SAXSdb — 8y9y

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein translocase subunit SecA

Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–778	未记录	Protein translocase subunit SecY × 1 （A4IJK8） Protein translocase subunit SecE × 1 （A4IJH4） Substrate FtsQ-LacY(+1C) × 1 （P06136,P02920） MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y9Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1M6N Crystal structure of the SecA translocation ATPase from Bacillus subtilis 提交 2002-07-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–802（802 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 14	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；2 M ammonium sulfate, 30% glycerol, 1 mM DTT, 100 mM BES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 299K	分辨率 2.70 Å R-free 0.301
1M74 Crystal structure of Mg-ADP-bound SecA from Bacillus subtilis 提交 2002-07-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–802（802 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；5 mM ADP, 5 mM MgCl, 2 M ammonium sulfate, 30% glycerol, 1 mM DTT, 100 mM BES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 299K	分辨率 3.00 Å R-free 0.291
1TF2 Crystal structure of SecA:ADP in an open conformation from Bacillus Subtilis 提交 2004-05-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–841（841 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 250mM Magnesium Acetate, 7-12% PEG 8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.90 Å R-free 0.292
1TF5 Crystal structure of SecA in an open conformation from Bacillus Subtilis 提交 2004-05-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–841（841 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 250mM Magnesium Acetate, 7-12% PEG 8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.18 Å R-free 0.273
2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–780（780 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K	分辨率 3.20 Å R-free 0.323
2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–780（780 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K	分辨率 3.20 Å R-free 0.323
2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–780（780 aa）链 B 1–780（780 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K	分辨率 3.20 Å R-free 0.323
2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–780（780 aa）链 B 1–780（780 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K	分辨率 3.20 Å R-free 0.323
3DL8 Structure of the complex of aquifex aeolicus SecYEG and bacillus subtilis SecA 提交 2008-06-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–779（779 aa）片段：UNP residues 1-779	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；26-28% (w/v) PEG 3350 and 250mM lithium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 7.50 Å R-free 0.390
3DL8 Structure of the complex of aquifex aeolicus SecYEG and bacillus subtilis SecA 提交 2008-06-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–779（779 aa）片段：UNP residues 1-779	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；26-28% (w/v) PEG 3350 and 250mM lithium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 7.50 Å R-free 0.390
3IQM Active site mutants of B. subtilis SecA 提交 2009-08-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–802（802 aa）片段：UNP residues 1-802	突变：E208Q	SO4 SULFATE ION × 22	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；20 mM BES pH 7.0, 2.12 M Ammonium sulfate, 31% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K	分辨率 3.40 Å R-free 0.267
3IQY Active site mutants of B. subtilis SecA 提交 2009-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–841（841 aa）	突变：E208Q, R489K	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；20 mM BES pH 7.0, 2.1 M Ammonium sulfate, 32 % Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K	分辨率 3.30 Å R-free 0.269
5EUL Structure of the SecA-SecY complex with a translocating polypeptide substrate 提交 2015-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–742（742 aa）链 A 744–780（37 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TBR HEXATANTALUM DODECABROMIDE × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；21-24% polyethylene glycol 1500, 100mM Tris-HCl pH8.5, 50-100 mM MgAc2, 2% 2-methyl-2,4-pentandiol	分辨率 3.70 Å R-free 0.315
6ITC Structure of a substrate engaged SecA-SecY protein translocation machine 提交 2018-11-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 1–780（780 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
7XHA Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP.BeF3-. 提交 2022-04-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–778（778 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
7XHB Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP 提交 2022-04-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–778（778 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8Y9Z Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-3TM 提交 2024-02-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–778（778 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8YA0 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) 提交 2024-02-07	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 14–778（765 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–778（778 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å
8YAS Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-7TM 提交 2024-02-10	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–778（778 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å

共 16 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SECA_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–778； UniProt 1–778

Protein translocase subunit SecY

Geobacillus thermodenitrificans NG80-2

UniProt A4IJK8

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 1–430	突变：G60C, Q202T, F211T, R213N	Protein translocase subunit SecA × 1 （P28366） Protein translocase subunit SecE × 1 （A4IJH4） Substrate FtsQ-LacY(+1C) × 1 （P06136,P02920） MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y9Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5EUL Structure of the SecA-SecY complex with a translocating polypeptide substrate 提交 2015-11-18	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Y 1–430（430 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TBR HEXATANTALUM DODECABROMIDE × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；21-24% polyethylene glycol 1500, 100mM Tris-HCl pH8.5, 50-100 mM MgAc2, 2% 2-methyl-2,4-pentandiol	分辨率 3.70 Å R-free 0.315
6ITC Structure of a substrate engaged SecA-SecY protein translocation machine 提交 2018-11-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C,Q202T,L210G,F211G,R213N	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
7XHA Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP.BeF3-. 提交 2022-04-07	突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
7XHB Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP 提交 2022-04-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8Y9Z Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-3TM 提交 2024-02-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C, Q202T, F211T, R213N	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8YA0 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) 提交 2024-02-07	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 Y 2–430（429 aa）	突变：G60C, Q202T, F211T, R213N	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C, Q202T, F211T, R213N	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å
8YA3 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) treated with DTT 提交 2024-02-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C, Q202T, F211T, R213N	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8YAS Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-7TM 提交 2024-02-10	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Y 1–430（430 aa）	突变：G60C, Q202T, F211T, R213N	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A4IJK8_GEOTN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–430； UniProt 1–430

Protein translocase subunit SecE

Geobacillus thermodenitrificans NG80-2

UniProt A4IJH4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–60	未记录	Protein translocase subunit SecA × 1 （P28366） Protein translocase subunit SecY × 1 （A4IJK8） Substrate FtsQ-LacY(+1C) × 1 （P06136,P02920） MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y9Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5EUL Structure of the SecA-SecY complex with a translocating polypeptide substrate 提交 2015-11-18	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TBR HEXATANTALUM DODECABROMIDE × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；21-24% polyethylene glycol 1500, 100mM Tris-HCl pH8.5, 50-100 mM MgAc2, 2% 2-methyl-2,4-pentandiol	分辨率 3.70 Å R-free 0.315
6ITC Structure of a substrate engaged SecA-SecY protein translocation machine 提交 2018-11-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
7XHA Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP.BeF3-. 提交 2022-04-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.35 Å
7XHB Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP 提交 2022-04-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8Y9Z Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-3TM 提交 2024-02-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.41 Å
8YA0 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) 提交 2024-02-07	构建体不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 E 2–59（58 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å
8YA3 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) treated with DTT 提交 2024-02-07	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8YAS Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-7TM 提交 2024-02-10	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–60（60 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.97 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A4IJH4_GEOTN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

Substrate FtsQ-LacY(+1C)

Escherichia coli K-12

UniProt P02920

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 315–334	突变：T1M,R2A,L3K,A4K,G5T,C53A	Protein translocase subunit SecA × 1 （P28366） Protein translocase subunit SecY × 1 （A4IJK8） Protein translocase subunit SecE × 1 （A4IJH4） MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y9Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1PV6 Crystal structure of lactose permease 提交 2003-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–417（417 aa）	突变：C154G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.50 Å R-free 0.337
1PV6 Crystal structure of lactose permease 提交 2003-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–417（417 aa）	突变：C154G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.50 Å R-free 0.337
1PV7 Crystal structure of lactose permease with TDG 提交 2003-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–417（417 aa）	突变：C154G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.296
1PV7 Crystal structure of lactose permease with TDG 提交 2003-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–417（417 aa）	突变：C154G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.60 Å R-free 0.296
2CFP Sugar Free Lactose Permease at acidic pH 提交 2006-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–417（417 aa）	突变：YES	HG MERCURY (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.30 Å R-free 0.328
2CFQ Sugar Free Lactose Permease at neutral pH 提交 2006-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–417（417 aa）	突变：YES	HG MERCURY (II) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.95 Å R-free 0.298
2V8N Wild-type Structure of Lactose Permease 提交 2007-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–417（417 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 3.60 Å R-free 0.333
2V8N Wild-type Structure of Lactose Permease 提交 2007-08-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–417（417 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 3.60 Å R-free 0.333
2Y5Y Crystal structure of LacY in complex with an affinity inactivator 提交 2011-01-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–417（417 aa）链 B 1–417（417 aa）	突变：YES 突变：YES	BA BARIUM ION × 2 TGA 2-sulfanylethyl beta-D-galactopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；PH 6	分辨率 3.38 Å R-free 0.303
4ZYR Crystal structure of E. coli Lactose permease G46W/G262W bound to p-nitrophenyl alpha-D-galactopyranoside (alpha-NPG) 提交 2015-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–417（417 aa）	突变：G46W, G262W	9PG 4-nitrophenyl alpha-D-galactopyranoside × 1 BNG nonyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；1.0 M NaCl 0.05 M Tris (pH8.0) 26% PEG 600	分辨率 3.31 Å R-free 0.278
4ZYR Crystal structure of E. coli Lactose permease G46W/G262W bound to p-nitrophenyl alpha-D-galactopyranoside (alpha-NPG) 提交 2015-05-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–417（417 aa）	突变：G46W, G262W	9PG 4-nitrophenyl alpha-D-galactopyranoside × 1 BNG nonyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；1.0 M NaCl 0.05 M Tris (pH8.0) 26% PEG 600	分辨率 3.31 Å R-free 0.278
5GXB crystal structure of a LacY/Nanobody complex 提交 2016-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–417（417 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 LIPIDIC CUBIC PHASE；293 K；100mM MES pH 6.0, 100mM (NH4)2C4H4O6, 43% PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.346
6C9W Crystal Structure of a ligand bound LacY/Nanobody Complex 提交 2018-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–417（417 aa）片段：Full	突变：G46W, G262W	9PG 4-nitrophenyl alpha-D-galactopyranoside × 1 BNG nonyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；0.1 M MgCl2, 28% PEG1000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
8YA0 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) 提交 2024-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 316–332（17 aa）	突变：R2A, L3K, A4K, G5T, C14T, F17L	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07	突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 315–334（20 aa）	突变：T1M,R2A,L3K,A4K,G5T,E45C,C53A	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å
8YA3 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) treated with DTT 提交 2024-02-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 315–334（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
9XOU CryoEM structure of LacY with Trimbody 提交 2025-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 G 1–417（417 aa）链 H 1–417（417 aa）链 I 1–417（417 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å

共 13 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	LACY_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 35–54； UniProt 315–334

Substrate FtsQ-LacY(+1C)

Escherichia coli K-12

UniProt P06136

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 23–47	突变：T1M,R2A,L3K,A4K,G5T,C53A	Protein translocase subunit SecA × 1 （P28366） Protein translocase subunit SecY × 1 （A4IJK8） Protein translocase subunit SecE × 1 （A4IJH4） MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.29 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8Y9Y	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2VH1 Crystal structure of bacterial cell division protein FtsQ from E.coli 提交 2007-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 58–276（219 aa）片段：RESIDUES 58-276	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 33 MM N-OCTYL-B-D-GLUCOSIDE, 50 MM TRIS PH8.5, 8% PEG550MME, 8% PEG20K, 1.2 M NAFORMATE	分辨率 2.70 Å R-free 0.288
2VH1 Crystal structure of bacterial cell division protein FtsQ from E.coli 提交 2007-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 58–276（219 aa）片段：RESIDUES 58-276	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 33 MM N-OCTYL-B-D-GLUCOSIDE, 50 MM TRIS PH8.5, 8% PEG550MME, 8% PEG20K, 1.2 M NAFORMATE	分辨率 2.70 Å R-free 0.288
6H9N Complex of the periplasmic domains of bacterial cell division proteins FtsQ and FtsB 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–276（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M potassium thiocyanate, 20 % PEG 550 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.252
6H9O Complex of the periplasmic domains of bacterial cell division proteins FtsQ and FtsB 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 58–276（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.057 M potassium thiocyanate, 10 % PEG 550 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5.	分辨率 2.80 Å R-free 0.277
6H9O Complex of the periplasmic domains of bacterial cell division proteins FtsQ and FtsB 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 58–276（219 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；0.057 M potassium thiocyanate, 10 % PEG 550 MME, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5.	分辨率 2.80 Å R-free 0.277
8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07	突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 23–47（25 aa）	突变：T1M,R2A,L3K,A4K,G5T,E45C,C53A	MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.84 Å
8YA3 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) treated with DTT 提交 2024-02-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 28–47（20 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å

共 5 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FTSQ_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–25； UniProt 23–47

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8y9y
沉积日期 deposition_date	2024-02-07
结构标题 title	Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+1C)
关键词 keywords	Protein translocation, Membrane protein insertion, Protein chaperone, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	36.52 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.10 Å
零角强度 I(0) i0	301757000.00
分子量 molecular_weight	145080.0 kDa
排除体积 excluded_volume	183700 Å³
包络体积 envelope_volume	241460 Å³
水化壳体积 shell_volume	54864 Å³
包络直径 envelope_diameter	120.7 Å
壳层 Rg shell_rg	43.07 Å
包络 Rg envelope_rg	35.81 Å
形状 Rg shape_rg	36.10 Å
总 Rg total_rg	36.59 Å
总原子数 total_atoms	10207
残基数 n_residues	1284
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	114.7 Å
Rg (实空间) rg_real	36.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.76 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.0180e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.6170e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	36.47 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	301800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9058
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	42.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.184
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.586
角度范围 angular_range	— – 0.2150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	52530000.0000
实空间数据点数 n_real_points	44
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.949; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.923

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein translocase subunit SecA
分子量 formula_weight	88673.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.4.2.8
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	10207

MLGILNKMFDPTKRTLNRYEKIANDIDAIRGDYENLSDDALKHKTIEFKERLEKGATTDDLLVEAFAVVREASRRVTGMFPFKVQLMGGVALHDGNIAEMKTGEGKTLTSTLPVYLNALTGKGVHVVTVNEYLASRDAEQMGKIFEFLGLTVGLNLNSMSKDEKREAYAADITYSTNNELGFDYLRDNMVLYKEQMVQRPLHFAVIDEVDSILIDEARTPLIISGQAAKSTKLYVQANAFVRTLKAEKDYTYDIKTKAVQLTEEGMTKAEKAFGIDNLFDVKHVALNHHINQALKAHVAMQKDVDYVVEDGQVVIVDSFTGRLMKGRRYSEGLHQAIEAKEGLEIQNESMTLATITFQNYFRMYEKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMQVVTIPTNRPVVRDDRPDLIYRTMEGKFKAVAEDVAQRYMTGQPVLVGTVAVETSELISKLLKNKGIPHQVLNAKNHEREAQIIEEAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVKELGGLAVVGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGITQFYLSMEDELMRRFGAERTMAMLDRFGMDDSTPIQSKMVSRAVESSQKRVEGNNFDSRKQLLQYDDVLRQQREVIYKQRFEVIDSENLREIVENMIKSSLERAIAAYTPREELPEEWKLDGLVDLINTTYLDEGALEKSDIFGKEPDEMLELIMDRIITKYNEKEEQFGKEQMREFEKVIVLRAVDSKWMDHIDAMDQLRQGIHLRAYAQTNPLREYQMEGFAMFEHMIESIEDEVAKFVMKA

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	224308
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein translocase subunit SecY
分子量 formula_weight	47512.1 kDa
突变 mutation	G60C, Q202T, F211T, R213N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

MFRTISNFMRVSDIRNKIIFTLLMLIVFRIGTFIPVPSVNTDVLKLQDQLNAFGVLNIFCGGALQNFSIFAMGVMPYITASIIVQLLQMDVVPKFAEWSKQGEMGRRKLAQFTRYFTIVLGFIQALGMSYGFNNLAGGMLIQNPGIGTYLLIAVVLTAGTAFLMWLGEQITAKGVGNGISIIIFAGIVSGIPTILNQIYAQTFENVGEDLTLNIVRLLLVALAVVAVIVGVIYIQQAFRKIPIQYAKRLEGRNPVGGHSTHLPLKVNPAGVIPVIFAVSFLIAPPTIASFFGTNDVTLWIRRTFDYTHPVGMTIYVVLIIAFTYFYAFVQVNPEQMADNLKKQGGYIPGIRPGKNTQEYVTRILYRLTLVGSLFLAFIAVLPVFFVNFANLPPSAQIGGTSLLIVVGVALETMKQLESQLVKRHYRGFIK

来源 Source

来源生物 organism	Geobacillus thermodenitrificans NG80-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	420246
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein translocase subunit SecE
分子量 formula_weight	8249.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MQRVTNFFKEVVRELKKVSWPNRKELVNYTAVVLATVAFFTVFFAVIDLGISQLIRLVFEGGHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Geobacillus thermodenitrificans NG80-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	420246
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Substrate FtsQ-LacY(+1C)
分子量 formula_weight	7793.0 kDa
突变 mutation	T1M,R2A,L3K,A4K,G5T,C53A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAKKTILFLLTVLTTVLVSGWVVLGCQYEDGSSGVVILKTLHMFEVPFLLVGAFSISGDGDSPHSYHSGDGDK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION
分子量 formula_weight	66.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.29 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	212292

fit	/app/data/saxs_computation/y9/8y9y/8y9y.fit
pddf	/app/data/pr_computation/y9/8y9y/8y9y.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/y9/8y9y/8y9y.dat

Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+1C)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein translocase subunit SecA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein translocase subunit SecY

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein translocase subunit SecE

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Substrate FtsQ-LacY(+1C)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Substrate FtsQ-LacY(+1C)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)