crystal structure of PAK1 bound to C2 提交 2025-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–218（217 aa）链 B 2–218（217 aa）	未记录	A1BW5 (6M)-8-(3-aminopropyl)-6-(4-butoxy-2-methylphenyl)-2-(methylamino)pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2M Lithium Sulfate, 0.1M Tris pH8.5, 30% PEG 4000	分辨率 2.15 Å R-free 0.265
9NMC SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile 提交 2025-03-04	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY2 (3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.285
9NMD SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 3-(6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl)propanenitrile 提交 2025-03-04	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY1 3-[(3P)-6-bromo-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxoquinolin-1(4H)-yl]propanenitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；0.2 M sodium chloride, 0.1 M Bis-TRIS pH 5.5-7.5, 25 % PEG 33500	分辨率 2.40 Å R-free 0.268
9NME SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-[2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-8-yl]benzonitrile 提交 2025-03-04	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY3 (2M)-2-[(3P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-4-oxo-6-(trifluoromethyl)-1,4-dihydroquinolin-8-yl]benzonitrile × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350	分辨率 1.60 Å R-free 0.228
9NMF SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(6-amino-3-pyridyl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	A1BY4 (3P,8M)-8-(6-aminopyridin-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.2 M Lithium Sulfate monohydrate, 0.1M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.225
9NMG SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）链 B 1–218（218 aa）	未记录	A1BY5 (3P,8P)-8-(2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2 M lithium sulfate, 0.1 M BIS-TRIS pH 6.5-7.5, 25 % PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
9NMH SARS-CoV-2 3CLPro in complex with 2-hydroxy-3-(4-isoquinolyl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)-1H-quinolin-4-one 提交 2025-03-04	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–218（218 aa）	未记录	A1BY6 (3P,8P)-2-hydroxy-3-(isoquinolin-4-yl)-8-(1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-6-(trifluoromethyl)quinolin-4(1H)-one × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M NaCl, 0.1 M BIS-TRIS pH 5.5-7.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.274
9RPD D. melanogaster Augmin TII N-clamp (GST-fusion) bound to a microtubule, well-defined subset of particles 提交 2025-06-24	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 K 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
9YW2 Complex structure of human p97 bound to Faf1 and Ufd1 (NTD focused) 提交 2025-10-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 1–218（218 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å

共 64 个其他 PDB 条目、70 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	GST26_SCHJA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218

Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme,Cyclin-dependent kinase 3

Homo sapiens

UniProt Q00526

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–305	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G1/S-specific cyclin-E1 × 1 （P24864） 1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH 6.60	分辨率 2.75 Å R-free 0.223

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8H4R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7XQK The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex from Biortus. 提交 2022-05-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–305（305 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH6.5	分辨率 2.25 Å R-free 0.202

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	CDK3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 229–533； UniProt 1–305

G1/S-specific cyclin-E1

Homo sapiens

UniProt P24864

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 96–378	未记录	Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme,Cyclin-dependent kinase 3 × 1 （P08515,Q00526） 1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH 6.60	分辨率 2.75 Å R-free 0.223

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8H4R	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1W98 The structural basis of CDK2 activation by cyclin E 提交 2004-10-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）片段：FRAGMENT DERIVED FROM ELASTASE CLEAVAGE, RESIDUES 96-378	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；PCDK2/CYCLIN E (6-8 MG/ML), 1 MM AMPPNP, 10-15% PEG3350, 0.2 M SODIUM CITRATE PH7.5, pH 7.50	分辨率 2.15 Å R-free 0.246
5L2W The X-ray co-crystal structure of human CDK2/CyclinE and Dinaciclib. 提交 2016-08-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 81–363（283 aa）片段：UNP residues 81-363	未记录	1QK 3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；286.15 K；PEG20K, 180mM Mg(HCO2)2, 0.1M MES pH 6.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.246
7KJS Crystal structure of CDK2/cyclin E in complex with PF-06873600 提交 2020-10-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	WG1 6-(difluoromethyl)-8-[(1R,2R)-2-hydroxy-2-methylcyclopentyl]-2-{[1-(methylsulfonyl)piperidin-4-yl]amino}pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；294.15 K；0.1 M MES pH 6, .18 M magnesium formate, and 9.0 % (w/v) PEG 20000	分辨率 2.19 Å R-free 0.278
7XQK The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex from Biortus. 提交 2022-05-07	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.6M MgSO4, 0.1M MES pH6.5	分辨率 2.25 Å R-free 0.202
8H6P Complex structure of CDK2/Cyclin E1 and a potent, selective macrocyclic inhibitor 提交 2022-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 103–373（271 aa）片段：Residues 103-373	未记录	WZU (7S,10R)-11-oxa-2,4,5,13,17,23-hexaazatetracyclo[17.3.1.1~3,6~.1~7,10~]pentacosa-1(23),3(25),5,19,21-pentaene-12,18-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M sodium citrate pH 6.5, 10% PEG3350	分辨率 2.44 Å R-free 0.292
8H6T Complex structure of CDK2/Cyclin E1 and a potent, selective small molecule inhibitor 提交 2022-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 102–373（272 aa）片段：Residues 103-373	未记录	WZZ (1R,3S)-3-{3-[(pyridin-2-yl)amino]-1H-pyrazol-5-yl}cyclopentyl propan-2-ylcarbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.2 M sodium citrate pH 6.5, 10% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.358
8VQ3 CDK2-CyclinE1 in complex with allosteric inhibitor I-198. 提交 2024-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1AC4 (8R)-N-[(2S,3R)-3-(cyclohexylmethoxy)-1-(morpholin-4-yl)-1-oxobutan-2-yl]-2-[(1S)-2,2-dimethylcyclopropane-1-carbonyl]-6-(1,3-thiazole-5-carbonyl)-2,6-diazaspiro[3.4]octane-8-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.21 M sodium citrate tribasic dihydrate, 19.09% PEG3350	分辨率 1.84 Å R-free 0.217
8VQ4 CDK2-CyclinE1 in complex with allosteric inhibitor I-125A. 提交 2024-01-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1AC5 (8R)-6-(1-benzyl-1H-pyrazole-4-carbonyl)-N-[(2S,3R)-3-(2-cyclohexylethoxy)-1-(methylamino)-1-oxobutan-2-yl]-2-[(1S)-2,2-dimethylcyclopropane-1-carbonyl]-2,6-diazaspiro[3.4]octane-8-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；0.21 M sodium citrate tribasic dihydrate, 19.5% PEG3350	分辨率 1.90 Å R-free 0.219
9BJC Crystal structure of CDK2/Cyclin E1 in complex with XC208 提交 2024-04-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）片段：residues 96-378	未记录	A1AQZ (5aS,6S,7S)-3,7-dihydroxy-6-methoxy-1,4,6,9-tetramethyl-6,7-dihydrodibenzo[b,f][1,4]oxazepine-8,11(5aH,10H)-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M Tris pH 7.5, 3.6M NaCl	分辨率 2.22 Å R-free 0.213
9D0V Crystal structure of CDK2/CyclinE1 in complex with Cpd 2 提交 2024-08-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	A1A1H 6-chloro-8-cyclopentyl-2-[4-(ethanesulfonyl)-2-methylanilino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-7(8H)-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 3.0 M Sodium Chloride, 25% glycerol.	分辨率 2.54 Å R-free 0.231
9D0W Cryo-EM structure of CDK2/CyclinE1 in complex with CRBN/DDB1 and Cpd 4 提交 2024-08-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 96–378（283 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1A1I (3R)-3-(5-{4-[(2-{4-[(8-cyclopentyl-7-oxo-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)amino]-3-methylbenzene-1-sulfonyl}-7-azaspiro[3.5]nonan-7-yl)methyl]piperidin-1-yl}-4-fluoro-3-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)piperidine-2,6-dione × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
9D0X Cryo-EM structure of CDK2/CyclinE1 in complex with CRBN/DDB1 and Cpd 4 (local mask) 提交 2024-08-07	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 96–378（283 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1A1I (3R)-3-(5-{4-[(2-{4-[(8-cyclopentyl-7-oxo-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)amino]-3-methylbenzene-1-sulfonyl}-7-azaspiro[3.5]nonan-7-yl)methyl]piperidin-1-yl}-4-fluoro-3-methyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-1,3-benzimidazol-1-yl)piperidine-2,6-dione × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.84 Å
9GOP Crystal structure of CDK2-cyclin E1 bound by compound 30 提交 2024-09-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1IOI 2-[(2~{S})-1-[9-ethyl-6-[(2-methyl-5-methylsulfonyl-pyrazol-3-yl)amino]purin-2-yl]-4,4-bis(fluoranyl)pyrrolidin-2-yl]propan-2-ol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8-15 % PEG3350, 0.2M Na3Cit pH 8.0	分辨率 2.16 Å R-free 0.271
9GP3 Crystal structure of CDK2-cyclin E1 bound by compound 11 (AZD8421) 提交 2024-09-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1IOP (3~{S})-~{N}-ethyl-3-[[9-ethyl-2-[[(2~{R},3~{S})-2-oxidanylpentan-3-yl]amino]purin-6-yl]amino]pyrrolidine-1-sulfonamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；8-15% PEG3350 / 0.2M Na3Cit pH8.0	分辨率 2.45 Å R-free 0.273
9NYQ Crystal structure of CDK2/CyclinE1 in complex with Cpd 3 提交 2025-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–410（410 aa）	未记录	A1B7H 4-({4-[(1s,4s)-4-hydroxy-4-methylcyclohexyl]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl}amino)-N,3-dimethylbenzene-1-sulfonamide × 1 CIT CITRIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Tri-Ammonium citrate, pH7.0,13% PEG3350	分辨率 2.85 Å R-free 0.264
9NYR Cryo-EM structure of CDK2/CyclinE1 in complex with CRBN/DDB1 and Cpd 24 提交 2025-03-28	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 96–378（283 aa）	未记录	A1B7G N-{(1R,4S)-4-[(4-{3-chloro-4-[(3R)-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyridin-3-yl]phenyl}piperazin-1-yl)methyl]cyclohexyl}-4-({4-[(3S)-3-hydroxy-3-methylpiperidin-1-yl]-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-2-yl}amino)-3-methylbenzene-1-sulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50mM HEPES, pH 7.5, 150mM NaCl, 2mM TCEP, 2 mM FFC8, protein = 13.4 mg/ml cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
9OB2 CDK2/CyclinE bound to compound 11 with P-loop in the EE and CC conformations 提交 2025-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1CAE (1R,3R)-3-(3-{2-[4-(methanesulfonyl)phenyl]acetamido}-1H-pyrazol-5-yl)cyclopentyl (1-methylcyclopropyl)carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.115 M Sodium Citrate, 15% PEG 3350	分辨率 2.12 Å R-free 0.254
9OB3 CDK2/CyclinE bound to compound 16 with P-loop in the EE conformation 提交 2025-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1CAH (1R,3R)-3-{3-[(pyrazine-2-carbonyl)amino]-1H-pyrazol-5-yl}cyclopentyl [(1S)-1-cyclopropylethyl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.115 M Sodium Citrate, 15% PEG 3350	分辨率 1.98 Å R-free 0.244
9OB4 CDK2/CyclinE bound to compound 19 with P-loop in the EE and EC conformations 提交 2025-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1CAF (1R,3R)-3-{3-[(cyclohexanecarbonyl)amino]-1H-pyrazol-5-yl}cyclopentyl [(1S)-1-cyclopropylethyl]carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；P24864	分辨率 1.95 Å R-free 0.251
9OB5 CDK2/CyclinE bound to compound 20 with P-loop in the EE and CC conformations 提交 2025-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1CAG (1R,3R)-3-{3-[3-(pyridin-3-yl)propanamido]-1H-pyrazol-5-yl}cyclopentyl (1-methylcyclopropyl)carbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.115 M Sodium Citrate, 15% PEG 3350	分辨率 2.10 Å R-free 0.255
9OB6 CDK2/CyclinE bound to compound 21 with P-loop in the EE and CC conformations 提交 2025-04-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 96–378（283 aa）	未记录	A1CAI (1R,3R)-3-{3-[2-(4-methoxyphenyl)acetamido]-1H-pyrazol-5-yl}cyclopentyl propan-2-ylcarbamate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.115 M Sodium Citrate, 15% PEG 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.256

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCNE1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 23–305； UniProt 96–378

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8h4r
沉积日期 deposition_date	2022-10-11
结构标题 title	The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex with Dinaciclib from Biortus
关键词 keywords	complex, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.15 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.03 Å
零角强度 I(0) i0	67386500.00
分子量 molecular_weight	66309.0 kDa
排除体积 excluded_volume	83967 Å³
包络体积 envelope_volume	97638 Å³
水化壳体积 shell_volume	31915 Å³
包络直径 envelope_diameter	84.3 Å
壳层 Rg shell_rg	32.97 Å
包络 Rg envelope_rg	25.21 Å
形状 Rg shape_rg	25.01 Å
总 Rg total_rg	25.99 Å
总原子数 total_atoms	4660
残基数 n_residues	561
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	81.7 Å
Rg (实空间) rg_real	26.06 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.52 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.7390e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.3430e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.09 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	67390000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7238
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.252
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.457
角度范围 angular_range	— – 0.3050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	23710000.0000
实空间数据点数 n_real_points	62
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.221; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.966

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme,Cyclin-dependent kinase 3
分子量 formula_weight	61776.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.18,2.7.11.22
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4942

MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHPPKSDLEVLFQGPMDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKHPNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHSHRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFYTTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGTPSEDTWPGVTQLPDYKGSFPKWTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAARQYVLQRFRH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	G1/S-specific cyclin-E1
分子量 formula_weight	35718.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MDYKDDDDKHHHHHHENLYFQGIIAPSRGSPLPVLSWANREEVWKIMLNKEKTYLRDQHFLEQHPLLQPKMRAILLDWLMEVCEVYKLHRETFYLAQDFFDRYMATQENVVKTLLQLIGISSLFIAAKLEEIYPPKLHQFAYVTDGACSGDEILTMELMIMKALKWRLSPLTIVSWLNVYMQVAYLNDLHEVLLPQYPQQIFIQIAELLDLCVLDVDCLEFPYGILAASALYHFSSSELMQKVSGYQWCDIENCVKWMVPFAMVIRETGSSKLKHFRGVADEDAHNIQTHRDSLDLLDKARAKKA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	3-[({3-ethyl-5-[(2S)-2-(2-hydroxyethyl)piperidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-7-yl}amino)methyl]-1-hydroxypyridinium
分子量 formula_weight	397.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	195.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	273

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	155.027 Å
晶胞边长 b length_b	155.027 Å
晶胞边长 c length_c	76.788 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.750 Å
最低分辨率 resolution_low	42.371 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.1614
R_free r_free	0.2234

fit	/app/data/saxs_computation/h4/8h4r/8h4r.fit
pddf	/app/data/pr_computation/h4/8h4r/8h4r.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/h4/8h4r/8h4r.dat

The Crystal Structure of CDK3 and CyclinE1 Complex with Dinaciclib from Biortus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme,Cyclin-dependent kinase 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Glutathione S-transferase class-mu 26 kDa isozyme,Cyclin-dependent kinase 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

G1/S-specific cyclin-E1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)