9ofv

Consensus reconstruction of the eukaryotic Ribosome-associated Quality Control complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 322.4 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9ofv

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9ofv
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9ofv
沉积日期 deposition_date2025-04-30
结构标题 titleConsensus reconstruction of the eukaryotic Ribosome-associated Quality Control complex
关键词 keywordsubiquitin, structural protein; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron115.80
零角强度 I(0) i0175595000000.00
分子量 molecular_weight2685600.0 kDa
排除体积 excluded_volume2991200 ų
包络体积 envelope_volume5596600 ų
水化壳体积 shell_volume409810 ų
包络直径 envelope_diameter422.4
壳层 Rg shell_rg105.50
包络 Rg envelope_rg117.50
形状 Rg shape_rg116.10
总 Rg total_rg115.00
总原子数 total_atoms183832
残基数 n_residues17229
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax322.4
Rg (实空间) rg_real101.90
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.61
I(0) (实空间) i0_real1.6990e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.7030e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal96.37
I(0) (倒空间) i0_reciprocal170200000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8759
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary99.2
偏度 Skewness skewness0.701
峰度 Kurtosis kurtosis-0.016
角度范围 angular_range— – 0.0650 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.7154
最高正则化参数 α highest_alpha11020000000.0000
实空间数据点数 n_real_points14
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.002; Oscil: 0.764; Stabil: 0.970; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.950; Smooth: 0.234

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (61)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)