9om6

22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, hydrolyzing, class 23

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 112.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Syntaxin-1A

Rattus norvegicus

UniProt P32851

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–267 链 B; UniProt 1–267 未记录 Synaptosomal-associated protein 25 × 2 (P60881) Alpha-soluble NSF attachment protein × 4 (P54921) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.14 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 53 个其他 PDB 条目、72 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 STX1A_RAT
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–267; UniProt 1–267 作者链 B; PDB构建体 1–267; UniProt 1–267

Synaptosomal-associated protein 25

Rattus norvegicus

UniProt P60881

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–206 链 D; UniProt 1–206 未记录 Syntaxin-1A × 2 (P32851) Alpha-soluble NSF attachment protein × 4 (P54921) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.14 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 39 个其他 PDB 条目、48 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNP25_RAT
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 17–222; UniProt 1–206 作者链 D; PDB构建体 17–222; UniProt 1–206

Alpha-soluble NSF attachment protein

Rattus norvegicus

UniProt P54921

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–295 链 F; UniProt 1–295 链 G; UniProt 1–295 链 H; UniProt 1–295 未记录 Syntaxin-1A × 2 (P32851) Synaptosomal-associated protein 25 × 2 (P60881) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.14 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 21 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SNAA_RAT
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 2–296; UniProt 1–295 作者链 F; PDB构建体 2–296; UniProt 1–295 作者链 G; PDB构建体 2–296; UniProt 1–295 作者链 H; PDB构建体 2–296; UniProt 1–295

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9om6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9om6
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9om6
沉积日期 deposition_date2025-05-13
结构标题 title22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, hydrolyzing, class 23
关键词 keywords;ATPase, SNARE, hydrolysis, disassembly, translocation, exocytosis, neurotransmitter release, synapse, synaptic transmission, membrane fusion, HYDROLASE ;; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.23
回转半径 Rg (电子) rg_electron35.48
零角强度 I(0) i0414080000.00
分子量 molecular_weight160780.0 kDa
排除体积 excluded_volume199930 ų
包络体积 envelope_volume282810 ų
水化壳体积 shell_volume64194 ų
包络直径 envelope_diameter115.0
壳层 Rg shell_rg43.55
包络 Rg envelope_rg34.80
形状 Rg shape_rg35.48
总 Rg total_rg36.07
总原子数 total_atoms22312
残基数 n_residues1426
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax112.3
Rg (实空间) rg_real36.00
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.61
I(0) (实空间) i0_real4.1410e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.5020e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal36.14
I(0) (倒空间) i0_reciprocal414100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8874
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary46.0
偏度 Skewness skewness0.146
峰度 Kurtosis kurtosis-0.397
角度范围 angular_range— – 0.2200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha84430000.0000
实空间数据点数 n_real_points45
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.891; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.969; Smooth: 0.889

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)