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9h2q

Stabilized complex of Chlamydia trachomatic efector CT622 in complex with human WD40 domain of ATG16L1

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 96.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,CHLPN 76 kD protein-like

Chlamydia trachomatis

UniProt A0A0H2X2S1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 361–651 未记录 Autophagy-related protein 16-1 × 1 （Q676U5） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0H2X2S1_CHLTA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 384–674； UniProt 361–651

Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,CHLPN 76 kD protein-like

Chlamydia trachomatis

UniProt P0AEY0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 27–395 未记录 Autophagy-related protein 16-1 × 1 （Q676U5） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 9H2Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1HSJ SARR MBP FUSION STRUCTURE 提交 2000-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–387（361 aa）
链 B 27–387（361 aa）
未记录 GLC alpha-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.304
2V93 EQUILLIBRIUM MIXTURE OF OPEN AND PARTIALLY-CLOSED SPECIES IN THE APO STATE OF MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN BY PARAMAGNETIC RELAXATION ENHANCEMENT NMR 提交 2007-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：YES MXT 1-(1-HYDROXY-2,2,6,6-TETRAMETHYLPIPERIDIN-4-YL)PYRROLIDINE-2,5-DIONE × 2 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0MM NACL；压力 1.0
NMR样品组成 10MM TRIS-HCL
分辨率未提供
3IO4 Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - Crystal C90 提交 2009-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–384（358 aa） 片段：Fusion protein, see remark 999
链 B 27–384（358 aa） 片段：Fusion protein, see remark 999
链 C 27–384（358 aa） 片段：Fusion protein, see remark 999
未记录 ZN ZINC ION × 8 CA CALCIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；12% polyethylene glycol, 200 mM Zn Acetate, 200 mM Sodium Acetate, 100 mM Sodium Cacodylate pH 6.5 to 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.63 Å R-free 0.304
3IO6 Huntingtin amino-terminal region with 17 Gln residues - crystal C92-a 提交 2009-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–384（358 aa） 片段：FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999
链 B 27–384（358 aa） 片段：FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999
链 C 27–384（358 aa） 片段：FUSION PROTEIN, SEE REMARK 999
未记录 ZN ZINC ION × 5 CA CALCIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.70 Å R-free 0.293
3OSQ Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 175 提交 2010-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–199（173 aa） 片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
链 A 200–396（197 aa） 片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；296 K；0.5 M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6, 1.0 M Lithium sulfate monohydrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.90 Å R-free 0.199
3OSR Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 311 提交 2010-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–337（311 aa） 片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
链 A 338–396（59 aa） 片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；296 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
3OSR Maltose-bound maltose sensor engineered by insertion of circularly permuted green fluorescent protein into E. coli maltose binding protein at position 311 提交 2010-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–337（311 aa） 片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
链 B 338–396（59 aa） 片段：GFP P42212 residues 2-146, 147-238, MBP P0AEX9 residues 27-199, 201-396
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；296 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6, 8% w/v polyethylene glycol 4000, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.00 Å R-free 0.226
3VD8 Crystal structure of human AIM2 PYD domain with MBP fusion 提交 2012-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–384（358 aa） 片段：PYD domain (UNP Residues 1-107)
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 K POTASSIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；20% PEG3350, 0.1M Potassium Acetate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.07 Å R-free 0.221
4FEB Crystal Structure of Htt36Q3H-EX1-X1-C2(Beta) 提交 2012-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–384（358 aa）
链 B 27–384（358 aa）
链 C 27–384（358 aa）
突变：HQHQH 突变：HQHQH 突变：HQHQH ZN ZINC ION × 38 NA SODIUM ION × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.5；278 K；PEG12K, Na Acetate, Zn Acetate, Na Cacodylate, pH 6.5, hanging drop, temperature 278K
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
4MY2 Crystal Structure of Norrin in fusion with Maltose Binding Protein 提交 2013-09-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–392（367 aa） 片段：Maltose binding protein (UNP residues 26-392), Norrin (UNP residues 30-133) fusion protein
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；15% PEG 3350, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, 0.2 M ammonium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.40 Å R-free 0.237
4WGI A Single Diastereomer of a Macrolactam Core Binds Specifically to Myeloid Cell Leukemia 1 (MCL1) 提交 2014-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：unp residues 27-392,unp residues 173-291
突变：K194A, K197A, R201A 3M6 (2S)-2-[(2S,3R)-10-{[(4-fluorophenyl)sulfonyl]amino}-3-methyl-2-[(methyl{[4-(trifluoromethyl)phenyl]carbamoyl}amino)methyl]-6-oxo-3,4-dihydro-2H-1,5-benzoxazocin-5(6H)-yl]propanoic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 FMT FORMIC ACID × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；10 MG/ML MBP-MCL1 VCID 9272, 200MM MG FORMATE, 20% PEG3350, 0.5M BRD-0611, 1MM MALTOSE, CRYOPROTECTANT 20% ETHYLENE GLYCOL
分辨率 1.85 Å R-free 0.213
4WRN Crystal structure of the polymerization region of human uromodulin/Tamm-Horsfall protein 提交 2014-10-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–393（367 aa）
链 B 27–393（367 aa）
突变：;I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A,I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A ; 突变：;I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A,I28T, D108A, K109A, E198A, N199A, A241H, K245H, K265A, A338V, I343V, E385A, E388A, D389A, R393N,R586A, R588A ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；Sodium/potassium tartrate, Tris-HCl
分辨率 3.20 Å R-free 0.246
4WTH Ataxin-3 Carboxy Terminal Region - Crystal C2 (triclinic) 提交 2014-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG5000 MME, 0.9 M sodium acetate, 0.06 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate
分辨率 2.25 Å R-free 0.250
4WTH Ataxin-3 Carboxy Terminal Region - Crystal C2 (triclinic) 提交 2014-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa） 片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)
未记录 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；24% PEG5000 MME, 0.9 M sodium acetate, 0.06 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate
分辨率 2.25 Å R-free 0.250
4WVG Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB). 提交 2014-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 33–392（360 aa） 片段：UNP RESIDUES 33-393, UNP RESIDUES 26-191
突变：S36A, R393N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 0.2 M amino acids mix (0.2 M sodium-L-glutamate, 0.2 M DL-alanine, 0.2 M glycine, 0.2 M DL-lysine, 0.2 M DL-serine), 100 mM Tris.Cl pH 8.5
分辨率 2.05 Å R-free 0.242
4WVH Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep1). 提交 2014-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–392（360 aa） 片段：unp residues 33-382, unp reisdues 26-175
突变：K143G, Q78C,K143G, Q78C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；296 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5
分辨率 2.10 Å R-free 0.248
4WVI Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with a substrate peptide (pep2). 提交 2014-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–392（360 aa） 片段：unp residues 33-393, unp residues 26-175
突变：K143G, Q78C, R393N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；290 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.219
4WVJ Crystal structure of the Type-I signal peptidase from Staphylococcus aureus (SpsB) in complex with an inhibitor peptide (pep3). 提交 2014-11-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 33–392（360 aa） 片段：UNP RESIDUES 33-393, unp residues 26-175
突变：K143G, Q78C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；290 K；12 % PEG 8000, 20 % ethylene glycol, 100 mM sodium acetate pH 5.3 - 5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
4XA2 Structure of the Major Type IV pilin of Acinetobacter baumannii 提交 2014-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–393（367 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-Tris, 22.5% PEG 3350, 0.3M 1,6 Hexandediol
分辨率 1.98 Å R-free 0.241
4XA2 Structure of the Major Type IV pilin of Acinetobacter baumannii 提交 2014-12-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–393（367 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-Tris, 22.5% PEG 3350, 0.3M 1,6 Hexandediol
分辨率 1.98 Å R-free 0.241
4XAI Crystal Structure of red flour beetle NR2E1/TLX 提交 2014-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa） 片段：maltose binding protein fused ligand binding domain,maltose binding protein fused ligand binding domain
链 B 27–392（366 aa） 片段：maltose binding protein fused ligand binding domain,maltose binding protein fused ligand binding domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；298 K；PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.262
4XAJ Crystal structure of human NR2E1/TLX 提交 2014-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 26–392（367 aa） 片段：maltose binding protein fused ligand binding domain
链 C 26–392（367 aa） 片段：maltose binding protein fused ligand binding domain
突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V 突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；PEG3350
分辨率 3.55 Å R-free 0.314
4XAJ Crystal structure of human NR2E1/TLX 提交 2014-12-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 26–392（367 aa） 片段：maltose binding protein fused ligand binding domain
链 D 26–392（367 aa） 片段：maltose binding protein fused ligand binding domain
突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V 突变：K257R, N259T, K260L, C338V,K257R, N259T, K260L, C338V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；PEG3350
分辨率 3.55 Å R-free 0.314
4XHS Crystal structure of human NLRP12 PYD domain and implication in homotypic interaction 提交 2015-01-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP P59046 residues 10-106
链 B 27–392（366 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP P59046 residues 10-106
未记录 FMT FORMIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；3.5 M Sodium Formate, 0.1 M Sodium Acetate pH 4.6
分辨率 1.70 Å R-free 0.190
4YS9 Ataxin-3 Carboxy-Terminal Region - Crystal C1 (tetragonal) 提交 2015-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa） 片段：MBP residues 27-392 (UNP) + Ataxin-3 C-terminal region (UNP residues 278-324)
未记录 ZN ZINC ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；278 K；25% PEG5000 MME, 1.0 M sodium acetate, 0.1 M imidazole, pH 8.0, 0.1 M zinc acetate
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
5BJZ Crystal structure of maltose binding protein in complex with an allosteric synthetic antibody 提交 2017-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 26–393（368 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；283 K；0.1 M HEPES: pH 7.0 and 15% PEG4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
5BJZ Crystal structure of maltose binding protein in complex with an allosteric synthetic antibody 提交 2017-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 26–393（368 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；283 K；0.1 M HEPES: pH 7.0 and 15% PEG4000
分辨率 1.95 Å R-free 0.229
5BMY Crystal structure of hPin1 WW domain (5-21) fused with maltose-binding protein 提交 2015-05-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–393（367 aa）
突变：R393N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；2.1 M DL-malic acid
分辨率 2.00 Å R-free 0.194
5C7R Revealing surface waters on an antifreeze protein by fusion protein crystallography 提交 2015-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–384（358 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-384, UNP P19614 residues 1-63
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.75 M (NH4)2SO4, 100 mM NaOAC (pH 4.4)
分辨率 1.94 Å R-free 0.234
5C7R Revealing surface waters on an antifreeze protein by fusion protein crystallography 提交 2015-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–384（358 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-384, UNP P19614 residues 1-63
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.75 M (NH4)2SO4, 100 mM NaOAC (pH 4.4)
分辨率 1.94 Å R-free 0.234
5CL1 Complex structure of Norrin with human Frizzled 4 提交 2015-07-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 26–392（367 aa） 片段：UNP Q00604 residues 31-133
链 B 26–392（367 aa） 片段：UNP Q00604 residues 31-133
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；200 mM ammonium sulfate, 100 mM sodium cacodylate trihydrate (pH 6.5), 15% w/v polyethylene glycol 8,000
分辨率 3.80 Å R-free 0.310
5DFM Structure of Tetrahymena telomerase p19 fused to MBP 提交 2015-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–384（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；12 mg/ml MBP-P19 protein, 0.1 M Sodium Acetate, 2.0 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5DFM Structure of Tetrahymena telomerase p19 fused to MBP 提交 2015-08-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–384（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；12 mg/ml MBP-P19 protein, 0.1 M Sodium Acetate, 2.0 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5DFM Structure of Tetrahymena telomerase p19 fused to MBP 提交 2015-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 27–384（358 aa）
链 B 27–384（358 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 45 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；12 mg/ml MBP-P19 protein, 0.1 M Sodium Acetate, 2.0 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
5E24 Structure of the Su(H)-Hairless-DNA Repressor Complex 提交 2015-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 73 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；277 K；Tris, PEG3350, (NH4)2SO4
分辨率 2.14 Å R-free 0.193
5E24 Structure of the Su(H)-Hairless-DNA Repressor Complex 提交 2015-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 C 27–396（370 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 40 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；277 K；Tris, PEG3350, (NH4)2SO4
分辨率 2.14 Å R-free 0.193
5E24 Structure of the Su(H)-Hairless-DNA Repressor Complex 提交 2015-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 27–396（370 aa）
链 C 27–396（370 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R 突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, N367R EDO 1,2-ETHANEDIOL × 113 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 8；277 K；Tris, PEG3350, (NH4)2SO4
分辨率 2.14 Å R-free 0.193
5E7U MBP-MamC loop structure, a magnetite biomineralizing protein from Magnetospirillium magneticum AMB-1 提交 2015-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–389（363 aa）
链 A 390–392（3 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M sodium acetate , 2 M Ammonium sulfate
分辨率 2.80 Å R-free 0.307
5EDU Crystal structure of human histone deacetylase 6 catalytic domain 2 in complex with trichostatin A 提交 2015-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa） 片段：MBP + HD6 catalytic domain 2 (UNP residues 479-835)
未记录 TSN TRICHOSTATIN A × 1 ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate, 20% PEG3350
分辨率 2.79 Å R-free 0.275
5EDU Crystal structure of human histone deacetylase 6 catalytic domain 2 in complex with trichostatin A 提交 2015-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：MBP + HD6 catalytic domain 2 (UNP residues 479-835)
未记录 TSN TRICHOSTATIN A × 1 ZN ZINC ION × 1 K POTASSIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M potassium sodium tartrate, 20% PEG3350
分辨率 2.79 Å R-free 0.275
5FIO DARPins as a new tool for experimental phasing in protein crystallography 提交 2015-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 29–392（364 aa） 片段：UNP RESIDUES 29-392
未记录 HG MERCURY (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；30.55% W/V PEG 6000, 0.1M TRIS-CL, PH 8.0
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
5GPP Crystal structure of zebrafish ASC PYD domain 提交 2016-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–384（358 aa） 片段：UNP residues 27-384,UNP residues 3-88
突变：D83A,K84A,E173A,N174A,K240A SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；20% PEG2000MME, 0.1 M NaAcO
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
5GPP Crystal structure of zebrafish ASC PYD domain 提交 2016-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–384（358 aa） 片段：UNP residues 27-384,UNP residues 3-88
突变：D83A,K84A,E173A,N174A,K240A SO4 SULFATE ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；20% PEG2000MME, 0.1 M NaAcO
分辨率 2.00 Å R-free 0.252
5GPQ Crystal Structure of zebrafish ASC CARD Domain 提交 2016-08-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–384（358 aa） 片段：UNP residues 27-384,UNP residues 119-201
突变：D83A,K84A,E173A,N174A,K240A CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.0 M Ammonium Citrate, 0.1 M HEPES
分辨率 2.10 Å R-free 0.199
5II4 Crystal structure of red abalone VERL repeat 1 with linker at 2.0 A resolution 提交 2016-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–393（367 aa）
突变：N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q,N4115Q, N4122T, N4142Y, N4171Q PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；293 K；40% PEG 600, 0.1M CHES
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
5JJ4 Crystal Structure of a Variant Human Activation-induced Deoxycytidine Deaminase as an MBP fusion protein 提交 2016-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 27–393（367 aa） 片段：unp residues 27-384, unp residues 3-183
未记录 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM MES pH 6.5, 200mM Calcium Acetate, 15%PEG8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.232
5JJ4 Crystal Structure of a Variant Human Activation-induced Deoxycytidine Deaminase as an MBP fusion protein 提交 2016-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–393（367 aa） 片段：unp residues 27-384, unp residues 3-183
未记录 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM MES pH 6.5, 200mM Calcium Acetate, 15%PEG8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.232
5JJ4 Crystal Structure of a Variant Human Activation-induced Deoxycytidine Deaminase as an MBP fusion protein 提交 2016-04-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–393（367 aa） 片段：unp residues 27-384, unp residues 3-183
未记录 ZN ZINC ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100mM MES pH 6.5, 200mM Calcium Acetate, 15%PEG8000
分辨率 2.81 Å R-free 0.232
5JON Crystal structure of the unliganded form of HCN2 CNBD 提交 2016-05-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；34-36% dimethyl PEG 500, 240 mM potassium nitrate, 20 mM magnesium chloride, 100 mM BIS-TRIS, pH 6.0
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
5JON Crystal structure of the unliganded form of HCN2 CNBD 提交 2016-05-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa）
未记录 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；34-36% dimethyl PEG 500, 240 mM potassium nitrate, 20 mM magnesium chloride, 100 mM BIS-TRIS, pH 6.0
分辨率 2.04 Å R-free 0.221
5JTQ The structure of chaperone SecB in complex with unstructured MBP binding site d 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 108–149（42 aa） 片段：residues 108-149
链 F 108–149（42 aa） 片段：residues 108-149
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Maltose Binding Protein (MBP) binding site d, 150 mM potassium chloride, 50 mM potassium phosphate, 50 mM sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5JTR The structure of chaperone SecB in complex with unstructured MBP binding site e 提交 2016-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 168–207（40 aa） 片段：residues 168-207
链 F 168–207（40 aa） 片段：residues 168-207
链 G 168–207（40 aa） 片段：residues 168-207
链 H 168–207（40 aa） 片段：residues 168-207
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；301 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1
NMR样品组成 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Chaperone SecB, 300 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] E.coli Maltose Binding Protein (MBP) binding site e, 150 mM potassium chloride, 50 mM sodium phosphate, 50 mM potassium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
5K94 Deletion-Insertion Chimera of MBP with the Preprotein Cross-Linking Domain of the SecA ATPase 提交 2016-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–197（171 aa）
链 A 202–396（195 aa）
未记录 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PCB buffer (Qiagen; sodium propionate, sodium cacodylate, bis-tris propane), pH 7.0; 19.5 % PEG 1500; 10% glycerol; 28 mg/mL protein concentration
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
5K94 Deletion-Insertion Chimera of MBP with the Preprotein Cross-Linking Domain of the SecA ATPase 提交 2016-05-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–197（171 aa）
链 B 202–396（195 aa）
未记录 B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；50 mM PCB buffer (Qiagen; sodium propionate, sodium cacodylate, bis-tris propane), pH 7.0; 19.5 % PEG 1500; 10% glycerol; 28 mg/mL protein concentration
分辨率 2.10 Å R-free 0.230
5LDF Maltose binding protein genetically fused to dodecameric glutamine synthetase 提交 2016-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 M 27–396（370 aa）
链 N 27–396（370 aa）
链 O 27–396（370 aa）
链 P 27–396（370 aa）
链 Q 27–396（370 aa）
链 R 27–396（370 aa）
链 S 27–396（370 aa）
链 T 27–396（370 aa）
链 U 27–396（370 aa）
链 V 27–396（370 aa）
链 W 27–396（370 aa）
链 X 27–396（370 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 29–392（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0
分辨率 3.10 Å R-free 0.306
5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 29–392（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0
分辨率 3.10 Å R-free 0.306
5LEL Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_10_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 H 29–392（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；PEG3350 23.2% w/v, Sodium acetate 0.2 M, Bis-Tris propane 0.1 M, pH 8.0
分辨率 3.10 Å R-free 0.306
5LEM Crystal structure of DARPin-DARPin rigid fusion, variant DD_Off7_11_3G124 in complex with Maltose-binding Protein and Green Fluorescent Protein 提交 2016-06-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 29–392（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；293 K；PEG6000 20% w/v, TAPS 0.02 M, pH 9.0
分辨率 2.98 Å R-free 0.295
5LOF Crystal structure of the MBP-MCL1 complex with highly selective and potent inhibitor of MCL1 提交 2016-08-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：K194A, K197A, R201A,K194A, K197A, R201A 70R (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(5-fluoranylfuran-2-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-[[2-[2,2,2-tris(fluoranyl)ethyl]pyrazol-3-yl]methoxy]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；284 K；25% PEG3350, 0.2M Magnesium Formate, 1mM Maltose
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
5T03 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and glucuronic acid containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM di-sodium tartrate, 18-19% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.212
5T03 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and glucuronic acid containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM di-sodium tartrate, 18-19% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.212
5T05 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and IdoA2S containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 5 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM disodium tartrate, 18-19% PEG 3350, 1mM PAP, 5mM maltose, 10mM oligosaccharide ligand
分辨率 1.95 Å R-free 0.212
5T05 Crystal structure of heparan sulfate 6-O-sulfotransferase with bound PAP and IdoA2S containing hexasaccharide substrate 提交 2016-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100mM Tris pH 7.5, 200mM disodium tartrate, 18-19% PEG 3350, 1mM PAP, 5mM maltose, 10mM oligosaccharide ligand
分辨率 1.95 Å R-free 0.212
5T0A Crystal Structure of Heparan Sulfate 6-O-Sulfotransferase with bound PAP and heptasaccharide substrate 提交 2016-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A NPO P-NITROPHENOL × 1 A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 11 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25mM Tris pH 7.5 200mM disodium tartrate 18-19% PEG3350 1mM PAP 10mM oligosaccharide 5mM maltose
分辨率 1.95 Å R-free 0.213
5T0A Crystal Structure of Heparan Sulfate 6-O-Sulfotransferase with bound PAP and heptasaccharide substrate 提交 2016-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa）
突变：D82A, K83A, E172A, N173A, K239A, E359A, K362A, D363A NPO P-NITROPHENOL × 1 A3P ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 TLA L(+)-TARTARIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；25mM Tris pH 7.5 200mM disodium tartrate 18-19% PEG3350 1mM PAP 10mM oligosaccharide 5mM maltose
分辨率 1.95 Å R-free 0.213
5TTD Minor pilin FctB from S. pyogenes with engineered intramolecular isopeptide bond 提交 2016-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 33–392（360 aa） 片段：UNP residues 33-392,UNP residues 26-148
未记录 FMT FORMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；12.5% PEG 1000, 10% PEG 3350, 12.5% MPD, 0.1M MES/imidazole pH 6.5, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5TTD Minor pilin FctB from S. pyogenes with engineered intramolecular isopeptide bond 提交 2016-11-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 33–392（360 aa） 片段：UNP residues 33-392,UNP residues 26-148
未记录 FMT FORMIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；12.5% PEG 1000, 10% PEG 3350, 12.5% MPD, 0.1M MES/imidazole pH 6.5, 0.02 M sodium formate, 0.02 M ammonium acetate, 0.02 M trisodium citrate, 0.02 M sodium potassium L-tartrate, 0.02 M sodium oxamate
分辨率 2.00 Å R-free 0.230
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5V6Y Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer with bound high-affinity and altered selectivity adrenomedullin variant 提交 2017-03-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；15% PEG3350, 0.1 M Sodium Malonate pH 6.0, 50 mM Potassium/Sodium tartrate, 1% Cadaverine
分辨率 2.80 Å R-free 0.244
5W0R Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with cacodylic acid 提交 2017-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP Q9GZX7 residues 13-181
未记录 ZN ZINC ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.05 M sodium cacodylate at pH 5.5, 20 mM MgCl2, 10 mM CaCl2, 10 mM spermidine, 5% PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
5W0R Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with cacodylic acid 提交 2017-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-392, UNP Q9GZX7 residues 13-181
未记录 ZN ZINC ION × 1 CAC CACODYLATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；289 K；0.05 M sodium cacodylate at pH 5.5, 20 mM MgCl2, 10 mM CaCl2, 10 mM spermidine, 5% PEG3350
分辨率 2.40 Å R-free 0.239
5W0U Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with dCMP 提交 2017-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 27–392（366 aa） 片段：UNP residues 27-392,UNP residues 13-181
未记录 ZN ZINC ION × 1 DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.1 M MES at pH 6.2, 3%PEG3350, 10 mM CaCl2, 20mM dCMP
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
5W0U Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with dCMP 提交 2017-05-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：UNP residues 27-392,UNP residues 13-181
未记录 ZN ZINC ION × 1 DCM 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.1 M MES at pH 6.2, 3%PEG3350, 10 mM CaCl2, 20mM dCMP
分辨率 2.90 Å R-free 0.281
5W0Z Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) 提交 2017-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-392,UNP Q9GZX7 residues 13-181
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.26 M NaCl, 0.1 M MES pH 6.0, 12% PEG3350
分辨率 3.61 Å R-free 0.307
5W0Z Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) 提交 2017-06-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa） 片段：UNP P0AEY0 residues 27-392,UNP Q9GZX7 residues 13-181
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.26 M NaCl, 0.1 M MES pH 6.0, 12% PEG3350
分辨率 3.61 Å R-free 0.307
5W1C Crystal structure of MBP fused activation-induced cytidine deaminase (AID) in complex with cytidine 提交 2017-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa）
链 B 27–392（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CTN 4-AMINO-1-BETA-D-RIBOFURANOSYL-2(1H)-PYRIMIDINONE × 2 CA CALCIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；289 K；0.1 M MES at pH 6.2, 3% PEG3350, 10 mM CaCl2 and 20mM Cytidine
分辨率 3.18 Å R-free 0.270
5ZD4 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 in complex with double-stranded DNA 提交 2018-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 27–392（366 aa）
链 D 27–392（366 aa）
突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A 突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM sodium cacodylate (pH 6.5), 200mM potassium chloride, 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000
分辨率 2.17 Å R-free 0.244
5ZD4 Crystal structure of MBP-fused BIL1/BZR1 in complex with double-stranded DNA 提交 2018-02-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa）
链 B 27–392（366 aa）
突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A 突变：D108A,K109A,E198A,N199A,K265A,E385A,K388A,D389A EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50mM sodium cacodylate (pH 6.5), 200mM potassium chloride, 10% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000
分辨率 2.17 Å R-free 0.244
6AEO TssL periplasmic domain 提交 2018-08-06 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG MME 2000, KSCN
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
6AEO TssL periplasmic domain 提交 2018-08-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–392（366 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG MME 2000, KSCN
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
6ANV Crystal structure of anti-CRISPR protein AcrF1 提交 2017-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–396（370 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.2；293 K；0.1 M MES (pH 6.2), 2.5% PEG 3000 (v/v), and 42% PEG400 (v/v)
分辨率 2.27 Å R-free 0.223
6ANV Crystal structure of anti-CRISPR protein AcrF1 提交 2017-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–396（370 aa）
未记录 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.2；293 K；0.1 M MES (pH 6.2), 2.5% PEG 3000 (v/v), and 42% PEG400 (v/v)
分辨率 2.27 Å R-free 0.223
6BUZ Cryo-EM structure of CENP-A nucleosome in complex with kinetochore protein CENP-N 提交 2017-12-11 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 N 26–394（369 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
6D1U Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer in complex with adrenomedullin 2/intermedin 提交 2018-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 26–392（367 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% v/v PEG 3,350 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5 0.15 M DL-malic acid
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6D1U Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer in complex with adrenomedullin 2/intermedin 提交 2018-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% v/v PEG 3,350 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5 0.15 M DL-malic acid
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6D1U Crystal structure of the human CLR:RAMP1 extracellular domain heterodimer in complex with adrenomedullin 2/intermedin 提交 2018-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 26–392（367 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；13% v/v PEG 3,350 0.1 M Na cacodylate, pH 6.5 0.15 M DL-malic acid
分辨率 2.05 Å R-free 0.223
6DD5 Crystal Structure of the Cas6 Domain of Marinomonas mediterranea MMB-1 Cas6-RT-Cas1 Fusion Protein 提交 2018-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–384（358 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；295 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.5 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.85 Å R-free 0.225
6DD5 Crystal Structure of the Cas6 Domain of Marinomonas mediterranea MMB-1 Cas6-RT-Cas1 Fusion Protein 提交 2018-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–384（358 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；295 K；0.1 M Sodium Acetate, 2.5 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.85 Å R-free 0.225
6DKS Structure of the Rbpj-SHARP-DNA Repressor Complex 提交 2018-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 D 28–392（365 aa） 片段：residues 28-392
链 H 28–392（365 aa） 片段：residues 28-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.6；277 K；Bis-Tris pH6.6 100mM NaCl 40% PEG400 200mM NDSB-256
分辨率 2.78 Å R-free 0.228
6DKS Structure of the Rbpj-SHARP-DNA Repressor Complex 提交 2018-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 D 28–392（365 aa） 片段：residues 28-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.6；277 K；Bis-Tris pH6.6 100mM NaCl 40% PEG400 200mM NDSB-256
分辨率 2.78 Å R-free 0.228
6DKS Structure of the Rbpj-SHARP-DNA Repressor Complex 提交 2018-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 H 28–392（365 aa） 片段：residues 28-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.6；277 K；Bis-Tris pH6.6 100mM NaCl 40% PEG400 200mM NDSB-256
分辨率 2.78 Å R-free 0.228
6EG2 Crystal structure of human BRM in complex with compound 16 提交 2018-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 J7J N-(5-amino-2-chloropyridin-4-yl)-N'-(4-bromo-3-{[3-(hydroxymethyl)phenyl]ethynyl}-1,2-thiazol-5-yl)urea × 2 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；100mM Hepes pH7.5, 200mM sodium chloride, 8% isopropanol
分辨率 2.98 Å R-free 0.304
6EG3 Crystal structure of human BRM in complex with compound 15 提交 2018-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 J7G 3-[(4-{[(2-chloropyridin-4-yl)carbamoyl]amino}pyridin-2-yl)ethynyl]benzoic acid × 1 EOH ETHANOL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；100mM Tris pH7, 14% Ethanol
分辨率 2.84 Å R-free 0.267
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–195（169 aa）
链 A 207–392（186 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate
分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 27–195（169 aa）
链 B 207–392（186 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate
分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 27–195（169 aa）
链 D 207–392（186 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate
分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6EQZ A MamC-MIC insertion in MBP scaffold at position K170 提交 2017-10-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 27–195（169 aa）
链 G 207–392（186 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；1,86 M Tris-Ammonium citrate
分辨率 2.29 Å R-free 0.274
6N84 MBP-fusion protein of transducin-alpha residues 327-350 提交 2018-11-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：D83A, K84A, E173A, N174A, A216H, K220H, K240A SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；291 K；2 M Ammonium Sulphate, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6
分辨率 1.75 Å R-free 0.185
6N85 Resistance to inhibitors of cholinesterase 8A (Ric8A) protein in complex with MBP-tagged transducin-alpha residues 327-350 提交 2018-11-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 M 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；0.1 M MIB buffer, 25 % PEG3350pH 8.0
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
6QGD Structure of human Mcl-1 in complex with thienopyrimidine inhibitor 提交 2019-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 J1N 2-[(6-ethyl-5-phenyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]-3-oxidanyl-propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
6QXJ Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 6a 提交 2019-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：K194A, K197A, R201A,K194A, K197A, R201A JKQ (2~{R})-2-[[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-5-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；279 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE,1MM MALTOSE
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6QYK Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 7a 提交 2019-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 JLB (2~{R})-2-[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-5-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxypropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE
分辨率 2.30 Å R-free 0.266
6QYL Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 8a 提交 2019-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 JLE (2~{R})-2-[[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-4-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]-3-phenyl-propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE
分辨率 2.20 Å R-free 0.235
6QYN Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 10d 提交 2019-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 JL8 (2~{R})-2-[5-(3-chloranyl-2-methyl-4-oxidanyl-phenyl)-6-ethyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-phenyl-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE
分辨率 2.50 Å R-free 0.251
6QYO Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 18a 提交 2019-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 JLH (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-ethyl-thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-phenyl-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE
分辨率 2.10 Å R-free 0.221
6QZ7 Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 8b 提交 2019-03-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 JLE (2~{R})-2-[[6-ethyl-5-(1~{H}-indol-4-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]amino]-3-phenyl-propanoic acid × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；284 K；25% PEG3350, 0.2M MAGNESIUM FORMATE, 1MM MALTOSE
分辨率 2.20 Å R-free 0.211
6YBJ Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 3e 提交 2020-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：K194A,K197A,R201A CL CHLORIDE ION × 1 OJW (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(5-fluoranylfuran-2-yl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-[(2-methylpyrazol-3-yl)methoxy]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris buffer pH 6.5, 20% PegMME5K
分辨率 2.50 Å R-free 0.237
6YBK Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 4d 提交 2020-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：K194A,K197A,R201A CL CHLORIDE ION × 1 OK2 (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(4-fluorophenyl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-(pyrazin-2-ylmethoxy)phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；0.1M BisTris buffer pH 6.5, 20% PegMME5K
分辨率 2.00 Å R-free 0.235
6YBL Structure of MBP-Mcl-1 in complex with compound 9m 提交 2020-03-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：K194A,K197A,R201A OK5 (2~{R})-2-[5-[3-chloranyl-2-methyl-4-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)ethoxy]phenyl]-6-(4-fluorophenyl)thieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl]oxy-3-[2-[[2-(2-methoxyphenyl)pyrimidin-4-yl]methoxy]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1M BisTris buffer pH 6.5, 20% PegMME5K
分辨率 2.10 Å R-free 0.228
7ZNJ Structure of an ALYREF-exon junction complex hexamer 提交 2022-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：30-meric
链 D 23–392（370 aa）
链 I 23–392（370 aa）
链 N 23–392（370 aa）
链 d 23–392（370 aa）
链 i 23–392（370 aa）
链 n 23–392（370 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8C8F Crystal structure of the E. coli maltodextrin-binding protein 提交 2023-01-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–396（396 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；0.1 M Tris pH 7.4, 30 % PEG Smear Broad, 0.1 M NaBr and 0.1 M KSCN
分辨率 1.15 Å R-free 0.152
8ETB the crystal structure of a rationally designed zinc sensor based on maltose binding protein - Zn binding conformation 提交 2022-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M MgCl2 , 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 25% PEG 3350.
分辨率 1.63 Å R-free 0.234
8F23 The crystal structure of a rationally designed zinc sensor based on maltose binding protein - Apo conformation 提交 2022-11-06 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；0.2M sodium formate, pH 7.0, 20% PEG 3350
分辨率 1.93 Å R-free 0.229
8GCR HPV16 E6-E6AP-p53 complex 提交 2023-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 27–396（370 aa）
突变：C87S,C104S,C118S,C147S ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8H68 Crystal structure of Caenorhabditis elegans NMAD-1 in complex with NOG and Mg(II) 提交 2022-10-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 GLY GLYCINE × 1 OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 10% (w/v) PEG 6000, 10% (v/v) MPD
分辨率 2.20 Å R-free 0.242
8SOJ Cryo-EM structure of human CST bound to POT1(ESDL)/TPP1 in the absence of telomeric ssDNA 提交 2023-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SOK Cryo-EM structure of human CST bound to POT1(ESDL)/TPP1 in the presence of telomeric ssDNA 提交 2023-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：hexameric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8SVY MBP-Mcl1 in complex with ligand 10 提交 2023-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 WUC (15P)-17-chloro-33-fluoro-12-[(2-methoxyethoxy)methyl]-5,14,22-trimethyl-28-oxa-9-thia-5,6,13,14,22-pentaazaheptacyclo[27.7.1.1~4,7~.0~11,15~.0~16,21~.0~20,24~.0~30,35~]octatriaconta-1(36),4(38),6,11(15),12,16,18,20,23,29(37),30,32,34-tridecaene-23-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；285 K；19% (w/v) PEG3350, 0.17M Mg formate
分辨率 1.47 Å R-free 0.206
8T2I Negative stain EM assembly of MYC, JAZ, and NINJA complex 提交 2023-06-06 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 M 27–392（366 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
分辨率 10.40 Å
8W23 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, TDI-2804 (consensus map). 提交 2024-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 28–392（365 aa）
链 B 28–392（365 aa）
链 C 28–392（365 aa）
链 D 28–392（365 aa）
链 E 28–392（365 aa）
链 F 28–392（365 aa）
链 G 28–392（365 aa）
链 H 28–392（365 aa）
链 I 28–392（365 aa）
链 K 28–392（365 aa）
链 L 28–392（365 aa）
链 M 28–392（365 aa）
链 N 28–392（365 aa）
链 O 28–392（365 aa）
链 P 28–392（365 aa）
链 Q 28–392（365 aa）
链 R 28–392（365 aa）
链 S 28–392（365 aa）
链 T 28–392（365 aa）
链 U 28–392（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 20 A1AE4 N-{2-[4-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl]-4-oxo-1,4-dihydroquinazolin-7-yl}-4-methoxy-6-phenylpyridine-3-carboxamide × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.28 Å
8W25 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, TDI-2804 (focused refinement map). 提交 2024-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 28–392（365 aa）
链 Q 28–392（365 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 A1AE4 N-{2-[4-(2-hydroxypropan-2-yl)phenyl]-4-oxo-1,4-dihydroquinazolin-7-yl}-4-methoxy-6-phenylpyridine-3-carboxamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8W27 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, XAV (consensus map). 提交 2024-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric
链 A 28–392（365 aa）
链 B 28–392（365 aa）
链 C 28–392（365 aa）
链 D 28–392（365 aa）
链 E 28–392（365 aa）
链 F 28–392（365 aa）
链 G 28–392（365 aa）
链 H 28–392（365 aa）
链 I 28–392（365 aa）
链 J 28–392（365 aa）
链 L 28–392（365 aa）
链 M 28–392（365 aa）
链 N 28–392（365 aa）
链 O 28–392（365 aa）
链 P 28–392（365 aa）
链 Q 28–392（365 aa）
链 R 28–392（365 aa）
链 S 28–392（365 aa）
链 T 28–392（365 aa）
链 U 28–392（365 aa）
未记录 XAV 2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-7,8-dihydro-5H-thiopyrano[4,3-d]pyrimidin-4-ol × 20 ZN ZINC ION × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.21 Å
8W28 Cryo-EM structure of human tankyrase 2 SAM-PARP filament bound to compound, XAV (focused refinement map). 提交 2024-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 28–392（365 aa）
链 Q 28–392（365 aa）
未记录 XAV 2-[4-(trifluoromethyl)phenyl]-7,8-dihydro-5H-thiopyrano[4,3-d]pyrimidin-4-ol × 2 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Sample was purified and concentrated in the above buffer but exchanged prior to vitrification to a low-salt (minimal) buffer composed of 20 millimolar HEPES pH 7.5. Sample buffer was exchanged on grid via manual side-blotting.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
8Y20 Crystal structure of the Mcl-1 in complex with A-1210477 提交 2024-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：E173A,N174A,K240A,K391A,K394A,R398A A1LXV A-1210477 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；25% PEG 3350, 0.2M Magnesium Formate, 1mM Maltose
分辨率 2.23 Å R-free 0.243
9GIV Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier inhibited by a UK5099-derivative 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 33–392（360 aa）
未记录 A1IL4 (2E)-2-cyano-3-[(5M)-5-(2-nitrophenyl)furan-2-yl]prop-2-enoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9GIW Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier inhibited by zaprinast 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 33–392（360 aa）
未记录 A1IL3 5-(2-propoxyphenyl)-3,4-dihydro-[1,2,3]triazolo[4,5-d]pyrimidin-7-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
9GIX Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier in the apo-state 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 33–392（360 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9GIY Structure of the human mitochondrial pyruvate carrier inhibited by mitoglitazone 提交 2024-08-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 33–392（360 aa）
未记录 LO7 Mitoglitazone × 1 A1IMZ Mitoglitazone (R-form) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
9I3P CryoEM structure of the Themis:Grb2 complex with bound ProMacrobody 256 提交 2025-01-23 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 33–392（360 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris pH8, 100 mM NaCl, 2 mM DTT with added 8 mM CHAPSO for cryogrid sample preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2, 5 s blotting time
分辨率 3.30 Å
9IAZ CryoEM structure of the Themis:Grb2 complex with bound ProMacrobody 256, local refinement 提交 2025-02-11 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 33–392（360 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；25 mM Tris pH8, 100 mM NaCl, 2 mM DTT with added 8 mM CHAPSO for cryogrid sample preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Leica EM GP2, 5 s blotting time
分辨率 3.20 Å
9MAN Structure of Norrin in complex with human Tspan12 large extracellular loop (Tspan12 LEL) 提交 2025-03-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 26–392（367 aa）
链 B 26–392（367 aa）
链 C 26–392（367 aa）
链 D 26–392（367 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9ME8 Co-crystal structure of maltose binding protein (MBP)-human SENP3 fusion protein in complex with PELP1 peptide 提交 2024-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 27–384（358 aa）
突变：C532S NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.085M HEPES pH 7.5, 17-20% (v/v) PEG8000
分辨率 2.93 Å R-free 0.232
9P0X Nanodisc-embedded human TF/FVIIa/XK1 in complex with 10H10 Fab (nanodisc-subtracted) 提交 2025-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 T 27–392（366 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 12 BGC beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9QBJ Legobody dimer 提交 2025-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 I 27–384（358 aa）
链 J 27–384（358 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9UYY Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with L-Trp 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 TRP TRYPTOPHAN × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.25 Å R-free 0.300
9UYZ Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with 5-HT 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 SRO SEROTONIN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.45 Å R-free 0.264
9UZ0 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) as resting state 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CIT CITRIC ACID × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.45 Å R-free 0.248
9UZ1 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) H143Y mutant complexed with L-Trp 提交 2025-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
突变：H143Y TRP TRYPTOPHAN × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.35 Å R-free 0.236
9UZ2 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with Cyanide ion 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.55 Å R-free 0.238
9UZ3 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with D-Trp 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 DTR D-TRYPTOPHAN × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.275
9UZ4 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with 5-methoxy-L-Trp 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 A1A2Y 5-methoxy-L-tryptophan × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.280
9UZ5 Crystal structure of the indoleamine 2,3-dioxygenagse 2 (IDO2) complexed with 5-methyl-L-Trp 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 27–392（366 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 CYN CYANIDE ION × 1 D0Q 5-methyl-L-tryptophan × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；PEG 3350, Sodium citrate tribasic dihydrate
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
9VFI Structure of hTRPC3 solubilized with 4F peptide at 2.72 angstrom 提交 2025-06-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 27–392（366 aa）
链 B 27–392（366 aa）
链 C 27–392（366 aa）
链 D 27–392（366 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 4 A1L5I [(2~{S})-2-[(~{E})-octadec-9-enoyl]oxy-3-oxidanyl-propyl] octadec-9-enoate × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
9W3K GPR151-Legobody complex 提交 2025-07-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 27–394（368 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å

共 109 个其他 PDB 条目、148 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALE_ECO57
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 7–375； UniProt 27–395

Autophagy-related protein 16-1

Homo sapiens

UniProt Q676U5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 303–607 未记录 Maltose/maltodextrin-binding periplasmic protein,CHLPN 76 kD protein-like × 1 （P0AEY0,A0A0H2X2S1） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 3.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9H2Q Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4GDK Crystal Structure of Human Atg12~Atg5 Conjugate in Complex with an N-terminal Fragment of Atg16L1 提交 2012-07-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 11–43（33 aa）
链 F 11–43（33 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN: 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.3 M NaCl, 0.001 M DTT; RESERVOIR: 0.1M Hepes pH7.5, 0.2 M lithium citrate, 20% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.236
4GDL Crystal Structure of Human Atg12~Atg5 Conjugate in Complex with an N-terminal Fragment of Atg16L1 提交 2012-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 11–43（33 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PROTEIN: 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.3 M NaCl, 0.001 M DTT; RESERVOIR: 0.1M BICINE pH9.0, 0.2 M sodium phosphate dibasic, 18% PEG 3350, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.88 Å R-free 0.254
4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 11–43（33 aa） 片段：UNP residues 11-43
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
分辨率 2.19 Å R-free 0.215
4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 11–43（33 aa） 片段：UNP residues 11-43
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
分辨率 2.19 Å R-free 0.215
4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 K 11–43（33 aa） 片段：UNP residues 11-43
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
分辨率 2.19 Å R-free 0.215
4NAW Crystal Structure of Human ATG12~ATG5-ATG16N in complex with a fragment of ATG3 提交 2013-10-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 O 11–43（33 aa） 片段：UNP residues 11-43
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PROTEIN - 10 MG/ML in 0.01M HEPES pH 7.0, 0.15 M NaCl, 0.001 M DTT, RESERVOIR - 0.1M MES pH6.0-6.75, 0.2 M ammonium sulfate, 10-16% PEG 5000 MME, vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K
分辨率 2.19 Å R-free 0.215
4TQ0 Crystal structure of human ATG5-ATG16N69 提交 2014-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, MgCl2, KCl, Tris-HCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
4TQ0 Crystal structure of human ATG5-ATG16N69 提交 2014-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, MgCl2, KCl, Tris-HCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
4TQ0 Crystal structure of human ATG5-ATG16N69 提交 2014-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 400, MgCl2, KCl, Tris-HCl
分辨率 2.70 Å R-free 0.274
5D7G Structure of human ATG5 E122D-ATG16L1 complex at 3.0 Angstroms 提交 2015-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
链 D 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；Micro crystal: 37.5 mM MES, pH 5.2 to pH 5.8, 0.2 M sodium tartrate, and 11 to 13% polyethylene glycol 3350; Micor seeding condition:40 mM MES, pH 5.5, 0.2M sodium tartrate, 8.5% PEG3350, 10 mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
5D7G Structure of human ATG5 E122D-ATG16L1 complex at 3.0 Angstroms 提交 2015-08-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
链 H 1–69（69 aa） 片段：UNP residues 1-69
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；Micro crystal: 37.5 mM MES, pH 5.2 to pH 5.8, 0.2 M sodium tartrate, and 11 to 13% polyethylene glycol 3350; Micor seeding condition:40 mM MES, pH 5.5, 0.2M sodium tartrate, 8.5% PEG3350, 10 mM DTT
分辨率 3.00 Å R-free 0.244
5NPV Structure of human ATG5-ATG16L1(ATG5BD) complex (I4) 提交 2017-04-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 11–307（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.76；293 K；0.1 M MES pH 5.76, 0.378 M KCl, 21.7 % PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.278
5NPV Structure of human ATG5-ATG16L1(ATG5BD) complex (I4) 提交 2017-04-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 11–307（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.76；293 K；0.1 M MES pH 5.76, 0.378 M KCl, 21.7 % PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.278
5NPW Structure of human ATG5-ATG16L1(ATG5BD) complex (C2) 提交 2017-04-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 11–307（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M KCl and 18 % PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.264
5NPW Structure of human ATG5-ATG16L1(ATG5BD) complex (C2) 提交 2017-04-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 11–307（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M KCl and 18 % PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.264
5NPW Structure of human ATG5-ATG16L1(ATG5BD) complex (C2) 提交 2017-04-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 11–307（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M KCl and 18 % PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.264
5NPW Structure of human ATG5-ATG16L1(ATG5BD) complex (C2) 提交 2017-04-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 11–307（297 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.4 M KCl and 18 % PEG 3350
分辨率 3.10 Å R-free 0.264
5NUV Structure of the WD40-domain of human ATG16L1 提交 2017-05-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 303–607（305 aa）
突变：E354A/K355A/Y607P BU3 (R,R)-2,3-BUTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.3；303 K；1.61 M (NH4)2SO4, 0.09 M NaCl, 0.1 M MES pH 6.3
分辨率 1.55 Å R-free 0.197
7W36 Crystal structure of human Atg5 complexed with a stapled peptide 提交 2021-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 13–33（21 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris-HCl pH8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
7XFR Crystal structure of WIPI2b in complex with the second site of ATG16L1 提交 2022-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 124–188（65 aa）
链 D 124–188（65 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M MES monohydrate(pH 6.5), 12% w/v Polyethylene glycol 20000
分辨率 1.76 Å R-free 0.193
8ZQG Crystal structure of WIPI3 in complex with ATG16L1 提交 2024-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 124–188（65 aa）
链 D 124–188（65 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；289 K；0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane (pH 8.8); 16% w/v Polyethylene glycol 3350
分辨率 2.77 Å R-free 0.233
9J54 Crystal structure of FIP200 Claw in complex with ATG16L1 提交 2024-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 235–247（13 aa）
链 D 235–247（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；289 K；10% v/v 2-Propanol, 0.1 M BICINE (pH 8.5), 30% w/v Polyethylene glycol 1500
分辨率 1.61 Å R-free 0.216
9JF2 Crystal structure of GABARAPL1 in complex with ATG16L1 提交 2024-09-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 235–247（13 aa）
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M Sodium cacodylate (pH 6.5), 40% v/v MPD, 5% w/v PEG 8000
分辨率 1.76 Å R-free 0.215
9JF2 Crystal structure of GABARAPL1 in complex with ATG16L1 提交 2024-09-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 235–247（13 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；289 K；0.1 M Sodium cacodylate (pH 6.5), 40% v/v MPD, 5% w/v PEG 8000
分辨率 1.76 Å R-free 0.215

共 13 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A16L1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 5–309； UniProt 303–607

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9h2q

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9h2q
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9h2q
沉积日期 deposition_date2024-10-14
结构标题 titleStabilized complex of Chlamydia trachomatic efector CT622 in complex with human WD40 domain of ATG16L1
关键词 keywordsEffector protein, autophagy, xenophagy, infection, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron28.17 Å
零角强度 I(0) i058017800.00
分子量 molecular_weight58324.0 kDa
排除体积 excluded_volume72509 ų
包络体积 envelope_volume91149 ų
水化壳体积 shell_volume28491 ų
包络直径 envelope_diameter99.0 Å
壳层 Rg shell_rg33.80 Å
包络 Rg envelope_rg28.26 Å
形状 Rg shape_rg28.19 Å
总 Rg total_rg28.68 Å
总原子数 total_atoms4102
残基数 n_residues542
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax96.1 Å
Rg (实空间) rg_real28.71 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.82 Å
I(0) (实空间) i0_real5.8020e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.5180e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.63 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal58010000.0000
解质量估计 total_estimate0.8388
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary27.4 Å
偏度 Skewness skewness0.534
峰度 Kurtosis kurtosis-0.281
角度范围 angular_range— – 0.2800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha16160000.0000
实空间数据点数 n_real_points57
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.769; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.823; Smooth: 0.771
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)