8sqa

The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Outer membrane protein assembly factor BamA

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （C3T0D3） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator × 1 （P0AEY0,Q7BSW5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C3TPJ2_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–786； UniProt 25–810

Outer membrane protein assembly factor BamB

Escherichia coli

UniProt P77774

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （C3TPJ2） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （C3T0D3） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator × 1 （P0AEY0,Q7BSW5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BAMB_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–372； UniProt 21–392

Outer membrane protein assembly factor BamC

Escherichia coli

UniProt C3T0D3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （C3TPJ2） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator × 1 （P0AEY0,Q7BSW5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C3T0D3_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–319； UniProt 27–345

Outer membrane protein assembly factor BamD

Escherichia coli

UniProt C3SYV7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （C3TPJ2） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （C3T0D3） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator × 1 （P0AEY0,Q7BSW5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C3SYV7_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–225； UniProt 21–245

Outer membrane protein assembly factor BamE

Escherichia coli

UniProt A0A366UU94

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （C3TPJ2） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （C3T0D3） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator × 1 （P0AEY0,Q7BSW5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A366UU94_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–93； UniProt 21–113

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator

Escherichia coli O157

UniProt P0AEY0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （C3TPJ2） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （C3T0D3） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	MALE_ECO57
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 3–369； UniProt 26–392

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator

Escherichia coli O157

UniProt Q7BSW5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （C3TPJ2） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （C3T0D3） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ESPP_ECO57
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 446–551； UniProt 1195–1300

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8sqa
沉积日期 deposition_date	2023-05-04
结构标题 title	The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex
关键词 keywords	membrane proteins, protein folding, BAM complex, outer membrane protein, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8sqa__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8sqa__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8sqa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	43.33 Å
Rg（电子密度）	42.93 Å
总 Rg	43.19 Å
原子数	12156
残基数	1563
排除体积	214200 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8sqa__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Outer membrane protein assembly factor BamA
分子量 formula_weight	88100.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	12156

VVKDIHFEGLQRVAVGAALLSMPVRTGDTVNDEDISNTIRALFATGNFEDVRVLRDGDTLLVQVKERPTIASITFSGNKSVKDDMLKQNLEASGVRVGESLDRTTIADIEKGLEDFYYSVGKYSASVKAVVTPLPRNRVDLKLVFQEGVSAEIQQINIVGNHAFTTDELISHFQLRDEVPWWNVVGDRKYQKQKLAGDLETLRSYYLDRGYARFNIDSTQVSLTPDKKGIYVTVNITEGDQYKLSGVEVSGNLAGHSAEIEQLTKIEPGELYNGTKVTKMEDDIKKLLGRYGYAYPRVQSMPEINDADKTVKLRVNVDAGNRFYVRKIRFEGNDTSKDAVLRREMRQMEGAWLGSDLVDQGKERLNRLGFFETVDTDTQRVPGSPDQVDVVYKVKERNTGSFNFGIGYGTESGVSFQAGVQQDNWLGTGYAVGINGTKNDYQTYAELSVTNPYFTVDGVSLGGRLFYNDFQADDADLSDYTNKSYGTDVTLGFPINEYNSLRAGLGYVHNSLSNMQPQVAMWRYLYSMGEHPSTSDQDNSFKTDDFTFNYGWTYNKLDRGYFPTDGSRVNLTGKVTIPGSDNEYYKVTLDTATYVPIDDDHKWVVLGRTRWGYGDGLGGKEMPFYENFYAGGSSTVRGFQSNTIGPKAVYFPHQASNYDPDYDYECATQDGAKDLCKSDDAVGGNAMAVASLEFITPTPFISDKYANSVRTSFFWDMGTVWDTNWDSSQYSGYPDYSDPSNIRMSAGIALQWMSPLGPLVFSYAQPFKKYDGDKAEQFQFNCGKTW

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Outer membrane protein assembly factor BamB
分子量 formula_weight	39779.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SLFNSEEDVVKMSPLPTVENQFTPTTAWSTSVGSGIGNFYSNLHPALADNVVYAADRAGLVKALNADDGKEIWSVSLAEKDGWFSKEPALLSGGVTVSGGHVYIGSEKAQVYALNTSDGTVAWQTKVAGEALSRPVVSDGLVLIHTSNGQLQALNEADGAVKWTVNLDMPSLSLRGESAPTTAFGAAVVGGDNGRVSAVLMEQGQMIWQQRISQATGSTEIDRLSDVDTTPVVVNGVVFALAYNGNLTALDLRSGQIMWKRELGSVNDFIVDGNRIYLVDQNDRVMALTIDGGVTLWTQSDLLHRLLTSPVLYNGNLVVGDSEGYLHWINVEDGRFVAQQKVDSSGFQTEPVAADGKLLIQAKDGTVYSITR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Outer membrane protein assembly factor BamC
分子量 formula_weight	34298.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

SSDSRYKRQVSGDEAYLEAAPLAELHAPAGMILPVTSGDYAIPVTNGSGAVGKALDIRPPAQPLALVSGARTQFTGDTASLLVENGRGNTLWPQVVSVLQAKNYTITQRDDAGQTLTTDWVQWNRLDEDEQYRGRYQISVKPQGYQQAVTVKLLNLEQAGKPVADAASMQRYSTEMMNVISAGLDKSATDAANAAQNRASTTMDVQSAADDTGLPMLVVRGPFNVVWQRLPAALEKVGMKVTDSTRSQGNMAVTYKPLSDSDWQELGASDPGLASGDYKLQVGDLDNRSSLQFIDPKGHTLTQSQNDALVAVFQAAFSK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Outer membrane protein assembly factor BamD
分子量 formula_weight	25713.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

SGSKEEVPDNPPNEIYATAQQKLQDGNWRQAITQLEALDNRYPFGPYSQQVQLDLIYAYYKNADLPLAQAAIDRFIRLNPTHPNIDYVMYMRGLTNMALDDSALQGFFGVDRSDRDPQHARAAFSDFSKLVRGYPNSQYTTDATKRLVFLKDRLAKYEYSVAEYYTERGAWVAVVNRVEGMLRDYPDTQATRDALPLMENAYRQMQMNAQAEKVAKIIAANSSNT

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Outer membrane protein assembly factor BamE
分子量 formula_weight	10288.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

STLERVVYRPDINQGNYLTANDVSKIRVGMTQQQVAYALGTPLMSDPFGTNTWFYVFRQQPGHEGVTQQTLTLTFNSSGVLTNIDNKPALSGN

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator
分子量 formula_weight	60668.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MGAKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELVKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTGSIELVSAPKDTNENVFKASKQTIGFSDVTPVITTRETDDKITWSLTGYNTVANKEATRNAAALFSVDYKAFLNEVKDKDYNPLIGRTGCDVGKSFSGKDWKVTARAGLGYQFDLLANGETVLRDASGEKRIKGEKDSRMLMSVGLNAEIRDNVRFGLEFEKSAFGKYNVDNAVNANFRYSF

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli O157
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1045010
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	92335

The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Outer membrane protein assembly factor BamA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Outer membrane protein assembly factor BamB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Outer membrane protein assembly factor BamC

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Outer membrane protein assembly factor BamD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Outer membrane protein assembly factor BamE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,Autotransporter protein EspP translocator

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8sqa__assembly_1__model_1

8sqa__assembly_1__model_1 | I(q)

8sqa__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source