8p1h

Crystal structure of the chimera of human 14-3-3 zeta and phosphorylated cytoplasmic loop fragment of the alpha7 acetylcholine receptor

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 94.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta,Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7

Homo sapiens

UniProt E7EX29

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–72 链 A; UniProt 76–164 链 A; UniProt 168–237 链 B; UniProt 1–72 链 B; UniProt 76–164 链 B; UniProt 168–237 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 AZI AZIDE ION × 3 BEZ BENZOIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;288 K;0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate; 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5; 20% w/v Polyethylene glycol 8,000 分辨率 1.95 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 E7EX29_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–75; UniProt 1–72 作者链 A; PDB构建体 79–159; UniProt 76–164 作者链 A; PDB构建体 163–232; UniProt 168–237 作者链 B; PDB构建体 4–75; UniProt 1–72 作者链 B; PDB构建体 79–159; UniProt 76–164 作者链 B; PDB构建体 163–232; UniProt 168–237

Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein zeta,Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7

Homo sapiens

UniProt P36544

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 361–372 链 B; UniProt 361–372 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 AZI AZIDE ION × 3 BEZ BENZOIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;288 K;0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate; 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5; 20% w/v Polyethylene glycol 8,000 分辨率 1.95 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 44 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHA7_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 237–248; UniProt 361–372 作者链 B; PDB构建体 237–248; UniProt 361–372

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8p1h

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8p1h
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8p1h
沉积日期 deposition_date2023-05-12
结构标题 titleCrystal structure of the chimera of human 14-3-3 zeta and phosphorylated cytoplasmic loop fragment of the alpha7 acetylcholine receptor
关键词 keywords14-3-3, acetylcholine receptor, PROTEIN BINDING, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier29.59
回转半径 Rg (电子) rg_electron28.98
零角强度 I(0) i051004800.00
分子量 molecular_weight53876.0 kDa
排除体积 excluded_volume66727 ų
包络体积 envelope_volume87143 ų
水化壳体积 shell_volume26408 ų
包络直径 envelope_diameter95.6
壳层 Rg shell_rg34.69
包络 Rg envelope_rg28.80
形状 Rg shape_rg28.96
总 Rg total_rg29.61
总原子数 total_atoms3775
残基数 n_residues479
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax94.6
Rg (实空间) rg_real29.71
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.85
I(0) (实空间) i0_real5.1000e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.8170e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal29.66
I(0) (倒空间) i0_reciprocal51000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8806
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary28.0
偏度 Skewness skewness0.354
峰度 Kurtosis kurtosis-0.695
角度范围 angular_range— – 0.2700 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha5172000.0000
实空间数据点数 n_real_points55
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.886; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.890; Smooth: 0.898

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)