9p7h

In situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 244.9 Å Quality: EXCELLENT

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9p7h

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9p7h
下载 Download

1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id9p7h
沉积日期 deposition_date2025-06-20
结构标题 titleIn situ HHT and CHX treated human eEF1A-A/T-P state 80S ribosome
关键词 keywordsIn situ, Ribosome; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier94.16
回转半径 Rg (电子) rg_electron95.25
零角强度 I(0) i0306351000000.00
分子量 molecular_weight3298300.0 kDa
排除体积 excluded_volume3538600 ų
包络体积 envelope_volume5887600 ų
水化壳体积 shell_volume465650 ų
包络直径 envelope_diameter314.7
壳层 Rg shell_rg113.10
包络 Rg envelope_rg94.38
形状 Rg shape_rg95.32
总 Rg total_rg95.15
总原子数 total_atoms223411
残基数 n_residues17921
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax244.9
Rg (实空间) rg_real91.64
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.39
I(0) (实空间) i0_real2.9330e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.3320e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal95.89
I(0) (倒空间) i0_reciprocal308100000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9104
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary107.2
偏度 Skewness skewness0.120
峰度 Kurtosis kurtosis-0.586
角度范围 angular_range— – 0.0800 −1
当前正则化参数 α current_alpha1.0400
最高正则化参数 α highest_alpha20040000000.0000
实空间数据点数 n_real_points17
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 1.000; Stabil: 0.951; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.000

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (91)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)