9ei4

Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1970； UniProt 1–1970

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

物种未注明

UniProt P30876

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1174； UniProt 1–1174

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt P19387

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPB3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

物种未注明

UniProt O15514

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPB4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

物种未注明

UniProt P19388

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPAB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

物种未注明

UniProt P61218

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt P62487

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPB7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt P52434

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

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UniProt名称	RPAB3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P36954

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB9_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt P62875

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

物种未注明

UniProt P52435

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB11_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

物种未注明

UniProt P53803

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ATP-dependent DNA helicase Q5 × 1 （O94762） ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

ATP-dependent DNA helicase Q5

Homo sapiens

UniProt O94762

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 13 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RECQ5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–991； UniProt 1–991

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ei4
沉积日期 deposition_date	2024-11-25
结构标题 title	Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP
关键词 keywords	translocation, Human RNA polymerase II, RECQL5 helicase, TRANSCRIPTION, TRANSFERASE-DNA-RNA complex; TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ei4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ei4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ei4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	53.53 Å
Rg（电子密度）	53.55 Å
总 Rg	53.63 Å
原子数	35848
残基数	4419
排除体积	635980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9ei4__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
分子量 formula_weight	217420.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	35854

MHGGGPPSGDSACPLRTIKRVQFGVLSPDELKRMSVTEGGIKYPETTEGGRPKLGGLMDPRQGVIERTGRCQTCAGNMTECPGHFGHIELAKPVFHVGFLVKTMKVLRCVCFFCSKLLVDSNNPKIKDILAKSKGQPKKRLTHVYDLCKGKNICEGGEEMDNKFGVEQPEGDEDLTKEKGHGGCGRYQPRIRRSGLELYAEWKHVNEDSQEKKILLSPERVHEIFKRISDEECFVLGMEPRYARPEWMIVTVLPVPPLSVRPAVVMQGSARNQDDLTHKLADIVKINNQLRRNEQNGAAAHVIAEDVKLLQFHVATMVDNELPGLPRAMQKSGRPLKSLKQRLKGKEGRVRGNLMGKRVDFSARTVITPDPNLSIDQVGVPRSIAANMTFAEIVTPFNIDRLQELVRRGNSQYPGAKYIIRDNGDRIDLRFHPKPSDLHLQTGYKVERHMCDGDIVIFNRQPTLHKMSMMGHRVRILPWSTFRLNLSVTTPYNADFDGDEMNLHLPQSLETRAEIQELAMVPRMIVTPQSNRPVMGIVQDTLTAVRKFTKRDVFLERGEVMNLLMFLSTWDGKVPQPAILKPRPLWTGKQIFSLIIPGHINCIRTHSTHPDDEDSGPYKHISPGDTKVVVENGELIMGILCKKSLGTSAGSLVHISYLEMGHDITRLFYSNIQTVINNWLLIEGHTIGIGDSIADSKTYQDIQNTIKKAKQDVIEVIEKAHNNELEPTPGNTLRQTFENQVNRILNDARDKTGSSAQKSLSEYNNFKSMVVSGAKGSKINISQVIAVVGQQNVEGKRIPFGFKHRTLPHFIKDDYGPESRGFVENSYLAGLTPTEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLIKSMESVMVKYDATVRNSINQVVQLRYGEDGLAGESVEFQNLATLKPSNKAFEKKFRFDYTNERALRRTLQEDLVKDVLSNAHIQNELEREFERMREDREVLRVIFPTGDSKVVLPCNLLRMIWNAQKIFHINPRLPSDLHPIKVVEGVKELSKKLVIVNGDDPLSRQAQENATLLFNIHLRSTLCSRRMAEEFRLSGEAFDWLLGEIESKFNQAIAHPGEMVGALAAQSLGEPATQMTLNTFHYAGVSAKNVTLGVPRLKELINISKKPKTPSLTVFLLGQSARDAERAKDILCRLEHTTLRKVTANTAIYYDPNPQSTVVAEDQEWVNVYYEMPDFDVARISPWLLRVELDRKHMTDRKLTMEQIAEKINAGFGDDLNCIFNDDNAEKLVLRIRIMNSDENKMQEEEEVVDKMDDDVFLRCIESNMLTDMTLQGIEQISKVYMHLPQTDNKKKIIITEDGEFKALQEWILETDGVSLMRVLSEKDVDPVRTTSNDIVEIFTVLGIEAVRKALERELYHVISFDGSYVNYRHLALLCDTMTCRGHLMAITRHGVNRQDTGPLMKCSFEETVDVLMEAAAHGESDPMKGVSENIMLGQLAPAGTGCFDLLLDAEKCKYGMEIPTNIPGLGAAGPTGMFFGSAPSPMGGISPAMTPWNQGATPAYGAWSPSVGSGMTPGAAGFSPSAASDASGFSPGYSPAWSPTPGSPGSPGPSSPYIPSPGGAMSPSYSPTSPAYEPRSPGGYTPQSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPNYTPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYTPTSPNYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPSSPRYTPQSPTYTPSSPSYSPSSPSYSPASPKYTPTSPSYSPSSPEYTPTSPKYSPTSPKYSPTSPKYSPTSPTYSPTTPKYSPTSPTYSPTSPVYTPTSPKYSPTSPTYSPTSPKYSPTSPTYSPTSPKGSTYSPTSPGYSPTSPTYSLTSPAISPDDSDEEN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
分子量 formula_weight	134071.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGMRHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELESTNRRYTKRDCSTFLRTSETGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEGITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSRDGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGCRNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	31478.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MPYANQPTVRITELTDENVKFIIENTDLAVANSIRRVFIAEVPIIAIDWVQIDANSSVLHDEFIAHRLGLIPLISDDIVDKLQYSRDCTCEEFCPECSVEFTLDVRCNEDQTRHVTSRDLISNSPRVIPVTSRNRDNDPNDYVEQDDILIVKLRKGQELRLRAYAKKGFGKEHAKWNPTAGVAFEYDPDNALRHTVYPKPEEWPKSEYSELDEDESQAPYDPNGKPERFYYNVESCGSLRPETIVLSALSGLKKKLSDLQTQLSHEIQSDVLTIN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4
分子量 formula_weight	16331.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAAGGSDPRAGDVEEDASQLIFPKEFETAETLLNSEVHMLLEHRKQQNESAEDEQELSEVFMKTLNYTARFSRFKNRETIASVRSLLLQKKLHKFELACLANLCPETAEESKALIPSLEGRFEDEELQQILDDIQTKRSFQY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
分子量 formula_weight	24644.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDDEEETYRLWKIRKTIMQLCHDRGYLVTQDELDQTLEEFKAQFGDKPSEGRPRRTDLTVLVAHNDDPTDQMFVFFPEEPKVGIKTIKVYCQRMQEENITRALIVVQQGMTPSAKQSLVDMAPKYILEQFLQQELLINITEHELVPEHVVMTKEEVTELLARYKLRENQLPRIQAGDPVARYFGIKRGQVVKIIRPSETAGRYITYRLVQ

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
分子量 formula_weight	14491.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSDNEDNFDGDDFDDVEEDEGLDDLENAEEEGQENVEILPSGERPQANQKRITTPYMTKYERARVLGTRALQIAMCAPVMVELEGETDPLLIAMKELKARKIPIIIRRYLPDGSYEDWGVDELIITD

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
分子量 formula_weight	19314.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFYHISLEHEILLHPRYFGPNLLNTVKQKLFTEVEGTCTGKYGFVIAVTTIDNIGAGVIQPGRGFVLYPVKYKAIVFRPFKGEVVDAVVTQVNKVGLFTEIGPMSCFISRHSIPSEMEFDPNSNPPCYKTMDEDIVIQQDDEIRLKIVGTRVDKNDIFAIGSLMDDYLGLVS

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	17162.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAGILFEDIFDVKDIDPEGKKFDRVSRLHCESESFKMDLILDVNIQIYPVDLGDKFRLVIASTLYEDGTLDDGEYNPTDDRPSRADQFEYVMYGKVYRIEGDETSTEAATRLSAYVSYGGLLMRLQGDANNLHGFEVDSRVYLLMKKLAF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	14541.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MEPDGTYEPGFVGIRFCQECNNMLYPKEDKENRILLYACRNCDYQQEADNSCIYVNKITHEVDELTQIIADVSQDPTLPRTEDHPCQKCGHKEAVFFQSHSARAEDAMRLYYVCTAPHCGHRWTE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	7655.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIIPVRCFTCGKIVGNKWEAYLGLLQAEYTEGDALDALGLKRYCCRRMLLAHVDLIEKLLNYAPLEK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a
分子量 formula_weight	13310.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPPAFESFLLFEGEKKITINKDTKVPNACLFTINKEDHTLGNIIKSQLLKDPQVLFAGYKVPHPLEHKIIIRVQTTPDYSPQEAFTNAITDLISELSLLEERFRVAIKDKQEGIE

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
分子量 formula_weight	7018.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MDTQKDVQPPKQQPMIYICGECHTENEIKSRDPIRCRECGYRIMYKKRTKRLVVFDAR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Non-template DNA, nucleic acid scaffold
分子量 formula_weight	13305.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

TAGTAAACTAGTATTGAAAGTACTTGAGCTTAGACAGCATGTC

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	RNA, nucleic acid scaffold
分子量 formula_weight	6414.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	P

UAUAUGCAUAAAGACCAGGC

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Template DNA, nucleic acid scaffold
分子量 formula_weight	8515.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

CTCAAGTACTTACGCCTGGTCATTACTA

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	ATP-dependent DNA helicase Q5
分子量 formula_weight	109024.9 kDa
EC 编号 ec_number	5.6.2.4
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MSSHHTTFPFDPERRVRSTLKKVFGFDSFKTPLQESATMAVVKGNKDVFVCMPTGAGKSLCYQLPALLAKGITIVVSPLIALIQDQVDHLLTLKVRVSSLNSKLSAQERKELLADLEREKPQTKILYITPEMAASSSFQPTLNSLVSRHLLSYLVVDEAHCVSQWGHDFRPDYLRLGALRSRLGHAPCVALTATATPQVQEDVFAALHLKKPVAIFKTPCFRANLFYDVQFKELISDPYGNLKDFCLKALGQEADKGLSGCGIVYCRTREACEQLAIELSCRGVNAKAYHAGLKASERTLVQNDWMEEKVPVIVATISFGMGVDKANVRFVAHWNIAKSMAGYYQESGRAGRDGKPSWCRLYYSRNDRDQVSFLIRKEVAKLQEKRGNKASDKATIMAFDALVTFCEELGCRHAAIAKYFGDALPACAKGCDHCQNPTAVRRRLEALERSSSWSKTCIGPSQGNGFDPELYEGGRKGYGDFSRYDEGSGGSGDEGRDEAHKREWNLFYQKQMQLRKGKDPKIEEFVPPDENCPLKEASSRRIPRLTVKAREHCLRLLEEALSSNRQSTRTADEADLRAKAVELEHETFRNAKVANLYKASVLKKVADIHRASKDGQPYDMGGSAKSCSAQAEPPEPNEYDIPPASHVYSLKPKRVGAGFPKGSCPFQTATELMETTRIREQAPQPERGGEHEPPSRPCGLLDEDGSEPLPGPRGEVPGGSAHYGGPSPEKKAKSSSGGSSLAKGRASKKQQLLATAAHKDSQSIARFFCRRVESPALLASAPEAEGACPSCEGVQGPPMAPEKYTGEEDGAGGHSPAPPQTEECLRERPSTCPPRDQGTPEVQPTPAKDTWKGKRPRSQQENPESQPQKRPRPSAKPSVVAEVKGSVSASEQGTLNPTAQDPFQLSAPGVSLKEAANVVVKCLTPFYKEGKFASKELFKGFARHLSHLLTQKTSPGRSVKEEAQNLIRHFFHGRARCESEADWHGLCGPQR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	17442

Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体