9euf

Cryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the pre-contraction state - complete

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DUF4815 domain-containing protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8E5NSA0_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 1； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 2； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 3； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 4； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 h； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 i； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 j； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 k； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 l； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 m； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152 作者链 z； PDB构建体 1–1152； UniProt 1–1152

Receptor binding protein

物种未注明

UniProt A0A0U1WIJ9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1WIJ9_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 6； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 7； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 n； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 o； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458 作者链 p； PDB构建体 1–458； UniProt 1–458

CBM-cenC domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1UXW5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1UXW5_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 8； PDB构建体 1–640； UniProt 1–640 作者链 9； PDB构建体 1–640； UniProt 1–640 作者链 AA； PDB构建体 1–640； UniProt 1–640 作者链 q； PDB构建体 1–640； UniProt 1–640 作者链 r； PDB构建体 1–640； UniProt 1–640 作者链 s； PDB构建体 1–640； UniProt 1–640

NlpC/P60 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1UXW0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1UXW0_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295

GP-PDE domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1WFD7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1WFD7_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–848； UniProt 1–848

Baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1WF63

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1WF63_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 D； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 I； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 K； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348

Peptidase C51 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1X189

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1X189_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–808； UniProt 1–808

Baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1UXD6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1UXD6_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–174； UniProt 1–174 作者链 G； PDB构建体 1–174； UniProt 1–174

TmpF

物种未注明

UniProt A0A0U1WGD3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1WGD3_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–1019； UniProt 1–1019 作者链 J； PDB构建体 1–1019； UniProt 1–1019

Baseplate wedge subunit

物种未注明

UniProt A0A0U1UXD7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1UXD7_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 O； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234

Putative baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1X2L4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1X2L4_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263 作者链 N； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263

Major tail sheath protein

物种未注明

UniProt A0A0U1WZ79

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Capsid protein × 18 （A1YTP2） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1WZ79_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–587； UniProt 1–587 作者链 Q； PDB构建体 1–587； UniProt 1–587 作者链 T； PDB构建体 1–587； UniProt 1–587 作者链 U； PDB构建体 1–587； UniProt 1–587 作者链 X； PDB构建体 1–587； UniProt 1–587 作者链 Y； PDB构建体 1–587； UniProt 1–587

Capsid protein

物种未注明

UniProt A1YTP2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Baseplate protein × 36 （A0A0U1WGQ5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A1YTP2_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 S； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 V； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 W； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 Z； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142 作者链 a； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

Baseplate protein

Staphylococcus phage 812

UniProt A0A0U1WGQ5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 189	DUF4815 domain-containing protein × 36 （A0A8E5NSA0） Receptor binding protein × 18 （A0A0U1WIJ9） CBM-cenC domain-containing protein × 18 （A0A0U1UXW5） NlpC/P60 domain-containing protein × 3 （A0A0U1UXW0） GP-PDE domain-containing protein × 3 （A0A0U1WFD7） Baseplate component × 12 （A0A0U1WF63） Peptidase C51 domain-containing protein × 3 （A0A0U1X189） Baseplate component × 6 （A0A0U1UXD6） TmpF × 6 （A0A0U1WGD3） Baseplate wedge subunit × 6 （A0A0U1UXD7） Putative baseplate component × 6 （A0A0U1X2L4） Major tail sheath protein × 18 （A0A0U1WZ79） Capsid protein × 18 （A1YTP2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0U1WGQ5_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 c； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 d； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 e； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 f； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 g； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 t； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 u； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 v； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 w； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 x； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173 作者链 y； PDB构建体 1–173； UniProt 1–173

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9euf
沉积日期 deposition_date	2024-03-27
结构标题 title	Cryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the pre-contraction state - complete
关键词 keywords	bacteriophage, phage, contractile, phi812, baseplate, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9euf__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9euf__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9euf__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	161.10 Å
总 Rg	159.90 Å
原子数	672876
残基数	90690
排除体积	7592900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9euf__assembly_1__model_1`	189-meric （189）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DUF4815 domain-containing protein
分子量 formula_weight	129263.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0,1,2,3,4,h,i,j,k,l,m,z
原子数 atom_count	224293

MAINFKGSPYLDRFDPSKDRTKVLFNPDRPLQQAELNEMQSIDQYYLKNLGDAIFKDGDKQSGLGFTLSEDNVLTVNPGYVYINGKIRYYDNDDSVKITGVGKETIGIKLTERIVTPDEDASLLDQTSGVPSYFSKGADRLEEKMSLTVNDPTSATIYTFMDGDLYIQSTNAEMDKINKVLAERTYDESGSYKVNGFELFSEGNAEDDDHVSVVVDAGKAYVKGFKVDKPVSTRISVPKSYDLGTAENESTIFNKSNNSISLANSPVKEIRRVTGQVLIEKERVTRGAQGDGQDFLSNNTAFEIVKVWTETSPGVTTKEYKQGEDFRLTDGQTIDWSPQGQEPSGGTSYYVSYKYNKRMEAGKDYEVTTQGEGLSKKWYINFTPSNGAKPIDQTVVLVDYTYYLARKDSVFINKYGDIAILPGEPNIMRLVTPPLNTDPENLQLGTVTVLPDSDEAVCISFAITRLSMEDLQKVKTRVDNLEYNQAVNALDDGAMEGQNPLTLRSVFSEGFISLDKADITHPDFGIVFSFEDAEATLAYTEAVNQPKIIPGDTTAHIWGRLISAPFTEERTIYQGQASETLNVNPYNIPNKQGVLKLTPSEDNWIDTENVTITEQKTKKVTMKRFWRHNESYYGETEHYLYSNLQLDAGQKWKGETYAYDREHGRTGTLLESGGQRTLEEMIEFIRIRDVSFEVKGLNPNDNNLYLLFDGVRCAITPATGYRKGSEDGTIMTDAKGTAKGKFTIPAGIRCGNREVTLKNANSTSATTYTAQGRKKTAQDIIIRTRVTVNLVDPLAQSFQYDENRTISSLGLYFASKGDKQSNVVIQIRGMGDQGYPNKTIYAETVMNADDIKVSNNASAETRVYFDDPMMAEGGKEYAIVIITENSDYTMWVGTRTKPKIDKPNEVISGNPYLQGVLFSSSNASTWTPHQNSDLKFGIYTSKFNETATIEFEPIKDVSADRIVLMSTYLTPERTGCTWEMKLILDDMASSTTFDQLKWEPIGNYQDLDVLGLARQVKLRATFESNRYISPLMSSSDLTFTTFLTELTGSYVGRAIDMTEAPYNTVRFSYEAFLPKGTKVVPKYSADDGKTWKTFTKSPTTTRANNEFTRYVIDEKVKSSGTNTKLQVRLDLSTENSFLRPRVRRLMVTTRDE

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Receptor binding protein
分子量 formula_weight	50474.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5,6,7,n,o,p

MALNFTTITENNVIRDLTTQVNNIGEELTKERNIFDITDDLVYNFNKSQKIKLTDDKGLTKSYGNITALRDIKEPGYYYIGARTLATLLDRPDMESLDVVLHVVPLDTSSKVVQHLYTLSTNNNQIKMLYRFVSGNSSSEWQFIQGLPSNKNAVISGTNILDIASPGVYFVMGMTGGMPSGVSSGFLDLSVDANDNRLARLTDAETGKEYTSIKKPTGTYTAWKKEFEPKDMEKYLLSSIRDDGSASFPLLVYTSDSKTFQQAIIDHIDRTGQTTFTFYVQGGVSGSPMSNSCRGLFMSDTPNTSSLHGVYNAIGTDGRNVTGSVVGSNWTSPKTSPSHKELWTGAQSFLSTGTTKNLSDDISNYSYVEVYTTHKTTEKTKGNDNTGTICHKFYLDGSGTYVCSGTFVSGDRTDTKPPITEFYRVGVSFKGSTWTLVDSAVQNSKTQYVTRIIGINMP

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	CBM-cenC domain-containing protein
分子量 formula_weight	72654.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	8,9,AA,q,r,s

MAFNYTPLTETQKLKDMYPKVNDIGNFLKTEVNLSDVKQISQPDFNNILASIPDSGNYYVTNSKGAPSGEATAGFVRLDKRNVNYYKIYYSPYSSNKMYIKTYANGTVYDWISFKLDEGSLYNEGNTLNVKELTESTTQYATLVNPPKENLNTGWVNYKESKNGVSSLVEFNPVNSTSTFKMIRKLPVQEQKPNLLKDSLFVYPETSYSNIKTDNWDTPPFWGYSSNSGRSGVRFRGENTVQIDDGSDTYPSVVSNRFKMGKELSVGDTVTVSVYAKINDPALLKDNLVYFELAGYDTVDDTSKNPYTGGRREITASEITTEWKKYSFTFTIPENTIGASGVKVNYVSLLLRMNCSSSKGNGAVVYYALPKLEKSSKVTPFITHENDVRKYDEIWSNWQEVISKDELKGHSPVDIEYNDYFKYQWWKSEVNEKSLKDLAMTVPQGYHTFYCQGSIAGTPKGRSIRGTIQVDYDKCDPYRANKFVKLLFTDTEGIPYTLYYGGYNQGWKPLKQSETSTLLWKGTLDFGSTEAVNLNDSLDNYDLIEVTYWTRSAGHFSTKRLDIKNTSNLLYIRDFNISNDSTGSSVDFFEGYCTFPTRTSVQPGMVKSITLDGSTNTTKVASWNEKERIKVYNIMGINRG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	NlpC/P60 domain-containing protein
分子量 formula_weight	34645.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MATDKEAKDVIDKFIDNVFNFDVLTKERIKEKDEEIKKITTDDMYEKVVYIRPYVGVIQSLNPQHVQYESFSNNGYDIEAELSFRKVSYLVDKGSIPTDSLSTLTVHLVERNQELLIDYFDEIQDVLYGEYMEEEYVFDEDVPLSTILALDLNDNLKSLSNIKYMFKGAPKENPFGTDKDVYIDTYNLLYWLYLGEDEELAYPMNINYFFTEGRFFTIFGKGHKYKVDVSKFIVGDILFFGRSDTNIGIYVGDGEFISMMGKFPKDETPIGKYKLDDYWNEFNGRVMRFDEEVYI

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	GP-PDE domain-containing protein
分子量 formula_weight	96199.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MVVRFQSSMGRSLKRVDSDDLNVKGLVLATVSKINYKYQSVEVKVNNLTLGSRIGDDGSLAVPYPKSFIGRTPEGSVFGTKPLITEGSVVLIGFLNDDINSPIILSVYGDNEQNKMINTNPLDGGKFDTESVYKYSSSLYEILPSLNYKYDDGEGTSIRTYNGKSFFSMTSGEEEKPQATDFYTGTEYQDLFTSYYGNKTLIEPRIQKAPNMLFKHQGVFYDDGTPDNHITTLFISERGDIRASVLNTETQKRTTQEMSSDGSYRVIKQDDDLMLDEAQVWIEYGISEDNKFYIKNDKHKFEFTDEGIYIDDKPMLENLDESIAEAMKNLNEIQKELDDINYLLKGVGKDNLEELIESTKESIEASKKATSDVNRLTTQIAEVSGRTEGIITQFQKFRDETFKDFYEDASTVINEVNQNFPTMKTDVKTLKTKVDNLEKTEIPNIKTRLTELENNNNNADKIISDRGEHIGAMIQLEENVTVPMRKYMPIPWSKVTYNNAEFWDSNNPTRLVVPKGITKVRVAGNVLWDSNATGQRMLRILKNGTYSIGLPYTRDVAISTAPQNGTSGVIPVKEGDYFEFEAFQDSEGDRQFRADPYTWFSIEAIELETETMEKDFMLIGHRGATGYTDEHTIKGYQMALDKGADYIELDLQLTKDNKLLCMHDSTIDRTTTGTGKVGDMTLSYIQTNFTSLNGEPIPSLDDVLNHFGTKVKYYIETKRPFDANMDRELLTQLKAKGLIGIGSERFQVIIQSFARESLINIHNQFSNIPLAYLTSTFSESEMDDCLSYGFYAIAPKYTTITKELVDLAHSKGLKVHAWTVNTKEEMQSLIQMGVDGFFTNYLDEYKKI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Baseplate component
分子量 formula_weight	39248.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,I,K

MKTRKLTNILSKLIDKTMAGTSKITDFTPGSASRSLLEAVSLEIEQFYILTKENIDWGIQEGIIEAFDFQKRQSKRAYGDVTIQFYQPLDMRMYIPAGTTFTSTRQEYPQQFETLVDYYAEPDSTEIVVEVYCKETGVAGNVPEGTINTIASGSSLIRSVNNEYSFNTGTKEESQEDFKRRFHSFVESRGRATNKSVRYGALQIPDVEGVYVYEETGHITVFAHDRNGNLSDTLKEDIIDALQDYRPSGIMLDVTGVEKEEVNVSATVTISNKSRIGDTLQKHIESVIRSYLNNLKTSDDLIITDLIQAIMNIDDVLIYDVSFDNLDENIIVPPQGIIRAGEIKVELK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Peptidase C51 domain-containing protein
分子量 formula_weight	91364.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MRRIRRPKVRIEIVTDDNTFTLRFEDTRDYNGDEFGAKLLGFQTKNSMEDDSSVFQINMAGDTYWDKLVMANDIIRIFITPNDDPNDKEGKQERLIQVGMVSQVSKVGSYGNDQTQFRITGQSFVKPFMKFGLGVIQEVQAVLPEVGWLIDGDGDNEVKFTGSSAHEVMTGIIRRFIPYMKYNYTEKTYNTIDNYLDYDDLSSWDEFEKLTEVSAFTNFDGSLKQLMDMVTARPFNELFFKNSEKTPGKAQLVLRKTPFNPTEWRALDMIKVPTEDFIEEDVGKSDVETYSIFTATPAGMLKELNGDVFSKPQFHPELTDRYGYTKFEVENIYLSTKSGSATEDSDSSGDDNGTERGTYSKIMKDLSNYGRDNISKGIDKYTSKLSSKYKNLKKAQAKKIIEKFVKEGKVTEKEYEKITGNKVDDELTSDNRPKLTKDKLKSILKEKFKTQDDFNNSKKKKKAKTDALKELTTKYRFGNKTHATTLLDEYIKYKGEPPNDEAFDKYLKAIEGVSNVATDTGSDASDSPLVMFSRMLFNWYHGNPNFYAGDIIVLGDPKYDLGKRLFIEDKQRGDTWEFYIESVEHKFDYKQGYYTTVGVTRGLKDAILEDGKGSPHRFAGLWNQSSDFMGGLMGEDTSKELKEKGVAEKQSSGDKDGGSDSGGAQDGGSLDSLKKYNGKLPKHDPSFVQPGNRHYKYQCTWYAYNRRGQLGIPVPLWGDAADWIGGAKGAGYGVGRTPKQGACVIWQRGVQGGSPQYGHVAFVEKVLDGGKKIFISEHNYATPNGYGTRTIDMSSAIGKNAQFIYDKK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Baseplate component
分子量 formula_weight	19998.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,G

MNNFIPQPQGLLRFLNTLDTDLTSSHMNLLDEEVSFVSKFYTPQLQLSELAKKVLTNIKTDDIPVLEREFNDNTIIHKANDTLLKVQAPRMYMILQSIVLEAYAIVNCFVENPSSLKYLTEEDVSITRENLNYVADYLGNYDDYNSVVLDLRDLDLCFSAIELQLPLIKKEANV

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	TmpF
分子量 formula_weight	116389.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,J

MANFLKNLHPLLRRDRNKKDNQDPNFALIDALNEEMNQVEKDAIESKLQSSLKTSTSEYLDKFGDWFGVYRKTDEKDDVYRARIIKYLLLKRGTNNAIIDAIKDYLGRDDIDVSVYEPFTNIFYTNKSHLNGEDHLMGYYYRFAVINVSIGDYFPVEIIDVINEFKPAGVTLYVTYDGASTIRGGAIIKWLDGLPKIETYQEFDRFTGYDDTFYGHINMNQSKDTDNSSSDIFKTNHSLINSLDVLTGSSSVGRQYINYGYVTSYVYNPGMTSSVNQISASTEGRGQEVPTDYYMYTSTKNNNTVELSMQTTSGVSYLYNNFNFRDYMSKYRPQVDLQSDEARRIVSDYIKELSIDYYLSAVIPPDESIEIKLQVYDFSINRWLTVSINNLSFYEKNIGSNIGYIKDYLNSELNMFTRLEINAGKRDSVDIKVNYLDLMFYYYERGIYTIKPYKALIENYLDISRETYVEAFKIASLSNGDIITKTGFQPIGYLKLVGNYENTIPSTINIVAKDTDNNPIESNELDVYNTVENRNLLQSYKGVNTIAREITSTKEFTVSGWAKEIYSTNYLSKVLKPGKVYTLSFDMEITGNDPTLKSYSDNHGIYLYSNTKGIVVNGVKSMERTIGNKVSVTQTFTAPTITDHRLLIYTGRYTSDGKASTPPVFFNTVKITELKLTEGSSKLEYSPAPEDKPNVIEKGIKFNNILTNIQTLSINSDTILKNVTLYYSYYGDSWVELKTLGNISTGETTETNNLIDLYGLQTVDYSNINPMSKVSLRSIWNVKLGELNNQEGSLSNMPNDYFNAVWQDIDKLSDIELGSMRMVKDTEGGVFDGATGEIIKATLFNVGAYTDLDMLAYTLTNYTEPLTLGSSRLISELKEELLTSESFNVDNRIKVIDSIYEELPNTSIIKNGFVEREVTGSKYLDYGLYEPIEDGTRYKLIVEGEFKDNIEFISLYNSNPNFNETFIYPSEIINGVAEKEFIAKPSTEDKPRLNTDVRIYIRPYDSTISKVRRVELRKV

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Baseplate wedge subunit
分子量 formula_weight	26611.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,O

MRFKKHVVQHEETMQAIAQRYYGDVSYWIDLVEHNNLKYPYLVETDEEKMKDPERLASTGDTLIIPIESDLTDVSAKEINSRDKDVLVELALGRDLNITADEKYFNEHGTSDNILAFSTNGNGDLDTVKGIDNMKQQLQARLLTPRGSLMLHPNYGSDLHNLFGLNIPEQATLIEMEVLRTLTSDNRVKSANLIDWKIQGNVYSGQFSVEIKSVEESINFVLGQDEEGIFALFE

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Putative baseplate component
分子量 formula_weight	29381.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,N

MPQSDGISNLHRIALRFPKEGGGYDMYRFKVNPENYTIDSPQRTTAIKTKSDIVIEDYGKDIEVINFTGTTGFRPVREADGLKTGKQKMEELQSRVSEYAMQGGSGNVSGSYLQFFNFTDDSYYKVHLAPQGLKITRSKDEPLLFRYEITLVVIGSLTEADRSAVTTEEFGNVKPNASQRVDEGIKELDKNARKTRDRNNQEISRRENTIPKSTGDNTNEGNRLKQSFPSSSIYNPRQSTNGLKGNIDNMALIIGYGDGGVSS

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Major tail sheath protein
分子量 formula_weight	64559.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,T,U,X,Y

MAVEPFPRRPITRPHASIEVDTSGIGGSAGSSEKVFCLIGQAEGGEPNTVYELRNYSQAKRLFRSGELLDAIELAWGSNPNYTAGRILAMRIEDAKPASAEIGGLKITSKIYGNVANNIQVGLEKNTLSDSLRLRVIFQDDRFNEVYDNIGNIFTIKYKGEEANATFSVEHDEETQKASRLVLKVGDQEVKSYDLTGGAYDYTNAIITDINQLPDFEAKLSPFGDKNLESSKLDKIENANIKDKAVYVKAVFGDLEKQTAYNGIVSFEQLNAEGEVPSNVEVEAGEESATVTATSPIKTIEPFELTKLKGGTNGEPPATWADKLDKFAHEGGYYIVPLSSKQSVHAEVASFVKERSDAGEPMRAIVGGGFNESKEQLFGRQASLSNPRVSLVANSGTFVMDDGRKNHVPAYMVAVALGGLASGLEIGESITFKPLRVSSLDQIYESIDLDELNENGIISIEFVRNRTNTFFRIVDDVTTFNDKSDPVKAEMAVGEANDFLVSELKVQLEDQFIGTRTINTSASIIKDFIQSYLGRKKRDNEIQDFPAEDVQVIVEGNEARISMTVYPIRSFKKISVSLVYKQQTLQA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Capsid protein
分子量 formula_weight	15943.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,S,V,W,Z,a

MASEAKQTVHTGNTVLLMIKGKPVGRAQSASGQREYGTTGVYEIGSIMPQEHVYLRYEGTITVERLRMKKENFADLGYASLGEEILKKDIIDILVVDNLTKQVIISYHGCSANNYNETWQTNEIVTEEIEFSYLTASDKART

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Baseplate protein
分子量 formula_weight	21588.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,c,d,e,f,g,t,u,v,w,x,y

MAIATYNSHVELAKYLVSKADSVYLTIGKSTPWSNETNPPQPDENATVLQEVIGYKKATKVTLVRPSKSPEDDNKNLISYGNKSWVEVTPENAKAEGAKWVYLESSIVGDELPLGTYRQVGFVMDLVAKSGISKFNLVPSEVESTGTLLFFDNKQFQNRSEQTTAKERFIVEVDPNSSSVDKLAAALEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Staphylococcus phage 812
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	307898
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	7.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	9705

Cryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the pre-contraction state - complete

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DUF4815 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Receptor binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CBM-cenC domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

NlpC/P60 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

GP-PDE domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Peptidase C51 domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate component

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TmpF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Baseplate wedge subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体