9e7m

In situ cryoEM structure of bacteriophage Ur-lambda tail tip complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 231.0 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tape measure protein

Escherichia phage Lambda

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 Ha； UniProt 818–849 链 Hb； UniProt 818–849 链 Hc； UniProt 818–849	未记录	Tail tip assembly protein I × 2 （P03730） Tail tip assembly protein I × 1 （P03730） Tip attachment protein J × 3 （P03749） Tail tip protein L × 3 （P03738） Tail fiber protein × 12 （P03764） Tail tip protein M × 6 （P03737） Tail tube protein × 6 （P03733） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 H 1–853（853 aa）链 O 1–853（853 aa）链 g 1–853（853 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 H 1–853（853 aa）链 K 1–853（853 aa）链 e 1–853（853 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 M 1–853（853 aa）链 P 1–853（853 aa）链 S 1–853（853 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TMP_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 Ha； PDB构建体 1–32； UniProt 818–849 作者链 Hb； PDB构建体 1–32； UniProt 818–849 作者链 Hc； PDB构建体 1–32； UniProt 818–849

Tail tip assembly protein I

Escherichia phage Lambda

UniProt P03730

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 Ia； UniProt 133–222 链 Ib； UniProt 133–222 链 Ic； UniProt 133–222	未记录	Tape measure protein × 3 （P03736） Tip attachment protein J × 3 （P03749） Tail tip protein L × 3 （P03738） Tail fiber protein × 12 （P03764） Tail tip protein M × 6 （P03737） Tail tube protein × 6 （P03733） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 I 1–223（223 aa）链 P 1–223（223 aa）链 h 1–223（223 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 I 1–223（223 aa）链 N 1–223（223 aa）链 f 1–223（223 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 K 1–223（223 aa）链 Q 1–223（223 aa）链 x 1–223（223 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8XCG Tail tip complex of bacteriophage lambda in the open state 提交 2023-12-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 I 1–223（223 aa）链 P 1–223（223 aa）链 h 1–223（223 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIPI_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	2, 3
链与序列区间	作者链 Ia； PDB构建体 1–90； UniProt 133–222 作者链 Ib； PDB构建体 1–90； UniProt 133–222 作者链 Ic； PDB构建体 1–90； UniProt 133–222

Tip attachment protein J

Escherichia phage Lambda

UniProt P03749

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 Ja； UniProt 1–835 链 Jb； UniProt 1–835 链 Jc； UniProt 1–835	未记录	Tape measure protein × 3 （P03736） Tail tip assembly protein I × 2 （P03730） Tail tip assembly protein I × 1 （P03730） Tail tip protein L × 3 （P03738） Tail fiber protein × 12 （P03764） Tail tip protein M × 6 （P03737） Tail tube protein × 6 （P03733） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 F 1–1132（1132 aa）链 J 1–1132（1132 aa）链 Z 1–1132（1132 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 E 1–1132（1132 aa）链 J 1–1132（1132 aa）链 Y 1–1132（1132 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
8JVM AHS-CSF domains of phage lambda tail 提交 2023-06-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 830–995（166 aa）片段：AHS-CSF domains 链 J 830–995（166 aa）片段：AHS-CSF domains 链 Z 830–995（166 aa）片段：AHS-CSF domains	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.86 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 A 1–1132（1132 aa）链 B 1–1132（1132 aa）链 I 1–1132（1132 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8XCG Tail tip complex of bacteriophage lambda in the open state 提交 2023-12-09	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 F 1–1132（1132 aa）链 J 1–1132（1132 aa）链 Z 1–1132（1132 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å
8XCI Open state of central tail fiber of bacteriophage lambda upon binding to LamB 提交 2023-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1132（1132 aa）链 J 1–1132（1132 aa）链 Z 1–1132（1132 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.57 Å
8XCJ Open State of central tail fiber of bacteriophage lambda upon binding to LamB (gpJ713-LamB complex) 提交 2023-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 713–1132（420 aa）链 J 713–1132（420 aa）链 Z 713–1132（420 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
8XCK Closed state of central tail fiber of bacteriophage lambda 提交 2023-12-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 713–1132（420 aa）链 J 713–1132（420 aa）链 Z 713–1132（420 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
9OIK Structure of S. Typhimurium 14028 Gifsy-1 prophage HepS bound to bacteriophage lambda J Tail Tip 提交 2025-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 902–933（32 aa）链 D 902–933（32 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.2 M Sodium Acetate, 16% PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5	分辨率 1.86 Å R-free 0.209

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIPJ_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 Ja； PDB构建体 1–835； UniProt 1–835 作者链 Jb； PDB构建体 1–835； UniProt 1–835 作者链 Jc； PDB构建体 1–835； UniProt 1–835

Tail tip protein L

Escherichia phage Lambda

UniProt P03738

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 La； UniProt 1–232 链 Lb； UniProt 1–232 链 Lc； UniProt 1–232	未记录	Tape measure protein × 3 （P03736） Tail tip assembly protein I × 2 （P03730） Tail tip assembly protein I × 1 （P03730） Tip attachment protein J × 3 （P03749） Tail fiber protein × 12 （P03764） Tail tip protein M × 6 （P03737） Tail tube protein × 6 （P03733） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 L 1–232（232 aa）链 N 1–232（232 aa）链 f 1–232（232 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 G 1–232（232 aa）链 L 1–232（232 aa）链 d 1–232（232 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 G 1–232（232 aa）链 J 1–232（232 aa）链 N 1–232（232 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8XCG Tail tip complex of bacteriophage lambda in the open state 提交 2023-12-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 L 1–232（232 aa）链 N 1–232（232 aa）链 f 1–232（232 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIPL_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 La； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 Lb； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232 作者链 Lc； PDB构建体 1–232； UniProt 1–232

Tail fiber protein

Escherichia phage Lambda

UniProt P03764

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 Ta； UniProt 1–94 链 Tb； UniProt 1–94 链 Tc； UniProt 1–94 链 Td； UniProt 1–94 链 Te； UniProt 1–94 链 Tf； UniProt 1–94 链 Tg； UniProt 1–94 链 Th； UniProt 1–94 链 Ti； UniProt 1–94 链 Tj； UniProt 1–94 链 Tk； UniProt 1–94 链 Tl； UniProt 1–94	未记录	Tape measure protein × 3 （P03736） Tail tip assembly protein I × 2 （P03730） Tail tip assembly protein I × 1 （P03730） Tip attachment protein J × 3 （P03749） Tail tip protein L × 3 （P03738） Tail tip protein M × 6 （P03737） Tail tube protein × 6 （P03733） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9MGH In situ cryo-EM structure of bacteriophage Ur-lambda tail side fiber 提交 2024-12-10	聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 Ta 1–94（94 aa）链 Tb 1–94（94 aa）链 Tc 1–94（94 aa）链 Td 1–94（94 aa）链 Te 1–94（94 aa）链 Tf 1–94（94 aa）链 Tg 1–94（94 aa）链 Th 1–94（94 aa）链 Ti 1–94（94 aa）链 Tj 1–94（94 aa）链 Tk 1–94（94 aa）链 Tl 1–94（94 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.31 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIBER_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 Ta； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tb； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tc； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Td； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Te； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tf； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tg； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Th； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Ti； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tj； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tk； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94 作者链 Tl； PDB构建体 1–94； UniProt 1–94

Tail tip protein M

Escherichia phage Lambda

UniProt P03737

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 Ma； UniProt 1–109 链 Mb； UniProt 1–109 链 Mc； UniProt 1–109 链 Md； UniProt 1–109 链 Me； UniProt 1–109 链 Mf； UniProt 1–109	未记录	Tape measure protein × 3 （P03736） Tail tip assembly protein I × 2 （P03730） Tail tip assembly protein I × 1 （P03730） Tip attachment protein J × 3 （P03749） Tail tip protein L × 3 （P03738） Tail fiber protein × 12 （P03764） Tail tube protein × 6 （P03733） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 E 1–109（109 aa）链 K 1–109（109 aa）链 M 1–109（109 aa）链 Y 1–109（109 aa）链 e 1–109（109 aa）链 m 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 D 1–109（109 aa）链 F 1–109（109 aa）链 M 1–109（109 aa）链 X 1–109（109 aa）链 Z 1–109（109 aa）链 m 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 C 1–109（109 aa）链 D 1–109（109 aa）链 E 1–109（109 aa）链 F 1–109（109 aa）链 H 1–109（109 aa）链 O 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8XCG Tail tip complex of bacteriophage lambda in the open state 提交 2023-12-09	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 E 1–109（109 aa）链 K 1–109（109 aa）链 M 1–109（109 aa）链 Y 1–109（109 aa）链 e 1–109（109 aa）链 m 1–109（109 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TIPM_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 Ma； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109 作者链 Mb； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109 作者链 Mc； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109 作者链 Md； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109 作者链 Me； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109 作者链 Mf； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109

Tail tube protein

Escherichia phage Lambda

UniProt P03733

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36）与蛋白拷贝数一致	链 Va； UniProt 3–157 链 Vb； UniProt 3–157 链 Vc； UniProt 3–157 链 Vd； UniProt 3–157 链 Ve； UniProt 3–157 链 Vf； UniProt 3–157	未记录	Tape measure protein × 3 （P03736） Tail tip assembly protein I × 2 （P03730） Tail tip assembly protein I × 1 （P03730） Tip attachment protein J × 3 （P03749） Tail tip protein L × 3 （P03738） Tail fiber protein × 12 （P03764） Tail tip protein M × 6 （P03737） SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9E7M	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2K4Q The Solution Structure of gpV, the Major Tail Protein from Bacteriophage Lambda 提交 2008-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–153（153 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 0.6 mM DSS, 200 mM sodium chloride, 8-10 % D2O, 0.1% % sodium azide, 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] gpV protein, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] gpV protein, 90-99 % D2O, 0.6 mM DSS, 50 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 0.1 % sodium azide, 90% D2O, 10% H2O \| 90% D2O, 10% H2O	分辨率未提供
2L04 The Solution Structure of the C-terminal Ig-like Domain of the Bacteriophage Lambda Tail Tube Protein 提交 2010-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 160–246（87 aa）片段：C-terminal, UNP residues 160-246	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）.2；压力 ambient NMR样品组成 50 mM sodium phosphate-1, 200 mM sodium chloride-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 50 mM sodium phosphate-3, 200 mM sodium chloride-4, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
6P3E Mobile loops and electrostatic interactions maintain the flexible lambda tail tube 提交 2019-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 A 1–246（246 aa）链 B 1–246（246 aa）链 C 1–246（246 aa）链 D 1–246（246 aa）链 E 1–246（246 aa）链 F 1–246（246 aa）链 G 1–246（246 aa）链 H 1–246（246 aa）链 I 1–246（246 aa）链 J 1–246（246 aa）链 K 1–246（246 aa）链 L 1–246（246 aa）链 M 1–246（246 aa）链 N 1–246（246 aa）链 O 1–246（246 aa）链 P 1–246（246 aa）链 Q 1–246（246 aa）链 R 1–246（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 5.40 Å
7T2E Structure of bacteriophage lambda tube protein V in C6 提交 2021-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 2–157（156 aa）链 B 2–157（156 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7T4F Structure of bacteriophage lambda tube protein V in C3 提交 2021-12-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 2–246（245 aa）链 B 2–246（245 aa）链 C 2–246（245 aa）链 D 2–246（245 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
8IYD Tail cap of phage lambda tail 提交 2023-04-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 A 1–246（246 aa）链 B 1–246（246 aa）链 C 1–246（246 aa）链 D 1–246（246 aa）链 E 1–246（246 aa）链 F 1–246（246 aa）链 H 1–246（246 aa）链 I 1–246（246 aa）链 J 1–246（246 aa）链 L 1–246（246 aa）链 M 1–246（246 aa）链 N 1–246（246 aa）链 O 1–246（246 aa）链 P 1–246（246 aa）链 R 1–246（246 aa）链 S 1–246（246 aa）链 T 1–246（246 aa）链 V 1–246（246 aa）链 X 1–246（246 aa）链 Y 1–246（246 aa）链 a 1–246（246 aa）链 b 1–246（246 aa）链 c 1–246（246 aa）链 v 1–246（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 A 1–246（246 aa）链 B 1–246（246 aa）链 C 1–246（246 aa）链 D 1–246（246 aa）链 G 1–246（246 aa）链 Q 1–246（246 aa）链 R 1–246（246 aa）链 S 1–246（246 aa）链 T 1–246（246 aa）链 U 1–246（246 aa）链 V 1–246（246 aa）链 W 1–246（246 aa）链 X 1–246（246 aa）链 a 1–246（246 aa）链 b 1–246（246 aa）链 c 1–246（246 aa）链 d 1–246（246 aa）链 i 1–246（246 aa）链 j 1–246（246 aa）链 k 1–246（246 aa）链 l 1–246（246 aa）链 n 1–246（246 aa）链 o 1–246（246 aa）链 v 1–246（246 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：42-meric	链 A 1–246（246 aa）链 B 1–246（246 aa）链 C 1–246（246 aa）链 O 1–246（246 aa）链 P 1–246（246 aa）链 Q 1–246（246 aa）链 R 1–246（246 aa）链 S 1–246（246 aa）链 T 1–246（246 aa）链 U 1–246（246 aa）链 V 1–246（246 aa）链 W 1–246（246 aa）链 a 1–246（246 aa）链 b 1–246（246 aa）链 c 1–246（246 aa）链 g 1–246（246 aa）链 h 1–246（246 aa）链 i 1–246（246 aa）链 j 1–246（246 aa）链 k 1–246（246 aa）链 l 1–246（246 aa）链 n 1–246（246 aa）链 o 1–246（246 aa）链 v 1–246（246 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.00 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 L 1–246（246 aa）链 R 1–246（246 aa）链 T 1–246（246 aa）链 U 1–246（246 aa）链 V 1–246（246 aa）链 W 1–246（246 aa）	未记录	SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.44 Å
8K36 Structure of the bacteriophage lambda tail tube 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–246（246 aa）链 B 1–246（246 aa）链 C 1–246（246 aa）链 D 1–246（246 aa）链 E 1–246（246 aa）链 F 1–246（246 aa）链 G 1–246（246 aa）链 H 1–246（246 aa）链 I 1–246（246 aa）链 J 1–246（246 aa）链 K 1–246（246 aa）链 L 1–246（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.48 Å
8K37 Structure of the bacteriophage lambda neck 提交 2023-07-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 G 1–246（246 aa）链 H 1–246（246 aa）链 I 1–246（246 aa）链 J 1–246（246 aa）链 K 1–246（246 aa）链 L 1–246（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8KGE Dimeric tail tube protein gpVs of bacteriophage lambda 提交 2023-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 1–246（246 aa）链 v 1–246（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.80 Å
8XPM Mature virion portal of phage lambda with DNA 提交 2024-01-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric	链 O 1–246（246 aa）链 O1 1–246（246 aa）链 O2 1–246（246 aa）链 P 1–246（246 aa）链 P1 1–246（246 aa）链 P2 1–246（246 aa）链 Q 1–246（246 aa）链 Q1 1–246（246 aa）链 Q2 1–246（246 aa）链 R 1–246（246 aa）链 R1 1–246（246 aa）链 R2 1–246（246 aa）链 V 1–246（246 aa）链 V1 1–246（246 aa）链 V2 1–246（246 aa）链 o 1–246（246 aa）链 o1 1–246（246 aa）链 o2 1–246（246 aa）链 p 1–246（246 aa）链 p1 1–246（246 aa）链 p2 1–246（246 aa）链 q 1–246（246 aa）链 q1 1–246（246 aa）链 q2 1–246（246 aa）链 r 1–246（246 aa）链 r1 1–246（246 aa）链 r2 1–246（246 aa）链 v 1–246（246 aa）链 v1 1–246（246 aa）链 v2 1–246（246 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.90 Å

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TUBE_LAMBD
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 Va； PDB构建体 1–152； UniProt 3–157 作者链 Vb； PDB构建体 1–152； UniProt 3–157 作者链 Vc； PDB构建体 1–152； UniProt 3–157 作者链 Vd； PDB构建体 1–152； UniProt 3–157 作者链 Ve； PDB构建体 1–152； UniProt 3–157 作者链 Vf； PDB构建体 1–152； UniProt 3–157

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9e7m
沉积日期 deposition_date	2024-11-03
结构标题 title	In situ cryoEM structure of bacteriophage Ur-lambda tail tip complex
关键词 keywords	bacteriophage, tail tip complex, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	68.64 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	69.55 Å
零角强度 I(0) i0	6924270000.00
分子量 molecular_weight	686500.0 kDa
排除体积 excluded_volume	851970 Å³
包络体积 envelope_volume	1322900 Å³
水化壳体积 shell_volume	162410 Å³
包络直径 envelope_diameter	269.2 Å
壳层 Rg shell_rg	66.91 Å
包络 Rg envelope_rg	69.01 Å
形状 Rg shape_rg	69.58 Å
总 Rg total_rg	69.38 Å
总原子数 total_atoms	48257
残基数 n_residues	6260
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	231.0 Å
Rg (实空间) rg_real	68.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.66 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.9100e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.5070e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	67.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	6906000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8215
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	70.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.639
峰度 Kurtosis kurtosis	0.117
角度范围 angular_range	— – 0.1150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0306
最高正则化参数 α highest_alpha	842800000.0000
实空间数据点数 n_real_points	24
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.740; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.453

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tape measure protein
分子量 formula_weight	3472.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ha,Hb,Hc
原子数 atom_count	48257

IGPAALKAVYDMARKGARDEIQTQMRDGGLFS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Tail tip assembly protein I
分子量 formula_weight	9322.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ia,Ib

GGMTGILFSLGASMVLGGVAQMLAPKARTPRIQTTDNGKQNTYFSSLDNMVAQGNVLPVLYGEMRVGSRVVSQEISTADEGDGGQVVVIG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Tail tip assembly protein I
分子量 formula_weight	9308.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ic

GGMTGVLFSLGASMVLGGVAQMLAPKARTPRIQTTDNGKQNTYFSSLDNMVAQGNVLPVLYGEMRVGSRVVSQEISTADEGDGGQVVVIG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Tip attachment protein J
分子量 formula_weight	92362.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ja,Jb,Jc

MGKGSSKGHTPREAKDNLKSTQLLSVIDAISEGPIEGPVDGLKSVLLNSTPVLDTEGNTNISGVTVVFRAGEQEQTPPEGFESSGSETVLGTEVKYDTPITRTITSANIDRLRFTFGVQALVETTSKGDRNPSEVRLLVQIQRNGGWVTEKDITIKGKTTSQYLASVVMGNLPPRPFNIRMRRMTPDSTTDQLQNKTLWSSYTEIIDVKQCYPNTALVGVQVDSEQFGSQQVSRNYHLRGRILQVPSNYNPQTRQYSGIWDGTFKPAYSNNMAWCLWDMLTHPRYGMGKRLGAADVDKWALYVIGQYCDQSVPDGFGGTEPRITCNAYLTTQRKAWDVLSDFCSAMRCMPVWNGQTLTFVQDRPSDKTWTYNRSNVVMPDDGAPFRYSFSALKDRHNAVEVNWIDPNNGWETATELVEDTQAIARYGRNVTKMDAFGCTSRGQAHRAGLWLIKTELLETQTVDFSVGAEGLRHVPGDVIEICDDDYAGISTGGRVLAVNSQTRTLTLDREITLPSSGTALISLVDGSGNPVSVEVQSVTDGVKVKVSRVPDGVAEYSVWELKLPTLRQRLFRCVSIRENDDGTYAITAVQHVPEKEAIVDNGAHFDGEQSGTVNGVTPPAVQHLTAEVTADSGEYQVLARWDTPKVVKGVSFLLRLTVTADDGSERLVSTARTTETTYRFTQLALGNYRLTVRAVNAWGQQGDPASVSFRIAAPAAPSRIELTPGYFQITATPHLAVYDPTVQFEFWFSEKQIADIRQVETSTRYLGTALYWIAASINIKPGHDYYFYIRSVNTVGKSAFVEAVGRASDDAEGYLDFFKGKITESHLGKELLEKV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Tail tip protein L
分子量 formula_weight	25730.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Lc,Lb,La

MQDIRQETLNECTRAEQSASVVLWEIDLTEVGGERYFFCNEQNEKGEPVTWQGRQYQPYPIQGSGFELNGKGTSTRPTLTVSNLYGMVTGMAEDMQSLVGGTVVRRKVYARFLDAVNFVNGNSYADPEQEVISRWRIEQCSELSAVSASFVLSTPTETDGAVFPGRIMLANTCTWTYRGDECGYSGPAVADEYDQPTSDITKDKCSKCLSGCKFRNNVGNFGGFLSINKLSQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Tail fiber protein
分子量 formula_weight	10092.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ta,Tb,Tc,Td,Te,Tf,Tg,Tl,Th,Ti,Tj,Tk

MAVKISGVLKDGTGKPVQNCTIQLKARRNSTTVVVNTVGSENPDEAGRYSMDVEYGQYSVILQVDGFPPSHAGTITVYEDSQPGTLNDFLCAMT

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Tail tip protein M
分子量 formula_weight	12547.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Ma,Mb,Mc,Md,Me,Mf

MKTFRWKVKPGMDVASVPSVRKVRFGDGYSQRAPAGLNANLKTYSVTLSVPREEATVLESFLEEHGGWKSFLWTPPYEWRQIKVTCAKWSSRVSMLRVEFSAEFEQVVN

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Tail tube protein
分子量 formula_weight	16540.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Va,Vb,Vc,Vd,Ve,Vf

VPNPTMPVKGAGTTLWVYKGSGDPYANPLSDVDWSRLAKVKDLTPGELTAESYDDSYLDDEDADWTATGQGQKSAGDTSFTLAWMPGEQGQQALLAWFNEGDTRAYKIRFPNGTVDVFRGWVSSIGKAVTVITRTVKVTNVGRPSMAEDRST

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia phage Lambda
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2681611
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

▶

8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.37 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	6517

fit	/app/data/saxs_computation/e7/9e7m/9e7m.fit
pddf	/app/data/pr_computation/e7/9e7m/9e7m.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/e7/9e7m/9e7m.dat

In situ cryoEM structure of bacteriophage Ur-lambda tail tip complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tape measure protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tail tip assembly protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tip attachment protein J

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tail tip protein L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tail fiber protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tail tip protein M

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tail tube protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 9 Entity 9 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)