8ixa

GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 232.7 Å Quality: EXCELLENT

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1A chain

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–451 链 B； UniProt 1–451 链 C； UniProt 1–451 链 D； UniProt 1–451 链 E； UniProt 1–451 链 F； UniProt 1–451 链 G； UniProt 1–451 链 H； UniProt 1–451 链 I； UniProt 1–451	未记录	Tubulin beta-2A chain × 9 （Q7TMM9） Kinesin-1 heavy chain × 9 （P33176） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8IXA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8IXB GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–451（451 aa）链 E 1–451（451 aa）链 F 1–451（451 aa）链 H 1–451（451 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8TO0 48-nm repeating structure of doublets from mouse sperm flagella 提交 2023-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 471 PDB 声明：471-meric	链 A5 1–451（451 aa）链 A7 1–451（451 aa）链 A9 1–451（451 aa）链 AM 1–451（451 aa）链 AO 1–451（451 aa）链 AQ 1–451（451 aa）链 AS 1–451（451 aa）链 AU 1–451（451 aa）链 AW 1–451（451 aa）链 AY 1–451（451 aa）链 Aj 1–451（451 aa）链 Al 1–451（451 aa）链 An 1–451（451 aa）链 Ap 1–451（451 aa）链 Ar 1–451（451 aa）链 At 1–451（451 aa）链 Av 1–451（451 aa）链 B0 1–451（451 aa）链 B2 1–451（451 aa）链 B4 1–451（451 aa）链 B8 1–451（451 aa）链 BA 1–451（451 aa）链 BC 1–451（451 aa）链 BE 1–451（451 aa）链 BO 1–451（451 aa）链 BQ 1–451（451 aa）链 BS 1–451（451 aa）链 BU 1–451（451 aa）链 BW 1–451（451 aa）链 BY 1–451（451 aa）链 Bc 1–451（451 aa）链 Be 1–451（451 aa）链 Bg 1–451（451 aa）链 Bi 1–451（451 aa）链 Bk 1–451（451 aa）链 Bm 1–451（451 aa）链 Br 1–451（451 aa）链 Bt 1–451（451 aa）链 Bv 1–451（451 aa）链 Bx 1–451（451 aa）链 Bz 1–451（451 aa）链 C0 1–451（451 aa）链 C1 1–451（451 aa）链 C3 1–451（451 aa）链 C8 1–451（451 aa）链 CB 1–451（451 aa）链 CD 1–451（451 aa）链 CF 1–451（451 aa）链 CH 1–451（451 aa）链 CJ 1–451（451 aa）链 CN 1–451（451 aa）链 CP 1–451（451 aa）链 CR 1–451（451 aa）链 CT 1–451（451 aa）链 CV 1–451（451 aa）链 CX 1–451（451 aa）链 Cc 1–451（451 aa）链 Ce 1–451（451 aa）链 Cg 1–451（451 aa）链 Ci 1–451（451 aa）链 Ck 1–451（451 aa）链 Cm 1–451（451 aa）链 Co 1–451（451 aa）链 Cs 1–451（451 aa）链 Cu 1–451（451 aa）链 Cw 1–451（451 aa）链 Cy 1–451（451 aa）链 D2 1–451（451 aa）链 D5 1–451（451 aa）链 D7 1–451（451 aa）链 D9 1–451（451 aa）链 DB 1–451（451 aa）链 DD 1–451（451 aa）链 DF 1–451（451 aa）链 DH 1–451（451 aa）链 DM 1–451（451 aa）链 DO 1–451（451 aa）链 DQ 1–451（451 aa）链 DS 1–451（451 aa）链 DU 1–451（451 aa）链 DW 1–451（451 aa）链 Db 1–451（451 aa）链 Dd 1–451（451 aa）链 Df 1–451（451 aa）链 Dh 1–451（451 aa）链 Dj 1–451（451 aa）链 Dl 1–451（451 aa）链 Dp 1–451（451 aa）链 Dr 1–451（451 aa）链 Dt 1–451（451 aa）链 Dv 1–451（451 aa）链 Dx 1–451（451 aa）链 Dz 1–451（451 aa）链 E3 1–451（451 aa）链 E5 1–451（451 aa）链 E7 1–451（451 aa）链 E9 1–451（451 aa）链 EA 1–451（451 aa）链 EC 1–451（451 aa）链 EE 1–451（451 aa）链 EG 1–451（451 aa）链 EJ 1–451（451 aa）链 EL 1–451（451 aa）链 EN 1–451（451 aa）链 EP 1–451（451 aa）链 ER 1–451（451 aa）链 ET 1–451（451 aa）链 EV 1–451（451 aa）链 EY 1–451（451 aa）链 Ea 1–451（451 aa）链 Ec 1–451（451 aa）链 Ee 1–451（451 aa）链 Eg 1–451（451 aa）链 Ei 1–451（451 aa）链 Ek 1–451（451 aa）链 Eo 1–451（451 aa）链 Eq 1–451（451 aa）链 Es 1–451（451 aa）链 Eu 1–451（451 aa）链 Ew 1–451（451 aa）链 Ey 1–451（451 aa）链 FA 1–451（451 aa）链 FC 1–451（451 aa）链 FG 1–451（451 aa）链 FI 1–451（451 aa）链 FK 1–451（451 aa）链 FM 1–451（451 aa）链 FO 1–451（451 aa）链 FQ 1–451（451 aa）链 FU 1–451（451 aa）链 FW 1–451（451 aa）链 FY 1–451（451 aa）链 Fa 1–451（451 aa）链 Fc 1–451（451 aa）链 Fe 1–451（451 aa）链 N 1–451（451 aa）链 P 1–451（451 aa）链 R 1–451（451 aa）链 T 1–451（451 aa）链 V 1–451（451 aa）链 X 1–451（451 aa）链 Z 1–451（451 aa）链 n 1–451（451 aa）链 p 1–451（451 aa）链 r 1–451（451 aa）链 t 1–451（451 aa）链 v 1–451（451 aa）链 x 1–451（451 aa）链 z 1–451（451 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.70 Å
9PND In situ microtubule of EpoB-induced regenerating axons 提交 2025-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–451（451 aa）链 C 1–451（451 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 EPB 7,11-DIHYDROXY-8,8,10,12,16-PENTAMETHYL-3-[1-METHYL-2-(2-METHYL-THIAZOL-4-YL)VINYL]-4,17-DIOXABICYCLO[14.1.0]HEPTADECANE-5,9-DIONE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；Gibco Neurobasal Media cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
9SFP Native cytoplasmic lattices from mouse oocytes 提交 2025-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 a 1–451（451 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.20 Å
9XRL Structure of mouse cytoplasmic lattice (CPL) repeating unit 提交 2025-11-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：73-meric	链 AF 1–451（451 aa）链 AO 1–451（451 aa）链 u 1–451（451 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBA1A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 B； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 C； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 D； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 E； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 F； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 G； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 H； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451 作者链 I； PDB构建体 1–457； UniProt 1–451

Tubulin beta-2A chain

Mus musculus

UniProt Q7TMM9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 1–445 链 K； UniProt 1–445 链 L； UniProt 1–445 链 M； UniProt 1–445 链 N； UniProt 1–445 链 O； UniProt 1–445 链 P； UniProt 1–445 链 Q； UniProt 1–445 链 R； UniProt 1–445	未记录	Tubulin alpha-1A chain × 9 （P68369） Kinesin-1 heavy chain × 9 （P33176） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8IXA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
24MC Structure of oocyte cytoplasmic lattices 提交 2026-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 W 1–445（445 aa）链 Z 1–445（445 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8IXB GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 Q 1–445（445 aa）链 U 1–445（445 aa）链 V 1–445（445 aa）链 W 1–445（445 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8IXD GMPCPP-Alpha1C/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 J 1–445（445 aa）链 K 1–445（445 aa）链 L 1–445（445 aa）链 M 1–445（445 aa）链 N 1–445（445 aa）链 O 1–445（445 aa）链 P 1–445（445 aa）链 Q 1–445（445 aa）链 R 1–445（445 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8IXE GMPCPP-Alpha1C/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 R 1–445（445 aa）链 W 1–445（445 aa）链 Z 1–445（445 aa）链 a 1–445（445 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8IXF GMPCPP-Alpha4A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 J 1–445（445 aa）链 K 1–445（445 aa）链 L 1–445（445 aa）链 M 1–445（445 aa）链 N 1–445（445 aa）链 O 1–445（445 aa）链 P 1–445（445 aa）链 Q 1–445（445 aa）链 R 1–445（445 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8IXG GMPCPP-Alpha4A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 R 1–445（445 aa）链 W 1–445（445 aa）链 Z 1–445（445 aa）链 a 1–445（445 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
9W2M Cryo-EM structure of the Cytoplasmic lattice(CPL) from mouse oocyte 提交 2025-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：56-meric	链 L 1–445（445 aa）链 l 1–445（445 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TBB2A_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 K； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 L； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 M； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 N； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 O； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 P； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 Q； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445 作者链 R； PDB构建体 1–445； UniProt 1–445

Kinesin-1 heavy chain

Homo sapiens

UniProt P33176

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27）与蛋白拷贝数一致	链 S； UniProt 1–349 链 T； UniProt 1–349 链 U； UniProt 1–349 链 V； UniProt 1–349 链 W； UniProt 1–349 链 X； UniProt 1–349 链 Y； UniProt 1–349 链 Z； UniProt 1–349 链 a； UniProt 1–349	未记录	Tubulin alpha-1A chain × 9 （P68369） Tubulin beta-2A chain × 9 （Q7TMM9） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8IXA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BG2 HUMAN UBIQUITOUS KINESIN MOTOR DOMAIN 提交 1998-06-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–325（325 aa）片段：MOTOR DOMAIN	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；5 MG/ML PROTEIN, 50 MM NA ACETATE PH 4.6, 75 MM KCL, 3.5% PEG 4K, 2.5 MM ATP, 10 MM MGCL2	分辨率 1.80 Å R-free 0.288
1MKJ Human Kinesin Motor Domain With Docked Neck Linker 提交 2002-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–349（349 aa）片段：Residues 1-349	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；277 K；1.5-2 M Li2SO4, 25 mM HEPES pH 7.5, 0-50 mM KCl, pH 7.50, temperature 277K	分辨率 2.70 Å R-free 0.255
3J8X High-resolution structure of no-nucleotide kinesin on microtubules 提交 2014-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–349（349 aa）片段：Truncated catalytic head domain (monomeric, UNP residues 1-349)	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA；pH 6.8；25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件 No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.；冷冻剂 ETHANE；No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.	分辨率 5.00 Å
3J8Y High-resolution structure of ATP analog-bound kinesin on microtubules 提交 2014-11-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–349（349 aa）片段：Truncated catalytic head domain (monomeric, UNP residues 1-349)	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA；pH 6.8；25 mM PIPES, 25 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件 No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging.；冷冻剂 ETHANE；No glow discharge was applied. After sample application to grid, liquid was mostly 'wicked' away by edgewise application of filter paper. Subsequently, blotting and plunge freezing were performed with ~0.5 second delay after blotting but prior to plunging into liquid ethane.	分辨率 5.00 Å
4HNA Kinesin motor domain in the ADP-MG-ALFX state in complex with tubulin and a DARPIN 提交 2012-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–349（349 aa）片段：RESIDUES 1-349	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；PEG, PIPES BUFFER, PH 6.8, 0.8 MM ALCL3, 4 MM NAF, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.19 Å R-free 0.211
4LNU Nucleotide-free kinesin motor domain in complex with tubulin and a DARPin 提交 2013-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–325（325 aa）片段：UNP RESIDUES 1-325	突变：C7S, C65A, C168A, C174S, C294A	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 11 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；PEG, MES BUFFER, 0.2M AMMONIUM SULFATE, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.19 Å R-free 0.195
5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.2M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.59 Å R-free 0.263
5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.2M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.59 Å R-free 0.263
5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.2M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.59 Å R-free 0.263
5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.2M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.59 Å R-free 0.263
5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.2M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.59 Å R-free 0.263
5LT3 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T87A mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T87A, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.2M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.59 Å R-free 0.263
5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.16 M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.88 Å R-free 0.280
5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.16 M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.88 Å R-free 0.280
5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.16 M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.88 Å R-free 0.280
5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.16 M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.88 Å R-free 0.280
5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.16 M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.88 Å R-free 0.280
5LT4 nucleotide-free kinesin-1 motor domain T92V mutant, P1 crystal form 提交 2016-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1–325（325 aa）	突变：C7S, C65A, T92V, C168A, C174S, C294A	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM Mes pH 6.5 0.16 M ammonium sulfate 30% mPEG 5000	分辨率 2.88 Å R-free 0.280
6OJQ Monomeric kinesin-1 motor domain in no-nucleotide state bound to GMPCPP-stabilized microtubule 提交 2019-04-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 8–324（317 aa）	未记录	G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.67 Å
7RIK Magic-Angle-Spinning NMR Structure of Kinesin-1 Motor Domain Assembled with Microtubules 提交 2021-07-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–349（349 aa）片段：Kinesin motor domain residues 1-349	未记录	未记录非水小分子	SOLID-STATE NMR NMR测量条件 pH 7.4；283 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 9.1 % w/w [U-100% 13C; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 58.1 % w/w Buffer, 100% H2O \| 100% H2O NMR样品组成 9.1 % w/w [U-100% 13C; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 58.1 % w/w Buffer, 100% H2O \| 100% H2O NMR样品组成 8.2 % w/w [1,6-13C-glucose; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 59 % w/w Buffer, 100% H2O \| 100% H2O NMR样品组成 7.6 % w/w [2-13C-glucose; U-100% 15N] Apo-Kif5b, 16.4 % w/w Porcine-alpha-tubulin, 16.4 % w/w Porcine-beta-tubulin, 5 uM TAXOL, 1 mM GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, 1 mM GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE, 59.6 % w/w Buffer, 100% H2O \| 100% H2O	分辨率未提供
7TR1 CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) - AMP-PNP in complex with a microtubule 提交 2022-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 41–44（4 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7TR2 Apo CaKip3[2-436]-L2-mutant(HsKHC) in complex with a microtubule 提交 2022-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 41–44（4 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8IXB GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 g 1–349（349 aa）链 k 1–349（349 aa）链 l 1–349（349 aa）链 m 1–349（349 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
8IXD GMPCPP-Alpha1C/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 S 1–349（349 aa）链 T 1–349（349 aa）链 U 1–349（349 aa）链 V 1–349（349 aa）链 W 1–349（349 aa）链 X 1–349（349 aa）链 Y 1–349（349 aa）链 Z 1–349（349 aa）链 a 1–349（349 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8IXE GMPCPP-Alpha1C/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 h 1–349（349 aa）链 l 1–349（349 aa）链 p 1–349（349 aa）链 q 1–349（349 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8IXF GMPCPP-Alpha4A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region 提交 2023-03-31	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric	链 S 1–349（349 aa）链 T 1–349（349 aa）链 U 1–349（349 aa）链 V 1–349（349 aa）链 W 1–349（349 aa）链 X 1–349（349 aa）链 Y 1–349（349 aa）链 Z 1–349（349 aa）链 a 1–349（349 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8IXG GMPCPP-Alpha4A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin seam region 提交 2023-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 h 1–349（349 aa）链 l 1–349（349 aa）链 p 1–349（349 aa）链 q 1–349（349 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 G2P PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
8RHB Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, single-headed state 提交 2023-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 K 1–963（963 aa）链 T 1–963（963 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8RHH Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to AMPPNP, two-headed state 提交 2023-12-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：pentameric	链 K 1–963（963 aa）链 L 1–963（963 aa）链 T 1–963（963 aa）链 t 1–963（963 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8RIK Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, single-headed state 提交 2023-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：tetrameric	链 K 1–963（963 aa）链 T 1–963（963 aa）链 t 1–963（963 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；BRB80 + 5 mM ADP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8RIZ Microtubule-associated kinesin-1 tail complex bound to ADP, two-headed state 提交 2023-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 K 1–963（963 aa）链 L 1–963（963 aa）链 T 1–963（963 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；BRB80 + 5mM ADP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
9GNQ Microtubule-associated Kif5B IAK tail mutant bound to ADP 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 1–357（357 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TA1 TAXOL × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；BRB80 + 5mM AMPPNP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9L6K Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234V mutant) 提交 2024-12-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–336（335 aa）	突变：G234V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol	分辨率 2.80 Å R-free 0.258
9L6K Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234V mutant) 提交 2024-12-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–336（335 aa）	突变：G234V	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；277 K；20% PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol	分辨率 2.80 Å R-free 0.258
9L78 Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234A mutant) 提交 2024-12-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–336（335 aa）	突变：G234A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 % PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol, pH 7.9	分辨率 2.82 Å R-free 0.265
9L78 Crystal structure of nucleotide-free human kinesin-1 motor domain (G234A mutant) 提交 2024-12-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–336（335 aa）	突变：G234A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；20 % PEG 3350, 100mM HEPES-NaOH, 200mM ammonium acetate, 3% xylitol, pH 7.9	分辨率 2.82 Å R-free 0.265
9L7E Crystal structure of human kinesin-1 motor domain (G234A mutant) in complex with ADP 提交 2024-12-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–349（349 aa）	突变：G234A	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；23% PEG 3350, 100mM Bis-Tris, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.252
9L7M Nucleotide-free kinesin-1 motor domain bound to the microtubule 提交 2024-12-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 K 1–349（349 aa）	未记录	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å

共 26 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KINH_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 T； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 U； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 V； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 W； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 X； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 Y； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 Z； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349 作者链 a； PDB构建体 24–372； UniProt 1–349

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ixa
沉积日期 deposition_date	2023-03-31
结构标题 title	GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region
关键词 keywords	microtubule, tubulin isotype, cryo-EM structure, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	87.84 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	88.13 Å
零角强度 I(0) i0	21062700000.00
分子量 molecular_weight	1199300.0 kDa
排除体积 excluded_volume	1484500 Å³
包络体积 envelope_volume	2223800 Å³
水化壳体积 shell_volume	212100 Å³
包络直径 envelope_diameter	316.7 Å
壳层 Rg shell_rg	80.55 Å
包络 Rg envelope_rg	85.91 Å
形状 Rg shape_rg	88.13 Å
总 Rg total_rg	88.07 Å
总原子数 total_atoms	84087
残基数 n_residues	10602
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	232.7 Å
Rg (实空间) rg_real	84.31 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.68 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.0120e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.6340e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	86.51 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	20980000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9117
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	90.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.259
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.639
角度范围 angular_range	— – 0.0900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	1.0270
最高正则化参数 α highest_alpha	719800000.0000
实空间数据点数 n_real_points	19
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 1.000; Stabil: 0.966; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.955; Smooth: 0.002

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tubulin alpha-1A chain
分子量 formula_weight	51017.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	9

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,A,B,C,D,E,F,G,H
原子数 atom_count	84087

MRECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDKTIHHHHHHGGGDDSFNTFFSETGAGKHVPRAVFVDLEPTVIDEVRTGTYRQLFHPEQLITGKEDAANNYARGHYTIGKEIIDLVLDRIRKLADQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMERLSVDYGKKSKLEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTLEHSDCAFMVDNEAIYDICRRNLDIERPTYTNLNRLIGQIVSSITASLRFDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEKAYHEQLSVAEITNACFEPANQMVKCDPRHGKYMACCLLYRGDVVPKDVNAAIATIKTKRTIQFVDWCPTGFKVGINYQPPTVVPGGDLAKVQRAVCMLSNTTAIAEAWARLDHKFDLMYAKRAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEKDYEEVGVDSVEGEGEEEGEEY

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Insecta environmental sample

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tubulin beta-2A chain
分子量 formula_weight	51151.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	9

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,J,K,L,M,N,O,P,R

MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEAAGNKYVPRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVVRKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYSIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMMAACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATADEQGEFEEEEGEDEAGGSGGDYKDDDK

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Insecta environmental sample

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Kinesin-1 heavy chain
分子量 formula_weight	41721.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	9

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,S,T,U,V,W,X,Z,a

MGSSHHHHHHSSGLVPRGSHMASMADLAECNIKVMCRFRPLNESEVNRGDKYIAKFQGEDTVVIASKPYAFDRVFQSSTSQEQVYNDCAKKIVKDVLEGYNGTIFAYGQTSSGKTHTMEGKLHDPEGMGIIPRIVQDIFNYIYSMDENLEFHIKVSYFEIYLDKIRDLLDVSKTNLSVHEDKNRVPYVKGCTERFVCSPDEVMDTIDEGKSNRHVAVTNMNEHSSRSHSIFLINVKQENTQTEQKLSGKLYLVDLAGSAKVSKTGAEGAVLDEAKNINKSLSALGNVISALAEGSTYVPYRDSKMTRILQDSLGGNCRTTIVICCSPSSYNESETKSTLLFGQRAKTIKNTVCVNVELTAEQWKKKYEKEKE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER
分子量 formula_weight	521.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

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8. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	4.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	19287

fit	/app/data/saxs_computation/ix/8ixa/8ixa.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ix/8ixa/8ixa.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ix/8ixa/8ixa.dat

GMPCPP-Alpha1A/Beta2A-microtubule decorated with kinesin non-seam region

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tubulin alpha-1A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tubulin beta-2A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Kinesin-1 heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)