8zp5

Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc5 basic patch mutations) with ARS1 DNA bound

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 156.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 2

Saccharomyces cerevisiae S288C

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 6 DNA 2 PDB 声明：octameric（8）与全部聚合物数一致	链 B； UniProt 1–620	未记录	Origin recognition complex subunit 5 × 1 （P50874） Origin recognition complex subunit 6 × 1 （P38826） DNA (35-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 Origin recognition complex subunit 1 × 1 （P54784） Origin recognition complex subunit 3 × 1 （P54790） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （P54791） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8ZP5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
5ZR1 Saccharomyces Cerevisiae Origin Recognition Complex Bound to a 72-bp Origin DNA containing ACS and B1 element 提交 2018-04-21	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7TJF S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA 提交 2022-01-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8ZP4 Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc1 to 5) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-29	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8ZPK Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc6 with residues 1 to 270 deleted) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-30	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 C 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 B 61–620（560 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 B 1–620（620 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–620； UniProt 1–620

Origin recognition complex subunit 5

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P50874

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 6 DNA 2 PDB 声明：octameric（8）与全部聚合物数一致	链 E； UniProt 1–479	突变：R360A, R366A, K367A	Origin recognition complex subunit 2 × 1 （P32833） Origin recognition complex subunit 6 × 1 （P38826） DNA (35-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 Origin recognition complex subunit 1 × 1 （P54784） Origin recognition complex subunit 3 × 1 （P54790） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （P54791） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ZP5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
5ZR1 Saccharomyces Cerevisiae Origin Recognition Complex Bound to a 72-bp Origin DNA containing ACS and B1 element 提交 2018-04-21	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7TJF S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA 提交 2022-01-16	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8ZP4 Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc1 to 5) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-29	突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8ZPK Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc6 with residues 1 to 270 deleted) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-30	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 F 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 E 1–479（479 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–479； UniProt 1–479

Origin recognition complex subunit 6

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P38826

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 6 DNA 2 PDB 声明：octameric（8）与全部聚合物数一致	链 F； UniProt 1–435	未记录	Origin recognition complex subunit 2 × 1 （P32833） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （P50874） DNA (35-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 Origin recognition complex subunit 1 × 1 （P54784） Origin recognition complex subunit 3 × 1 （P54790） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （P54791） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ZP5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
5ZR1 Saccharomyces Cerevisiae Origin Recognition Complex Bound to a 72-bp Origin DNA containing ACS and B1 element 提交 2018-04-21	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7TJF S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA 提交 2022-01-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8ZPK Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc6 with residues 1 to 270 deleted) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-30	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 F 271–435（165 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 G 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 F 1–435（435 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	ORC6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–435； UniProt 1–435

Origin recognition complex subunit 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P54784

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 6 DNA 2 PDB 声明：octameric（8）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 1–914	未记录	Origin recognition complex subunit 2 × 1 （P32833） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （P50874） Origin recognition complex subunit 6 × 1 （P38826） DNA (35-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 Origin recognition complex subunit 3 × 1 （P54790） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （P54791） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ZP5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1M4Z Crystal structure of the N-terminal BAH domain of Orc1p 提交 2002-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–235（235 aa）片段：BAH-containing Domain (RESIDUE 1-235) 链 B 1–235（235 aa）片段：BAH-containing Domain (RESIDUE 1-235)	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEGMME 2000, magnesium acetate, magnese chloride, MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.20 Å R-free 0.225
1M4Z Crystal structure of the N-terminal BAH domain of Orc1p 提交 2002-07-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–235（235 aa）片段：BAH-containing Domain (RESIDUE 1-235) 链 B 1–235（235 aa）片段：BAH-containing Domain (RESIDUE 1-235)	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；290 K；PEGMME 2000, magnesium acetate, magnese chloride, MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.20 Å R-free 0.225
1ZBX Crystal structure of a Orc1p-Sir1p complex 提交 2005-04-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–219（219 aa）片段：N-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；290 K；MES, NaCl, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 2.50 Å R-free 0.260
1ZHI Complex of the S. cerevisiae Orc1 and Sir1 interacting domains 提交 2005-04-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–219（219 aa）片段：BAH domain of Orc1	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；Tris, NaCl, Ammonium Sulfate, pH 7.5, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.70 Å R-free 0.293
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–913（913 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
5ZR1 Saccharomyces Cerevisiae Origin Recognition Complex Bound to a 72-bp Origin DNA containing ACS and B1 element 提交 2018-04-21	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 2–214（213 aa）链 L 2–214（213 aa）	突变：L79I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：L79I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6OM3 Crystal structure of the Orc1 BAH domain in complex with a nucleosome core particle 提交 2019-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 W 2–214（213 aa）链 X 2–214（213 aa）	突变：L79I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：L79I 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；6 mM Na-Cacodylate pH 6.0, 0.4 mM Spermine-HCl, 2 mM MgCl2 and 1.75% v/v PEG 400	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 A 1–913（913 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–913（913 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–913（913 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7E9C Cryo-EM structure of the 1:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 2–219（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7E9F Cryo-EM structure of the 2:1 Orc1 BAH domain in complex with nucleosome 提交 2021-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 2–219（218 aa）链 L 2–219（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7TJF S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA 提交 2022-01-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8ZP4 Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc1 to 5) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-29	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8ZPK Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc6 with residues 1 to 270 deleted) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-30	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 B 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 A 1–914（914 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å

共 25 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–914； UniProt 1–914

Origin recognition complex subunit 3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P54790

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 6 DNA 2 PDB 声明：octameric（8）与全部聚合物数一致	链 C； UniProt 1–616	未记录	Origin recognition complex subunit 2 × 1 （P32833） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （P50874） Origin recognition complex subunit 6 × 1 （P38826） DNA (35-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 Origin recognition complex subunit 1 × 1 （P54784） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （P54791） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ZP5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
5ZR1 Saccharomyces Cerevisiae Origin Recognition Complex Bound to a 72-bp Origin DNA containing ACS and B1 element 提交 2018-04-21	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7TJF S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA 提交 2022-01-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8ZP4 Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc1 to 5) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-29	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8ZPK Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc6 with residues 1 to 270 deleted) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-30	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 D 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 C 1–616（616 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–616； UniProt 1–616

Origin recognition complex subunit 4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P54791

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 异源复合物蛋白 × 6 DNA 2 PDB 声明：octameric（8）与全部聚合物数一致	链 D； UniProt 1–529	未记录	Origin recognition complex subunit 2 × 1 （P32833） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （P50874） Origin recognition complex subunit 6 × 1 （P38826） DNA (35-MER) × 1 DNA (34-MER) × 1 Origin recognition complex subunit 1 × 1 （P54784） Origin recognition complex subunit 3 × 1 （P54790） AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8ZP5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5V8F Structural basis of MCM2-7 replicative helicase loading by ORC-Cdc6 and Cdt1 提交 2017-03-21	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
5ZR1 Saccharomyces Cerevisiae Origin Recognition Complex Bound to a 72-bp Origin DNA containing ACS and B1 element 提交 2018-04-21	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
6RQC Cryo-EM structure of an MCM loading intermediate 提交 2019-05-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å
6WGC Atomic model of semi-attached mutant OCCM-DNA complex (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.30 Å
6WGG Atomic model of pre-insertion mutant OCCM-DNA complex(ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 8.10 Å
6WGI Atomic model of the mutant OCCM (ORC-Cdc6-Cdt1-Mcm2-7 with Mcm6 WHD truncation) loaded on DNA at 10.5 A resolution 提交 2020-04-05	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：hexadecameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
7MCA Structure of the S. cerevisiae origin recognition complex bound to the replication initiator Cdc6 and the ARS1 origin DNA. 提交 2021-04-01	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
7TJF S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA 提交 2022-01-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7TJH S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
7TJI S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with flexible Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJJ S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 1) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7TJK S. cerevisiae ORC bound to 84 bp ARS1 DNA and Cdc6 (state 2) with docked Orc6 N-terminal domain 提交 2022-01-16	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8ZP4 Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc1 to 5) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-29	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.33 Å
8ZPK Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc6 with residues 1 to 270 deleted) with ARS1 DNA bound 提交 2024-05-30	结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
9BCX Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate 提交 2024-04-10	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：16-meric	链 E 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.10 Å
9GJP OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9GJW OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm2 提交 2024-08-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9GM5 OCCM maturation intermediate stalled with an Arginine Finger mutation in Mcm5: Conformer 1 提交 2024-08-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：15-meric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
9I3I Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication. 提交 2025-01-23	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric	链 D 1–529（529 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting.	分辨率 4.40 Å

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–529； UniProt 1–529

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8zp5
沉积日期 deposition_date	2024-05-29
最后修订 last_revision	2025-04-16
结构标题 title	Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc5 basic patch mutations) with ARS1 DNA bound
关键词 keywords	REPLICATION; REPLICATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	45.77 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	45.92 Å
零角强度 I(0) i0	1400190000.00
分子量 molecular_weight	306380.0 kDa
排除体积 excluded_volume	381450 Å³
包络体积 envelope_volume	511000 Å³
水化壳体积 shell_volume	90315 Å³
包络直径 envelope_diameter	171.8 Å
壳层 Rg shell_rg	51.99 Å
包络 Rg envelope_rg	45.77 Å
形状 Rg shape_rg	45.95 Å
总 Rg total_rg	46.06 Å
总原子数 total_atoms	21482
残基数 n_residues	2515
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	156.9 Å
Rg (实空间) rg_real	45.72 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.34 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.4000e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.5960e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	45.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1400000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8654
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	152.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.366
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.203
角度范围 angular_range	— – 0.1700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	228100000.0000
实空间数据点数 n_real_points	35
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.784; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.907

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 2
分子量 formula_weight	71342.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	21482

MLNGEDFVEHNDILSSPAKSRNVTPKRVDPHGERQLRRIHSSKKNLLERISLVGNERKNTSPDPALKPKTPSKAPRKRGRPRKIQEELTDRIKKDEKDTISSKKKRKLDKDTSGNVNEESKTSNNKQVMEKTGIKEKREREKIQVATTTYEDNVTPQTDDNFVSNSPEPPEPATPSKKSLTTNHDFTSPLKQIIMNNLKEYKDSTSPGKLTLSRNFTPTPVPKNKKLYQTSETKSASSFLDTFEGYFDQRKIVRTNAKSRHTMSMAPDVTREEFSLVSNFFNENFQKRPRQKLFEIQKKMFPQYWFELTQGFSLLFYGVGSKRNFLEEFAIDYLSPKIAYSQLAYENELQQNKPVNSIPCLILNGYNPSCNYRDVFKEITDLLVPAELTRSETKYWGNHVILQIQKMIDFYKNQPLDIKLILVVHNLDGPSIRKNTFQTMLSFLSVIRQIAIVASTDHIYAPLLWDNMKAQNYNFVFHDISNFEPSTVESTFQDVMKMGKSDTSSGAEGAKYVLQSLTVNSKKMYKLLIETQMQNMGNLSANTGPKRGTQRTGVELKLFNHLCAADFIASNEIALRSMLREFIEHKMANITKNNSGMEIIWVPYTYAELEKLLKTVLNTL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 5
分子量 formula_weight	55116.8 kDa
突变 mutation	R360A, R366A, K367A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MNVTTPEVAFREYQTNCLASYISADPDITPSNLILQGYSGTGKTYTLKKYFNANPNLHAVWLEPVELVSWKPLLQAIARTVQYKLKTLYPNIPTTDYDPLQVEEPFLLVKTLHNIFVQYESLQEKTCLFLILDGFDSLQDLDAALFNKYIKLNELLPKDSKINIKFIYTMLETSFLQRYSTHCIPTVMFPRYNVDEVSTILVMSRCGELMEDSCLRKRIIEEQITDCTDDQFQNVAANFIHLIVQAFHSYTGNDIFALNDLIDFKWPKYVSRITKENIFEPLALYKSAIKLFLSTDDNLSENGQGESAITTNRDDLENSQTYDLSIISKYLLIASYICSYLEPRYDASIFSRKTRIIQGAAAYGRAAKKEVNPRYLQPSLFAIERLLAIFQAIFPIQGKAESGSLSALREESLMKANIEVFQNLSELHTLKLIATTMNKNIDYLSPKVRWKVNVPWEIIKEISESVHFNISDYFSDIHE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 6
分子量 formula_weight	50369.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSMQQVQHCVAEVLRLDPQEKPDWSSGYLKKLTNATSILYNTSLNKVMLKQDEEVARCHICAYIASQKMNEKHMPDLCYYIDSIPLEPKKAKHLMNLFRQSLSNSSPMKQFAWTPSPKKNKRSPVKNGGRFTSSDPKELRNQLFGTPTKVRKSQNNDSFVIPELPPMQTNESPSITRRKLAFEEDEDEDEEEPGNDGLSLKSHSNKSITGTRNVDSDEYENHESDPTSEEEPLGVQESRSGRTKQNKAVGKPQSELKTAKALRKRGRIPNSLLVKKYCKMTTEEIIRLCNDFELPREVAYKIVDEYNINASRLVCPWQLVCGLVLNCTFIVFNERRRKDPRIDHFIVSKMCSLMLTSKVDDVIECVKLVKELIIGEKWFRDLQIRYDDFDGIRYDEIIFRKLGSMLQTTNILVTDDQYNIWKKRIEMDLALTEPL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA (35-MER)
分子量 formula_weight	23708.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	G

TACAGATTTTATGTTTAGATCTTTTATGCTTGCTTTTCAAAAGGCCTGCAGGCAAGTGCACAAACAATACTTAAATA

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA (34-MER)
分子量 formula_weight	23766.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	H

TATTTAAGTATTGTTTGTGCACTTGCCTGCAGGCCTTTTGAAAAGCAAGCATAAAAGATCTAAACATAAAATCTGTA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 1
分子量 formula_weight	104546.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MAKTLKDLQGWEIITTDEQGNIIDGGQKRLRRRGAKTEHYLKRSSDGIKLGRGDSVVMHNEAAGTYSVYMIQELRLNTLNNVVELWALTYLRWFEVNPLAHYRQFNPDANILNRPLNYYNKLFSETANKNELYLTAELAELQLFNFIRVANVMDGSKWEVLKGNVDPERDFTVRYICEPTGEKFVDINIEDVKAYIKKVEPREAQEYLKDLTLPSKKKEIKRGPQKKDKATQTAQISDAETRATDITDNEDGNEDESSDYESPSDIDVSEDMDSGEISADELEEEEDEEEDEDEEEKEARHTNSPRKRGRKIKLGKDDIDASVQPPPKKRGRKPKDPSKPRQMLLISSCRANNTPVIRKFTKKNVARAKKKYTPFSKRFKSIAAIPDLTSLPEFYGNSSELMASRFENKLKTTQKHQIVETIFSKVKKQLNSSYVKEEILKSANFQDYLPARENEFASIYLSAYSAIESDSATTIYVAGTPGVGKTLTVREVVKELLSSSAQREIPDFLYVEINGLKMVKPTDCYETLWNKVSGERLTWAASMESLEFYFKRVPKNKKKTIVVLLDELDAMVTKSQDIMYNFFNWTTYENAKLIVIAVANTMDLPERQLGNKITSRIGFTRIMFTGYTHEELKNIIDLRLKGLNDSFFYVDTKTGNAILIDAAGNDTTVKQTLPEDVRKVRLRMSADAIEIASRKVASVSGDARRALKVCKRAAEIAEKHYMAKHGYGYDGKTVIEDENEEQIYDDEDKDLIESNKAKDDNDDDDDNDGVQTVHITHVMKALNETLNSHVITFMTRLSFTAKLFIYALLNLMKKNGSQEQELGDIVDEIKLLIEVNGSNKFVMEIAKTLFQQGSDNISEQLRIISWDFVLNQLLDAGILFKQTMKNDRICCVKLNISVEEAKRAMNEDETLRNL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 3
分子量 formula_weight	72161.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSDLNQSKKMNVSEFADAQRSHYTVYPSLPQSNKNDKHIPFVKLLSGKESEVNVEKRWELYHQLHSHFHDQVDHIIDNIEADLKAEISDLLYSETTQKRRCFNTIFLLGSDSTTKIELKDESSRYNVLIELTPKESPNVRMMLRRSMYKLYSAADAEEHPTIKYEDINDEDGDFTEQNNDVSYDLSLVENFKRLFGKDLAMVFNFKDVDSINFNTLDNFIILLKSAFKYDHVKISLIFNINTNLSNIEKNLRQSTIRLLKRNYHKLDVSSNKGFKYGNQIFQSFLDTVDGKLNLSDRFVEFILSKMANNTNHNLQLLTKMLDYSLMSYFFQNAFSVFIDPVNVDFLNDDYLKILSRCPTFMFFVEGLIKQHAPADEILSLLTNKNRGLEEFFVEFLVRENPINGHAKFVARFLEEELNITNFNLIELYHNLLIGKLDSYLDRWSACKEYKDRLHFEPIDTIFQELFTLDNRSGLLTQSIFPSYKSNIEDNLLSWEQVLPSLDKENYDTLSGDLDKIMAPVLGQLFKLYREANMTINIYDFYIAFRETLPKEEILNFIRKDPSNTKLLELAETPDAFDKVALILFMQAIFAFENMGLIKFQSTKSYDLVEKCVWRGI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 4
分子量 formula_weight	60772.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MTISEARLSPQVNLLPIKRHSNEEVEETAAILKKRTIDNEKCKDSDPGFGSLQRRLLQQLYGTLPTDEKIIFTYLQDCQQEIDRIIKQSIIQKESHSVILVGPRQSYKTYLLDYELSLLQQSYKEQFITIRLNGFIHSEQTAINGIATQLEQQLQKIHGSEEKIDDTSLETISSGSLTEVFEKILLLLDSTTKTRNEDSGEVDRESITKITVVFIFDEIDTFAGPVRQTLLYNLFDMVEHSRVPVCIFGCTTKLNILEYLEKRVKSRFSQRVIYMPQIQNLDDMVDAVRNLLTVRSEISPWVSQWNETLEKELSDPRSNLNRHIRMNFETFRSLPTLKNSIIPLVATSKNFGSLCTAIKSCSFLDIYNKNQLSNNLTGRLQSLSDLELAILISAARVALRAKDGSFNFNLAYAEYEKMIKAINSRIPTVAPTTNVGTGQSTFSIDNTIKLWLKKDVKNVWENLVQLDFFTEKSAVGLRDNATAAFYASNYQFQGTMIPFDLRSYQMQIILQELRRIIPKSNMYYSWTQL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae S288C
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	523.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.980 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	2.98 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	191281

fit	/app/data/saxs_computation/zp/8zp5/8zp5.fit
pddf	/app/data/pr_computation/zp/8zp5/8zp5.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/zp/8zp5/8zp5.dat

Cryo-EM structure of origin recognition complex (Orc5 basic patch mutations) with ARS1 DNA bound

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)