8to0

48-nm repeating structure of doublets from mouse sperm flagella

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 627.2 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8to0

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8to0
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8to0
沉积日期 deposition_date2023-08-02
结构标题 title48-nm repeating structure of doublets from mouse sperm flagella
关键词 keywords;Mammalian sperm, axoneme, microtubule-based structure, microtubule inner protein, non-motor proteins, cellular motility, fertility, structural protein ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron218.70
零角强度 I(0) i03196180000000.00
分子量 molecular_weight9446400.0 kDa
排除体积 excluded_volume9289300 ų
包络体积 envelope_volume48513000 ų
水化壳体积 shell_volume1831200 ų
包络直径 envelope_diameter714.5
壳层 Rg shell_rg221.30
包络 Rg envelope_rg201.10
形状 Rg shape_rg218.70
总 Rg total_rg218.70
总原子数 total_atoms673884
残基数 n_residues168471
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax627.2
Rg (实空间) rg_real216.80
Rg 误差 (实空间) rg_real_error3.21
I(0) (实空间) i0_real3.0680e+12
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.4570e+10
Rg (倒空间) rg_reciprocal198.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2594000000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8937
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary268.8
偏度 Skewness skewness0.198
峰度 Kurtosis kurtosis-0.597
角度范围 angular_range— – 0.0350 −1
当前正则化参数 α current_alpha2.2150
最高正则化参数 α highest_alpha137500000000.0000
实空间数据点数 n_real_points8
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 8.789; Oscil: 0.996; Stabil: 0.927; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.859; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (35)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)