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9h93

Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from a yeast expression system.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 95.3 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein VP1

Poliovirus 2

UniProt Q8QNU4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–301 突变：VP1 V107I, VP1 F134L, VP1 V183L Capsid protein, VP0 × 60 （P06210） Capsid protein VP3 × 60 （A0A0K1U2R1） SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV. 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9H93 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 1 25–301（277 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 1 25–301（277 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 1 25–301（277 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 1 25–301（277 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 1 25–301（277 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9H94 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC5a) from a yeast expression system. 提交 2024-10-29 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 A 1–301（301 aa）
突变：VP1 T41I, VP1 F134L, VP1 Y159F SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
分辨率 2.10 Å

共 2 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8QNU4_9ENTO
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–301； UniProt 1–301

Capsid protein, VP0

Poliovirus 2

UniProt P06210

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–340 突变：VP4 I57V, VP2 D57A Capsid protein VP1 × 60 （Q8QNU4） Capsid protein VP3 × 60 （A0A0K1U2R1） SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV. 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9H93 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 240 PDB 声明：240-MERIC
链 1 578–878（301 aa）
链 2 69–339（271 aa）
链 3 340–577（238 aa）
链 4 1–68（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 60 MYR MYRISTIC ACID × 60 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 1 578–878（301 aa）
链 2 69–339（271 aa）
链 3 340–577（238 aa）
链 4 1–68（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 1 578–878（301 aa）
链 2 69–339（271 aa）
链 3 340–577（238 aa）
链 4 1–68（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 5 MYR MYRISTIC ACID × 5 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric
链 1 578–878（301 aa）
链 2 69–339（271 aa）
链 3 340–577（238 aa）
链 4 1–68（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 6 MYR MYRISTIC ACID × 6 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 1 578–878（301 aa）
链 2 69–339（271 aa）
链 3 340–577（238 aa）
链 4 1–68（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
1EAH PV2L COMPLEXED WITH ANTIVIRAL AGENT SCH48973 提交 1997-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 120 PDB 声明：120-meric
链 1 578–878（301 aa）
链 2 69–339（271 aa）
链 3 340–577（238 aa）
链 4 1–68（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 30 MYR MYRISTIC ACID × 30 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-MERIC
链 1 602–879（278 aa）
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
链 4 2–69（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 60 MYR MYRISTIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 1 602–879（278 aa）
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
链 4 2–69（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric
链 1 602–879（278 aa）
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
链 4 2–69（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 5 MYR MYRISTIC ACID × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 1 602–879（278 aa）
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
链 4 2–69（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 6 MYR MYRISTIC ACID × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
3EPF CryoEM structure of poliovirus receptor bound to poliovirus type 2 提交 2008-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 1 602–879（278 aa）
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
链 4 2–69（68 aa）
未记录 SC4 1[2-CHLORO-4-METHOXY-PHENYL-OXYMETHYL]-4-[2,6-DICHLORO-PHENYL-OXYMETHYL]-BENZENE × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10mM Tris-HCl, 20mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
8AYZ Poliovirus type 2 (strain MEF-1) virus-like particle in complex with capsid binder compound 17 提交 2022-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 A 579–879（301 aa）
链 B 1–340（340 aa）
链 C 342–578（237 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 60 FHK 4-[[4-[1,3-bis(oxidanylidene)isoindol-2-yl]phenyl]sulfonylamino]benzoic acid × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；1 x DPBS was made from tissue culture grade Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (Sigma-Aldrich). 20 mM EDTA was prepared from fresh stocks of buffered EDTA.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Single blotting with 3.5ul of sample. Four second blot time and -17 blot force on the vitrobot.
分辨率 1.88 Å
9F59 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from a mammalian expression system. 提交 2024-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 A 579–879（301 aa）
链 B 2–340（339 aa）
链 C 341–578（238 aa）
突变：VP1 V107I, VP1 F134L, VP1 V183L 突变：VP2 I57V, VP2 D126A 突变：VP3 Q178L SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 ul of sample blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
分辨率 2.30 Å
9F5P Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from an insect cell expression system. 提交 2024-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 A 579–879（301 aa）
链 B 2–340（339 aa）
链 C 341–578（238 aa）
突变：VP1 V107I, VP1 V134L, VP1 V183L 突变：VP2 I57V, VP2 D126A 突变：VP3 Q178L SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 ul of sample blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
分辨率 2.60 Å
9H94 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC5a) from a yeast expression system. 提交 2024-10-29 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
分辨率 2.10 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 1 579–879（301 aa）
链 2 70–340（271 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 1 579–879（301 aa）
链 2 70–340（271 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 1 579–879（301 aa）
链 2 70–340（271 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 1 579–879（301 aa）
链 2 70–340（271 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 1 579–879（301 aa）
链 2 70–340（271 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å

共 7 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLG_POL2L
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–340； UniProt 1–340

Capsid protein VP3

Poliovirus 2

UniProt A0A0K1U2R1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 341–578 突变：VP3 Q178L Capsid protein VP1 × 60 （Q8QNU4） Capsid protein, VP0 × 60 （P06210） SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV. 分辨率 2.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9H93 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
8E8S 9H2 Fab-poliovirus 2 complex 提交 2022-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 2 79–340（262 aa）
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9H94 Poliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC5a) from a yeast expression system. 提交 2024-10-29 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric
链 C 341–578（238 aa）
突变：VP3 L85F, VP3 Q178L SPH SPHINGOSINE × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；1 x DPBS, 20 mM EDTA, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3ul of sample double blotted for 3.5 seconds with -15 blot force on FEI Vitrobot mark IV.
分辨率 2.10 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-meric
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 60 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9OCL PV2-10D2 Complex 提交 2025-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 3 341–575（235 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å

共 3 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0K1U2R1_9ENTO
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–238； UniProt 341–578

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9h93

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9h93
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9h93
沉积日期 deposition_date2024-10-29
结构标题 titlePoliovirus type 2 (strain MEF-1) stabilised virus-like particle (PV2 SC6b) from a yeast expression system.
关键词 keywordsCapsid protein, virus-like particle, vaccine, VIRUS LIKE PARTICLE; VIRUS LIKE PARTICLE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier29.10 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron28.26 Å
零角强度 I(0) i094684400.00
分子量 molecular_weight77731.0 kDa
排除体积 excluded_volume97640 ų
包络体积 envelope_volume119690 ų
水化壳体积 shell_volume35411 ų
包络直径 envelope_diameter103.0 Å
壳层 Rg shell_rg35.28 Å
包络 Rg envelope_rg28.88 Å
形状 Rg shape_rg28.25 Å
总 Rg total_rg28.98 Å
总原子数 total_atoms5474
残基数 n_residues696
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax95.3 Å
Rg (实空间) rg_real29.10 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.60 Å
I(0) (实空间) i0_real9.4680e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4210e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal29.11 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal94680000.0000
解质量估计 total_estimate0.8874
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks0
主峰位置 r_peak_primary— Å
偏度 Skewness skewness0.369
峰度 Kurtosis kurtosis-0.271
角度范围 angular_range— – 0.2700 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha19230000.0000
实空间数据点数 n_real_points55
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.881; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.890
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)