8q84

Outer kinetochore Dam1 protomer dimer Ndc80-Nuf2 coiled-coil complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Kinetochore protein NDC80

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40460

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 NDC80_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–691; UniProt 1–691 作者链 F; PDB构建体 1–691; UniProt 1–691

Kinetochore protein NUF2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P33895

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 NUF2_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 G; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

DASH complex subunit DAM1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53267

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DAM1_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–343; UniProt 1–343 作者链 U; PDB构建体 1–343; UniProt 1–343 作者链 e; PDB构建体 1–343; UniProt 1–343

DASH complex subunit DUO1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53168

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DUO1_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–247; UniProt 1–247 作者链 V; PDB构建体 1–247; UniProt 1–247

DASH complex subunit DAD2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P36162

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DAD2_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–133; UniProt 1–133 作者链 W; PDB构建体 1–133; UniProt 1–133

DASH complex subunit DAD1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q12248

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DAD1_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94 作者链 X; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94

DASH complex subunit DAD4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P69851

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DAD4_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–72; UniProt 1–72 作者链 Y; PDB构建体 1–72; UniProt 1–72

DASH complex subunit DAD3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P69850

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 DAD3_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94 作者链 Z; PDB构建体 1–94; UniProt 1–94

DASH complex subunit SPC34

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P36131

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 SPC34_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–295; UniProt 1–295 作者链 a; PDB构建体 1–295; UniProt 1–295

DASH complex subunit ASK1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P35734

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ASK1_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–292; UniProt 1–292 作者链 b; PDB构建体 1–292; UniProt 1–292

DASH complex subunit HSK3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P69852

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit SPC19 × 2 (Q03954) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 HSK3_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–69; UniProt 1–69 作者链 c; PDB构建体 1–69; UniProt 1–69

DASH complex subunit SPC19

Saccharomyces cerevisiae

UniProt Q03954

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 25 Kinetochore protein NDC80 × 2 (P40460) Kinetochore protein NUF2 × 2 (P33895) DASH complex subunit DAM1 × 3 (P53267) DASH complex subunit DUO1 × 2 (P53168) DASH complex subunit DAD2 × 2 (P36162) DASH complex subunit DAD1 × 2 (Q12248) DASH complex subunit DAD4 × 2 (P69851) DASH complex subunit DAD3 × 2 (P69850) DASH complex subunit SPC34 × 2 (P36131) DASH complex subunit ASK1 × 2 (P35734) DASH complex subunit HSK3 × 2 (P69852) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 SPC19_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–165; UniProt 1–165 作者链 d; PDB构建体 1–165; UniProt 1–165

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8q84
沉积日期 deposition_date2023-08-17
结构标题 titleOuter kinetochore Dam1 protomer dimer Ndc80-Nuf2 coiled-coil complex
关键词 keywordsKinetochore, microtubule, error correction, chromosome segregation, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8q84__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8q84__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8q84__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)77.40 Å
Rg(电子密度)76.64 Å
总 Rg75.38 Å
原子数21802
残基数3115
排除体积378840 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8q84__assembly_1__model_1 25-meric (25) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

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7. 引用文献 (1)