8ony

Human Methionine Aminopeptidase 2 at the 80S ribosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

60S ribosomal protein L38

物种未注明

UniProt P63173

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 6 RNA 2 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L26 × 1 (P61254) 60S ribosomal protein L35 × 1 (P42766) 60S ribosomal protein L23a × 1 (P62750) 60S ribosomal protein L19 × 1 (P84098) 5.8S rRNA × 1 Methionine aminopeptidase 2 × 1 (P50579) COBALT (II) ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL38_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 Lk; PDB构建体 1–70; UniProt 1–70

60S ribosomal protein L26

物种未注明

UniProt P61254

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 6 RNA 2 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L38 × 1 (P63173) 60S ribosomal protein L35 × 1 (P42766) 60S ribosomal protein L23a × 1 (P62750) 60S ribosomal protein L19 × 1 (P84098) 5.8S rRNA × 1 Methionine aminopeptidase 2 × 1 (P50579) COBALT (II) ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL26_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 LY; PDB构建体 1–145; UniProt 1–145

60S ribosomal protein L35

物种未注明

UniProt P42766

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 6 RNA 2 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L38 × 1 (P63173) 60S ribosomal protein L26 × 1 (P61254) 60S ribosomal protein L23a × 1 (P62750) 60S ribosomal protein L19 × 1 (P84098) 5.8S rRNA × 1 Methionine aminopeptidase 2 × 1 (P50579) COBALT (II) ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL35_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 Lh; PDB构建体 1–123; UniProt 1–123

60S ribosomal protein L23a

物种未注明

UniProt P62750

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 6 RNA 2 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L38 × 1 (P63173) 60S ribosomal protein L26 × 1 (P61254) 60S ribosomal protein L35 × 1 (P42766) 60S ribosomal protein L19 × 1 (P84098) 5.8S rRNA × 1 Methionine aminopeptidase 2 × 1 (P50579) COBALT (II) ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL23A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 LX; PDB构建体 1–156; UniProt 1–156

60S ribosomal protein L19

物种未注明

UniProt P84098

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 6 RNA 2 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L38 × 1 (P63173) 60S ribosomal protein L26 × 1 (P61254) 60S ribosomal protein L35 × 1 (P42766) 60S ribosomal protein L23a × 1 (P62750) 5.8S rRNA × 1 Methionine aminopeptidase 2 × 1 (P50579) COBALT (II) ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL19_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 LR; PDB构建体 1–196; UniProt 1–196

Methionine aminopeptidase 2

Homo sapiens

UniProt P50579

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 6 RNA 2 28S rRNA × 1 60S ribosomal protein L38 × 1 (P63173) 60S ribosomal protein L26 × 1 (P61254) 60S ribosomal protein L35 × 1 (P42766) 60S ribosomal protein L23a × 1 (P62750) 60S ribosomal protein L19 × 1 (P84098) 5.8S rRNA × 1 COBALT (II) ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 MAP2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–478; UniProt 1–478

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8ony
沉积日期 deposition_date2023-04-04
最后修订 last_revision2024-02-21
结构标题 titleHuman Methionine Aminopeptidase 2 at the 80S ribosome
关键词 keywords;Ribosome Associated Factor, Protease, Tunnel exit, Protein Maturation, Proteostasis, NME, p67, MAP, MetAP, MAP2, MetAP2, ES27L, PTE, METAL BINDING PROTEIN ;; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ony__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ony__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ony__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)47.43 Å
Rg(电子密度)49.15 Å
总 Rg49.08 Å
原子数12382
残基数1174
排除体积204860 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8ony__assembly_1__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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7. 引用文献 (1)