9ob1

S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromatin-remodeling ATPase INO80

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	INO80_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–1489； UniProt 1–1489

Actin-related protein 5

物种未注明

UniProt P53946

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–755； UniProt 1–755

Chromatin-remodeling complex subunit IES6

物种未注明

UniProt P32617

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IES6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166

RuvB-like protein 1

物种未注明

UniProt Q03940

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 V； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463 作者链 X； PDB构建体 1–463； UniProt 1–463

RuvB-like protein 2

物种未注明

UniProt Q12464

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 W； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 Y； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471

Ino eighty subunit 2

物种未注明

UniProt P40154

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	IES2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–320； UniProt 1–320

Histone H3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P61830

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 E； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62798

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H2A.1 × 2 （P04911） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_XENBO
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 F； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone H2A.1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P04911

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2B.1 × 2 （P02293） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2A1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 G； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

Histone H2B.1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P02293

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 18 DNA 2	DNA (227-MER) × 1 DNA (227-MER) × 1 Chromatin-remodeling ATPase INO80 × 1 （P53115） Actin-related protein 5 × 1 （P53946） Chromatin-remodeling complex subunit IES6 × 1 （P32617） RuvB-like protein 1 × 3 （Q03940） RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Ino eighty subunit 2 × 1 （P40154） Histone H3 × 2 （P61830） Histone H4 × 2 （P62798） Histone H2A.1 × 2 （P04911） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H2B1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 H； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9ob1
沉积日期 deposition_date	2025-04-21
结构标题 title	S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State
关键词 keywords	Chromatin Remodeler, nucleosome, DNA BINDING PROTEIN, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ob1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ob1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ob1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	64.19 Å
Rg（电子密度）	62.70 Å
总 Rg	63.03 Å
原子数	40498
残基数	4704
排除体积	703880 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9ob1__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA (227-MER)
分子量 formula_weight	69840.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	I
原子数 atom_count	40498

CTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCATGTATTGAACAGCGACCTTGCCGGTGCCAGTCGGATAGTGTTCCGAGCTCCCACTCTAGAGGATCCCCGGGTACCGA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA (227-MER)
分子量 formula_weight	70347.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	J

TCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGTGGGAGCTCGGAACACTATCCGACTGGCACCGGCAAGGTCGCTGTTCAATACATGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Chromatin-remodeling ATPase INO80
分子量 formula_weight	171693.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MSLAVLLNKEDKDISDFSKTTAGKSAKKNSRERVADVAPTRVLDKKQAYLSQLNSEFNRIKRRDSIEQLYQDWKFINLQEFELISEWNQQSKDWQFDNTNDSQDLHFKKLYRDMSMINKEWAEYQSFKNANLSDIINEKDADEDEEDDEDELEDGEEDMEEDEASTGRHTNGKSMRGNGIQKSRKKDAAAAAAIGKAIKDDQTHADTVVTVNGDENEDGNNGEDEDNDNDNENNNDNDNDNENENDNDSDNDDEEENGEEDEEEEEIEDLDEEDFAAFEEQDDNDDEDFNPDVEKRRKRSSSSSSSTKLSMNSLSLITSKKINKNITINSDRPKIVRELIKMCNKNKHQKIKKRRFTNCIVTDYNPIDSKLNIKITLKQYHVKRLKKLINDAKREREREEALKNNVGLDGNDLDNDEDGSESHKRRKLNNNTANGADDANKRKFNTRHGLPTYGMKMNAKEARAIQRHYDNTYTTIWKDMARKDSTKMSRLVQQIQSIRSTNFRKTSSLCAREAKKWQSKNFKQIKDFQTRARRGIREMSNFWKKNEREERDLKKKIEKEAMEQAKKEEEEKESKRQAKKLNFLLTQTELYSHFIGRKIKTNELEGNNVSSNDSESQKNIDISALAPNKNDFHAIDFDNENDEQLRLRAAENASNALAETRAKAKQFDDHANAHEEEEEEDELNFQNPTSLGEITIEQPKILACTLKEYQLKGLNWLANLYDQGINGILADEMGLGKTVQSISVLAHLAENHNIWGPFLVVTPASTLHNWVNEISKFLPQFKILPYWGNANDRKVLRKFWDRKNLRYNKNAPFHVMVTSYQMVVTDANYLQKMKWQYMILDEAQAIKSSQSSRWKNLLSFHCRNRLLLTGTPIQNSMQELWALLHFIMPSLFDSHDEFNEWFSKDIESHAEANTKLNQQQLRRLHMILKPFMLRRVKKNVQSELGDKIEIDVLCDLTQRQAKLYQVLKSQISTNYDAIENAATNDSTSNSASNSGSDQNLINAVMQFRKVCNHPDLFERADVDSPFSFTTFGKTTSMLTASVANNNSSVISNSNMNLSSMSSNNISNGKFTDLIYSSRNPIKYSLPRLIYEDLILPNYNNDVDIANKLKNVKFNIFNPSTNYELCLFLSKLTGEPSLNEFFRVSTTPLLKRVIERTNGPKNTDSLSFKTITQELLEVTRNAPSEGVMASLLNVEKHAYEREYLNCIQRGYHPNVSAPPVTIEVLGSSHVTNSINNELFDPLISQALSDIPAITQYNMHVKKGIPVEDFPKTGLFPEPLNKNFSSNISMPSMDRFITESAKLRKLDELLVKLKSEGHRVLIYFQMTKMMDLMEEYLTYRQYNHIRLDGSSKLEDRRDLVHDWQTNPEIFVFLLSTRAGGLGINLTAADTVIFYDSDWNPTIDSQAMDRAHRLGQTRQVTVYRLLVRGTIEERMRDRAKQKEQVQQVVMEGKTQEKNIKTIEVGENDSEVTREGSKSISQDGIKEAASALA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Actin-related protein 5
分子量 formula_weight	87682.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MSSRDASLTPLKAVVIDDPPLRQTPEPFDEQSAYNPQSPIAIDFGSSKLRAGFVNHATPTHIFPNALTKFRDRKLNKNFTFVGNDTLLDQAVRSQSRSPFDGPFVTNWNLTEEILDYTFHHLGVVPDNGIPNPILLTERLATVQSQRTNWYQILFETYNVPGVTFGIDSLFSFYNYNPSGNKTGLVISCGHEDTNVIPVVDGAGILTDAKRINWGGHQAVDYLNDLMALKYPYFPTKMSYLQYETMYKDYCYVSRNYDEDIEKILTLENLDTNDVVVEAPFTEVLQPQKTEEELRIQAEKRKETGKRLQEQARLKRMEKLVQKQEEFEYFSKVRDQLIDEPKKKVLSVLQNAGFDDERDFKKYLHSLEQSLKKAQMVEAEDDSHLDEMNEDKTAQKFDLLDIADEDLNEDQIKEKRKQRFLKASQDARQKAKEEKERVAKEEEEKKLKEQQWRETDLNGWIKDKRLKLNKLIKRRKEKLKLRDEMKDRKSQVSQNRMKNLASLAEDNVKQGAKRNRHQATIDNDPNDTFGANDEDWLIYTDITQNPEAFEEALEYEYKDIVELERLLLEHDPNFTEEDTLEAQYDWRNSILHLFLRGPRPHDSENIHEQHQMHLNVERIRVPEVIFQPTMGGQDQAGICELSETILLKKFGSQPGKLSQTSIDMVNNVLITGGNAKVPGLKERIVKEFTGFLPTGTNITVNMSSDPSLDAWKGMAALARNEEQYRKTVISKKEYEEYGPEYIKEHKLGNTKYFED

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Chromatin-remodeling complex subunit IES6
分子量 formula_weight	18565.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MSGSRGNSSNSSVSNNSNNNNNNDGGDERLLFLRSVGERNEIGFPSRFKSAHYKKPTRRHKSARQLISDENKRINALLTKANKAAESSTAARRLVPKATYFSVEAPPSIRPAKKYCDVTGLKGFYKSPTNNIRYHNAEIYQLIVKPMAPGVDQEYLKLRGANFVLK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	RuvB-like protein 1
分子量 formula_weight	50516.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,V,X

MVAISEVKENPGVNSSNSGAVTRTAAHTHIKGLGLDESGVAKRVEGGFVGQIEAREACGVIVDLIKAKKMSGRAILLAGGPSTGKTALALAISQELGPKVPFCPLVGSELYSVEVKKTETLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPEDAENPLGGYGKTISHVIVGLKSAKGTKTLRLDPTIYESIQREKVSIGDVIYIEANTGAVKRVGRSDAYATEFDLETEEYVPLPKGEVHKKKEIVQDVTLHDLDVANARPQGGQDVISMMGQLLKPKKTEITEKLRQEVNKVVAKYIDQGVAELIPGVLFIDEVNMLDIEIFTYLNKALESNIAPVVVLASNRGMTTVRGTEDVISPHGVPPDLIDRLLIVRTLPYDKDEIRTIIERRATVERLQVESSALDLLATMGTETSLRYALQLLAPCGILAQTSNRKEIVVNDVNEAKLLFLDAKRSTKILETSANYL

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	RuvB-like protein 2
分子量 formula_weight	51673.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,W,Y

MSIQTSDPNETSDLKSLSLIAAHSHITGLGLDENLQPRPTSEGMVGQLQARRAAGVILKMVQNGTIAGRAVLVAGPPSTGKTALAMGVSQSLGKDVPFTAIAGSEIFSLELSKTEALTQAFRKSIGIKIKEETELIEGEVVEIQIDRSITGGHKQGKLTIKTTDMETIYELGNKMIDGLTKEKVLAGDVISIDKASGKITKLGRSFARSRDYDAMGADTRFVQCPEGELQKRKTVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFTGDTGEIRSEVRDQINTKVAEWKEEGKAEIVPGVLFIDEVHMLDIECFSFINRALEDEFAPIVMMATNRGVSKTRGTNYKSPHGLPLDLLDRSIIITTKSYNEQEIKTILSIRAQEEEVELSSDALDLLTKTGVETSLRYSSNLISVAQQIAMKRKNNTVEVEDVKRAYLLFLDSARSVKYVQENESQYIDDQGNVQISIAKSADPDAMDTTE

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Ino eighty subunit 2
分子量 formula_weight	36211.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MDSEASDIEAELSDSVSAGGEEYIDDDDYTEDIDDQIVTAKSSRRTARRSVPKGVRTSKRIRDKELSVEVDEDYDEEEDVLSPSKKRHLHTRSMDKRQVAATASEKSDIGDSKGNDGEIEDGILEEEESLEKELNRGGGKEVEKSEESYYAQNDVGQKGEEEQDGESGGYEDNEPSISKESDELVSVVNGNGNEEDDEVEATKENTTDSTRSTTTRSKMLLDLLEDGGSKKKLTDEEIQLRRAENARKRKNLSEKRLEEEKQDTINKLLKKRAGKSRSHLPNDDEKNDGSSSFVKPRRPYNSEGMTRILRRYEEDLFCTF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	15391.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11394.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Histone H2A.1
分子量 formula_weight	14013.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,G

MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Histone H2B.1
分子量 formula_weight	14280.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H

MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATEASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	17836

S.c INO80 in complex with Yeast 0/80 nucleosome, Apo State

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromatin-remodeling ATPase INO80

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-related protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Chromatin-remodeling complex subunit IES6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ino eighty subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体