Chromosome partition protein MukB
Photorhabdus thracensis
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 9 DNA 2 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物数一致 | 链 A; UniProt 1–1482 链 B; UniProt 1–1482 | 未记录 | Chromosome partition protein MukF × 2 (A0A0F7LMQ4) Chromosome partition protein MukE × 3 (A0A0F7LPV6) Acyl carrier protein × 2 (P0A6A8) pFB526 × 1 pFB526 × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 NITROGEN | 分辨率 7.80 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9GM9 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7NYW Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA head module 提交 2021-03-23 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7NYX Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (closed conformation) 提交 2021-03-23 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7NYY Cryo-EM structure of the MukBEF monomer 提交 2021-03-23 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 7NYZ Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (partially open conformation) 提交 2021-03-23 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7NZ0 Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA monomer (open conformation) 提交 2021-03-23 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:tetradecameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7NZ2 Cryo-EM structure of the MukBEF-MatP-DNA tetrad 提交 2021-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:44-meric |
链 A1
1–1482(1482 aa)
链 A2
1–1482(1482 aa)
链 A3
1–1482(1482 aa)
链 A4
1–1482(1482 aa)
链 B1
1–1482(1482 aa)
链 B2
1–1482(1482 aa)
链 B3
1–1482(1482 aa)
链 B4
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q | MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.00 Å |
| 7NZ3 Cryo-EM structure of apposed MukBEF-MatP monomers on DNA 提交 2021-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:24-meric |
链 A1
1–1482(1482 aa)
链 A2
1–1482(1482 aa)
链 B1
1–1482(1482 aa)
链 B2
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q | MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.00 Å |
| 7NZ4 Cryo-EM structure of the MukBEF dimer 提交 2021-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric |
链 A1
1–1482(1482 aa)
链 A2
1–1482(1482 aa)
链 B1
1–1482(1482 aa)
链 B2
1–1482(1482 aa)
|
突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q 突变:E1407Q | PNS 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 13.00 Å |
| 9GM6 MukBEF in a nucleotide-bound state with open neck gate (heads core) 提交 2024-08-28 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.70 Å |
| 9GM7 MukBEF in a nucleotide-bound state with open neck gate (monomer) 提交 2024-08-28 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.30 Å |
| 9GM8 MukBEF in a nucleotide-bound state with open neck gate 提交 2024-08-28 | 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.90 Å |
| 9GMA MukBEF in a DNA capture state (dimer) 提交 2024-08-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:hexadecameric |
链 A
1–1482(1482 aa)
链 B
1–1482(1482 aa)
链 O
1–1482(1482 aa)
链 P
1–1482(1482 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 9.10 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | A0A0F7LRY2_9GAMM |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–1482; UniProt 1–1482 作者链 B; PDB构建体 1–1482; UniProt 1–1482 |