8uz2

E. coli acetyl-CoA carboxylase, narrow helical local reconstruction, 3.18 Angstrom

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 191.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha

Escherichia coli

UniProt P0ABD5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 4–319 链 E; UniProt 4–319 未记录 Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase × 2 (P0ABD8) Biotin carboxylase × 2 (P24182) Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta × 3 (P0A9Q5) BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.18 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACCA_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–316; UniProt 4–319 作者链 E; PDB构建体 1–316; UniProt 4–319

Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase

Escherichia coli

UniProt P0ABD8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 80–156 链 F; UniProt 80–156 未记录 Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha × 2 (P0ABD5) Biotin carboxylase × 2 (P24182) Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta × 3 (P0A9Q5) BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.18 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BCCP_ECOLI
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–77; UniProt 80–156 作者链 F; PDB构建体 1–77; UniProt 80–156

Biotin carboxylase

Escherichia coli

UniProt P24182

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–446 链 G; UniProt 1–446 未记录 Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha × 2 (P0ABD5) Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase × 2 (P0ABD8) Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta × 3 (P0A9Q5) BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.18 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 29 个其他 PDB 条目、49 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACCC_ECOLI
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–446; UniProt 1–446 作者链 G; PDB构建体 1–446; UniProt 1–446

Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit beta

Escherichia coli

UniProt P0A9Q5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 2–285 链 H; UniProt 2–285 链 I; UniProt 2–285 未记录 Acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha × 2 (P0ABD5) Biotin carboxyl carrier protein of acetyl-CoA carboxylase × 2 (P0ABD8) Biotin carboxylase × 2 (P24182) BTN BIOTIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ACO ACETYL COENZYME *A × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;2.5 mg/ml ACC complex in 50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM bicarbonate, 7.5 mM ATP, 20 mM MgCl2 and 1 mM acetyl-CoA cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.18 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACCD_ECOLI
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–284; UniProt 2–285 作者链 H; PDB构建体 1–284; UniProt 2–285 作者链 I; PDB构建体 1–284; UniProt 2–285

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8uz2

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8uz2
下载 Download

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8uz2
沉积日期 deposition_date2023-11-14
最后修订 last_revision2024-11-20
结构标题 titleE. coli acetyl-CoA carboxylase, narrow helical local reconstruction, 3.18 Angstrom
关键词 keywordscomplex, enzyme, biosynthesis of fatty acids, BIOSYNTHETIC PROTEIN; BIOSYNTHETIC PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier53.31
回转半径 Rg (电子) rg_electron53.70
零角强度 I(0) i0919420000.00
分子量 molecular_weight249780.0 kDa
排除体积 excluded_volume312000 ų
包络体积 envelope_volume439500 ų
水化壳体积 shell_volume70691 ų
包络直径 envelope_diameter188.5
壳层 Rg shell_rg53.30
包络 Rg envelope_rg53.00
形状 Rg shape_rg53.70
总 Rg total_rg53.70
总原子数 total_atoms17474
残基数 n_residues2246
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax191.3
Rg (实空间) rg_real53.70
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.32
I(0) (实空间) i0_real9.1940e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.8430e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal52.97
I(0) (倒空间) i0_reciprocal918500000.0000
解质量估计 total_estimate0.8224
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary44.6
偏度 Skewness skewness0.480
峰度 Kurtosis kurtosis-0.521
角度范围 angular_range— – 0.1500 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha79670000.0000
实空间数据点数 n_real_points31
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.673; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.853; Smooth: 0.814

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)