Concanavalin-A
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 164–281 链 A; UniProt 30–148 | 未记录 | GOL GLYCEROL × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;1.8M Ammonium Sulfate, 0.1M MES pH 6.5, 0.01M Cobalt Chloride | 分辨率 1.48 Å R-free 0.213 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9J1A | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1APN THE CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF METAL-FREE CONCANAVALIN A AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1995-07-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–290(127 aa)
链 B
164–290(127 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.247 |
| 1BXH CONCANAVALIN A COMPLEXED TO METHYL ALPHA1-2 MANNOBIOSIDE 提交 1998-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 B
164–281(118 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 B
30–148(119 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 C
164–281(118 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 C
30–148(119 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 D
164–281(118 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 D
30–148(119 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;13.5% PEG 6K, 1.0M LICL, 0.1M TRIS PH 7.0
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.238 |
| 1CES CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A SOAKED WITH ZINC HAVE A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-02-15 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;pH 5.
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.249 |
| 1CJP CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-METHYLUMBELLIFERYL-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MUG 4-METHYLUMBELLIFERYL-ALPHA-D-GLUCOSE × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.78 Å R-free 0.216 |
| 1CN1 CRYSTAL STRUCTURE OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A. THE METAL-BINDING REGION 提交 1981-12-21 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–237(237 aa)
链 B
1–237(237 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1CON THE REFINED STRUCTURE OF CADMIUM SUBSTITUTED CONCANAVALIN A AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1993-03-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 8 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1CVN CONCANAVALIN A COMPLEXED TO TRIMANNOSIDE 提交 1995-08-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 9;pH 9.0
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.255 |
| 1DQ6 Manganese;Manganese concanavalin A at pH 7.0 提交 1999-12-30 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;2 M ammonium sulphate, 60 mM sodium acetate at pH 7, 3% PEGMe 5000, 1 mM MnCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 1.90 Å |
| 1ENQ CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH ZINC HAVING A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;pH 5.
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.284 |
| 1ENR CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH ZINC AND CALCIUM HAVING A ZINC ION BOUND IN THE S1 SITE AND A CALCIUM ION BOUND IN THE S2 SITE 提交 1996-03-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;pH 7.
|
分辨率 1.83 Å |
| 1ENS CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A SOAKED WITH COBALT HAVING A COBALT ION BOUND IN THE S1 SITE 提交 1996-03-20 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;pH 5.
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.259 |
| 1GIC CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH METHYL ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-08-08 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | GYP methyl alpha-D-glucopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
dialysis;pH 6.8;DIALYSIS; 5MM PROTEIN CONCENTRATION WITH, pH 6.8, dialysis
|
分辨率 2.00 Å |
| 1GKB CONCANAVALIN A, NEW CRYSTAL FORM 提交 2001-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;HANGING DROP, 30MG/ML, 10+10 UL 1 ML WELL, TRIS/HCL PH 8.0, 25%
|
分辨率 1.56 Å R-free 0.206 |
| 1I3H CONCANAVALIN A-DIMANNOSE STRUCTURE 提交 2001-02-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:residues 164-281,residues 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:residues 164-281,residues 30-148
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;PEG 6000, citirc acid, manganese chloride, calcium chloride, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.190 |
| 1JBC CONCANAVALIN A 提交 1996-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
8–148(141 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.15 Å R-free 0.167 |
| 1JN2 Crystal Structure of meso-tetrasulphonatophenyl porphyrin complexed with Concanavalin A 提交 2001-07-22 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 P
164–281(118 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 P
30–148(119 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SFP 5,10,15,20-TETRAKIS(4-SULPFONATOPHENYL)-21H,23H-PORPHINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 1JN2 Crystal Structure of meso-tetrasulphonatophenyl porphyrin complexed with Concanavalin A 提交 2001-07-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 P
164–281(118 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
链 P
30–148(119 aa)
片段:UNP P02866 residues 164-281, 30-148
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 SFP 5,10,15,20-TETRAKIS(4-SULPFONATOPHENYL)-21H,23H-PORPHINE × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å R-free 0.232 |
| 1JW6 Crystal Structure of the Complex of Concanavalin A and Hexapeptide 提交 2001-09-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 PTD PENTANEDIAL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.45;300 K;Sodium phosphate , pH 5.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.0K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.250 |
| 1JW6 Crystal Structure of the Complex of Concanavalin A and Hexapeptide 提交 2001-09-02 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 PTD PENTANEDIAL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.45;300 K;Sodium phosphate , pH 5.45, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300.0K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.250 |
| 1NLS CONCANAVALIN A AND ITS BOUND SOLVENT AT 0.94A RESOLUTION 提交 1997-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;pH 6.8
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.154 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 1
164–281(118 aa)
链 1
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 2
164–281(118 aa)
链 2
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 3
164–281(118 aa)
链 3
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 4
164–281(118 aa)
链 4
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 2 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 1
164–281(118 aa)
链 1
30–148(119 aa)
链 2
164–281(118 aa)
链 2
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 28 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 3
164–281(118 aa)
链 3
30–148(119 aa)
链 4
164–281(118 aa)
链 4
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 16 MN MANGANESE (II) ION × 8 NA SODIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 22 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 1
164–281(118 aa)
链 1
30–148(119 aa)
链 2
164–281(118 aa)
链 2
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1NXD Crystal structure of MnMn Concanavalin A 提交 2003-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
164–281(118 aa)
链 3
30–148(119 aa)
链 4
164–281(118 aa)
链 4
30–148(119 aa)
|
未记录 | AZI AZIDE ION × 8 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
Gel Acupuncture Method (GAME);pH 8;293 K;PEG 6000, Sodium Chloride, Calcium Chloride, Manganese Chloride, Sodium Azide, Tris-HCl , pH 8, Gel Acupuncture Method (GAME), temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 1ONA CO-CRYSTALS OF CONCANAVALIN A WITH METHYL-3,6-DI-O-(ALPHA-D-MANNOPYRANOSYL)-ALPHA-D-MANNOPYRANOSIDE 提交 1996-07-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;13% POLYETHYLENEGLYCOLMETHYLETHER, 40 MM HEPES PH 6.5
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.282 |
| 1QNY X-ray refinement of D2O soaked crystal of concanavalin A 提交 1999-10-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 A
164–281(118 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;CRYSTALS SELECTED FOR X-RAY STUDY WERE TRANSFERRED TO A 1ML BUFFER MADE OF 99.9% D2O WITH 0.1M NANO3, 0.05M TRIS-ACETATE, 1MM MNCL2 AND 1MM CACL2 PH 6.5.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.198 |
| 1SCR HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF SINGLE-METAL-SUBSTITUTED CONCANAVALIN A: THE CO,CA-PROTEIN AT 1.6 ANGSTROMS AND THE NI,CA-PROTEIN AT 2.0 ANGSTROMS 提交 1993-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1SCS HIGH-RESOLUTION STRUCTURES OF SINGLE-METAL-SUBSTITUTED CONCANAVALIN A: THE CO,CA-PROTEIN AT 1.6 ANGSTROMS AND THE NI,CA-PROTEIN AT 2.0 ANGSTROMS 提交 1993-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å |
| 1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.219 |
| 1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 E
30–148(119 aa)
链 F
30–148(119 aa)
链 G
30–148(119 aa)
链 H
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.219 |
| 1TEI STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED TO BETA-D-GLCNAC (1,2)ALPHA-D-MAN-(1,6)[BETA-D-GLCNAC(1,2)ALPHA-D-MAN (1,6)]ALPHA-D-MAN 提交 1997-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
链 E
30–148(119 aa)
链 F
30–148(119 aa)
链 G
30–148(119 aa)
链 H
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 8 CA CALCIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;POLYETHYLENE GLYCOL 15%, pH 5.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.219 |
| 1VAL CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-NITROPHENYL-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSIDE 提交 1996-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | PNG 4-nitrophenyl alpha-D-glucopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å R-free 0.274 |
| 1VAM CONCANAVALIN A COMPLEX WITH 4'-NITROPHENYL-ALPHA-D-MANNOPYRANOSIDE 提交 1996-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | PNA 4-nitrophenyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.75 Å R-free 0.260 |
| 1XQN The 15k neutron structure of saccharide-free concanavalin A 提交 2004-10-13 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
NEUTRON DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH DIALYSIS;pH 6.5;293 K;0.1M NaNO3, 0.05M Tris-acetate, 1mM MnCl2, 1mM CaCl2 (all in D2O), pH 6.50, BATCH DIALYSIS, temperature 293.0K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.320 |
| 2CNA THE COVALENT AND THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF CONCANAVALIN A, IV.ATOMIC COORDINATES,HYDROGEN BONDING,AND QUATERNARY STRUCTURE 提交 1975-04-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–290(127 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 2CTV HIGH RESOLUTION CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF NATIVE CONCANAVALIN A USING RAPID LAUE DATA COLLECTION METHODS AND THE INTRODUCTION OF A MONOCHROMATIC LARGE-ANGLE OSCILLATION TECHNIQUE (LOT) 提交 1993-08-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.95 Å |
| 2ENR CO-CRYSTALS OF DEMETALLIZED CONCANAVALIN A WITH CADMIUM HAVING A CADMIUM ION BOUND IN BOTH THE S1 SITE AND THE S2 SITE 提交 1998-07-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
8–148(141 aa)
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;pH 5.0
|
分辨率 2.35 Å |
| 2UU8 X-ray structure of Ni, Ca concanavalin A at Ultra-high resolution (0. 94A) 提交 2007-03-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.5
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.142 |
| 2YZ4 The neutron structure of concanavalin A at 2.2 Angstroms 提交 2007-05-02 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
NEUTRON DIFFRACTION
X-ray结晶条件
BATCH DIALYSIS;pH 6.5;293 K;0.1M NaNO3, 0.05M Tris-acetate, 1mM MnCl2, 1mM CaCl2, pH 6.5, BATCH DIALYSIS, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.312 |
| 3CNA STRUCTURE OF CONCANAVALIN A AT 2.4 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1976-09-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–237(237 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å |
| 3D4K Concanavalin A Complexed to a Synthetic Analog of the Trimannoside 提交 2008-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;291 K;10-16% PEG 6000, 100 mM Sodium cacodylate, 50 mM NaCL, 1 mM MnCL2, 1 mM CaCL2, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.238 |
| 3ENR ZINC-CALCIUM CONCANAVALIN A AT PH 6.15 提交 1999-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.15;ZNCL2, CACL2, (NH4)2SO4, sodium acetate, pH 6.15, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation;pH 8.5;273 K;10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.212 |
| 3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 GOL GLYCEROL × 12 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation;pH 8.5;273 K;10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.212 |
| 3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation;pH 8.5;273 K;10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.212 |
| 3NWK A second C2221 form of concanavalin A (Canavalia ensiformis) 提交 2010-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation;pH 8.5;273 K;10 mM Tris, pH 8.5, 1 M ammonium sulfate, hanging drop vapor diffusion using polymer-induced heteronucleation, temperature 273K
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.212 |
| 4P9W Structure of ConA/Rh3Man 提交 2014-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 B
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 B
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 C
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 C
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 D
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 D
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
|
未记录 | R3M 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION;pH 7.2;298 K;buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.202 |
| 4P9X Structure of ConA/Rh3Glu complex 提交 2014-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 B
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 B
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 C
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 C
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 D
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 D
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
|
未记录 | R3G 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-glucopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION;pH 7.2;298 K;buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.295 |
| 4P9Y Structure of ConA/Rh4man 提交 2014-04-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 B
164–281(118 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
链 B
30–148(119 aa)
片段:UNP residues 164-281, 30-148
|
未记录 | 2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION;pH 7.2;298 K;buffer: 20 mM HEPES, 5 mM of CaCl2, and 5 mM of MnCl2; pH = 7.2. The crystal was obtained by diffusion method in glass tube sequentially put with ConA solution, pure buffer, and the ligand solution.
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.258 |
| 4PF5 Crystal structure of Concanavalin A complexed with a synthetic derivative of high-mannose chain 提交 2014-04-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:Tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:Residues 164-281, 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:Residues 164-281, 30-148
链 B
164–281(118 aa)
片段:Residues 164-281, 30-148
链 B
30–148(119 aa)
片段:Residues 164-281, 30-148
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 8 M3N 4-(hydroxymethyl)-1-(alpha-D-mannopyranosyl)-1H-1,2,3-triazole × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;Sodium Acetate, 1,4-dioxane
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.227 |
| 5CNA REFINED STRUCTURE OF CONCANAVALIN A COMPLEXED WITH ALPHA-METHYL-D-MANNOPYRANOSIDE AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION AND COMPARISON WITH THE SACCHARIDE-FREE STRUCTURE 提交 1994-02-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–148(119 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 5O6N High pressure flash cooled concanavalin A 提交 2017-06-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;291 K;10 mg/ml Concanavalin A in 0.025 M HEPES pH 7.0 were mixed in a 1:1 ratio with 6 % (w/v) PEG 8000 and 0.1 M Tris pH 8.5.
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.164 |
| 5WEY Joint X-ray/neutron structure of Concanavalin A with alpha1-2 D-mannobiose 提交 2017-07-11 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
164–281(118 aa)
片段:unp residues 164-281; unp residues 30-148
链 A
30–148(119 aa)
片段:unp residues 164-281; unp residues 30-148
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
实验方法未声明
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;291 K;10% PEG 6K, 0.1 M sodium citrate, pH 5 in H2O
|
分辨率未提供 |
| 5YGM Monomeric structure of concanavalin A at pH 7.5 from Carnivalia ensiformis 提交 2017-09-24 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;PEK6K, MPD in HEPES, pH 7.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.196 |
| 5Z5L Crystal structure of ConA-R5M 提交 2018-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 96O (1-methyl-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methyl alpha-D-mannopyranoside × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;293 K;20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 5Z5L Crystal structure of ConA-R5M 提交 2018-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;293 K;20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.277 |
| 5Z5N Crystal structure of ConA-R1M 提交 2018-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;300 K;20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.225 |
| 5Z5P Crystal structure of ConA-R3M 提交 2018-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 R3M 2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;300 K;20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.241 |
| 5Z5Y Crystal structure of ConA-R4M 提交 2018-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | 2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;300 K;20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.244 |
| 5Z5Y Crystal structure of ConA-R4M 提交 2018-01-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | 2KO 2-{2-[2-(2-{4-[(alpha-D-mannopyranosyloxy)methyl]-1H-1,2,3-triazol-1-yl}ethoxy)ethoxy]ethoxy}ethyl 2-[3,6-bis(diethylamino)-9H-xanthen-9-yl]benzoate × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;300 K;20% polyethylene glycol 6000, 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.244 |
| 5ZAC Crystal structure of ConA-R2M 提交 2018-02-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 6 MAN alpha-D-mannopyranose × 2 TA5 2H-1,2,3-TRIAZOL-4-YLMETHANOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.2;300 K;each 0.2 mM ConA in 20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2 pH 7.2
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.372 |
| 6AHG Trimeric structure of concanavalin A from Canavalia ensiformis 提交 2018-08-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 CD CADMIUM ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Polyethylene glycol 400, 0.1 M Cadmium chloride hydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.279 |
| 6H2M Long wavelength Mesh&Collect native SAD phasing on microcrystals 提交 2018-07-13 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;drops made from equal amounts of protein solution (1 l, 10 mg/ml in water) and reservoir solution (1l, 34%(v/v) PEG 1500), buffered with 5mM HEPES, pH 6.0
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.177 |
| 6XT6 pro-concanavalin A: Precursor of circularly permuted concanavalin A 提交 2020-07-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
30–290(261 aa)
链 B
30–290(261 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;289 K;Zinc chloride, HEPES, PEG 6000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.244 |
| 7MG1 Concanavalin A crystallized without DNA glycoconjugate 提交 2021-04-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H3: 0.1 M potassium chloride, 0.005 M barium chloride dihydrate, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 12% w/v PEG 8000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 7MG2 Concanavalin A crystallized in the presence of Man-8 提交 2021-04-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and mannose-squaramide (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B6: 0.1 M sodium chloride, 0.005 M strontium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 7MG3 Concanavalin A crystallized in the presence of H2N-ATAT 提交 2021-04-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and 5'-ATAT-3' (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D11: 0.2 M lithium chloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 22% w/v PEG 2000 MME). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.213 |
| 7MG4 Concanavalin A crystallized in the presence of Gal-ATAT 提交 2021-04-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Gal-ATAT (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H9: 0.1 M potassium chloride, 0.002 M spermine tetrahydrochloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7.5), 7% w/v PEG 8000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 7MG5 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-ATAT 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and Man-ATAT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D9: 0.05 M bis-Tris (pH 7), 2 M ammonium sulfate, 5% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.245 |
| 7MG6 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-AGCT 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and Man-AGCT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D3: 0.2 M lithium sulfate, 0.05 M bis Tris (pH 7), 20% v/v MPD). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition.
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.207 |
| 7MG7 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-GTAC 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Man-GTAC (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition A4: 0.2 M potassium chloride, 0.005 M hexammine cobalt(III) chloride, 0.05 M MES (pH 6.5), 25% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.215 |
| 7MG8 Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-CGCG 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (80 uM) and Man-CGCG (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition D9: 0.05 M bis-Tris (pH 7), 2 M ammonium sulfate, 5% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.284 |
| 7MG9 Concanavalin A bound to DNA glycoconjugates, Man-TTTT and Man-AAAA 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM), Man-TTTT (64 uM), and Man-AAAA (64 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B5: 0.1 M lithium chloride, 0.01 M manganese(II) chloride tetrahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.314 |
| 7MGA Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, Man-AAATTT 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:octameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 SQ0 3-{[2-(2-hydroxyethoxy)ethyl]amino}-4-[(6-hydroxyhexyl)amino]cyclobut-3-ene-1,2-dione × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and Man-AAATTT (64 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition A3: 0.1 M sodium chloride, 0.05 M lithium chloride, 0.01 M magnesium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 25% v/v PEG 400). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.229 |
| 7MGB Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, A(Man-T)AT 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and A(Man-T)AT (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H10: 0.05 M lithium sulfate, 0.03 M magnesium sulfate heptahydrate, 0.05 M bis Tris (pH 8), 15% w/v PEG 3350). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.262 |
| 7MGC Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, G(Man-T)AC 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (40 uM) and G(Man-T)AC (160 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition H6: 0.1 M potassium chloride, 0.002 M spermine tetrahydrochloride, 0.05 M bis-Tris (pH 7), 15% w/v PEG 2000 MME). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.277 |
| 7MGD Concanavalin A bound to a DNA glycoconjugate, T(Man-T)TT 提交 2021-04-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 MMA methyl alpha-D-mannopyranoside × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;295 K;Sitting drop comprising 1 uL of Concanavalin A (32 uM) and T(Man-T)TT (128 uM) + 1 uL crystallization condition (Helix screen, condition B6: 0.1 M sodium chloride, 0.005 M strontium chloride hexahydrate, 0.05 M MES (pH 6.5), 17% w/v PEG 4000). Reservoir contained 70 uL of crystallization condition
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.255 |
| 8WMG Structure of ConA/Man3 提交 2023-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
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未记录 | WRW 4-[3,5-bis(4-carboxyphenyl)phenyl]benzoic acid × 1 ETA ETHANOLAMINE × 3 MAN alpha-D-mannopyranose × 3 MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2, pH = 7.5, Precipitant: 200 mM Ammonium phosphate
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分辨率 1.97 Å R-free 0.212 |
| 8WMK Structure of ConA/Man2 提交 2023-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
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未记录 | WU0 4-[3-(4-carboxyphenyl)phenyl]benzoic acid × 2 ETA ETHANOLAMINE × 4 MAN alpha-D-mannopyranose × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2; pH = 7.2, precipitant: Ammonium phosphate
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.267 |
| 9B34 Structure of concanavalin A (ConA) dimer from the open-state structure of kainate receptor GluK2 in complex with agonist glutamate and positive allosteric modulator BPAM344 bound to two ConA dimers. Type I interface between GluK2 ligand-binding domain and ConA 提交 2024-03-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
164–281(118 aa)
链 E
30–148(119 aa)
链 F
164–281(118 aa)
链 F
30–148(119 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.58 Å |
| 9J1B Structure of ConA/IMI-Man 提交 2024-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 A1EAT ~{N}-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethyl]-4-[3-[4-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethylcarbamoyl]phenyl]imidazol-3-ium-1-yl]benzamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;buffer: 20 mM HEPES, 5 mM CaCl2, 5 mM MnCl2; pH = 7.2, precipitant: Ammonium phosphate
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分辨率 2.48 Å R-free 0.228 |
| 9J1C Structure of ConA/NAP-Man 提交 2024-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 A1EAU ~{N}2,~{N}6-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]naphthalene-2,6-dicarboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1 M MES monohydrate pH 6.5, 12 % w/v Polyethylene glycol 20,000
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分辨率 2.43 Å R-free 0.282 |
| 9J1D Structure of ConA/PHE-Man 提交 2024-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
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未记录 | A1EAW ~{N}2,~{N}9-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide × 2 CA CALCIUM ION × 4 MN MANGANESE (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.1M Tris-HCl pH 8.5, 2.0M Ammonium phosphate monobasic
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分辨率 3.49 Å R-free 0.229 |
| 9J1F Dimeric Structure of ConA/M2P-Man 提交 2024-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
164–281(118 aa)
链 A
30–148(119 aa)
链 D
164–281(118 aa)
链 D
30–148(119 aa)
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2M Sodium chloride, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 10% (w/v) PEG 3000
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分辨率 2.17 Å R-free 0.257 |
| 9J1F Dimeric Structure of ConA/M2P-Man 提交 2024-08-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
164–281(118 aa)
链 B
30–148(119 aa)
链 C
164–281(118 aa)
链 C
30–148(119 aa)
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 A1EAW ~{N}2,~{N}9-bis[2-[2-[(2~{S},3~{S},4~{S},5~{S},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyethoxy]ethyl]-1,10-phenanthroline-2,9-dicarboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.2M Sodium chloride, 0.1M Phosphate-citrate pH 4.2 10% (w/v) PEG 3000
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分辨率 2.17 Å R-free 0.257 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CONA_CANEN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–118; UniProt 164–281 作者链 A; PDB构建体 119–237; UniProt 30–148 |