9ocl

PV2-10D2 Complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein VP1

物种未注明

UniProt P06210

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 360 Capsid protein VP3 × 60 (A0A0K1U2R1) Capsid protein VP4 × 60 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 60 10D2 Light Chain × 60 PALMITIC ACID × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Capsid protein VP3 × 1 (A0A0K1U2R1) Capsid protein VP4 × 1 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 1 10D2 Light Chain × 1 PALMITIC ACID × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 30 Capsid protein VP3 × 5 (A0A0K1U2R1) Capsid protein VP4 × 5 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 5 10D2 Light Chain × 5 PALMITIC ACID × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 36 Capsid protein VP3 × 6 (A0A0K1U2R1) Capsid protein VP4 × 6 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 6 10D2 Light Chain × 6 PALMITIC ACID × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Capsid protein VP3 × 1 (A0A0K1U2R1) Capsid protein VP4 × 1 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 1 10D2 Light Chain × 1 PALMITIC ACID × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POLG_POL2L
Isoform
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–301; UniProt 579–879 作者链 2; PDB构建体 1–271; UniProt 70–340

Capsid protein VP3

物种未注明

UniProt A0A0K1U2R1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 360 Capsid protein VP1 × 60 (P06210) Capsid protein VP2 × 60 (P06210) Capsid protein VP4 × 60 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 60 10D2 Light Chain × 60 PALMITIC ACID × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Capsid protein VP1 × 1 (P06210) Capsid protein VP2 × 1 (P06210) Capsid protein VP4 × 1 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 1 10D2 Light Chain × 1 PALMITIC ACID × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 30 Capsid protein VP1 × 5 (P06210) Capsid protein VP2 × 5 (P06210) Capsid protein VP4 × 5 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 5 10D2 Light Chain × 5 PALMITIC ACID × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 36 Capsid protein VP1 × 6 (P06210) Capsid protein VP2 × 6 (P06210) Capsid protein VP4 × 6 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 6 10D2 Light Chain × 6 PALMITIC ACID × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Capsid protein VP1 × 1 (P06210) Capsid protein VP2 × 1 (P06210) Capsid protein VP4 × 1 (D0QXH8) 10D2 Heavy Chain × 1 10D2 Light Chain × 1 PALMITIC ACID × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A0K1U2R1_9ENTO
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–235; UniProt 341–575

Capsid protein VP4

物种未注明

UniProt D0QXH8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 360 Capsid protein VP1 × 60 (P06210) Capsid protein VP2 × 60 (P06210) Capsid protein VP3 × 60 (A0A0K1U2R1) 10D2 Heavy Chain × 60 10D2 Light Chain × 60 PALMITIC ACID × 60 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Capsid protein VP1 × 1 (P06210) Capsid protein VP2 × 1 (P06210) Capsid protein VP3 × 1 (A0A0K1U2R1) 10D2 Heavy Chain × 1 10D2 Light Chain × 1 PALMITIC ACID × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 30 Capsid protein VP1 × 5 (P06210) Capsid protein VP2 × 5 (P06210) Capsid protein VP3 × 5 (A0A0K1U2R1) 10D2 Heavy Chain × 5 10D2 Light Chain × 5 PALMITIC ACID × 5 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 36 Capsid protein VP1 × 6 (P06210) Capsid protein VP2 × 6 (P06210) Capsid protein VP3 × 6 (A0A0K1U2R1) 10D2 Heavy Chain × 6 10D2 Light Chain × 6 PALMITIC ACID × 6 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Capsid protein VP1 × 1 (P06210) Capsid protein VP2 × 1 (P06210) Capsid protein VP3 × 1 (A0A0K1U2R1) 10D2 Heavy Chain × 1 10D2 Light Chain × 1 PALMITIC ACID × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 D0QXH8_9ENTO
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–68; UniProt 2–69

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ocl
沉积日期 deposition_date2025-04-24
结构标题 titlePV2-10D2 Complex
关键词 keywordsVirus, Antibody, Complex; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ocl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ocl__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ocl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)148.00 Å
总 Rg148.00 Å
原子数979080
残基数63900
排除体积8798500 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9ocl__assembly_1__model_1 360-meric (360) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 9ocl__assembly_2__model_1 hexameric (6) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 9ocl__assembly_3__model_1 30-meric (30) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 9ocl__assembly_4__model_1 36-meric (36) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 9ocl__assembly_5__model_1 hexameric (6) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

7. 引用文献 (1)